RAPD技术在几个苋属植物遗传分类中的应用研究

利用 RAPD技术结合聚类分析 ,研究了亚洲和中南美洲产的苋属植物 7种 1 4个品系遗传关系。从 80个 1 0碱基长度的随机引物中筛选出 8个有效引物 ,共扩增出 1 0 3个 DNA片段 ,平均每个引物扩增 1 2 .9个片段 ,其中多态性片段 95个 ,占 92 .2 %。依据 8个有效引物扩增的 DNA片段对供试材料进行了 UPGMA(非加权成组算术平均法 )聚类分析 ,结果分为4类 :1包括 A.deflexus和 A.dubius各 1品系的杂草苋种 ;2祖先野生种 A.hybridus1个品系 ;3包括 A.hypochondriacus6品系、A.caudatus2品系的籽粒苋种 ;4包括 A.tricolor2品系和 A.

一种基于粗集理论的遗传分类算法

本文提出了一种基于粗集理论的遗传分类算法,该算法可以无需任何辅助信息,只根据数据自身提供的信息对数据进行简化,提取有用的特征,并求得相应的规则。同时,还提出了一种基于属性重要度的分辨矩阵简化方法,该方法可提高对条件属性的约简效率。

西藏白菜型油菜Brassica rapa的遗传分类研究

根据不同地理来源和个体水平研究结果 ,筛选出 1 0 7个西藏地方白菜型油菜品种进行RAPD分析。结果表明 :西藏白菜型油菜具有丰富的遗传多样性。根据PCR扩增结果 ,计算遗传距离 ,对 1 0 7份白菜型油菜品种进行聚类分析。建立UPGMA系统树 ,并结合形态观察结果 ,对白菜型油菜进行了遗传分类研究 ,将其分为三大类 ,1 1小类 。

基于多值属性和数值属性数据的遗传分类算法

1 引言 传统的遗传分类算法[1]只能够从字符属性(枚举类型,取值有限)中发现分类规则.当属性取值很多时,所得到的规则数目也急剧增加,数据的规律性不能够很好地被认识到.虽然有许多算法可以合并规则,减少规则的数目,但是这种合并是在规则已经得到的情况下进行的,后面的实验可以表明,若合并在搜索过程进行,遗传算法的效率可以得到有效的提高.传统遗传分类算法的另外一个不足是它不能够处理数值属性(连续取值,取值无限).而现实的问题是数据开采面对的数据一般既包含字符属性又包含数值属性(这种数据在本文称之为混合数据),这时传统的遗传分类算法往往无能为力.这些数值属性,如医疗数据中的年龄(AGE)字段,即使在待开采数据集中它的取值是有限的,我们也不能把它与字符属性等同看待,因为它表示含义是连续的.

根据结直肠癌部位作遗传分类的证据

癌症的分子遗传学研究进展提示散发性结直肠癌与遗传性结直肠癌一样有遗传因素参与,所以对识别和研究癌易感性增加家族的意义日益明显。现已证实伴或不伴结肠息肉病的两种遗传性结直肠癌,均为常染色体显性遗传,但结肠病变及肠外临床特征不同。结直肠癌临床分类的临床标志之一是原发肿瘤在结肠内的部位。结肠腺瘤性息肉性癌肿主要发生在结肠脾曲的远侧肠段,而遗传性非息肉性结肠癌大都发生在脾曲近侧。以下从不同侧面论述结直肠癌的遗传现象。正常结肠和结直肠癌个体发生和肿瘤胚胎抗原大肠的近、远段胚胎起源不同。盲肠至横结肠近侧2/3起源于胚胎的中肠,而横结肠远侧1/3至肛管上部则起源于后肠。

遗传分类器在水下目标识别中的应用

结合实例详细介绍了用于水下目标识别的遗传分类器,并通过验证取得了良好效果.

