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烟草属植物遗传多样性和亲缘进化关系的荧光AFLP分析 被引量:20
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作者 李凤霞 王卫锋 +2 位作者 王鲁 崔萌萌 孙玉合 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期2418-2427,共10页
【目的】研究烟草属不同亚属以及不同类型栽培烟草的遗传相似性关系,为明确烟草野生种和栽培烟草的遗传多样性水平、研究栽培烟草起源演化提供依据。【方法】利用CEQ8000遗传分析系统,对烟草属内4种类型的5份栽培烟草以及28份烟草野生... 【目的】研究烟草属不同亚属以及不同类型栽培烟草的遗传相似性关系,为明确烟草野生种和栽培烟草的遗传多样性水平、研究栽培烟草起源演化提供依据。【方法】利用CEQ8000遗传分析系统,对烟草属内4种类型的5份栽培烟草以及28份烟草野生种进行荧光AFLP分析,估算其遗传相似系数,并对28份烟草野生种、5份栽培烟草及其可能的祖先种分别进行UPGMA聚类分析。【结果】利用10对AFLP引物在33份种质中共扩增到2 423个片段,2 394个具有多态性。烟草属33份种质的遗传相似系数在0.021—0.860,平均为0.269。当相似系数为0.309时,28份野生烟草按其亚属聚为3类。2个栽培烟草种的5份不同类型烟草与其对应的可能祖先种首先聚为一类。在不同类型普通烟草中扩增到的AFLP共有片段,有97.7%可以在其可能的祖先种中找到。【结论】烟草属植物具有丰富的遗传多样性。栽培烟草进化过程中,其假设的祖先亲本都有一定贡献,其中N.sylvestris对普通烟草的形成贡献最大。 展开更多
关键词 烟草属 遗传多样性 亲缘进化关系 荧光AFLP
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5种裸腹溞的核型及亲缘进化关系的研究 被引量:3
2
作者 张鹏 赵文 孙静娴 《大连水产学院学报》 CSCD 北大核心 2009年第2期109-113,共5页
以5种裸腹溞Moina为试验材料进行了染色体数目和核型的研究。染色体制片采用气干法,依据Levan等和Stebbins的标准进行染色体分类。结果表明:蒙古裸腹溞M.mongolica的核型公式为2N=6M+18T,NF=30,1A;多刺裸腹溞M.macrocopa,2N=10M+12T,NF=... 以5种裸腹溞Moina为试验材料进行了染色体数目和核型的研究。染色体制片采用气干法,依据Levan等和Stebbins的标准进行染色体分类。结果表明:蒙古裸腹溞M.mongolica的核型公式为2N=6M+18T,NF=30,1A;多刺裸腹溞M.macrocopa,2N=10M+12T,NF=32,1A;直额裸腹溞M.rectirostris,2N=12M+12T,NF=36,1B;微型裸腹溞M.micrura,2N=10M+14T,NF=34,1A;近亲裸腹溞M.affinis,2N=12M+14T,NF=38,1B。在此基础上进一步探讨了5种裸腹溞的亲缘进化关系,认为5种裸腹溞按进化地位的高低顺序依次为直额裸腹溞>近亲裸腹溞>多刺裸腹溞>微型裸腹溞>蒙古裸腹溞。 展开更多
关键词 裸腹溞 染色体 核型 亲缘进化关系
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Research on the Karyotype and Evolution of Drosophila melanogaster Species Group 被引量:1
3
作者 邓秋红 曾庆韬 +2 位作者 钱远槐 李春选 杨勇 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第3期196-213,共18页
Mitotic metaphase chromosomes of 34 species of Drosophila melanogaster species group were examined. Certain new karyotypes were described for the first time, and their evolutionary and interspecific genetic relationsh... Mitotic metaphase chromosomes of 34 species of Drosophila melanogaster species group were examined. Certain new karyotypes were described for the first time, and their evolutionary and interspecific genetic relationships among 8 subgroups of D. melanogaster species group were analyzed systematically. The results were as follows. The basic karyotype of elegans subgroup was type A. The karyotypes of eugracilis subgroup, melanogaster subgroup, and ficusphila subgroup were all type C. The karyotypes of takahashii subgroup and suzukii subgroup were both type C and type D. The montium subgroup had six kinds of karyotypes types B, C, C', D, D', and E. The ananassae subgroup had three kinds of karyotypes: types F, G, and H. Thus, the melanogaster species group was classified into five pedigrees based on the diversity of these karyotypes: 1) elegans; 2) eugracilis-melanogasterficusphila; 3) takkahashii-suzukii; 4) montium; 5) ananassae. The above-mentioned results in karyotypic evolution were consistent with those of DNA sequence analysis reported by Yang except for the elegans subgroup and this subgroup was considered as the ancestral subgroup. Karyotype analysis of the same drosophila from different isofemale lines indicated that the same Drosophila from different places showed karyotypic variation which might be due to different geographical environment and evolutionary degree or interaction between the two factors. 展开更多
