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逍遥散治疗抑郁症代谢网络的模块划分与生物学机制研究
被引量:
3
1
作者
高耀
穆俊芳
+4 位作者
令狐婷
周玉枝
高晓霞
田俊生
秦雪梅
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期528-537,共10页
逍遥散的抗抑郁作用已经明确,应用代谢网络的功能模块划分方法,从功能模块角度探究逍遥散治疗抑郁症的生物学机制具有重要意义和价值。通过数据库收集逍遥散调节差异代谢物、差异代谢物相关的酶以及与抑郁症相关的蛋白,对逍遥散调节差...
逍遥散的抗抑郁作用已经明确,应用代谢网络的功能模块划分方法,从功能模块角度探究逍遥散治疗抑郁症的生物学机制具有重要意义和价值。通过数据库收集逍遥散调节差异代谢物、差异代谢物相关的酶以及与抑郁症相关的蛋白,对逍遥散调节差异代谢物进行通路富集分析和交互分析,利用STRING工具构建差异代谢物相关的酶与抑郁症的蛋白网络,应用CNM分解算法提取网络蛋白功能模块并进行功能模块富集分析。结果发现,逍遥散调节差异代谢物97个、差异代谢物相关酶234个、抑郁症相关蛋白258个。通路交互分析划分为2个子网络,其中一个为神经系统和细胞信号转导相关通路,另一个为内分泌系统和代谢途径相关通路。对蛋白网络以及使用CNM算法从中提取的9个蛋白功能模块进行KEGG通路富集分析,结果发现模块1和模块3属于可用较少的蛋白富集到较多的通路,这些通路对应的功能包括内分泌系统、氨基酸代谢、神经系统和信号转导等。本研究采用通路交互分析和代谢网络模块划分策略阐释逍遥散治疗抑郁症的生物学机制,为从代谢调控角度深入研究中药复方药理作用机制提供思路参考和方法借鉴。
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关键词
逍遥散
抑郁症
通路交互分析
功能模块
核心蛋白
原文传递
题名
逍遥散治疗抑郁症代谢网络的模块划分与生物学机制研究
被引量:
3
1
作者
高耀
穆俊芳
令狐婷
周玉枝
高晓霞
田俊生
秦雪梅
机构
山西大学中医药现代研究中心
地产中药功效物质研究与利用山西省重点实验室
山西大学计算机与信息技术学院
出处
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期528-537,共10页
基金
国家“重大新药创制”科技重大专项(2017ZX09301047)
国家自然科学基金资助项目(82074147)
+4 种基金
山西省科技重点研发计划(201903D321210)
山西省重点实验室项目(201605D111004)
山西省科技创新重点团队项目(201605D131045-18)
山西省应用基础研究项目(201801D121291)
山西省“1331工程”协同创新中心建设计划经费资助。
文摘
逍遥散的抗抑郁作用已经明确,应用代谢网络的功能模块划分方法,从功能模块角度探究逍遥散治疗抑郁症的生物学机制具有重要意义和价值。通过数据库收集逍遥散调节差异代谢物、差异代谢物相关的酶以及与抑郁症相关的蛋白,对逍遥散调节差异代谢物进行通路富集分析和交互分析,利用STRING工具构建差异代谢物相关的酶与抑郁症的蛋白网络,应用CNM分解算法提取网络蛋白功能模块并进行功能模块富集分析。结果发现,逍遥散调节差异代谢物97个、差异代谢物相关酶234个、抑郁症相关蛋白258个。通路交互分析划分为2个子网络,其中一个为神经系统和细胞信号转导相关通路,另一个为内分泌系统和代谢途径相关通路。对蛋白网络以及使用CNM算法从中提取的9个蛋白功能模块进行KEGG通路富集分析,结果发现模块1和模块3属于可用较少的蛋白富集到较多的通路,这些通路对应的功能包括内分泌系统、氨基酸代谢、神经系统和信号转导等。本研究采用通路交互分析和代谢网络模块划分策略阐释逍遥散治疗抑郁症的生物学机制,为从代谢调控角度深入研究中药复方药理作用机制提供思路参考和方法借鉴。
关键词
逍遥散
抑郁症
通路交互分析
功能模块
核心蛋白
Keywords
Xiaoyaosan
depression
pathway crosstalk analysis
functional module
core protein
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
逍遥散治疗抑郁症代谢网络的模块划分与生物学机制研究
高耀
穆俊芳
令狐婷
周玉枝
高晓霞
田俊生
秦雪梅
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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