基于metaPRS与APOEε4优化轻度认知障碍遗传风险统计建模策略的应用研究

背景轻度认知障碍(MCI)是干预和延缓痴呆进展的重要阶段,既往研究发现MCI与遗传因素存在紧密关联,且载脂蛋白E(APOE)ε4是医学界公认的MCI重要风险等位基因。由于缺少MCI的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,当前普遍以阿尔茨海默病(AD)的GWAS汇总数据作为Base数据集来计算MCI的多基因风险评分(PRS),致使MCI的PRS遗传风险预测效果并不理想。目的本研究以多基因遗传风险综合评分(metaPRS)与APOEε4作为重要预测因子,从广义线性模型与机器学习角度,探索并优化MCI的遗传风险统计建模策略。方法计算MCI的12个亚表型PRS,并利用弹性网状Logistic回归模型将其整合为MCI的metaPRS。利用年龄矫正的APOEε4效应量计算APOEε4加权总和(SCORE_(APOE))。以metaPRS、SCORE_(APOE)及基本人口学信息(年龄、性别、受教育程度)构建不同的预测因子纳入策略,以XGBoost、GBM、Logistic回归及Lasso回归作为统计建模方法,采用AUC及F-measure评价MCI遗传风险统计建模的预测效果。结果metaPRS与SCORE_(APOE)对于MCI的遗传风险有较高的预测价值,纳入metaPRS、SCORE_(APOE)及基本人口学信息(年龄、性别、受教育程度)后,各个统计建模方法的预测效果为:XGBoost(AUC=0.69,F-measure=0.88),GBM(AUC=0.76,F-measure=0.87),Logistic回归(AUC=0.77,F-measure=0.89),Lasso回归(AUC=0.76,F-measure=0.92)。结论在样本量为325(<500)的情况下,以metaPRS、SCOR_(EAPOE)与基本人口学信息为预测因子,以Lasso回归为统计建模方法的MCI遗传风险预测效果最好。本研究为MCI等复杂疾病的遗传风险统计建模提供了新的思路与视角。

肿瘤专科护士主导的胃癌遗传风险评估和管理模式实践

目的:分析肿瘤专科护士主导的胃癌遗传风险评估和管理模式的应用效果。方法:由肿瘤专科护士主导,联合胃癌医疗专家,于2020年7月至2022年6月,为遗传性胃癌风险人群提供胃癌遗传风险人群初筛、胃癌遗传风险评估、基因检测指导、胃癌风险管理、长期随访等服务。结果:共筛查842人,纳入遗传性胃癌风险人群74人(8.79%),其中胃癌患者42人(4.99%),未罹患肿瘤的血缘亲属32人(3.80%)。15人(1.78%)行基因检测,其中3人(0.36%)存在肿瘤易感基因胚系突变。纳入者随访1个月时的胃癌风险知识试卷得分高于遗传风险评估阶段和风险管理阶段,差异有统计学意义(P<0.05);遗传风险评估阶段、风险管理阶段、随访1个月时的焦虑及抑郁评分均在正常范围内,差异无统计学意义(P>0.05)。未罹患肿瘤的血缘亲属随访6个月时的胃癌风险管理方案依从率高于随访1个月时,差异有统计学意义(P<0.05)。纳入者随访6个月时对胃癌遗传风险评估和管理工作综合满意度为98.64%。结论:肿瘤专科护士主导的胃癌遗传风险评估和管理模式有利于高风险人群胃癌风险知识水平、胃癌风险管理方案依从率的提升,且不会引发焦虑、抑郁等负性心理,值得在临床推广。

植物迁地保护中的遗传风险

稀有濒危植物迁地保护的长期目标之一就是要保护物种的遗传多样性和进化潜力。文章中介绍了稀有濒危植物在植物园迁地保护过程中存在的一系列遗传风险。由于引种或取样的不足,容易导致被保存的物种缺乏足够的遗传代表性;盲目的引种、不合理的定植以及材料的来源不清则会导致稀有濒危植物的遗传混杂、近交衰退或杂交衰退;人为选择和生长环境的改变也容易造成濒危物种对迁地保护的遗传适应。在实际的迁地保护工作中,这些遗传风险往往被忽视。植物迁地保护中遗传风险将严重影响稀有濒危物种的回归和恢复。植物园应当重视濒危植物的遗传管理,以降低或避免迁地保护中的遗传风险。