关键词 DROSOPHILA Drosophila melanogaster species group KARYOTYPE genetic relationships EVOLUTION
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植物三萜皂苷代谢中达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的生物信息学分析 被引量:1
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作者 赵志新 王星星 《江苏农业科学》 2019年第18期86-92,共7页
搜集4种植物的10条达玛烷合成酶及22种植物的30条β-香树脂合成酶,利用生物信息学工具对这2种三萜皂苷代谢关键酶的理化性质、蛋白特性及进化亲缘关系等进行分析。理化性质分析显示,这2种酶的氨基酸序列在氨基酸数目、组成、分子量、理... 搜集4种植物的10条达玛烷合成酶及22种植物的30条β-香树脂合成酶,利用生物信息学工具对这2种三萜皂苷代谢关键酶的理化性质、蛋白特性及进化亲缘关系等进行分析。理化性质分析显示,这2种酶的氨基酸序列在氨基酸数目、组成、分子量、理论pI和脂肪指数等方面均表现出较强的一致性;同时,这2种酶的糖基化位点具有高度的保守性,并且大豆(2)、绿玉树、木榄这3条β-香树脂合成酶序列有极大的可能性有糖基化位点;信号肽预测分析表明,这2种酶没有明确的信号肽;α-螺旋和无规则卷曲是多肽链中主要存在的二级结构元件;系统进化树显示序列间差异较小,并且聚类结果与序列的科属特性相一致。不同植物的达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶蛋白特性差别不大,进化距离也比较近,说明这2种酶具有较高的保守性和稳定性。这有助于理解达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的保守结构域及进化变异,为研究这2种酶的酶学特征及三萜皂苷代谢提供帮助。 展开更多
关键词 达玛烷合成酶 β-香树脂合成酶 生物信息学分析 三萜皂苷 理化性质 蛋白特性 进化亲缘关系 糖基化位点 保守结构域 酶学特征
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The New Discoveries of Specific Characteristics of Yulania Spach 被引量:2
5
作者 赵东欣 赵东武 孙军 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2008年第1期54-59,共6页
The research history and new discoveries of the specific characteristics of Yulania Spach were reported, as to the specific characteristics, such as the terminal , axillary and fascicled similar flower buds,sometimes ... The research history and new discoveries of the specific characteristics of Yulania Spach were reported, as to the specific characteristics, such as the terminal , axillary and fascicled similar flower buds,sometimes polycymes; 2-4 flower types of a plant; two spathe-like stipoles of single flower; drape or overlap of tepals, deep split or shallow split on the edge of tepals. The discoveries could provide valuable information for the further studies on the taxonomic system, anthotaxical evolution, phylogenetic relationship and breeding. 展开更多
关键词 Yulania Spach Specific characteristics New discoveries
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被子植物系统发育深层关系研究:进展与挑战 被引量:8
6
作者 曾丽萍 张宁 马红 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期21-39,共19页
被子植物系统发育学是研究被子植物及其各类群间亲缘关系与进化历史的学科。从20世纪90年代起,核苷酸和氨基酸序列等分子数据开始被广泛运用于被子植物系统发育研究,经过20多年的发展,从使用单个或联合少数几个细胞器基因,到近期应用整... 被子植物系统发育学是研究被子植物及其各类群间亲缘关系与进化历史的学科。从20世纪90年代起,核苷酸和氨基酸序列等分子数据开始被广泛运用于被子植物系统发育研究,经过20多年的发展,从使用单个或联合少数几个细胞器基因,到近期应用整个叶绿体基因组来重建被子植物的系统发育关系,目、科水平上的被子植物系统发育框架已被广泛接受。在这个框架中,基部类群、主要的5个分支(即真双子叶植物、单子叶植物、木兰类、金粟兰目和金鱼藻目)、每个分支所包含的目以及几个大分支包括的核心类群等都具有高度支持。与此同时,细胞器基因还存在一些固有的问题,例如单亲遗传、系统发育信息量有限等,因此近年来双亲遗传的核基因在被子植物系统发育研究中的重要性逐渐得到关注,并在不同分类阶元的研究中都取得了一定进展。但是,被子植物系统发育中仍然存在一些难以确定的关系,例如被子植物5个分支之间的关系、真双子叶植物内部某些类群的位置等。本文简述了20多年来被子植物系统发育深层关系的主要研究进展,讨论了被子植物系统发育学常用的细胞器基因和核基因的选用,已经确定和尚未确定系统发育位置的主要类群,以及研究中尚存在的问题和可能的解决方法。 展开更多
关键词 亲缘进化关系 分子系统发育 细胞器基因 核基因 系统发育基因组学
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陕西省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇病毒A组4型的基因特征 被引量:15
7
作者 王东艳 徐艺 +7 位作者 张勇 祝双利 司源 严冬梅 朱晖 杨倩 冀天娇 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期145-149,共5页