基于改进非劣分类遗传算法的多目标药物制备工艺优化分析

目的研究改进非劣分类遗传算法(nondominated sorting genetic algorithmⅡ,NSGA-Ⅱ)对葛根素亚微乳制备工艺的优化效果,并与多目标遗传算法(multiple objective genetic algorithm,MOGA)以及原文采用的效应面法的优化效果进行比较。方法利用制备葛根素亚微乳中心试验的数据,采用改进非劣分类遗传算法寻找平均粒径和跨距均最小、而包封率最大的工艺条件。结果采用NSGA-Ⅱ随机搜索30次,得到平均粒径为(220.173±18.153)nm;跨距的平均水平为(0.623±0.137)μm;包封率的平均水平为(83.873±2.176)%,与MOGA搜索结果的平均水平相比,NSGA-Ⅱ搜索精度更高,变异度更小。当乳化时间、搅拌转速、超声时间分别为12.97min、1613r·min-1、31.15min时,对应的目标值平均粒径、跨距、包封率分别为229.70nm、0.54μm、85.92%,优化效果满意,比MOGA及原文采用的效应面法找到的最优方案更理想。结论在确保多个目标值都达到最优的前提下,NSGA-Ⅱ搜索得到的Pareto非劣解是合理的,达到了较满意的效果,为试验设计最优条件的选择提供了合理的方法。同时研究人员可根据实际情况,从Pareto非劣解集中确定可行、合理且最优的工艺优化方案。

球坐标变换、主成分二次推断函数及改进非劣分类遗传算法在不含“0”缓释剂混料组分配比优化的效果研究

目的针对不含“0”混料组分配比中重复测量数据及不同时点累计释放度的多目标优化,研究基于球坐标变换的主成分二次推断函数和改进非劣分类遗传算法优化混料处方配比的效果。方法对尼莫地平缓释片不含“0”混料的处方配比的试验数据进行处理,使用球坐标变换方法去除定和约束,主成分二次推断函数建立模型解决组分的共线性及重复测量数据的相关性,根据药典对各时点累积释放度的要求,采用改进非劣分类遗传算法进行多目标优化,寻找最优的配比方案。结果当HPMC、乳糖、海藻酸钠的比例分别为26.49%、64.64%、8.87%时,3h、6h、9h、12h的累积释放度分别为21.21%、50.66%、77.60%、99.60%,均在处方筛选范围。比通过建立Scheffé多项式模型寻找到5个最优方案更好。结论针对不含“0”混料组分缓释制剂重复测量数据处方配比的多目标优化,采用球坐标变换的主成分二次推断函数和改进非劣分类遗传算法优化混料处方配比的效果满意,且研究者可在Pareto非劣解集中选择可行、合理的混料成分配比方案。

基于遗传算法地震短期综合预报分类系统在天山地震带的应用

应用"基于遗传算法的地震预报分类系统"建立天山地震带8个区的地震短期综合预报模型。在前人研究基础上对此分类系统的应用方法做了以下改进:以半年或一年样本窗内的地震活动资料预报未来3个月最大地震;采用阈值划分异常,区分高值和低值异常两类参数,再用异常持续时间进行地震环境信息编码;在研究区内,根据一年和半年样本窗和震级错半级的分档形式,形成4种地震环境信息编码方式。计算机自动运行此系统程序,寻找各自的预报模型。对预留样本的检验按震级区间进行规则对应率、虚报率和地震对应率、漏报率的效能评价,结果表明南天山各区检验情况好于北天山;对北天山预测出5级以上、南天山6级以上地震以及能给出有效重叠震级区间的模型加权后认为南天山中西段、柯坪块体区检验情况较好。结果还表明半年样本窗检验效能普遍高于一年窗,对较低震级的检验情况一般要好于较高震级。

隧道围岩分级的遗传-支持向量分类耦合模型

针对现阶段围岩分级方法存在的主要问题,提出隧道围岩分级的遗传-支持向量分类方法。结合佛岭隧道施工期围岩分级实践,以公路隧道设计规范BQ分级为基准,分别采用岩石回弹强度和掌子面状态替代饱和单轴抗压强度和地应力状态,并增加节理延展性观察的定性指标,在大量现场测试和室内试验的基础上,给出每个分级指标的现场快速测试方法,并以分级结果作为遗传-支持向量分类算法的训练样本,建立隧道围岩分级的遗传-支持向量分类智能模型。佛岭隧道围岩分级实例表明:该模型分级结果与现场勘测基本一致,且较遗传-神经网络模型有更高的分级准确性,为隧道围岩分级提供一种方法。

