内蒙古典型草原羊草种群遗传分化的RAPD分析

运用 RAPD技术对内蒙古典型草原不同生境 8个羊草种群进行分析。采用 2 4个随机引物 (10 nt)在 8个种群中共检测到2 2 4个扩增片断 ,其中多态性片断 173个 ,总的多态位点百分率达 77.2 % ,特异性片断 2 2个 ,占 9.82 % ,平均每个引物扩增的DNA带数为 9.3 3条。利用 Nei指数和 Shannon指数估算了 8个种群的遗传多样性 ,并计算种群相似系数和遗传距离 ,运用UPGMA法进行聚类分析。结果表明 :羊草大部分的遗传变异存在于种群内 ,只有少部分的遗传变异存在于种群间 ,Nei指数和Shannon指数计算结果分别为 85.4%和 66.8% ;羊草不同种群的遗传多样性存在差异 ;8个羊草种群平均遗传距离为 0 .2 3 16,变异范围为 0 .1587～ 0 .2 70 0 ,说明 8个羊草种群间的遗传变异不大 ,即 :在较小地理范围内羊草的遗传分化程度较小 ;8个种群可聚为 3个类群 ,聚类结果显示生境相似的种群能够聚在一起 ,而地理距离最近的种群不一定归为一类 ,说明小范围内羊草种群间的遗传分化与地理距离不存在相关性 ,而与其生境间的相似度相关。影响遗传相似性的不是单一因子而是各种因子的综合作用 。

广东高州普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)的遗传多样性和居群遗传分化研究

利用 30对SSR引物对广东高州普通野生稻 3个群体进行了遗传多样性分析和居群遗传分化研究。结果表明 ,30对引物中只有 2 0对表现出多态 ,多态位点比率P为 6 6 7% ;在 2 0个多态位点中共检测出 81个等位变异 ,平均等位变异数(Ap)为 4 0 5个 ;3个群体总的遗传多样性 (Ht)为 0 6 1,其中 ,居群内的遗传多样性为居群间的遗传多样性的 3倍多 ,说明总的遗传多样性主要来自居群内 ;虽然居群间的遗传分化系数 (GST)较低 ,仅为 0 2 4 2 7,但当遗传相似系数临界值增加时 ,3个群体在聚类图上相对独立 ,说明 3个群体既存在着高度的遗传相似性 ,又具有一定程度的遗传分化 ,可以作为 3个居群进行原生境保护。

利用结构基因座分析小尾寒羊、滩羊群体遗传分化水平

采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测60只小尾寒羊、73只滩羊编码血液蛋白17个结构基因座上的变异,引用国内外14个绵羊群体相同资料进行比较分析,探讨其遗传分化水平。研究表明:(1)小尾寒羊、滩羊结构基因座平均杂合度分别为0.2360和0.2587;平均多态信息含量分别为0.1974、0.2102;平均有效等位基因数分别为1.5723和1.5751。(2)4个组合(分别为4个、6个、13个及16个绵羊群体)的基因分化系数分别为0.049323、0.059987、0.1728和0.201256,说明湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊4个绵羊群体结构基因座的基因分化程度低;这4种绵羊与蒙古国绵羊的基因分化程度次之;蒙古羊系绵羊和南亚羊及欧洲羊之间基因传分化程度较高。(3)前人关于小尾寒羊、滩羊由蒙古羊分化而来的考证得到遗传学实验的进一步证明,湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊受蒙古羊血统的影响递减。群体间亲缘关系远近与其所处地理位置远近并未表现出紧密相关。

导入野血牦牛群体的遗传变异和基因分化

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法和火焰光度法对家牦牛和３个含野血牦牛群体ＴＦ，ＨＢ，Ｈｐ，ＫＥ，ＡＭＹ１和ＲＢＣＬＤＨ１６个基因座多态性的研究表明：家牦牛与３个含野血牦牛群体具有同样的多态性特征，但群体的遗传变异随野牦牛血比例的增多而减少。含野血牦牛群体之间的亲缘关系大于家牦牛，再大于野牦牛，但总群体所发生的基因分化程度很小（２７４８％）。

