荷兰一次结核病大暴发期间DNA指纹在发现国际传染源病例中的使用

背景:结核病在一个低患病国家中的暴发流行。目的:描述一个国际传染源追踪过程,在此过程中限定性片段长度多态性分析(RFLP)起到了一个必不可少的作用。设计:1993年报告一名患结核性脑膜炎的儿童因传染源不能确定,在荷兰北部的港口城镇Harlin-gen开始了一项大规模的传染源追踪行动。传统的接触者追踪以检出感染源。RFLP用于绘制结核病传播图和鉴定传染源病例。结果:此项调查由荷兰北部扩展至其西部的几个地方。在筛查的6519人中;有276例受到感染者,其中确定了49例活动性结核。来自所有28例培养阳性患者的结核菌分离株的RFLP分析显示Harlingen型DNA指纹。传染源追踪5个月后鉴定出传染源病例是在英国。直到1996年总共发现37例患者(荷兰28例、英国7例、苏里南1例、摩洛哥1例)具有Harlingen型DNA特征的分离株。除非更明确的评估,方可以确定37例患者中5例与传染源病例或Harlingen的暴发流行无关。结论:证实RFLP分型在指导国际传染源追踪和接触者调查中是一个很有用的工具。

脉冲场凝胶电泳技术及其在细菌感染性疾病中的应用

为研究细菌的流行特征、追踪传染源，国内外广泛采用的方法是对相关菌株进行分型，分析菌株间的同源性关系。细菌分型方法分为表型分型和基因分型两种，表型分型主要有根据菌落形态和生化特征等的生物分型、抗菌药物药敏谱分型、血清分型、噬菌体分型，基因分型包括质粒分型、核糖体分型、染色体DNA限制性内切核酸酶图谱分析（REA）、限制片段长度多态性分析（RFLP）、脉冲场凝胶电泳分型（pulsedfield gel electrophoresis，PFGE）、随机引物PCR（AP-PCR）、重复片段PCR分型、多位点序列分型（MLST）等，其中PFGE是分子分型技术的“金标准”，其结果重复性好，分辨率高，易于标准化，被国内外研究者广泛接受。本文就PFGE技术及其在细菌感染性疾病中的应用进行综述。

福建省莆田市2007年登革热暴发的流行病学调查分析

目的调查分析2007年福建省莆田市登革热暴发的流行病学特征、影响因素,并对病原体的可能来源进行追踪。方法利用流行病学调查和疫情报告数据以及病毒分离株的序列信息,分析、阐明暴发的流行学特点及影响因素;从感染者体内分离病毒并进行病毒序列测定,分析本次暴发可能的病毒来源。结果本次暴发为登革II型病毒引起的登革热暴发流行。共报告确诊病例103例,波及5个乡镇,发病主要集中在9月8日-10月8日,多数病例发生在1-2个村(街道),发病具有时间和空间的聚集性特征,病例临床表现均为典型登革热特征,无临床严重或死亡病例。从病毒分离株的序列分析表明,导致暴发的病毒来源可能为东南亚。外界病毒传入、高白纹伊蚊密度和临床漏诊可能是导致该起登革热暴发流行的主要原因。结论本次暴发流行为一起由输入性病例引起,在当地扩散造成的登革II型病毒暴发,病毒的来源可能是东南亚一带。