长期使用地西泮对神经活性配体受体相互作用信号通路的影响

研究长期使用地西泮对小鼠神经活性配体受体相互作用信号通路的影响。通过长期且逐量递增的方式给小鼠连续灌胃地西泮60 d,提取小鼠全脑总mRNA,进行小鼠全基因组芯片检测,运用生物信息学方法筛选出差异表达基因,并通过《京都基因与基因组百科全书》(KEGG)的基因功能通路数据库分析神经活性配体受体相互作用信号通路的变化。结果发现,与正常组比较,地西泮组的神经活性配体受体相互作用信号通路上的16个基因表达发生了显著性变化,其中表达上调的基因有9个,表达下调的有7个。实验结果表明,长期使用地西泮对神经活性配体受体相互作用信号通路具有显著的影响,可能和长期使用地西泮导致机体所产生的不良反应密切相关。

三价铬镀液中配体的作用

三价铬镀铬液中的配体对镀液的稳定性和沉积速度影响极大,从三价铬镀液的化学和电化学特性分析入手,介绍了镀液中所加配体(如羧酸、羟基羧酸、氨基羧酸及其盐)的作用:(1)与三价铬离子形成活性配位离子加快电沉积速度;(2)抑制Cr3+的羟桥化反应;(3)可以掩蔽杂质金属离子,减少杂质金属离子对镀层质量的干扰,使电镀能持续进行;(4)可以稳定镀液。特别指出,只有选用能形成活性配位离子的配体,使电镀能持续进行,才能获得性能良好的厚铬镀层。

配体-受体相互作用的计算机模拟及其在药物设计中的应用

配体－受体相互作用在许多生物过程中起重要作用，计算机分子模拟技术和理论化学计算方法在配体－受体相互作用研究中得到了广泛的应用。本文综述了有关配体－受体相互作用分子模拟和理论计算的常用方法及其在药物设计中的应用。

基于框架核酸的细胞表面受体配体相互作用研究进展

细胞表面受体与配体之间的特异性相互作用在细胞生物学过程中起着重要作用。然而,与均相溶液不同,受体分子在细胞膜上的分布是非连续的、动态的,因此细胞表面的受体配体相互作用通常呈现复杂的非线性结合模式。框架核酸作为一类具有确定几何形状的DNA纳米支架,可用于多价配体的偶联,为深入揭示受体配体相互作用机制提供了可靠的工具。利用框架核酸纳米分辨率的可寻址特性,可实现对配体数目、间距及空间构象等参数的精确调控,进而研究细胞表面受体配体的结合特性及影响因素,优化结合条件最终实现高效的分子识别及靶向治疗。本文综述了基于框架核酸的细胞表面受体配体相互作用研究进展,通过探讨细胞表面受体配体相互作用的重要影响因素及生物学应用,对该研究领域的发展前景和未来趋势予以展望。

阐释纳米晶溶解度的机理——固体核磁揭示表面配体的排布和相互作用

纳米颗粒的表面配体是决定纳米体系性质的重要组成部分,影响了纳米体系的稳定性1、生物相容性2、发光性质3和溶液性质等。例如在新型的发光材料—纳米晶量子点中,配体对量子点的溶解度有着至关重要的影响4。近年,浙江大学彭笑刚教授提出的“熵配体”概念4a,可通过混合长短链配体将量子点在有机相的溶解度提升5–6个数量级。这些熵配体已被广泛应用在纳米晶的合成和加工过程5。但其分子图像—配体的排列方式,配体间相互作用的定量改变—尚未可知。

跨膜激活剂及钙调亲环素配体相互作用分子对系统性红斑狼疮作用的研究进展

跨膜激活剂及钙调亲环素配体相互作用分子(TACI)对B淋巴细胞的稳态和自身免疫起负调控作用。敲除TACI基因的小鼠出现狼疮样自身免疫性疾病,同时TACI-Fc可影响B细胞的增生和存活,抑制抗体的产生,现已作为一种生物制剂用于治疗SLE,所以对TACI的研究及其在临床上的应用越来越受关注。本文就目前对TACI生物学作用及其应用于SLE的治疗研究进行综述。

