鄂版肺炎1号方治疗新型冠状病毒肺炎的生物信息学研究

目的利用生物信息学研究方法,探究筛选鄂版肺炎1号方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的物质基础及其作用机制。方法借助中药系统药理数据库平台(TCMSP)筛选鄂版肺炎1号方中的化学成分及其作用靶点,通过GEO数据库中SARS基因表达谱数据集,分析出SARS差异基因,通过Venny工具得到复方与SARS靶点的交集获得抗COVID-19可能的靶点,并利用R 3.6.1 clusterProfile对上述靶点对应基因进行GO生物学过程富集分析和KEGG信号通路富集分析。利用与SARS-CoV-23CL水解酶(Mpro)的分子对接加以验证。结果在复方中筛选到108个潜在成分,其中核心成分34个,相关靶点涉及HSP90AA1、CASP8、FASLG、CYP19A1、MAPK14等。GO富集结果得到GO条目303个(P<0.05),其中分子功能(MF)21个,细胞组成(CC)12个,生物过程(BP)270个,分别占6.9%、4.0%、89.1%。KEGG富集分析得到61条通路(P<0.05),涉及TRP通道的炎性介质调节通路、T细胞受体信号通路、细胞凋亡通路、B细胞受体信号通路等。分子对接结果显示,粗毛甘草素F、光果甘草酮、千层纸素A、4′-羟基汉黄芩素、刺槐素和黄芩素等显示出较好的对接活性。结论鄂版肺炎1号方参与了人体多条免疫和炎症通路,可能通过调节免疫及相关炎症因子治疗COVID-19,其中34个核心成分具有潜在的抗SARS-CoV-2作用。