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结直肠癌组织PHGDH、APOL3表达及临床预后价值
1
作者
潘艳
王蕾
+1 位作者
洪佳
薛建波
《疑难病杂志》
CAS
2024年第10期1171-1176,共6页
目的研究结直肠癌(CRC)中3-磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)、载脂蛋白L3(APOL3)表达,分析两者对CRC患者的预后评估价值。方法回顾性收集2018年3月—2021年2月首都医科大学大兴教学医院消化内科收治的CRC患者112例临床资料。采用实时荧光定量PC...
目的研究结直肠癌(CRC)中3-磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)、载脂蛋白L3(APOL3)表达,分析两者对CRC患者的预后评估价值。方法回顾性收集2018年3月—2021年2月首都医科大学大兴教学医院消化内科收治的CRC患者112例临床资料。采用实时荧光定量PCR(qPCR)和免疫组织化学法检测癌组织及癌旁组织中PHGDH、APOL3 mRNA和蛋白表达;Kaplan-Meier法分析PHGDH、APOL3 mRNA表达对CRC患者生存预后的影响;Cox回归分析CRC预后的影响因素;受试者工作特征(ROC)曲线评价PHGDH、APOL3 mRNA表达水平对CRC患者预后的评估价值。结果CRC患者癌组织中PHGDH mRNA相对表达量高于癌旁组织,APOL3 mRNA相对表达量低于癌旁组织(t/P=52.982/<0.001,35.679/<0.001);CRC患者癌组织中PHGDH、APOL3蛋白阳性率分别为78.10%(90/112)、8.57%(10/112),与癌旁组织的7.62%(8/112)、76.19%(88/112)比较,差异有统计学意义(χ^(2)/P=123.722/<0.001,110.367/<0.001);TNM分期Ⅲ期、有淋巴结转移的CRC癌组织中PHGDH mRNA表达水平高于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移,而APOL3 mRNA表达水平低于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移(PHGDH:t/P=52.268/<0.001,51.315/<0.001;APOL3:t/P=15.873/<0.001,14.769/<0.001)。PHGDH mRNA高表达组3年总生存率为50.00%(26/52),低于低表达组的73.33%(44/60)(Log rankχ^(2)=4.169,P=0.041);APOL3 mRNA低表达组3年总生存率为46.30%(25/54),低于高表达组的77.59%(45/58)(Log rankχ^(2)=10.650,P=0.001)。TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移、PHGDH mRNA高为影响CRC患者预后的独立危险因素[OR(95%CI)=1.465(1.172~1.832),1.501(1.159~1.944),1.384(1.088~1.761)],APOL3 mRNA高为独立保护因素[OR(95%CI)=0.775(0.617~0.924)];PHGDH、APOL3 mRNA表达水平及二者联合评估CRC患者预后的曲线下面积(AUC)分别为0.830、0.816、0.922,二者联合的AUC大于PHGDH、APOL3 mRNA表达水平单独评估(Z=4.482、4.130,P均<0.001)。结论CRC中PHGDH表达上调,APOL3表达下调,在CRC中均发挥重要的促癌作用,联合检测PHGDH、APOL3的表达有助于评估CRC的预后。
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关键词
结直肠癌
3
-磷酸甘油酸脱氢酶
载脂蛋白l3
预后
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职称材料
马氏珠母贝载脂蛋白基因Pm-APOL3克隆、表达量与类胡萝卜素含量相关分析
被引量:
5
2
作者
陈雪欣
雷超
+4 位作者
彭慧湃
王庆恒
焦钰
李俊辉
邓岳文
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期1707-1714,共8页
Apolipoprotein L3(APOL3)是新发现的一种高密度脂蛋白,属于载脂蛋白L基因家族的成员之一,具有运载脂类物质进行生化代谢的功能。本研究利用c DNA末端快速扩增技术获得了马氏珠母贝APOL3基因(Pm-APOL3)c DNA全长序列,分析其序列及功能特...