基于非劣分类遗传算法的多目标药物提取条件优化分析应用

目的研究非劣分类遗传算法在均匀试验设计多目标优化中的应用。方法对微萃取五味子的均匀试验数据建立以浸膏得率、五味子醇甲、五味子总木脂素含量的子目标模型,采用遗传算法分别对其单目标优化,NSGA对其进行多目标优化,搜索最优提取条件,比较搜索结果;利用课题组编写的Matlab2009a外挂SGALAB工具箱beta5008完成遗传算法寻优。结果单目标遗传算法优化可以得到各个目标最大时的最优提取条件,NSGA进行三目标优化时,使各子目标尽可能获得最大的解,确定的最优提取条件的效果高于均匀试验中的任何一个方案。结论 NSGA搜索的Pareto非劣解是合理的,达到了较好的效果,为试验设计最优条件选择提供了合理的方法,可推广到正交试验设计、析因试验设计的最优条件选择。

基于遗传算法地震短期综合预报分类系统在祁连山及海原地震带的应用

应用“基于遗传算法的地震预报分类系统”,建立祁连山及海原地震带3个区的以预报未来3个月最大地震为目标的地震短期综合预报模型。结果表明,能预测出5级以上地震,给出的有效重叠震级区间的模型在祁连西段、祁连中东段检验情况较好,而在海原断裂带应用检验较差。另外对较低震级的检验情况一般要好于较高震级。对2003年10月25日甘肃民乐、山丹间6.1、5.8级地震进行了实际的应用检验。

改进非劣分类遗传算法在金莲花醇提取条件优化中的应用

目的研究改进非劣分类遗传算法(NSGA-Ⅱ)在正交试验设计的多目标药物提取条件优化中的应用。方法对金莲花总黄酮醇提取工艺研究的正交试验数据建立以浸膏得率、总黄酮含量为子目标的数学模型,采用遗传算法对其进行单目标优化,NSGA-Ⅱ对其进行多目标优化,搜索最优提取条件,比较搜索结果;利用课题组编写的Matlab2009a外挂SGALAB工具箱beta5008完成遗传算法寻优。结果单目标遗传算法优化分别得到各子目标最大时的最优提取条件,NSGA-Ⅱ进行两目标优化时,确定的最优提取条件的效果以及由此得到的浸膏得率和总黄酮含量高于正交试验中的任何一个方案。结论 NSGA-Ⅱ搜索的Pareto非劣解是合理的,达到了较好的效果,为正交试验设计最优条件选择提供了合理的方法,可推广到均匀试验设计和析因试验设计。

基于分类遗传算法的给水管径优化设计

应用分类遗传算法优化设计给水管网,该方法有以下改进:直接以整数对离散的标准管径进行编码;对约束条件进行处理无须采用了惩罚函数;而且因借助于强大的管网水力求解器epanet,能处理大规模优化问题.最后以一经典算例验证了该方法的良好特性.

改进非劣分类遗传算法多目标优化效果评价及程序测试

目的评价改进非劣分类遗传算法(NSGA-Ⅱ)进行多目标优化的效果,测试其程序的可靠性。方法应用两目标简单测试函数、两目标复杂测试函数、三目标复杂测试函数对NSGA-Ⅱ进行模拟测试,利用课题组成员英国Glasgow大学软件工程师陈益编写的Matlab 2009a外挂SGALAB工具箱beta5008完成遗传算法寻优。结果 NSGA-Ⅱ得到的两目标简单测试函数95%Pareto非劣解分布范围包含交叉点值1,前沿呈一条光滑的曲线分布;两目标复杂测试函数Pareto非劣解前沿在小于1的范围内呈下降的带状分布;三目标测试函数的Pareto非劣解前沿呈非线性、非对称的曲面分布。认为NSGA-Ⅱ可得到测试函数的Pareto非劣解集,供决策者合理选择。结论 NSGA-Ⅱ多目标优化可以给出合理的Pareto非劣解集,效果理想、程序可靠,可用于实际问题的分析。

