牛环曲病毒云南流行株N基因序列分析

为深入了解云南省牛环曲病毒(bovine torovirus,BToV)的流行现状及遗传进化趋势,2021年3月—2023年6月采集云南省9市15个养牛场不同年龄段的655份牛粪便样品,进行BToV RT-PCR检测,并对其中具有代表性的6份样品进行N基因测序分析。结果显示:BToV阳性检出率为10.84%(71/655);扩增得到6条完整的N基因序列,其同源性在98.4%~100%,与国内外参考毒株相比发现,6个毒株N基因与我国四川、黑龙江毒株同源性高,亲缘关系较近,可能是由引种、调运或动物产品交易传播而来;发现2个毒株发生氨基酸突变,可能是由于云南独特的气候和不同的饲养条件造成的。结果表明:牛环曲病毒在云南存在范围较广,须密切注意监测、加强检疫,同时加快疫苗研发。