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遗传算法模拟生物多序列比对之初始化的改进
被引量:
1
1
作者
李满枝
王凯华
+1 位作者
王洪涛
修兴强
《辽宁工程技术大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017年第6期662-667,共6页
针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加入一定比例的在线比对工...
针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加入一定比例的在线比对工具MAFFT优质种子,优化初始种群的整体质量.通过数值模拟实例结果显示,经过这两个优化处理可以生成更高质量的初始种群,得到更好的比对结果,提高多序列比对的计算效率.
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关键词
多序列比对
遗传算法
初始化
连续空位
MAFFT种子
下载PDF
职称材料
题名
遗传算法模拟生物多序列比对之初始化的改进
被引量:
1
1
作者
李满枝
王凯华
王洪涛
修兴强
机构
海南师范大学数学与统计学院
出处
《辽宁工程技术大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017年第6期662-667,共6页
基金
海南省自然科学基金(20151003)
国家自然科学基金(71361008)
海南省重点项目(ZDXM20130080)
文摘
针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加入一定比例的在线比对工具MAFFT优质种子,优化初始种群的整体质量.通过数值模拟实例结果显示,经过这两个优化处理可以生成更高质量的初始种群,得到更好的比对结果,提高多序列比对的计算效率.
关键词
多序列比对
遗传算法
初始化
连续空位
MAFFT种子
Keywords
multiple sequence alignment
genetic algorithm
initialization
continuous gaps
MAFFT seed
分类号
O242.1 [理学—计算数学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
遗传算法模拟生物多序列比对之初始化的改进
李满枝
王凯华
王洪涛
修兴强
《辽宁工程技术大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017
1
下载PDF
职称材料
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