核酸适配体药物生物分析方法的研究进展

目的结合目前核酸适配体药物的体内研究,综述核酸适配体药物的生物分析方法。方法查阅国内外近年相关文献42篇,对其进行归纳、总结,从核酸适配体药物研究概况、分析样品前预处理差异及各方法的优缺点等方面进行了介绍。结果应用于核酸适配体药物定量的生物分析方法各有其优缺点,应用时应根据具体情况合理选择灵敏度高、专属性强的方法。结论随着核酸适配体技术的发展,不断有崭新的核酸适配体药物诞生、完善、进入临床阶段并最终成为上市药物,针对其体内定性和定量的分析方法也将越来越成为研究热点。

PPARγ在肝纤维化进程中的影响及其配体药物研发进展

过氧化物酶体增殖激活受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPARs)是由内源性或外源性配体激活的核因子家族成员之一,是调节脂肪生成与代谢、炎症以及与其他转录因子信号等串扰在纤维化进程的调节剂,是近年来较有潜力的一个治疗靶点。肝纤维化(hepatic fibrosis,HF)是由多种病因导致的以胶原沉积、细胞外基质(extracellular matrix,ECM)增多为主的复杂病理变化,活化的肝星状细胞(hepatic stellate cells,HSCs)是其中心环节,随着对PPARs研究发现其亚型PPARγ在脂肪组织、巨噬细胞与HSCs的表达共同参与炎症反应等,进而导致肝纤维化的形成,其上调在逆转肝纤维化中维持HSCs静止表型及促使活化HSCs凋亡也起一定作用,表明以PPARγ为靶点激活的配体药物可能在抗纤维化治疗中扮演重要角色。

非免疫球蛋白配体药物应用进展

同抗体药物相比,非免疫球蛋白配体药物(Non-immunoglobulin scaffolds,非免蛋白配体药物)具有分子量小,不需要翻译后修饰,通常缺乏二硫键,并可进行直接的多聚化修饰等优点。最近几年,研发的非免蛋白配体药物种类就达到了二十余种,如Adhirons,Alphabodies,Centyrins,Pronectins,Repebodies,Affimers,和Obodies等,其中的139个非免疫球蛋白配体,可以特异靶向结合102种蛋白。这些非免疫球蛋白配体多用于癌症和炎症性疾病的治疗和诊断,其中有10多种非免疫球蛋白配体已经进入临床试验研究。最近,非免蛋白配体也被用于伴侣蛋白作结构解析研究,翻译后修饰的细胞内监控,或作为显微镜,流式细胞仪,Western印迹法等检测方法中抗体的替代品。

药物配体与生物大分子受体相互作用核磁共振的研究进展

药物与生物体内目标大分子之间的相互作用 ,是决定药物药理活性和代谢稳定性的主要因素。如何快速高效地识别出能与靶分子相互作用且能抑制其体外活性的药物分子 ,是制药工业普遍关注的问题。核磁共振已经成为研究小分子配体和生物大分子相互作用的一种非常重要的手段。检测小分子配体信号在作用过程中的变化以识别药物分子 ,是核磁共振进行药物筛选的主要方法之一。本文介绍了近年来这方面的研究进展。

基于配体和受体的药物设计方法的对应性

基于配体和基于受体的药物设计,通常在方法设计上存在共同的理论基础。本文通过对基于格点能量计算、特征、类似物、知识以及分子对接等方面的方法进行总结,探讨了基于配体和受体在药物设计中的对应关系,并对今后药物设计的发展提出建议。

核酸药物的研究与应用

核酸药物是具有特定碱基序列的药物,包括寡聚核苷酸药物、核酸适配体药物和核酸疫苗。目前核酸药物已被广泛用于基础研究,疾病的临床诊断和治疗,如肿瘤、感染性疾病、血液病及神经退行性疾病等。主要介绍核酸药物在疾病诊断和治疗中的研究进展。

计算机辅助药物设计的研究进展

近年来,随着生物信息学和计算机技术的飞速发展,计算机辅助药物设计(CADD)取得了巨大的进展。CADD是通过计算配体与受体的相互作用进行合理药物设计,包括基于结构的药物设计(SBDD)、基于片段的药物设计(FBDD)和基于配体的药物设计(LBDD)。本文对SBDD、FBDD和LBDD的研究进展进行综述。

