目的构建一种基于常规超声和超声造影特征的列线图预测模型,可在术前鉴别诊断高级别或低级别的肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)。方法回顾性分析2019年1月至2021年7月于中国人民解放军总医院第一医学中心收治的258...目的构建一种基于常规超声和超声造影特征的列线图预测模型,可在术前鉴别诊断高级别或低级别的肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)。方法回顾性分析2019年1月至2021年7月于中国人民解放军总医院第一医学中心收治的258例ccRCC患者的临床资料。采用随机数种子的方法将患者分为训练集(n=180)和验证集(n=78),并依据世界卫生组织(World Health Organization,WHO)/国际泌尿病理学会(International Society of Urological Pathology,ISUP)分级标准对肿瘤切片进行分析,将WHO/ISUPⅠ~Ⅱ级归为低核分级(低级别组),WHO/ISUPⅢ~Ⅳ级归为高核分级(高级别组),评估入组患者的常规超声和超声造影特征。预测模型构建利用单因素Logistic回归分析筛选有统计学意义的变量纳入多因素Logistic回归,采用似然比检验筛选ccRCC核分级为高分级的独立预测因子并构建风险概率列线图,分析曲线评估模型性能。结果训练集与验证集患者年龄、性别、位置比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。训练集中单因素Logistic回归分析表明,年龄、肿瘤最大径、回声强度、边界、形态、肿瘤是否凸向集合系统、有无高增强环、增强均匀性、实质期增强程度在低级别组与高级别组患者差异均有统计学意义(均P<0.05)。多因素Logistic回归分析表明,年龄、增强不均匀和无高增强环均为肿瘤细胞核分级为高级别的独立危险因素(均P<0.05)。通过似然比检验,以年龄、肿瘤最大径、高增强环、增强均匀性为预测因素构建的列线图模型在预测ccRCC核分级中性能较高,在训练集中的准确率、敏感度、特异度、曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.87、0.86、0.88、0.91,在验证集中准确率、敏感度、特异度、AUC分别为0.78、0.76、0.85、0.88。校准曲线显示,列线图预测模型在训练集和验证集中拟合良好。决策曲线分析表明,阈值概率为0.07~0.77时,列线图预测模型可获得较好的净收益。一致性分析表明,常规超声和超声造影特征在观察者间Kappa值范围为0.63~0.80,一致性良好。结论年龄、肿瘤最大径、增强不均匀、无高增强环为ccRCC细胞核分级为高级别的危险因素,基于常规超声和超声造影特征的列线图预测模型可在术前有效区分高级别或低级别ccRCC,为临床决策制订提供依据。展开更多
目的:探讨G蛋白信号蛋白家族的调节因子17(regulator of G protein signaling 17,RGS17)在肾透明细胞癌患者中的临床意义和功能机制。方法:获得癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肾透明细胞癌(kidney renal clear c...目的:探讨G蛋白信号蛋白家族的调节因子17(regulator of G protein signaling 17,RGS17)在肾透明细胞癌患者中的临床意义和功能机制。方法:获得癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)的RNAseq数据和相应的临床信息。利用R软件研究RGS17在KIRC中的表达差异及其与临床特征的关系。使用免疫组化及PCR进行验证。采用Kaplan-Meier(K-M)分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、单因素COX分析、多因素COX分析来评估患者的生存和预后,并构建nomogram模型。使用STRING进行RGS17相关基因的PPI网络构建,并进行GO及KEGG富集分析。并采用RT-qPCR、Western blot、CCK-8、Transwell和划痕实验等方法检测RGS17对ACHN细胞增殖迁移及cAMP信号通路的影响。结果:RGS17在KIRC中高表达,且RGS17的高表达与更高的T分期、临床分期、肿瘤转移显著相关。K-M生存分析显示,RGS17上调与KIRC患者总生存期、无疾病进展生存期下降密切相关。ROC曲线表明RGS17能较好的区分正常和KIRC患者,并在预测KIRC患者的预后方面具有一定的准确性。RGS17是KIRC独立预后因素。使用RGS17表达、临床分期、病理分级构建nomogram预后模型能较好预测1、3、5年生存率。RGS17敲低显著抑制ACHN细胞的增殖、迁移和侵袭能力。另外,RGS17敲低能够抑制cAMP信号通路的激活。结论:RGS17在肾透明细胞癌中具有促癌基因的作用,其可能通过激活cAMP信号通路促进肾透明细胞癌的进展。展开更多
目的:建立基于自噬和铁死亡相关基因的预后模型,并基于肾透明细胞癌(ccrCC)的自噬基因(autophagy related genes,ARGs)和铁死亡基因(ferroptosis related genes,FRGs)模型评估预后。方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的ccRCC数据...目的:建立基于自噬和铁死亡相关基因的预后模型,并基于肾透明细胞癌(ccrCC)的自噬基因(autophagy related genes,ARGs)和铁死亡基因(ferroptosis related genes,FRGs)模型评估预后。方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的ccRCC数据集识别与风险相关的ARGs和FRGs,进行功能富集和肿瘤分型分析,通过单变量和多变量Cox回归建立537例患者的预后风险模型。多指标ROC用于评估模型的准确性。最后使用GSE29609数据集验证。结果:共发现37个差异表达的基因。单变量和多变量Cox回归确定了8个与OS相关的风险相关基因:CASP4、PRKCQ、BNIP3、BAG1、BIRC5、CHAC1、ATG16L2、EIF4EBP1。Kaplan-Meier生存分析显示,高危组患者生存率较低,多指标ROC曲线下面积>0.75,说明模型预测准确率较高。然后基于CIBERSORT算法进行免疫细胞浸润评估。结论:基于8个ARGs和FRGs的肾透明细胞癌相关基因预后模型具有一定的准确性,可更准确地指导临床治疗。展开更多