南亚热带森林片断化对厚壳桂种群遗传结构的影响

森林片断化是造成全球生物多样性丧失的主要原因,但从种群遗传学角度开展的研究还远远不够。因此,本文采用ISSR(inter-simplesequencerepeat)方法对广东省鼎湖山、黑石顶、大雾岭、古田、萝岗和饶平6个地点的南亚热带片断化森林中的厚壳桂(Cryptocaryachinensis)种群的遗传多样性进行了研究。每个种群分成体、小树和幼苗3个年龄级采样,共采集厚壳桂样品448个。7个ISSR引物共扩增出209条多态性带。研究结果表明,6个厚壳桂种群的总遗传多样性为0.1529,种群平均遗传多样性为0.0537。和保护较好的厚壳桂种群相比,萝岗和饶平的两个村边林种群的遗传多样性较低。6个厚壳桂种群间的遗传分化系数(GST)为0.6489。AMOVA分析结果表明,总的遗传变异中,67.97%(P<0.0002)的遗传变异存在于种群间,2.06%(P<0.01)的遗传变异存在于不同年龄级之间,29.96%(P<0.0002)的遗传变异存在于种群内。基于遗传距离的UPGMA分析结果表明,6个厚壳桂种群大致分成两支:一支包括大雾岭和黑石顶2个种群,另一支包括其他4个种群。鼎湖山、古田、大雾岭和黑石顶不同年龄级均各自聚合在一起。可以看出,森林的破碎化导致了南亚热带厚壳桂种群遗传多样性降低,种群间基因流受阻,提示我们对于同一地区的易危物种,这种威胁将很大,急需开展相关的保护研究。

蒙古栎天然群体遗传多样性的AFLP分析

以黑龙江省小兴安岭嘉荫、内蒙古大青沟和河北省雾灵山的 3个蒙古栎群体及北京东灵山辽东栎群体为供试材料 ,用筛选出的 4对荧光引物 ,对 4个群体共计 96个个体进行AFLP分析 ,每对AFLP引物扩增出 6 3～ 1 1 3条 ,共得到 346条多态带 ;群体特异带及群体间共有带的差异与分布揭示了群体间的遗传差异及相似性 ;蒙古栎遗传多样性主要存在于群体内 ,群体间的遗传分化系数Gst为 0 0 77。蒙古栎在种级水平的遗传多样性参数略高于群体水平 ,多态带百分率P分别为 96 8%、6 7 2 % ,有效等位基因数Ae分别为 1 2 2 0、1 2 0 8,Nei基因多样性指数H分别为 0 1 4 5、0 1 34,Shannon多样性指数I分别为 0 2 4 6、0 2 0 8。东灵山辽东栎群体的P为 6 7 6 % ,Shannon多样性指数I为 0 2 2 0 ,Nei基因多样性指数H为 0 1 34。UPGMA聚类分析结果表明 ,蒙古栎自然群体间的遗传距离有随地理距离跨度增加而递增的趋势。蒙古栎遗传多样性偏低可能与其在历史上长期用作经济树种、人为干预和环境破坏较为严重。

应用RAPD分析小豆种质资源遗传多样性及遗传演化趋势

用RAPD标记方法对来自中国、日本、韩国、不丹、尼泊尔、越南6国163份小豆种质资源DNA的遗传多样性进行检测。从27个引物共检测到285条带,有261条具多态性(占92.98%),其中野生型多态性带谱占85.82%,栽培型次之为83.52%,半野生型为80.46%,三类型小豆都有其自身特征带;遗传离散度大小顺序是:野生型>半野生型>栽培型,其遗传分化系数大小顺序为:野生型<半野生型<栽培型;从分化系数差异看,半野生型小豆更接近野生型小豆;从相似系数平均值来看,半野生型小豆材料之间亲缘关系较近,而处在进化两极的野生型材料之间、栽培型材料之间亲缘关系都较远;来自我国西南以及日本南部两地区的小豆材料遗传离散度较大,遗传分化系数、相似系数平均值较低。聚类分析结果表明,163个小豆材料以遗传相似系数0.32为截值,可分为8大类,归类有较明显的地理相关性及遗传类型的趋同性。

