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BALB/c突变卷毛小鼠基因组学测序差异的分析
1
作者
汤紫荣
李晓娟
+3 位作者
姜棋予
李兴杰
孙慧伟
李瑞生
《实验动物科学》
2023年第5期33-37,共5页
目的利用全基因组测序方法比较BALB/c突变卷毛鼠与正常BALB/c小鼠基因组之间的差异。方法采用Illumina PE 150测序平台对BALB/c突变卷毛鼠与正常BALB/c小鼠进行全基因组测序并对遗传变异信息(SNP、INDEL、SV和CNV)进行对比分析。结果正...
目的利用全基因组测序方法比较BALB/c突变卷毛鼠与正常BALB/c小鼠基因组之间的差异。方法采用Illumina PE 150测序平台对BALB/c突变卷毛鼠与正常BALB/c小鼠进行全基因组测序并对遗传变异信息(SNP、INDEL、SV和CNV)进行对比分析。结果正常小鼠与卷毛小鼠产生的Raw Data分别为122.85 Gb和118.04 Gb,过滤后的Clean Data分别为119.82 Gb和112.18 Gb,表明测序质量合格。正常小鼠与卷毛小鼠的GC含量分别为40.63%和40.48%,说明GC分布正常。卷毛小鼠的杂合分型SNPs总数显著高于正常小鼠,同时正常小鼠与卷毛小鼠之间的累计SNPs深度分布也存在显著的差异。卷毛小鼠与正常小鼠插入缺失(Indels)以及累计Indels深度分布均存在差异。卷毛小鼠与正常小鼠的SV类型中大片段的插入卷毛小鼠大于正常小鼠,而其他类型则小于正常小鼠。而拷贝数变异(CNVs)结果显示正常小鼠和卷毛小鼠的拷贝数增加的个数分别为1270和967个;而拷贝数减少的个数分别为5027和3505个。结论本研究发现正常小鼠与突变卷毛鼠的基因组存在一定的差异。
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关键词
卷毛鼠
全基因组测序
遗传变异信息
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职称材料
针刺经络穴位的物理化学-生物信号理论模式及作用机制研究
被引量:
8
2
作者
邹华彬
《世界中医药》
CAS
2022年第4期543-552,共10页
目的:经络系统既是一个生物信息系统,又是一个物理化学系统。探索建立经络产生及传输生物信息的数理模式。方法:基于生物遗传与变异信息理论方程结合物理化学原理,建立了经络生物信息传导方程及经络中表观渗透压计算方法。提出渗透压是...
目的:经络系统既是一个生物信息系统,又是一个物理化学系统。探索建立经络产生及传输生物信息的数理模式。方法:基于生物遗传与变异信息理论方程结合物理化学原理,建立了经络生物信息传导方程及经络中表观渗透压计算方法。提出渗透压是主要的经络信息传导动力及信息源。结果:基于新建立理论方法,可以确定细胞内外介质相似度Pg及二者之间的对称度k与生物信息传输效率之间的定量关系。理论分析表明,当细胞内外介质相似度Pg在0.002~0.01之间,k在0.001~0.01,经络具有最高生物信息传输效率。且经络内表观渗透压在0.4~5 MPa,这对生物组织具有安全性。结论:新理论方法得到的高效生物信息传输效率条件,可有效解释针灸学实验的许多结果及现象,为经络感传等现象的产生等重要内容提供了合理的科学机制。
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关键词
经络
穴位
循经感传
针灸
渗透压
遗传变异信息
信息
流
非线性斑图
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职称材料
题名
BALB/c突变卷毛小鼠基因组学测序差异的分析
1
作者
汤紫荣
李晓娟
姜棋予
李兴杰
孙慧伟
李瑞生
机构
中国人民解放军总医院第五医学中心住院与病案管理科
中国人民解放军总医院第五医学中心感染病医学部研究所
出处
《实验动物科学》
2023年第5期33-37,共5页
基金
军队实验动物专项基金面上项目(SYDW[2016]005,SYDW[2020]05)。
文摘
目的利用全基因组测序方法比较BALB/c突变卷毛鼠与正常BALB/c小鼠基因组之间的差异。方法采用Illumina PE 150测序平台对BALB/c突变卷毛鼠与正常BALB/c小鼠进行全基因组测序并对遗传变异信息(SNP、INDEL、SV和CNV)进行对比分析。结果正常小鼠与卷毛小鼠产生的Raw Data分别为122.85 Gb和118.04 Gb,过滤后的Clean Data分别为119.82 Gb和112.18 Gb,表明测序质量合格。正常小鼠与卷毛小鼠的GC含量分别为40.63%和40.48%,说明GC分布正常。卷毛小鼠的杂合分型SNPs总数显著高于正常小鼠,同时正常小鼠与卷毛小鼠之间的累计SNPs深度分布也存在显著的差异。卷毛小鼠与正常小鼠插入缺失(Indels)以及累计Indels深度分布均存在差异。卷毛小鼠与正常小鼠的SV类型中大片段的插入卷毛小鼠大于正常小鼠,而其他类型则小于正常小鼠。而拷贝数变异(CNVs)结果显示正常小鼠和卷毛小鼠的拷贝数增加的个数分别为1270和967个;而拷贝数减少的个数分别为5027和3505个。结论本研究发现正常小鼠与突变卷毛鼠的基因组存在一定的差异。
关键词
卷毛鼠
全基因组测序
遗传变异信息
Keywords
curly hair mice
whole genome sequencing
genetic variation information
分类号
Q95-3 [生物学—动物学]
下载PDF
职称材料
题名
针刺经络穴位的物理化学-生物信号理论模式及作用机制研究
被引量:
8
2
作者
邹华彬
机构
山东大学化学与化工学院
出处
《世界中医药》
CAS
2022年第4期543-552,共10页
基金
山东省中医药科技发展计划项目(2013-157)。
文摘
目的:经络系统既是一个生物信息系统,又是一个物理化学系统。探索建立经络产生及传输生物信息的数理模式。方法:基于生物遗传与变异信息理论方程结合物理化学原理,建立了经络生物信息传导方程及经络中表观渗透压计算方法。提出渗透压是主要的经络信息传导动力及信息源。结果:基于新建立理论方法,可以确定细胞内外介质相似度Pg及二者之间的对称度k与生物信息传输效率之间的定量关系。理论分析表明,当细胞内外介质相似度Pg在0.002~0.01之间,k在0.001~0.01,经络具有最高生物信息传输效率。且经络内表观渗透压在0.4~5 MPa,这对生物组织具有安全性。结论:新理论方法得到的高效生物信息传输效率条件,可有效解释针灸学实验的许多结果及现象,为经络感传等现象的产生等重要内容提供了合理的科学机制。
关键词
经络
穴位
循经感传
针灸
渗透压
遗传变异信息
信息
流
非线性斑图
Keywords
Meridians and collaterals
Acupoint
Sensitive meridian conduction
Acupuncture
Permeability pressure
Heredity and variation
Bio-information stream
Nonlinear pattern
分类号
R245 [医药卫生—针灸推拿学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
BALB/c突变卷毛小鼠基因组学测序差异的分析
汤紫荣
李晓娟
姜棋予
李兴杰
孙慧伟
李瑞生
《实验动物科学》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
针刺经络穴位的物理化学-生物信号理论模式及作用机制研究
邹华彬
《世界中医药》
CAS
2022
8
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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