改进非劣分类遗传算法对盐酸雷尼替丁脉冲片多目标区间优化策略及效果评价

目的研究区间均值代替区间目标后,再利用改进非劣分类遗传算法(NSGA-Ⅱ)对盐酸雷尼替丁进行多目标区间优化的策略及效果。方法利用二次多项式模型建立目标函数,采用区间均值代替区间目标,使用改进非劣分类遗传算法(NSGA-Ⅱ)对转换后的目标函数进行多目标优化,搜索Pareto非劣解,并与原文的结果进行比较。结果盐酸雷尼替丁脉冲片处方优化中,随机搜索的30个Pareto最优解中,23个达到了规定优化效果,其中3个效果满意。30号方案释药时滞及累积释放度分别达到了211.62分钟和91.11%,效果最为理想。结论区间均值代替区间目标后,再利用改进非劣分类遗传算法(NSGA-Ⅱ)进行多目标区间优化的策略可行、有效。

遗传标记在杨属植物遗传进化及分类研究中的应用

本文系统地综述了不同遗传标记在杨属植物遗传进化、分类系统、基因流、杂种鉴定及遗传多样性等方面的研究进展。同工酶的研究主要用于杨属植物遗传变异及无性系的特征和分化等方面的研究,DNA分子标记的研究很多,根据研究的目的选择RFLP、RAPD、AFLP、SSR(SSLP)和SNP等不同的方法进行分析,综合国内外的研究现状提出今后工作的展望。

基于需求分类遗传算法的Al/15% SiC_p复合材料电化学加工工艺参数的优化(英文)

电化学加工(ECM)是一种重要的非传统加工工艺,主要用于加工难加工材料和错综复杂的型材。作为一个复杂的过程,很难确定最优参数去改善切削性能。金属去除率和表面粗糙度是最重要的输出参数,决定切削性能。由于切削参数对金属去除率和表面粗糙度的影响不一致,从而没有简单的切削参数的最佳组合。用多元回归模型来表示输出与输入变量之间的关系,并用基于需求分类遗传算法(NSGA-II)的多目标优化方法来优化ECM过程,得到一个需求解集。

中国天津港海底吹填淤泥中嗜盐细菌的分离及遗传分析（英文）

[目的]天津港海底吹填淤泥含盐量较高,生活在其中的细菌进化出了独特的生理,代谢和形态特征。本研究的目的是分离耐受高盐环境的细菌并分析淤泥细菌的遗传进化。[方法]对海底吹填淤泥进行总DNA的提取,采用16S rDNA进行土壤细菌区系分析。在此基础上再结合牛肉膏蛋白胨培养基,在7种不同NaCl浓度条件下(0,0.5%,2%,5%,10%,15%和20%)分离海底淤泥嗜盐细菌,并对耐受不同盐分含量的优势种群进行鉴定和遗传分析。[结果] 1)随着盐度逐步增加,分离得到的细菌菌落总数减少。通过测序鉴定并分类,得到14种细菌菌株。其中,4种可以耐受0～2%的盐度,4种可以耐受0～5%的盐度,1种可以耐受0～15%的盐度,1种可以耐受0～20%的盐度范围。其余的4种菌株仅能够耐受很窄的盐度范围(例如5%～10%,10%～15%,10%～20%和15%～20%)。2)随着盐度的增加,可从海洋沉积物中分离出的细菌菌株数量减少。此外,海底淤泥细菌的香农威纳指数和物种丰富度指数从5%盐度开始显著下降。但物种均匀度指数没有显著差异。3)当盐度范围为0～10%时,海底淤泥中的优势细菌种为芽孢杆菌。当盐度为15%时,优势种为盐单胞菌。当盐度为20%时,这些物种的比例没有显著差异。[结论]我们的研究结果表明,一些细菌可以耐受高盐度的生活条件,甚至有一种能够耐受大范围盐度(0～20%)。在进一步研究中,分析这些细菌独特的用于适应高盐度环境的生理生化功能将是有价值的,可以为促进海底淤泥中细菌种群资源的开发和耐盐微生物对盐渍化土壤的改良提供理论依据。