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利用进化比较的方法确定β珠蛋白基因簇调控的顺式元件
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作者 郑毅 丁达夫 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第1期75-81,共7页
利用进化比较的方法对人、兔子和灵长类Galago的β珠蛋白基因以及所在的β珠蛋白基因簇进行分析,确定了可能的基因调控的顺式元件,并与一些实验结果进行比较,发现利用进行比较的方法确定基因调控的顺式元件是一种简单可行的方法。
关键词 进化比较 基因调控 顺式元件 β珠蛋白基因簇
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基于进化角度比较方法的高维多目标进化算法
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作者 刘中锋 李浩君 《现代计算机》 2020年第3期44-50,68,共8页
多目标进化算法对于高维多目标优化问题(MaOPs)关注较多,对大规模决策变量的相关研究较少。为了更好求解大规模MaOPs问题,提出基于进化角度比较方法的高维多目标进化算法(EACLMEA)。EACLMEA算法采用进化角度比较方法,将决策变量分为两类... 多目标进化算法对于高维多目标优化问题(MaOPs)关注较多,对大规模决策变量的相关研究较少。为了更好求解大规模MaOPs问题,提出基于进化角度比较方法的高维多目标进化算法(EACLMEA)。EACLMEA算法采用进化角度比较方法,将决策变量分为两类,即收敛性相关变量和多样性相关变量,分别采用收敛性优化策略和多样性优化策略对这两种决策变量进行优化。实验结果表明,在求解大规模MaOPs问题方面,相比目前最新的几种进化算法,EA⁃CLMEA算法具有更好的性能。 展开更多
关键词 大规模 高维多目标 进化算法 进化角度比较方法
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小黄鱼(Larimichthys polyactis)线粒体基因组结构与特征 被引量:9
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作者 柳淑芳 吴仁协 +1 位作者 朱玲 庄志猛 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期885-894,共10页
采用长片段扩增策略,获得鲈形目石首鱼科黄鱼属小黄鱼的线粒体基因组全序列。组装分析结果表明,其长度为16470bp,H链碱基组成呈明显反G偏倚,G含量仅为16%。13个蛋白质基因起始密码子均为ATG。COI基因的终止密码子为AGA,ND1和ND3基因为TA... 采用长片段扩增策略,获得鲈形目石首鱼科黄鱼属小黄鱼的线粒体基因组全序列。组装分析结果表明,其长度为16470bp,H链碱基组成呈明显反G偏倚,G含量仅为16%。13个蛋白质基因起始密码子均为ATG。COI基因的终止密码子为AGA,ND1和ND3基因为TAG,COII、ND4和Cytb基因为不完全终止密码子T,其余7个基因都是完整的TAA。在小黄鱼mtDNA中发现2个特殊发夹结构,一个是轻链复制起始区(OL)的发夹环,位于tRNA簇,环区T含量仅为9%,而G含量达45%,这与哺乳动物和爪蟾该区域富含T有所不同。另一个假定发夹结构位于ATP6基因末端,这种二级结构可能与准确转录有关。该mtDNA控制区长度为799bp,5′端含有9个连续TA串联重复和2个5′-ATGTA---TACAT-3′重复,与已报道的鱼类扩展终止相关序列模式恰恰相反;中央控制区仅识别出CSB-E结构;保守序列区含有CSB-1,2,3,其中CSB-2具有高度保守性。对小黄鱼和大黄鱼的mtDNA比较进化研究,根据分子钟假说,估计二者线粒体基因组的进化分歧时间为4.8百万年前。 展开更多
关键词 小黄鱼 线粒体基因组 比较进化
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The evolution of multi-component visual signals in darters (genus Etheostoma) 被引量:1
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作者 Jennifer M. GUMM Tamra C. MENDELSON 《Current Zoology》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第2期125-139,共15页
As complex traits evolve, each component of the trait may be under different selection pressures and could respond independently to distinct evolutionary forces. We used comparative methods to examine patterns of evol... As complex traits evolve, each component of the trait may be under different selection pressures and could respond independently to distinct evolutionary forces. We used comparative methods to examine patterns of evolution in multiple components of a complex courtship signal in darters, specifically addressing the question of how nuptial coloration evolves across different areas of the body. Using spectral reflectance, we defined 4 broad color classes present on the body and fins of 17 species of freshwater fishes (genus Etheostoma) and quantified differences in hue within each color class. Ancestral state reconstruction suggests that most color traits were expressed in the most recent common ancestor of sampled species and that differences among species are mostly due to losses in coloration. The evolutionary lability of coloration varied across body regions; we found sig- nificant phylogenetic signal for orange color on the body but not for most colors on fins. Finally, patterns of color evolution and hue Of the colors were correlated among the two dorsal fins and between the anterior dorsal and anal fins, but not between any of the fins and the body. The observed patterns support the hypothesis that different components of complex signals may be subject to distinct evolutionary pressures, and suggests that the combination of behavioral displays and morphology in communication may have a strong influence on patterns of signal evolution . 展开更多
关键词 Comparative method ETHEOSTOMA Independent evolution Nuptial coloration
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