蓝藻FBP/SBPase的制备及其与配体相互作用的分析--科研转化的化学生物学综合实验设计

以蓝藻果糖-1,6-/景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶为靶酶,异源表达获得靶酶,分析靶酶的纯度及含量,探讨配体与靶酶的相互作用。通过本实验,学生掌握获取靶酶的方法,掌握靶酶与配体相互作用的分析方法,了解药物筛选模型建立的研究思路及实验技术,提升分析、解决问题及综合运用知识的能力,增强科研服务社会意识及责任感。

核磁共振技术在蛋白质-配体相互作用研究中的应用

蛋白质与配体的相互作用在生物分子的识别和信号传递过程中起着非常重要的作用,其对药物设计和筛选都有重要的科学意义。核磁共振技术已经成为研究蛋白质-配体相互作用的一种重要方法。本文简要介绍了核磁共振技术在蛋白质与配体之间的相互作用方面的发展状况和应用。通过介绍蛋白质或配体与复合物的化学交换类型以及所能获得的有关蛋白质-配体相互作用的信息,应用核磁共振技术来研究其动力学等信息。

膜上相互作用对平板双分子层脂膜电性质的影响

以平板双分子层脂膜作为生物膜的简单模型 ,建立用平板双分子层脂膜电性质研究药物 -生物膜相互作用的方法。研究以具有典型特征的物质 -表面活性剂、自由基、金属手性配合物与平板膜的相互作用引起膜电性质的规律性改变 ;重组人B型血红细胞膜与溶液中抗B单克隆抗体发生特异相互作用时 ,膜电阻快速下降 ,下降的速率与加入的抗体量成正相关。在研究发生在平板膜上的典型反应的基础上 ,通过对膜电性质的监测和分析 ,从而确认平板双分子层脂膜能够成为研究药物 -生物膜相互作用和药物跨膜渗透的有力工具。

识别蛋白质配体绑定残基的生物计算方法综述

蛋白质与配体相互作用在生命过程中是普遍存在且不可或缺的,这种相互作用在生物分子的识别和信号传递过程中起着非常重要的作用。识别出蛋白质与配体相互作用的绑定残基对蛋白质功能研究、药物设计和筛选都有着重要的科学意义,而生物计算方法是蛋白质与配体绑定残基预测研究中的一种重要手段。本文首先给出了蛋白质与配体相互作用的绑定残基的一般性定义;其次,总结出了一种蛋白质与配体绑定残基预测方法的分类体系,并对其中一些代表性的预测方法进行了简要阐述;再次,给出了蛋白质与配体绑定残基预测研究中常用的数据库和评价指标,并通过在相关数据集上进行实验比较了具有代表性的预测方法的性能;最后,对若干挑战性问题进行分析并预测该领域未来的研究方向,以期对相关研究提供一定的参考。

入侵疟原虫与红细胞膜的相互作用

疟疾是广泛传播的人类严重寄生虫病。近十年来,从分子水平探索疟疾的发病机制和治疗、预防手段都取得了可喜的进展,尤其恶性疟原虫全基因组的成功测序为疟疾疫苗的设计和试制开拓了新途径。该文就疟原虫裂殖子入侵红细胞表面过程的生化背景,裂殖子与红细胞的配体-受体相互作用,疟原虫向红细胞输出的蛋白质,以及疟疾感染所致红细胞的遗传障碍等方面的近期有关报道作一简介,试图从细胞与分子机制讨论被感染红细胞的膜蛋白与膜骨架的某些改变。

过氧化体增殖物激活型受体γ配体与炎性细胞因子和左心室肥厚

左心室肥厚是临床上常见的心脏疾病 ,可以引起心肌梗死、猝死 ,严重地危害健康。压力负荷增加是引起左心室肥厚的主要原因 ,但其具体的细胞和分子机制还不清楚。近年来已经注意到炎性细胞因子在左心室肥厚发展过程中的作用。过氧化体增殖物激活型受体的配体具有抑制炎症的作用。本文通过综述过氧化体增殖物激活型受体γ配体与炎性细胞因子和左心室肥厚之间的关系 。

肿瘤坏死因子受体/配体凋亡信息系统的研究现状

肿瘤坏死因子 (TNF)家族和肿瘤坏死因子受体家族 (TNFR)这种配体 -受体间相互作用在诱导肿瘤细胞凋亡中的作用及其应用价值有些已被证实。对肿瘤细胞的杀伤机制是由多种分别具有正调和负调作用的配体 /受体间相互作用所介导的。深入探讨这些凋亡诱导配体的生物学功能 ,对新型肿瘤生物治疗的形成具有重要意义 。