Apolipoprotein L3(APOL3)是新发现的一种高密度脂蛋白,属于载脂蛋白L基因家族的成员之一,具有运载脂类物质进行生化代谢的功能。本研究利用c DNA末端快速扩增技术获得了马氏珠母贝APOL3基因(Pm-APOL3)c DNA全长序列,分析其序列及功能特征,检测Pm-APOL3基因在不同组织的表达,并分析了金黄壳色群体与养殖群体类胡萝卜素含量与Pm-APOL3基因表达量的相关性。结果表示,Pm-APOL3基因c DNA全长874 bp,开放阅读框(ORF)为357 bp,编码118个氨基酸,包含475 bp的5'UTR,42 bp的3'UTR,相对分子量为12.795 5 ku,等电点为4.71。该蛋白质的不稳定指数为34.09,属于稳定蛋白质,疏水性分析表明其亲水性平均系数为0.74,属疏水蛋白,信号肽预测结果表示其不含信号肽,为非分泌蛋白。荧光定量PCR分析表明Pm-APOL3基因在鳃、外套膜、闭壳肌与肝胰脏均有表达,其中肝胰脏表达量显著大于其它三个组织(p<0.05)。金黄壳色群体类胡萝卜素含量与Pm-APOL3基因表达量均显著大于养殖群体(p<0.05)。本研究结果表明Pm-APOL3是参与马氏珠母贝类胡萝卜素代谢重要基因。
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关键词
马氏珠母贝
载脂蛋白l3
基因克隆
类胡萝卜素
原文传递
题名
结直肠癌组织PHGDH、APOL3表达及临床预后价值
1
作者
潘艳
王蕾
洪佳
薛建波
机构
首都医科大学大兴教学医院消化内科
出处
《疑难病杂志》
CAS
2024年第10期1171-1176,共6页
基金
北京市医院管理中心“登峰”人才培养计划项目(DFL20220101)。
文摘
目的研究结直肠癌(CRC)中3-磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)、载脂蛋白L3(APOL3)表达,分析两者对CRC患者的预后评估价值。方法回顾性收集2018年3月—2021年2月首都医科大学大兴教学医院消化内科收治的CRC患者112例临床资料。采用实时荧光定量PCR(qPCR)和免疫组织化学法检测癌组织及癌旁组织中PHGDH、APOL3 mRNA和蛋白表达;Kaplan-Meier法分析PHGDH、APOL3 mRNA表达对CRC患者生存预后的影响;Cox回归分析CRC预后的影响因素;受试者工作特征(ROC)曲线评价PHGDH、APOL3 mRNA表达水平对CRC患者预后的评估价值。结果CRC患者癌组织中PHGDH mRNA相对表达量高于癌旁组织,APOL3 mRNA相对表达量低于癌旁组织(t/P=52.982/<0.001,35.679/<0.001);CRC患者癌组织中PHGDH、APOL3蛋白阳性率分别为78.10%(90/112)、8.57%(10/112),与癌旁组织的7.62%(8/112)、76.19%(88/112)比较,差异有统计学意义(χ^(2)/P=123.722/<0.001,110.367/<0.001);TNM分期Ⅲ期、有淋巴结转移的CRC癌组织中PHGDH mRNA表达水平高于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移,而APOL3 mRNA表达水平低于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移(PHGDH:t/P=52.268/<0.001,51.315/<0.001;APOL3:t/P=15.873/<0.001,14.769/<0.001)。PHGDH mRNA高表达组3年总生存率为50.00%(26/52),低于低表达组的73.33%(44/60)(Log rankχ^(2)=4.169,P=0.041);APOL3 mRNA低表达组3年总生存率为46.30%(25/54),低于高表达组的77.59%(45/58)(Log rankχ^(2)=10.650,P=0.001)。TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移、PHGDH mRNA高为影响CRC患者预后的独立危险因素[OR(95%CI)=1.465(1.172~1.832),1.501(1.159~1.944),1.384(1.088~1.761)],APOL3 mRNA高为独立保护因素[OR(95%CI)=0.775(0.617~0.924)];PHGDH、APOL3 mRNA表达水平及二者联合评估CRC患者预后的曲线下面积(AUC)分别为0.830、0.816、0.922,二者联合的AUC大于PHGDH、APOL3 mRNA表达水平单独评估(Z=4.482、4.130,P均<0.001)。结论CRC中PHGDH表达上调,APOL3表达下调,在CRC中均发挥重要的促癌作用,联合检测PHGDH、APOL3的表达有助于评估CRC的预后。
关键词
结直肠癌
3
-磷酸甘油酸脱氢酶
载脂蛋白l3
预后
Keywords
Co
l
orecta
l
cancer
3
-phosphog
l
ycerate dehydrogenase
Apo
l
ipoprotein
l
3
Prognosis
分类号
R735.34 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
马氏珠母贝载脂蛋白基因Pm-APOL3克隆、表达量与类胡萝卜素含量相关分析
被引量:
5
2
作者
陈雪欣
雷超
彭慧湃
王庆恒
焦钰
李俊辉
邓岳文
机构
广东海洋大学水产学院
广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期1707-1714,共8页
基金
广东省科技厅项目"近江牡蛎三倍体优质苗种及马氏珠母贝新品种培育技术研究与开发"(2013B020201002)
广东省海洋与渔业局科技专项"马氏珠母贝优质抗逆选系苗种规模化繁育与示范养殖"(Z2014009)
+1 种基金
2015年广东海洋大学"海之帆-起航计划"大学生科技创新项目"马氏珠母贝类胡萝卜素与相关基因表达量在关联分析"
2015年广东海洋大学水产学院创新项目"马氏珠母贝类胡萝卜富集机理分析"共同资助
文摘
Apolipoprotein L3(APOL3)是新发现的一种高密度脂蛋白,属于载脂蛋白L基因家族的成员之一,具有运载脂类物质进行生化代谢的功能。本研究利用c DNA末端快速扩增技术获得了马氏珠母贝APOL3基因(Pm-APOL3)c DNA全长序列,分析其序列及功能特征,检测Pm-APOL3基因在不同组织的表达,并分析了金黄壳色群体与养殖群体类胡萝卜素含量与Pm-APOL3基因表达量的相关性。结果表示,Pm-APOL3基因c DNA全长874 bp,开放阅读框(ORF)为357 bp,编码118个氨基酸,包含475 bp的5'UTR,42 bp的3'UTR,相对分子量为12.795 5 ku,等电点为4.71。该蛋白质的不稳定指数为34.09,属于稳定蛋白质,疏水性分析表明其亲水性平均系数为0.74,属疏水蛋白,信号肽预测结果表示其不含信号肽,为非分泌蛋白。荧光定量PCR分析表明Pm-APOL3基因在鳃、外套膜、闭壳肌与肝胰脏均有表达,其中肝胰脏表达量显著大于其它三个组织(p<0.05)。金黄壳色群体类胡萝卜素含量与Pm-APOL3基因表达量均显著大于养殖群体(p<0.05)。本研究结果表明Pm-APOL3是参与马氏珠母贝类胡萝卜素代谢重要基因。
关键词
马氏珠母贝
载脂蛋白l3
基因克隆
类胡萝卜素
Keywords
Pinctada fucata martensii
Apo
l
ipoprotein
l
3
Gene c
l
oning
Tota
l
carotenoid
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
结直肠癌组织PHGDH、APOL3表达及临床预后价值
潘艳
王蕾
洪佳
薛建波
《疑难病杂志》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
马氏珠母贝载脂蛋白基因Pm-APOL3克隆、表达量与类胡萝卜素含量相关分析
陈雪欣
雷超
彭慧湃
王庆恒
焦钰
李俊辉
邓岳文
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
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