男性不育症ICSI治疗的遗传风险分析

近年来,ICSI对男性不育的治疗取得了极大的成功。然而,精子的遗传学异常所带来的遗传风险引起了较大的关注。在这些不育症患者中,大部分的少弱精子症患者和部分无精子症患者选择了ICSI,所以对患少弱精子症和无精子症的男性不育夫妇进行遗传学咨询与筛查,对防止这种基因缺陷的遗传具有重要意义。本综述就不育男性的遗传学缺陷发生率进行了分析。

DVT遗传风险因子的研究进展

下肢深静脉血栓形成(DVT)是临床常见病,主要表现为患肢淤肿、色素沉着,严重者可引起股青肿、肢体缺血坏死,丧失劳动力,部分患者可随病情发展出现血栓脱落、引起肺栓塞,重者危及生命。DVT的发生除与手术、骨折、肥胖、老龄、妊娠等外部因素有关外,遗传风险因子也参与其中。本文就遗传因素与DVT的相关性研究作一综述。

WONCA研究论文摘要汇编(一百零七)——鼻病毒喘息性疾病与儿童哮喘发病的遗传风险

背景 17q21区域遗传变异及由病毒诱导的呼吸道喘息性疾病均与哮喘发病相关。此研究目的为将儿童期哮喘起因研究(COAST)及哥本哈根儿童期哮喘出生群体前瞻性研究(COPSAC)中的这两种因素对哮喘风险的作用进行检验。方法研究者检测了与哮喘、人类鼻病毒(HRV)及呼吸道合胞病毒(RSV)喘息性疾病相关的17q21区域基因型,也检测了17q21基因型与HRV和RSV喘息性疾病之间的交互作用所致的哮喘风险。最后,研究者检测了未加刺激及HRV刺激外周血液单核细胞(PBMCs)17q21特定基因型的表达。结果 17q21变异体与幼儿HRV喘息性疾病相关,但与RSV喘息性疾病无关。17q21变异与哮喘的关联仅限于曾患过HRV喘息性疾病的儿童,导致了与哮喘风险相关的明显的交互作用。此外,与未刺激PBMCs比较,HRV刺激PBMCs导致ORMDL3和GSDMB的表达水平升高。在以上条件中这些基因表达与17q21变异相关,HRV暴露的增加并不是特定基因的作用。结论 17q21区域的基因变异与曾患过HRV喘鸣性疾病儿童哮喘及此区域两种基因表达相关。两种基因的表达水平随着HRV刺激反应应答而增强,这种相关增强与17q21基因型无关。

使用肺癌GWAS数据进行遗传风险预测的方法和策略研究

目的探讨基于肺癌全基因组关联研究数据的遗传风险预测方法和策略。方法将肺癌GWAS数据中的南京子样本和北京子样本分别作为训练集和测试集,分别使用预测全集和最优预测子集两种策略,比较三种预测方法在不同连锁不平衡结构(LD)和初筛检验水准(α)下的预测准确度。结果 w GRS在高LD结构下,随着-log(α)增大,预测准确度呈现上升趋势;RF和SVM对LD结构不如w GRS敏感,但三种方法在低LD结构(r2<0.2)下预测准确度优于高LD结构;w GRS方法下最优预测子集效果略优于预测全集效果,SVM下子集效果与全集近似,但略逊于全集,RF下子集效果则不如全集,且差距较大。结论基于LD结构修剪SNP位点和选择适当的初筛水准可以提高遗传风险预测准确度,此时w GRS方法预测效果优于SVM和RF。

遗传风险评分在复杂疾病遗传学研究中的应用

心血管疾病、2型糖尿病、原发性高血压、哮喘、肥胖、肿瘤等复杂疾病在全球范围内流行,并成为人类死亡的主要原因。越来越多的人开始关注遗传易感性在复杂疾病发病机制中的作用。至今,与复杂疾病相关的易感基因和基因序列变异仍未完全清楚。人们希望通过遗传关联研究来阐明复杂疾病的遗传基础。近年来,全基因组关联研究和候选基因研究发现了大量与复杂疾病有关的基因序列变异。这些与复杂疾病有因果和(或)关联关系的基因序列变异的发现促进了复杂疾病预测和防治方法的产生和发展。遗传风险评分(Genetic risk score,GRS)作为探索单核苷酸多态(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)与复杂疾病临床表型之间关系的新兴方法,综合了若干SNPs的微弱效应,使基因多态对疾病的预测性大幅度提升。该方法在许多复杂疾病遗传学研究中得到成功应用。本文重点介绍了GRS的计算方法和评价标准,简要列举了运用GRS取得的系列成果,并对运用过程中所存在的局限性进行了探讨,最后对遗传风险评分的未来发展方向进行了展望。