毛红椿天然群体遗传多样性及取样策略探讨

[目的]研究毛红椿天然群体遗传多样性取样策略,为其种质资源收集、保存和遗传多样性保护等提供参考依据。[方法]利用8对微卫星分子标记进行毛红椿天然群体遗传多样性和空间自相关分析,综合制定其天然群体合理取样策略。[结果]毛红椿天然群体等位基因数平均为7.5个,期望杂合度(H_e)和多态性信息指数(PIC)均值分别为0.643 7和0.636 0,基因分化系数(G_(ST))均值为0.290 7。在遗传多样性取样策略方面,提出了根据毛红椿群体基因分化系数来确定取样群体遗传变异所占总变异比例的运算公式为1-(G_(ST))^(n-1),其中,n为取样群体的数量。当取样群体达到4个时,基本上能包括该树种97.5%的遗传变异;同时确定了目标群体的选择方法,应选择与其它群体间基因分化系数均值较大的4个群体,即贵州册亨(CH)、浙江遂昌(SC)、浙江仙居(XJ)和云南师宗(SZ)。通过构建云南宾川(BC)、云南师宗(SZ)和江西宜丰(YF)群体内取样单株数量与基因多样性和等位基因之间的捕获曲线,确定了群体内取样单株数量应达到15个以上;毛红椿天然群体内300～520 m范围内的单株间存在相似关系,超出此范围个体间差别较大,说明在进行群体内单株取样时,单株间距应大于520 m。[结论]取样群体数量、群体间遗传分化系数、群体内单株数量以及单株间距离等影响了毛红椿取样群体的遗传多样性。毛红椿天然群体遗传多样性取样策略为取样群体4个、每个群体最少取样15个单株,单株间距大于520 m。

广西武宣濠江流域普通野生稻居群遗传多样性及保护研究

选用平均分布于水稻基因组的2 4对SSR引物,对沿河分布最长的广西武宣濠江流域的12个普通野生稻居群343份材料的遗传结构进行研究。结果表明:(1)该地普通野生稻遗传多样性丰富。2 4个位点共检测到2 0 6个等位变异,平均等位变异数A =8 70 83,有效等位变异数Ae =3 7117;(2 )该地普通野生稻居群具有较高的遗传分化和一定频率的基因流。群体遗传分化系数Gst=0 2 6 5 9,基因流Nm =0 6 90 1,表明2 6 5 9%的遗传变异存在于居群间;(3)SSR标记使普通野生稻居群中一些稀有等位变异得以显现。2 0 6个等位变异中,6 5个等位变异仅出现在1个或2个居群中,且频率较低,其中12个等位变异只出现在居群B中;(4)通过聚类分析和主坐标分析(PCO) ,下游居群A和B遗传关系较近,中游居群C比较独特,单独成为一类,中游居群D、E、F和G遗传关系较近,中游居群H、I和J及上游居群K和L遗传关系较近。根据上述分析结果,建议对濠江下游和中游具有代表性的居群(即居群B、D和H)的普通野生稻进行重点保护。

一个皱纹盘鲍人工群体内个体大小遗传变异的RAPD分析

从以日本野生皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai Ino)为亲本进行群体繁殖所得人工群体的子1代中分别选择大(BI)、中(ME)、小(SM)等3个子群体各20个个体,进行RAPD分析。用11条随机引物及7个双引物组合共扩增出153条DNA片段,其中总群体多态性片段数为110条,多态性片段的比例为72.37％。根据扩增片段的共享度用TFPGA软件进行计算,结果表明:(1)SM与ME的遗传距离较近,而与BI的遗传距离相差较大;(2)子群体间遗传分化系数为7.64％,表明各个子群体间在遗传上存在一定的差异,对子群体进行选择将有一定的意义;(3)各子群体表现出了丰富的遗传变异,子群体BI、ME、SM的遗传多样性分别为 0.2063、0.2358和 0.2363,表明 BI子群体具有相对较高的纯合度,在选择育种中有较高价值。

利用微卫星标记对蒙古马和纯血马遗传多样性的研究

通过13个微卫星座位对蒙古马和纯血马两大品种的60匹马进行了遗传检测。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,并用银染法显色。通过软件计算了各微卫星座位的等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、多态信息含量(PIC)和杂合度(H)。结果13个座位中UCDEQ440变异最大,TKY16变异最小;纯血马的Ne、PIC和H的平均值均稍高于蒙古马;总群体的平均遗传分化系数是0 0429。这些研究将为今后我国培育优良品种马提供思路。