文摘目的构建一种基于常规超声和超声造影特征的列线图预测模型,可在术前鉴别诊断高级别或低级别的肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)。方法回顾性分析2019年1月至2021年7月于中国人民解放军总医院第一医学中心收治的258例ccRCC患者的临床资料。采用随机数种子的方法将患者分为训练集(n=180)和验证集(n=78),并依据世界卫生组织(World Health Organization,WHO)/国际泌尿病理学会(International Society of Urological Pathology,ISUP)分级标准对肿瘤切片进行分析,将WHO/ISUPⅠ~Ⅱ级归为低核分级(低级别组),WHO/ISUPⅢ~Ⅳ级归为高核分级(高级别组),评估入组患者的常规超声和超声造影特征。预测模型构建利用单因素Logistic回归分析筛选有统计学意义的变量纳入多因素Logistic回归,采用似然比检验筛选ccRCC核分级为高分级的独立预测因子并构建风险概率列线图,分析曲线评估模型性能。结果训练集与验证集患者年龄、性别、位置比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。训练集中单因素Logistic回归分析表明,年龄、肿瘤最大径、回声强度、边界、形态、肿瘤是否凸向集合系统、有无高增强环、增强均匀性、实质期增强程度在低级别组与高级别组患者差异均有统计学意义(均P<0.05)。多因素Logistic回归分析表明,年龄、增强不均匀和无高增强环均为肿瘤细胞核分级为高级别的独立危险因素(均P<0.05)。通过似然比检验,以年龄、肿瘤最大径、高增强环、增强均匀性为预测因素构建的列线图模型在预测ccRCC核分级中性能较高,在训练集中的准确率、敏感度、特异度、曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.87、0.86、0.88、0.91,在验证集中准确率、敏感度、特异度、AUC分别为0.78、0.76、0.85、0.88。校准曲线显示,列线图预测模型在训练集和验证集中拟合良好。决策曲线分析表明,阈值概率为0.07~0.77时,列线图预测模型可获得较好的净收益。一致性分析表明,常规超声和超声造影特征在观察者间Kappa值范围为0.63~0.80,一致性良好。结论年龄、肿瘤最大径、增强不均匀、无高增强环为ccRCC细胞核分级为高级别的危险因素,基于常规超声和超声造影特征的列线图预测模型可在术前有效区分高级别或低级别ccRCC,为临床决策制订提供依据。
文摘目的:探讨G蛋白信号蛋白家族的调节因子17(regulator of G protein signaling 17,RGS17)在肾透明细胞癌患者中的临床意义和功能机制。方法:获得癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)的RNAseq数据和相应的临床信息。利用R软件研究RGS17在KIRC中的表达差异及其与临床特征的关系。使用免疫组化及PCR进行验证。采用Kaplan-Meier(K-M)分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、单因素COX分析、多因素COX分析来评估患者的生存和预后,并构建nomogram模型。使用STRING进行RGS17相关基因的PPI网络构建,并进行GO及KEGG富集分析。并采用RT-qPCR、Western blot、CCK-8、Transwell和划痕实验等方法检测RGS17对ACHN细胞增殖迁移及cAMP信号通路的影响。结果:RGS17在KIRC中高表达,且RGS17的高表达与更高的T分期、临床分期、肿瘤转移显著相关。K-M生存分析显示,RGS17上调与KIRC患者总生存期、无疾病进展生存期下降密切相关。ROC曲线表明RGS17能较好的区分正常和KIRC患者,并在预测KIRC患者的预后方面具有一定的准确性。RGS17是KIRC独立预后因素。使用RGS17表达、临床分期、病理分级构建nomogram预后模型能较好预测1、3、5年生存率。RGS17敲低显著抑制ACHN细胞的增殖、迁移和侵袭能力。另外,RGS17敲低能够抑制cAMP信号通路的激活。结论:RGS17在肾透明细胞癌中具有促癌基因的作用,其可能通过激活cAMP信号通路促进肾透明细胞癌的进展。
文摘目的:建立基于自噬和铁死亡相关基因的预后模型,并基于肾透明细胞癌(ccrCC)的自噬基因(autophagy related genes,ARGs)和铁死亡基因(ferroptosis related genes,FRGs)模型评估预后。方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的ccRCC数据集识别与风险相关的ARGs和FRGs,进行功能富集和肿瘤分型分析,通过单变量和多变量Cox回归建立537例患者的预后风险模型。多指标ROC用于评估模型的准确性。最后使用GSE29609数据集验证。结果:共发现37个差异表达的基因。单变量和多变量Cox回归确定了8个与OS相关的风险相关基因:CASP4、PRKCQ、BNIP3、BAG1、BIRC5、CHAC1、ATG16L2、EIF4EBP1。Kaplan-Meier生存分析显示,高危组患者生存率较低,多指标ROC曲线下面积>0.75,说明模型预测准确率较高。然后基于CIBERSORT算法进行免疫细胞浸润评估。结论:基于8个ARGs和FRGs的肾透明细胞癌相关基因预后模型具有一定的准确性,可更准确地指导临床治疗。
