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基于基因次序的基因组间距离的计算
1
作者
王慧蕴
《科学技术与工程》
2008年第2期522-524,533,共4页
给出了计算两个具有相同内容、不同次序的基因组之间距离的算法。给定一组内容相同、次序不同的基因组,构造一个完全图,寻找一个基因组使得它与给定的各个基因组之间距离的累加和达到最小,这个问题可以转化为TSP问题。利用最小生成树方...
给出了计算两个具有相同内容、不同次序的基因组之间距离的算法。给定一组内容相同、次序不同的基因组,构造一个完全图,寻找一个基因组使得它与给定的各个基因组之间距离的累加和达到最小,这个问题可以转化为TSP问题。利用最小生成树方法找到一个中心基因组,接下来构造断点图,最后利用断点图来计算集合中的每一个基因组和中心基因组之间的距离。
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关键词
基因组重组
逆转距离
断点图
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职称材料
题名
基于基因次序的基因组间距离的计算
1
作者
王慧蕴
机构
西安电子科技大学计算机学院
出处
《科学技术与工程》
2008年第2期522-524,533,共4页
基金
国家自然科学基金(NO.60574039)资助
文摘
给出了计算两个具有相同内容、不同次序的基因组之间距离的算法。给定一组内容相同、次序不同的基因组,构造一个完全图,寻找一个基因组使得它与给定的各个基因组之间距离的累加和达到最小,这个问题可以转化为TSP问题。利用最小生成树方法找到一个中心基因组,接下来构造断点图,最后利用断点图来计算集合中的每一个基因组和中心基因组之间的距离。
关键词
基因组重组
逆转距离
断点图
Keywords
genome rearrangement
reversal distance
breakpoint graph
分类号
TP3-05 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于基因次序的基因组间距离的计算
王慧蕴
《科学技术与工程》
2008
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