濒危植物资源冷杉遗传多样性研究

资源冷杉(Abies ziyuanensis)属松科(Pinaceae)冷杉属(Abies),是国家一级保护的濒危植物。利用RAPD分子标记对分布于广西资源县银竹老山和湖南省炎陵县大院的2个资源冷杉种群共54株进行了遗传多样性分析。用20个随机引物共扩增到126个位点,其中66个位点是多态性的,总的多态位点百分率为52.4％,在两个种群分别为33.6％和31。2％。Nei's基因多样性为0.312,Shannon信息指数为0.475,两个种群的遗传分化系数Gst为0.455。基于Nei's遗传距离进行了UPGMA聚类分析,结果两种群的样品彼此明显区分开来。分析结果表明资源冷杉种群内的遗传多样性较低,但两种群间的遗传分化明显。需要同时重视两分布地的资源冷杉的保护工作。

滇牡丹遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR标记对中国西南地区特有植物滇牡丹 (Paeoniadelavayi)的遗传多样性进行了研究。从 100个引物中筛选出 10个用于正式扩增,在取自 16个自然居群和 1个迁地保护居群的 511个个体中,检测到 92个多态位点。在居群水平上,多态位点百分率(PPB)为 44. 61%,Nei′s基因多样性指数 (H)和Shannon信息指数 (I)分别为0. 1657和 0. 2448。在物种水平上,多态位点百分率 (PPB)为 79. 31%,Nei′s基因多样性指数 (H)和Shannon信息指数(I)分别为 0. 2947和 0. 4355。居群间的遗传分化系数 (GST)达 0. 4349。结果表明:滇牡丹遗传多样性水平较高,居群间遗传分化较大。结合以前的研究结果,对滇牡丹的现状进行评估的结果显示,滇牡丹并不濒危。

两个黄河鲤鱼群体遗传多样性的微卫星标记分析

为了给河南黄河鲤鱼的遗传资源提供较为准确的基础数据，对其种质资源进行保护和利用，研究利用微卫星标记技术，以河南黄河鲤鱼的人工养殖群体和野生群体为试验对象，对黄河鲤鱼进行遗传多样性分析。结果表明：两个黄河鲤鱼群体在6个微卫星位点上均检测出16个等位基因。人工养殖和野生鲤鱼群体平均有效等位基因数（Ne）分别为2．350和2．085。对人工养殖群体、野生群体和将两个群体混合进行计算分析后，各群体的无偏观测杂合度（Ho）分别为0．614，0．576和0．601，无偏期望杂合度（He）分别为0．569，0．535和0．559；多态信息含量（PIC）的平均值分别为0．474，0．428和0．468，6个位点的PIC为0．304—0．864。对两个不同鲤鱼群体的6个微卫星位点的遗传分化分析结果显示，除了微卫星位点HLJ483上的遗传分化系数（Fst）大于0．05外，其余位点的Fst均小于0．05，符合种群间无遗传分化的标准（Fst=0—0．05），6个位点Fst的平均值为0．02，各个位点基因流（Nm）均大于1，其平均值为12．202。说明本研究采用的两个黄河鲤鱼群体的遗传多样性较为丰富，其遗传种质资源目前尚处于安全状态。

白皮松交配系统及其种内遗传多样性分量比的研究

应用同工酶淀粉凝胶技术分析了白皮松天然群体的交配系统,结果表明白皮松天然群体的多位点异交率为0 451～0 522,在松属中处于较低水平,这与白皮松天然群体较低的杂合度和很弱的基因流结果吻合,进一步讨论了导致白皮松异交率低的原因。白皮松群体内家系间存在明显的遗传分化,其半同胞家系分化系数为0 322,高于群体间的遗传分化水平。群体/家系/子代个体三者间的遗传多样性分量比为DAP∶DAF∶DIF≈1∶2∶4。

