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基于COⅠ基因片段的中国南部沿海近亲拟相手蟹的群体遗传多样性研究
被引量:
3
1
作者
杨明柳
徐岩
+3 位作者
高霆炜
潘红平
吴斌
阎冰
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期105-115,共11页
为了研究我国南部沿海近亲拟相手蟹(Parasesarma affine)的群体遗传结构,本研究对12个地理群体共222个个体的线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段进行了分析。结果表明,612 bp的COⅠ基因片段检测到34个变异位点,共定义了40...
为了研究我国南部沿海近亲拟相手蟹(Parasesarma affine)的群体遗传结构,本研究对12个地理群体共222个个体的线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段进行了分析。结果表明,612 bp的COⅠ基因片段检测到34个变异位点,共定义了40个单倍型,其中Hap2为12个群体的共享单倍型,占个体总数的69.81%。总群体的单倍型多样性水平Hd为0.5089,核苷酸多样性水平Pi为0.001126,表现出中等水平的Hd和低水平的Pi。单倍型邻接发育树和单倍型中介网络图没有形成明显的地理系谱结构。近亲拟相手蟹群体内的遗传距离为0.00036~0.00173,群体间的遗传距离为0.00048~0.00172。群体间的遗传分化系数(Fst)和分子方差分析(AMOVA)结果表明,近亲拟相手蟹群体遗传分化水平低,其变异主要来自群体内。中性检验和核苷酸不配对分布结果提示,近亲拟相手蟹近期经历了群体扩张事件,扩张时间大约发生于5.1万年前的更新世晚期。研究表明,较长的幼虫浮游期以及海洋环境中缺少影响群体扩散的屏障可能是近亲拟相手蟹各地理群体间能进行广泛的基因交流,从而表现出较低的遗传分化水平的重要原因,更新世的剧烈气候变迁亦可能对其群体的遗传结构和分布格局产生影响。研究结果为近亲拟相手蟹自然资源的保护及合理开发利用提供了一定理论依据。
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关键词
近亲拟相手蟹
COⅠ基因
遗传多样性
遗传结构
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职称材料
题名
基于COⅠ基因片段的中国南部沿海近亲拟相手蟹的群体遗传多样性研究
被引量:
3
1
作者
杨明柳
徐岩
高霆炜
潘红平
吴斌
阎冰
机构
广西科学院广西红树林研究中心广西红树林保护与利用重点实验室
广西大学动物科学技术学院
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期105-115,共11页
基金
国家重点研发计划科技基础资源调查专项(2017FY100704)
广西自然科学基金项目(2017GXNSFBA198163)
广西“红树林和海草系统保育与生态监测”特聘专家岗基金资助。
文摘
为了研究我国南部沿海近亲拟相手蟹(Parasesarma affine)的群体遗传结构,本研究对12个地理群体共222个个体的线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段进行了分析。结果表明,612 bp的COⅠ基因片段检测到34个变异位点,共定义了40个单倍型,其中Hap2为12个群体的共享单倍型,占个体总数的69.81%。总群体的单倍型多样性水平Hd为0.5089,核苷酸多样性水平Pi为0.001126,表现出中等水平的Hd和低水平的Pi。单倍型邻接发育树和单倍型中介网络图没有形成明显的地理系谱结构。近亲拟相手蟹群体内的遗传距离为0.00036~0.00173,群体间的遗传距离为0.00048~0.00172。群体间的遗传分化系数(Fst)和分子方差分析(AMOVA)结果表明,近亲拟相手蟹群体遗传分化水平低,其变异主要来自群体内。中性检验和核苷酸不配对分布结果提示,近亲拟相手蟹近期经历了群体扩张事件,扩张时间大约发生于5.1万年前的更新世晚期。研究表明,较长的幼虫浮游期以及海洋环境中缺少影响群体扩散的屏障可能是近亲拟相手蟹各地理群体间能进行广泛的基因交流,从而表现出较低的遗传分化水平的重要原因,更新世的剧烈气候变迁亦可能对其群体的遗传结构和分布格局产生影响。研究结果为近亲拟相手蟹自然资源的保护及合理开发利用提供了一定理论依据。
关键词
近亲拟相手蟹
COⅠ基因
遗传多样性
遗传结构
Keywords
Parasesarma affine
COⅠgene
genetic diversity
genetic structure
分类号
Q347 [生物学—遗传学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
基于COⅠ基因片段的中国南部沿海近亲拟相手蟹的群体遗传多样性研究
杨明柳
徐岩
高霆炜
潘红平
吴斌
阎冰
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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职称材料
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