遗传风险评分在结直肠癌风险评估中的研究进展

结直肠癌的发生是多步骤、多因素参与的复杂过程,探讨结直肠癌的遗传病因及致病机制,对结直肠癌的早期防治具有重要的意义。结直肠癌相关的易感位点同时也可能在其他相关疾病中发挥作用。遗传风险评分作为探索单核苷酸多态性与复杂疾病之间关系的新兴方法,综合了若干易感位点的微弱效应,使基因多态对疾病的预测性大幅度提升。本文就结直肠癌遗传风险评分的研究进展作一综述。

肿瘤及其治疗对男性患者生育力的影响及遗传风险分析

伴随着肿瘤患者总生存期的延长,处于生育年龄的患者群体在治疗后的生育力及生育安全问题也越来越受到关注。本文探讨男性肿瘤患者肿瘤自身及抗肿瘤治疗对其生育力的影响并进一步分析可能由此导致的遗传风险。

健康生活可抵消阿尔茨海默病遗传风险

《美国医学会杂志》(Journal of the American Medical Association)(2019-07-14)发表的一项研究表明,即使你不幸携带易使你患上阿尔茨海默病的基因,健康的生活方式也可以降低这种风险。

非嵌合体克氏综合征患者睾丸显微取精成功率及子代遗传风险探索

目的探索非嵌合体克氏综合征(KS)患者睾丸显微取精成功率,为此类患者拥有自己遗传学意义的后代寻找出路,以及评估其子代遗传风险。方法对我院生殖男科就诊的18例KS患者实施显微镜下睾丸切开取精术(M-TESE),将获取的少量活动的精子冷冻保存,复苏后进行卵泡浆内单精子注射(ICSI)助孕,观察KS患者的手术获取成功率、术后恢复情况、妊娠情况以及子代遗传风险。结果以上18例进行了M-TESE手术的KS患者中,行单侧睾丸取精术3例,均获取适量精子;双侧睾丸取精术15例,其中8例患者未获取精子,其中总的精子获取率为55.6%,在这10例成功获取精子的患者中,均行单精子冷冻保存技术成功保存于人类精子库,冷冻精子管数45管,经后续ICSI时水浴复苏,精子回收率为82.33%,其中10例取精成功者均进入试管周期,已生育4个遗传学子代,并要求检查其子代染色体,未发现异常,3例获临床妊娠,3例仍在进行ICSI周期中,而未获取精子的患者夫妇最终选择AID/供精IVF助孕。结论M-TESE对KS患者具有较高的取精成功率,术后恢复快,可作为临床推广应用;而KS患者可通过ICSI助孕生育与自己有血缘关系的子代,子代遗传风险较低,但仍建议推荐在产前进行产前诊断评估相应风险。

心房颤动遗传风险与缺血性卒中机制

目前,尚不清楚对于基线左室射血分数（LVEF）≤35%的患者而言,随访期间LVEF改善至〉35%及未改善时植入型心律转复除颤器（ICD）治疗降低全因死亡率及心源性猝死的疗效是否有所差异？

帕金森症的遗传风险

据美国BIOCOMPARE科技新闻网（2006／8／14）报道，一项由Mayo诊所引领的国际合作研究，提供有力的证据证实遗传的风险因素占帕金森症起因的3％。

研究发现RSL的新遗传风险变异体

不宁腿多动症（RLS）系指小腿深部于休息时出现难以忍受的不适，需通过运动、按摩暂时缓解的一种综合征。目前，每10个欧洲血统人中就有1个受到RLS影响。RLS属于慢性疾病，长期发展会严重影响患者的睡眠．导致患者总体生活质量下降，增加患者罹患抑郁症、焦虑症、高血压及心血管疾病的风险。

心房颤动遗传风险与缺血性卒中机制

众所周知,心房颤动（AF）是心源性缺血性卒中的主要原因.但是,AF与非心源性缺血性卒中各亚型的相关性尚不确定.临床实践中,很多AF未被识别,而AF的发病有很强的遗传基础,Stroke杂志上发表的一项最新研究评估了各缺血性卒中亚型患者中AF的易感性.

家族评分作为原发性开角型青光眼遗传风险的指标

目的：通过计算家族评分(FS)来评价开角型青光眼(0AG)的遗传风险，FS总结了所有亲属的信息，包括他们的疾病状态、年龄、性别和血亲程度，并研究正常眼压及高眼压的0AG的遗传影响。

健康生活方式降低遗传风险

美国的一项最新研究发现．即使携带高遗传风险基因．只要遵循健康生活方式也能够降低心脏病或类似事件的风险。