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题名传染性支气管炎病毒S1和N基因遗传变异频率的分析
被引量:5
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作者
盛晓丹
徐怀英
刘霞
黄迪海
曲新泽
秦卓明
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机构
山东省农业科学院家禽研究所
山东省健牧生物药业有限公司
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出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期989-997,共9页
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基金
国家自然科学基金(31372332)
科技部农转资金(SQ2013ECC600059)
+1 种基金
山东省科技攻关重点支持项目(2009GG10009006)
济南市成果转化支持项目(2012CG92)
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文摘
旨在探讨中国北方地区传染性支气管炎病毒(IBV)的流行和分子变异,进而探讨IBV的遗传演变规律。利用生物信息学方法对IBV纤突蛋白(S1)和核蛋白(N)编码基因进行分析比较。结果显示:2012—2013年发生在山东、天津等北方地区的IBV流行株高度同源,其S1基因核苷酸(氨基酸)相似性为94.0%~100%(93.1%~100%),N基因为98.4%~99.1%(98.1%~99.8%),而与经典疫苗株H120相似性均较低,且至少在S1基因的3个高变区产生了较多的点突变、缺失和插入,且变异集中在第53—150和250—290位,以高变区HVR I居多,GM/13在62—65位缺失4个氨基酸。进一步的分析表明:IBV流行株S1基因与1998年在我国北方流行的A2株核苷酸相似性最高,为94.9%~97.2%,年核苷酸(nt)变异频率平均为2.4nt×10-3;而N基因则与LX4株相似性最高,为93.0%~93.5%,年变异频率平均为5.1nt×10-3。IBV流行株可能是A2-like和LX4-like毒株的重组,且N基因的变异频率明显高于S1基因。
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关键词
IBV
S1基因
N基因
遗传变异频率
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Keywords
infectious bronchitis virus
S1 gene
N gene
mutation frequency
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分类号
S852.65
[农业科学—基础兽医学]
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