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题名人类Y染色体36个新STR位点的筛选与鉴定
被引量:2
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作者
彭冬铂
姜正文
孙斯平
李才华
卢大儒
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机构
复旦大学生命科学学院
上海天昊生物科技有限公司遗传分析中心
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期1409-1416,共8页
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基金
上海天昊生物科技有限公司对本课题的研究提供了研究经费以及技术平台支持
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文摘
通过对NCBI数据库中的Y-STR位点和生物信息学预测的新Y-STR位点的分析,选取了133个位点在48个全球分布的样本中进行检测验证,获得41个可靠的高频位点,其中36个为首次发现验证的新Y-STR位点。利用这41个Y-STR位点,在200个上海随机男性样本中共发现200种单倍型,实现了人群内个体间100%区分,并通过对浙江江山一姜氏聚集地的9个5代以内无血缘关系的姜氏个体和7个上海随机人群的姜氏个体的单倍型的分析,发现6个江山姜氏个体具较近的亲缘关系(彼此差异位点在2~4个之间)。这41个Y-STR位点具备较高的信息度,能有效区分群体内不同家族来源的个体,这将有助于群体内个体间近代亲缘关系研究,并有望在法医学法医个体识别、亲权鉴定,人类起源、迁徙等研究中发挥重大作用。
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关键词
Y-STR
多态性
单倍型
区分度
近代亲缘关系
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Keywords
Y-STR
polymorphism
haplotype
discrimination
early modem genetic relationship
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分类号
Q987
[生物学—遗传学]
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题名利用Y-STR单倍型推断样品间亲缘关系
被引量:1
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作者
李为哲
李钊
党钦
王磊
曾昭书
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机构
郑州大学基础医学院法医学系
郑州大学临床医学专业
郑州市公安局刑侦局
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出处
《中国法医学杂志》
CSCD
2020年第3期305-308,共4页
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基金
郑州大学大学生创新创业训练计划项目(2014cxcz452)
国家自然科学基金——河南联合项目(U1804194)。
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文摘
目的通过对Y-STR单倍型的分析,推测不同样品间的亲缘关系远近。方法对郑州地区某单一姓氏男性182人取外周血,以Yfiler Plus试剂盒进行Y-STR基因座分型;以Arlequin分析单倍型多态性;以Network软件构建各样品间关系网络;以SPSS软件构建各样品间远近关系树状结构。结果单倍型分析发现,182例样品中共存在164种单倍型;Network软件分析显示,大部分样品间的网络距离呈均匀分布,但少部分样品距离较近;SPSS软件聚类分析发现,164个单倍型呈现出多个层级,大部分在短期内就发生了第一次聚集,再往根部又发生7次较大的汇集,最终全部汇集到两个分支上。结论即使在同姓男子中,Yfiler Plus试剂盒所包含的Y-STR基因座仍然有较高的基因差异度;以Y-STR检测结果进行Network分析及进化树分析,有助于揭示群体内个体间近代亲缘关系和遗传层级关系。该思路有望在法医学法医个体识别、亲权鉴定及族群迁徙等研究中发挥作用。
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关键词
Y染色体
STR基因组
单倍型
近代亲缘关系
系统进化树
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Keywords
Y chromosome
short tandem repeats(STR)
haplotype
genetic relationship
phylogenetic tree
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分类号
DF795.1
[医药卫生—法医学]
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