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一类逆组合问题的并行优化
1
作者
杨琪
李昭
祝明发
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期104-106,共3页
生物信息学作为生物学和计算机科学的交叉学科,以生物数据为处理的内容,辅以计算机处理手段,获得对生命完整系统的认识。文章通过对一个具体应用程序的并行优化,得到一个在理论上可以获得n2/lgn加速比的方法,n为拼接片段的数量。...
生物信息学作为生物学和计算机科学的交叉学科,以生物数据为处理的内容,辅以计算机处理手段,获得对生命完整系统的认识。文章通过对一个具体应用程序的并行优化,得到一个在理论上可以获得n2/lgn加速比的方法,n为拼接片段的数量。实际情况中,由于试验数据及实际的系统问题,达不到如此高的加速比,但是在一定程度上降低了时间复杂度。
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关键词
逆组合问题
并行优化
生物信息学
序列重组
问题
计算机
下载PDF
职称材料
题名
一类逆组合问题的并行优化
1
作者
杨琪
李昭
祝明发
机构
中国科学院计算技术研究所
测序
SSP问题
贪心法
重叠
拼接
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期104-106,共3页
文摘
生物信息学作为生物学和计算机科学的交叉学科,以生物数据为处理的内容,辅以计算机处理手段,获得对生命完整系统的认识。文章通过对一个具体应用程序的并行优化,得到一个在理论上可以获得n2/lgn加速比的方法,n为拼接片段的数量。实际情况中,由于试验数据及实际的系统问题,达不到如此高的加速比,但是在一定程度上降低了时间复杂度。
关键词
逆组合问题
并行优化
生物信息学
序列重组
问题
计算机
Keywords
Bioinformatics;Sequencing;SSP;Greedy algorithm;Overlap;Assembly
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
O224 [理学—运筹学与控制论]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一类逆组合问题的并行优化
杨琪
李昭
祝明发
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2003
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