蛋白质-配体分子对接中构象搜索方法

分子对接是研究蛋白质-配体分子间相互作用与识别的有效方法。分子间的相互作用过程中形成的近天然构象是结合自由能极低的构象,快速且准确搜索能量极低的构象对于蛋白质-配体分子对接至关重要。本文回顾了蛋白质-配体分子对接中主要的构象搜索算法,包括快速穷举搜索、启发式搜索和其他搜索方法,并列举了采用不同搜索算法的代表性分子对接软件。其次,介绍了蛋白质-配体分子对接的国际评估实验、常用的测试标准库和评价的重要指标。最后,分析并指出了当前蛋白质-配体对接构象搜索方法所存在的主要问题,并对未来的工作进行了展望。

流体剪应力作用下趋化因子CXCL12诱导的白细胞整合素LFA-1的激活

目的探究剪应力下趋化因子诱导的白细胞上整合素LFA-1激活过程。方法采用平行平板流动腔系统在10~30 mPa剪应力下,观察分析可溶性及固定趋化因子CXCL12对Jurkat细胞在ICAM-1上瞬时黏附行为的影响,提取特征参数。结果 CXCL12仅能介导Jurkat细胞的短暂栓缚(0.13~0.20 s)。只有固定的CXCL12才能有效激活Jurkat细胞上LFA-1与ICAM-1键合,从而提高栓缚事件的发生率,并大大延长细胞的栓缚时间(0.8~1.2 s)。激活的LFA-1/ICAM-1解离速率呈现明显双态性:k_1(1.09~1.24 s^(-1)),k_2(0.28~0.7 s^(-1)),剪应力主要通过调节k_2及k_2对整个黏附时间的贡献率β来控制细胞的瞬时黏附行为。结论剪应力通过G蛋白偶联受体与CXCL12的作用可在0.2 s内快速激活整合素LFA-1,进而调控白细胞的黏附过程。研究结果有助于深化趋化因子-力偶联调控整合素激活机制的认识。

基于网络药理学研究三棱-莪术药对治疗肝细胞癌的作用机制

目的:应用网络药理学的方法,研究三棱-莪术药对治疗肝细胞癌的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)数据库以及手工查阅相关文献,搜集并整理三棱-莪术药物的活性成分及其靶标。通过人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和人类基因数据库(Genecards)获得三棱-莪术药对治疗肝细胞癌潜在的靶标基因。使用Cytoscape 3.7.2软件建立相应的“成分-靶标”网络。结合String(functional protein association networks)数据库,构建其蛋白质相互作用网络。运用Bioconductor工具、R统计编程软件进行三棱-莪术药对的作用靶标进行相应的基因本体论(GO)分类富集分析以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选得到6个活性成分,包括豆甾醇、β-谷固醇、丁芒柄花黄素等和39个作用靶标,包括雌激素受体1、雄激素受体、核受体共激活剂2、核受体亚家族3C组成员1、孕激素受体等,主要涉及神经活性配体-受体相互作用、雌激素信号转导途径、胆碱能突触等主要信号通路。结论:本研究基于网络药理学的方法初步预测了三棱-莪术药对治疗肝细胞癌的可能作用机制,三棱-莪术治疗肝细胞癌主要通过神经活性配体-受体相互作用、雌激素信号转导途径、胆碱能突触等信号通路发挥作用。

基于网络药理学的僵蚕主要药效作用研究

目的:通过网络药理学方法探讨僵蚕的主要药效作用机制。方法:利用化学专业数据库及文献收集僵蚕的化学成分,借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及Swiss Target Prediction数据库获得僵蚕化合物潜在作用靶点,结合TTD、DisGeNET等生物信息库及僵蚕现代药理作用将靶标映射在相关疾病上。运用Cytoscape构建药材-成分-靶点-疾病网络模型,并应用DAVID数据库基于KEGG通路分析僵蚕作用机制。结果:僵蚕39个化学成分共作用451个靶点,主要富集在糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病方面,其中27个化合物和20个靶点是网络中的关键节点。僵蚕以代谢通路、神经活性配体-受体相互作用、PI3KAkt信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路、癌症通路等为主要作用通路。结论:僵蚕可通过多成分、多靶点、多通路治疗糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病。