阐明从陕西省2006~2010年急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例中分离的柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)VP1编码区的基因特征,探索其在我国流行的优势基因型及其与AFP病例之间的关系。本研究通过逆转录-聚... 阐明从陕西省2006~2010年急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例中分离的柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)VP1编码区的基因特征,探索其在我国流行的优势基因型及其与AFP病例之间的关系。本研究通过逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)对连续5年从AFP病例中分离的68株非脊灰肠道病毒(non-polio enteroviruses,NPEVs)进行分子定型,其中7株鉴定为CV-A4(7/68,10.3%);使用特异性引物扩增CV-A4VP1编码区并进行核苷酸序列测定分析和基因进化分析,将CV-A4划分为A(基因组1)、B(基因组2)和C三个基因型,其中C基因型又划分为C1(基因组3)和C2(基因组4)两个基因亚型。中国分离的CV-A4均位于第4基因组,属于C2基因亚型,提示其可能为中国大陆CV-A4的优势基因亚型;7株陕西CV-A4毒株依据分离年代的不同位于不同的三个小进化分支里,且和来自山东和吉林两省的邻近年份的CV-A4毒株位于同一小分支,提示7株陕西CV-A4分离株和它们存在共同进化和共循环。在无脊髓灰质炎时代应进一步加强监测CV-A4在AFP病例NPEV所占的比例和动态变化。 展开更多
关键词 急性弛缓性麻痹病例 柯萨奇病毒A组4型 亲缘关系进化 优势基因型
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2019—2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒基因特征分析 被引量:3
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作者 任丽萍 邵玉平 +7 位作者 王艳 孙静 杨晓丽 刘杨 赵玲 韩一楠 于艳 方兴 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期41-44,共4页
目的对2019—2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)的基因特征进行分析。方法选取2019—2020年辽宁省丹东、大连、盘锦市急性期甲型肝炎患者的血清或粪便标本(共162份),采用巢式PCR法进行HAV VP1/2A序列扩增,阳性... 目的对2019—2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)的基因特征进行分析。方法选取2019—2020年辽宁省丹东、大连、盘锦市急性期甲型肝炎患者的血清或粪便标本(共162份),采用巢式PCR法进行HAV VP1/2A序列扩增,阳性样本进行基因测序,选取28个代表序列,同时从GenBank中下载全球HAV不同型别的基因序列,通过Neighbor-Joining方法构建亲缘关系进化树,分析基因序列同源性。结果2019—2020年辽宁省沿海城市的162份甲型肝炎患者血清及粪便标本中,PCR阳性127份,均为ⅠA型;构建的亲缘关系进化树可分为2个进化分支,即分支1和分支2,与日本、韩国流行HAV的核苷酸同源性分别达98.8%~100%和98.4%~100%。结论2019—2020年辽宁省沿海城市HAV基因型均为ⅠA型,与日本、韩国流行的HAV属同一分支。本研究为辽宁省甲型肝炎的防控提供了实验依据。 展开更多
关键词 甲型肝炎病毒 基因型 巢式PCR法 亲缘关系进化
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Morphology, flight performance, and water crossing tendencies of Afro-Palearctic raptors during migration 被引量:5
9
作者 Nicolantonio AGOSTINI Michele PANUCCIO Cristian PASQUARETTA 《Current Zoology》 SCIE CAS CSCD 2015年第6期951-958,共8页
Raptors primarily use soaring-gliding flight which exploits thermals and ridge lifts over land to reduce energetic costs However during migration, these birds often have to cross water surfaces where thermal currents ... Raptors primarily use soaring-gliding flight which exploits thermals and ridge lifts over land to reduce energetic costs However during migration, these birds often have to cross water surfaces where thermal currents are weak; during these times, birds mainly use flapping (powered) flight which increases energy consumption and mortality risk. As a result, some species have evolved strategies to reduce the amount of time spent over water by taking extensive detours over land. In this paper, we con- ducted a meta-analysis of water-crossing tendencies in Afro-Palearctic migrating raptors in relation to their morphology, their flight performance, and their phylogenetic relationships. In particular, we considered the aspect ratio (calculated as the wing span squared divided by wing area), the energetic cost of powered flight, and the maximum water crossing length regularly performed by adult birds. Our results suggest that energy consumption during powered flight predominately affects the ability of raptors to fly over water surfaces 展开更多
关键词 Water crossing Aspect ratio Powered flight MIGRATION RAPTORS Wing tip
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