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Cε3-Cε4蛋白寡核苷酸适配子结合位点的预测与筛选
被引量:
1
1
作者
刘中成
刘世芳
+5 位作者
张苏
杨艳蕾
李飞
张楠
袁欣
张艳芬
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期83-89,共7页
采用NPDock程序对Cε3-Cε4蛋白与其核酸适配子A1的结合位点进行了预测与筛选,筛选出A1与Cε3-Cε4蛋白结合的关键位点.同时,根据蛋白与DNA片段复合物结合界面中氨基酸残基和碱基统计分析发现,结合界面氨基酸富集碱基G能力最强,富集碱基...
采用NPDock程序对Cε3-Cε4蛋白与其核酸适配子A1的结合位点进行了预测与筛选,筛选出A1与Cε3-Cε4蛋白结合的关键位点.同时,根据蛋白与DNA片段复合物结合界面中氨基酸残基和碱基统计分析发现,结合界面氨基酸富集碱基G能力最强,富集碱基T和C能力次之.本文建立了以NPDock程序虚拟对接为基础的高效适配子优化方法,为相关研究提供了实验参考.
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关键词
Cε3-Cε4蛋白
NPDock程序
分子对接
适配子筛选
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职称材料
题名
Cε3-Cε4蛋白寡核苷酸适配子结合位点的预测与筛选
被引量:
1
1
作者
刘中成
刘世芳
张苏
杨艳蕾
李飞
张楠
袁欣
张艳芬
机构
河北大学药学院
河北省药物质量分析控制实验室
河北大学科学技术处
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期83-89,共7页
基金
国家自然科学基金(批准号:81202338)
河北省自然科学基金(批准号:H2016201121)
+2 种基金
河北省高等学校科学技术研究项目(批准号:ZD2017010)
国家级大学生创新创业训练计划项目(批准号:201610075007
201710075016)资助~~
文摘
采用NPDock程序对Cε3-Cε4蛋白与其核酸适配子A1的结合位点进行了预测与筛选,筛选出A1与Cε3-Cε4蛋白结合的关键位点.同时,根据蛋白与DNA片段复合物结合界面中氨基酸残基和碱基统计分析发现,结合界面氨基酸富集碱基G能力最强,富集碱基T和C能力次之.本文建立了以NPDock程序虚拟对接为基础的高效适配子优化方法,为相关研究提供了实验参考.
关键词
Cε3-Cε4蛋白
NPDock程序
分子对接
适配子筛选
Keywords
Cε3-Cε4 protein
Nucleic acid-protein dock program
Molecular docking
Aptamers screening
分类号
O621 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Cε3-Cε4蛋白寡核苷酸适配子结合位点的预测与筛选
刘中成
刘世芳
张苏
杨艳蕾
李飞
张楠
袁欣
张艳芬
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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