虾源达卡气单胞菌全基因组分析和致病性研究

目的为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。方法对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型;利用β-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线虫液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性;通过药敏实验及耐药基因检测分析其耐药特征;利用eggnog、Prophage Hunter工具对全基因组序列进行分析。结果菌株18FX22鉴定为达卡气单胞菌。该菌的致病性主要表现:有β-溶血能力和胞外蛋白酶活性;对秀丽隐杆线虫、小鼠成纤维细胞和小鼠均有致病性。经检测,该菌携带7种毒力基因和12种耐药基因,发现其对阿莫西林/克拉维酸、头孢唑林和多粘菌素3种药物有耐药性。全基因组测序结果发现:18FX22的全基因组大小为4811079 bp,GC含量为61.33%。COG注释发现18FX22共有3850个基因,具有20类功能。前噬菌体预测结果发现18FX22的基因组中含有2个前噬菌体序列。全球达卡气单胞菌的聚类结果显示该菌与GCA016729585的进化关系更近。结论本研究从商品虾分离出达卡气单胞菌,发现该菌株的毒性较强,指示应加强海鲜食品安全的管控,并为达卡气单胞菌的防治提供参考。

1例罕见达卡气单胞菌感染合并大面积皮肤组织缺如患者的护理

达卡气单胞菌(Aeromonas dhakensis)是一个新发现的气单胞菌分离株,临床上以严重组织破坏的灾难性进展为特征,携带大量的毒力基因[1]。由气单胞菌引起的伤口感染最典型的表现是蜂窝织炎,患者大多有外伤史,后接触土壤、水或鱼刺直接刺伤而感染[2];肌坏死(伴或不伴产气)、横纹肌溶解也有报道,甚至严重者可进展为坏死性筋膜炎(necrotizing fasciitis,NF),NF通常发生在免疫功能低下(恶性肿瘤、肝硬化、糖尿病等)的患者中[3],这些患者常常出现低血压、发烧、皮肤软组织坏死和坏疽,甚至死亡[4]。

牛蛙源达卡气单胞菌的分离鉴定及毒力特性分析

采用细菌形态与生化鉴定方法并结合16S rRNA及gyrA基因测序分析,对海南省文昌市某养殖场死亡牛蛙病变组织中分离获得的1株优势菌株WC0803进行鉴定,并对其进行致病性试验、药物敏感性试验及耐药基因和毒力基因检测。结果显示,该菌株为革兰阴性短杆菌,培养特性、生化反应与达卡气单胞菌(Aeromonas dhakensis)基本一致;16S rRNA和gyrA基因同源性及系统进化分析显示,WC0803菌株与达卡气单胞菌参考菌株同源性大于99%,且为同一进化分支。该菌对头孢噻肟、环丙沙星、恩诺沙星等7种抗生素敏感,对头孢氨苄、万古霉素、磺胺异恶唑和链霉素等10种抗生素耐药;携带耐药基因qnrA、qnrS、ant3、tem、ctxM,毒力基因ascV、aer、act、ast、lip、ela和fla;对牛蛙的半数致死量(LD50)为4.68×10^(6)CFU/mL,具有较强的致病性。本研究首次从患病牛蛙体内分离出一株强致病性达卡气单胞菌,为该菌感染的防治提供科学依据。

达卡气单胞菌致脓毒性休克一例并文献复习

目的 了解达卡气单胞菌的特点、致病性及该菌感染的临床特点、治疗、转归及耐药性。方法 报告1例呼吸重症监护室收治的达卡气单胞菌感染的脓毒性休克致死病例,整理患者临床资料并回顾文献。结果 患者男,69岁,既往胃恶性肿瘤及肾肿瘤手术史,此次系“乏力3 d,发热咳嗽2 d,加重伴闷喘半天”入院,入院时存在呼吸衰竭及酸中毒,胸部CT斑片状高密度影,考虑为脓毒症,治疗上经验性使用广谱抗生素抗感染,辅以呼吸循环支持治疗,肺泡灌洗液送检相关病原学检查,但本例患者病情进展迅速,细菌培养结果未出即临床死亡,后基因测序结果提示达卡气单胞菌。文献回顾纳入3例患者,均短时间内死亡,且均通过基因测序检出该菌。达卡气单胞菌是一种条件致病菌,广泛分布于水生环境中,侵袭性强,致死率高。结论 达卡气单胞菌感染病情凶险,临床表现无显著特异性,基因测序能有效鉴别该菌,治疗上需谨慎选择抗生素,该菌感染预后差,目前该菌已出现多种耐药菌株。

用gyrB、rpoD基因扩增测序进行气单胞菌分类的探讨

目的获得气单胞菌更准确的分类结果。方法收集经Vitek全自动细菌分析仪及配套的GN鉴定卡鉴定为气单胞菌的菌株231株,对其gyr B、rpo D两个管家基因进行PCR扩增及测序,并与Gen Bank中标准序列进行基因序列比对和单核苷酸替代率分析,综合分析gyr B、rpo D两基因测序结果并进行基因分类。结果 231株气单胞菌中,69株(29.9%)gyr B和rpo D基因均获得测序结果,86株(37.2%)仅获得gyr B序列,50株(21.6%)仅获得rpo D序列,26株(11.3%)两种基因均未获得序列。生化表型鉴定为嗜水气单胞菌的菌株中62.7%基因分类结果为达卡气单胞菌,仅22.4%为嗜水气单胞菌,其种间生化反应结果相近。结论气单胞菌属的生化分类与基因分类结果存在差异。达卡气单胞菌与嗜水气单胞菌的鉴定依赖于基因序列分析。