含有碘代酪氨酸的铜(Ⅱ)三元混配配合物的圆二色光谱研究──碘对甲状腺激素生物活性的结构作用探索

用圆二色光谱法研究了铜 (Ⅱ )与 3 碘基 L 酪氨酸 (L Ityr) ,L 酪氨酸 (L Tyr) ,或L 高丝氨酸 (L Hser)和L AA(AA代表精氨酸 (Arg) ,赖氨酸 (Lys) ,天冬酰胺 (Asn) ,谷氨酰胺(Gln) ,或丙氨酸 (Ala)三元混配配合物体系在不同离子强度 (I =1 .0或 0 .1mol/LKNO3)和溶剂环境 (水 ,50 % (v/v)乙醇 水或 50 % (v/v)二氧六环 水 )条件下配体间相互作用 .全部混配配合物体系的圆二色光谱在 587～ 62 7nm范围均有负的极大吸收 ,且Cu(L Ityr)L Arg)和Cu(L Ityr) (L Lys)体系的Δε异常负 (- 0 .479～ - 0 .884) ;Cu(L Ityr) (L AA)体系的Δε明显比Cu(L Tyr) (L AA)负 .讨论了这些混配配合物中配体间相互作用的规律和碘的结构效应 .

虎杖提取物中白藜芦醇的定性定量分析及其与β-乳球蛋白相互作用的质谱研究

目的：通过构建高效液相色谱-四极杆-时间飞行（HPLC-Q-TOF）高分辨质谱方法定性地鉴定虎杖醇提物的主要组分，对其中的活性成分白藜芦醇含量进行定量分析，并用电喷雾质谱法（ESI-MS）首次研究白藜芦醇与β-乳球蛋白的相互作用。方法：定性分析采用高效液相色谱-四极杆-时间飞行（HPLC-Q-TOF）高分辨质谱方法，使用AgilentZORBAXEclipseXDB-C18柱（2．1×150mm，5-Micron），流动相为甲醇-水溶液，梯度洗脱：0～30min10％～90％甲醇，30．40min90％甲醇，40～60min90％～10％甲醇，柱温：40℃，进样量：2μL，流速：0．2mL／min-1，虎杖醇提物采用HPLC-Q-TOF负离子检测模式。结果：由高效液相分离和质谱特征负离子的精确质量解析，共鉴别出虎杖中13种化合物，测定出实验所用虎杖中白藜芦醇的含量为1．181mg／g，观测到白藜芦醇与β-乳球蛋白能形成稳定的蛋白复合物。结论：该方法定性分析了虎杖醇提物中主要药用成分，首次利用ESI-MS法研究了β-乳球蛋白与白藜芦醇的相互作用，检测到两者能有效形成稳定的蛋白复合物，有助于开发一种新的途径以提高白藜芦醇的稳定性和生物利用率。

麦门冬汤抗肺纤维化作用机制的网络药理学研究

目的:采用网络药理学方法探讨麦门冬汤治疗肺纤维化的潜在作用机制。方法:通过中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)、中医药百科全书数据库(ETCM)获取麦门冬汤的化学成分和潜在作用靶点;通过治疗靶点数据库(TTD)、人类的非线性孟德尔遗传数据库(OMIM)、DRUGBANK数据库获取肺纤维化相关的作用靶点。采用Cytoscape3.6.2软件绘制单味药-成分-共有靶点网络;采用STRING数据库并结合Cytoscape3.6.2软件绘制关键靶点相互作用图;采用David 6.8数据库进行基因本体论(GO)分析与京都基因和基因组数据库(KEGG)通路分析。结果:获得麦门冬汤392个成分,2682个潜在靶点,98个肺纤维化相关靶点,麦门冬汤和肺纤维化共有靶点49个。对单味药-成分-共有靶点网络进行网络参数分析,筛选出24个麦门冬汤抗肺纤维化的主要作用靶点。GO及KEGG分析显示,麦门冬汤抗肺纤维化的主要靶点涉及119个生物学过程,28个细胞组分,27个分子功能以及12条信号通路。结论:麦门冬汤抗肺纤维化作用可能与5-羟色胺受体(5-HTR)、转化生长因子受体(TGF)等密切相关,麦门冬汤可能通过调节神经活性配体-受体相互作用通路、钙信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路发挥抗肺纤维化作用,有待于进一步实验验证。