马尾松种子园无性系遗传结构的地理变异

运用RAPD技术,对湖北京山马尾松无性系种子园123株优树针叶的DNA进行测定,将样品按纬度、经度、空间实际距离及省份进行聚类分析,计算基因流、基因分化系数、遗传距离及遗传相似度等参数,分析该种子园的遗传结构地理变异及遗传多样性。结果表明:不同角度的聚类对马尾松无性系种子园遗传结构和遗传多样性的分析结果有较大的影响。按纬度、经度、空间实际距离及省份进行聚类的基因流(Nm)分别为2.8796、5.2186、2.4371、1.5282;基因分化系数(Gst)依次为0.1479、0.0874、0.1702、0.2465;遗传距离平均值分别为0.0607、0.0280、0.0595、0.1330。群体之间的聚类分析(UPGMA法)表明,各群体之间亲缘关系的远近与纬度的相关性明显,与地理距离的相关性较明显,而与经度的相关性不明显。传统的以行政区划即按省份采集优树建立马尾松无性系种子园的方法是可取的,其基因流动性小,基因分化系数、遗传距离平均值大,种子园遗传多样性丰富。

鱼腥草种质资源群体表型遗传多样性研究

本试验通过观测湖南怀化市不同地域鱼腥草居群，以揭示其变异规律和检测种质资源的遗传多样性状况，为其保护和利用提供依据。以湖南省怀化市的16份鱼腥草种质资源为材料，观测了其群体表型性状特征，并分析了这些表型性状的变异系数、遗传参数和遗传多样性。结果表明，鱼腥草种质资源的不同表型质量性状的频率不同，以绿色地上茎、白色地下茎和心形叶最具代表性。居群间各表型数量性状以地上茎的分枝数和鲜质量、地下茎的节间数、4-甲基-1-异丙基-3-环己烯-1-醇和2，4-甲基-3-环己烯基异丙醇变异较大，根的直径变异最小；而居群内以地上茎分枝数的变异系数最大（39．8％），甲基正壬酮含量最低（13．4％）。居群内各表型数量性状多样性指数为0．182．0．710，而居群间为0．213—0．804；不同地域类群间表型多样性指数存在一定差异，黄岩地区最高（1．024），鸡公界地区最低（0．574）。群体间的平均表型变异约占总变异的1／2而群体内的约占1／3，说明群体间变异是表型变异的主要来源；群体间表型分化最大的是地上茎的分枝数（77．04％），最小的是根的直径（51．88％）。在5％的选择强度下数量性状的绝对遗传进度都较小（RGS％〈40％）但遗传力均较大（h^2〉50％）。当遗传距离分别为2．0和1．5时，材料被聚为2类和3类，而且聚类首先是按地上部分的茎色，其次是按叶型，再次是以海拔高度，最后是以地域而划分的。群体表型变异丰富而且具有遗传分化程度较高。

4种天麻变型的表型性状遗传多样性研究

以4种天麻变型为研究材料,对其11个表型性状进行遗传多样性分析,结果表明:4种不同天麻变型的表型性状在变型间与变型内均具有广泛的变异,11个性状在变型间有10性状的F值达显著或极显著水平;变型内只有块茎宽和块茎形状指数达极显著水平;11个性状的平均表型性状分化系数为78.83%,多样性贡献变型间变异(65.86%)大于变型内变异(34.14%);11个表型性状的总多样性指数为3.76,变型间的多样性指数为2.67,变型内的多样性指数为1.09,变型间遗传多样性占总遗传多样性的比例达78.8%,变型内所占比例仅为21.2%;说明不同天麻变型的群体间变异是天麻表型性状的主要变异来源。研究结果为天麻遗传多样性的保护及资源利用提供科学依据。

香榧天然群体表型性状遗传多样性分析

以香榧主要分布区6个天然群体的92个样株为试验材料,对其针叶、果实、种子的8个表型性状进行分析,讨论群体间和群体内的表型多样性。结果表明:香榧各表型性状在群体间和群体内都存在显著差异,群体间表型分化系数占10.8%,群体内占89.2%,群体间的变异小于群体内。各群体表型性状中平均变异系数最小的为果实宽(CVv=13.95%),最大的为单粒重(CVv=34.71%);不同群体各形态性状平均变异系数由大到小顺序为:黄山>磐安>嵊州>钟家岭>诸暨东白湖、绍兴。通过表型性状的聚类分析可以将香榧6个群体划分为3个类群。