几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂

由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q^2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R^2引导的区域选择法(q^2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q^2值均比传统CoMFA的高.q^2-GRS方法得到的q^2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q^2较为理想,而在CoMSIA中,q^2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q^2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.

q^2引导构象选择CoMFA方法研究HIV-1 RT抑制剂

对未知受体结构的药物设计其主导方法CoMFA来说,柔性目标分子的多种构象造成了问题的复杂性.本文介绍交叉验证参数R^2(q^2)引导的构象选择CoMFA方法,选择化合物的最佳构象.将一组47个HIV-1 RT抑制剂进行有、无构象选择的CoMFA分析来作评价.根据化合物的活性、毒性、选择性指数(毒性/活性比)等实验数据构建得到的模型,其交叉验证参数q^2为0.7以上,非交叉验证的相应参数为0.94以上,最后,还经过试验集化合物验证该模型的预测能力,置信度(1-α)>0.99.

阿片受体亚型选择性拮抗剂的两种结构类型

1973年证实阿片受体的存在以来,对阿片受体及其配体药物的研究一直保持着快速的发展,发现了大量的阿片受体激动剂和部分激动剂,如吗啡、哌替啶、布托啡诺、芬太尼和喷他佐辛,并在临床中广泛应用.

配体靶向药物传递系统的研究进展

利用肿瘤细胞表面过度表达的某些生物大分子受体能够与其配体特异性结合的特点,用配体与药物结合,形成配体靶向药物递送系统。配体发挥导向物作用,将药物靶向递送到肿瘤细胞(或组织),实现主动靶向释药,提高药物的选择性,从而增加药效。文中介绍了以维生素(叶酸、维生素B12,维生素A)、蛋白质(转铁蛋白、低密度脂蛋白)、多糖(半乳糖、甘露糖、透明质酸)、整合素等生物大分子为配体的靶向药物递送系统研究进展。

基于吡咯烷与正丁烷类衍生物CCR5拮抗剂的药效团模型构建(英文)

吡咯烷与正丁烷类CCR5(化学趋化因子受体5)拮抗剂可通过抑制人类免疫缺陷病毒(HIV-1)包膜蛋白与CCR5的相互作用而阻断病毒进入细胞.本文使用已知拮抗剂结构和活性信息构建了一个三维药效团模型.按照Catalyst/HypoGen模块的要求,选择了25个结构和活性均具备差异性的分子作为药效团产生的训练集.其中训练集分子以IC_(50)值表示的生物活性值跨度为0.06到10000 nmol·L^(-1).最好的药效团模型(Hypo 1)由两个正离子化特征以及三个疏水特征组成,训练集预测相关系数为0.924,均方根偏差为1.068.模型用于预测由74个分子组成的测试集化合物活性,结果表明模型可以提供较好的活性预测结果并用于新的拮抗剂的设计.

G蛋白偶联受体计算研究的进展和前瞻

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)是含有七个跨膜螺旋的一类重要蛋白,是迄今为止发现的最大的多药物靶标受体超蛋白家族。例如,目前上市药物中有超过30%是以GPCR为靶点的。然而,与GPCR重要性形成强烈反差的是科学界对于其结构与功能的了解非常贫乏,主要原因是通过实验手段来获得GPCR的结构与功能信息极其困难。利用生物信息学方法从基因组规模的数据中识别GPCR并预测三维结构是可行途径之一。基于生物信息学的GPCR研究将为新型药物靶标的筛选和药物的开发提供一定的帮助。本文论述了几种较为典型的GPCR计算方法,并基于已有研究提出可能的创新性研究策略来解决GPCR蛋白识别、跨膜区定位、以及结构和功能预测等问题。

作用于FTase和Raf-1激酶的新型抗肿瘤药物的设计

Ras/Raf/MEK/ERK信号通路,在肿瘤细胞的增殖、分化、凋亡、转移、代谢等过程中起着重要的作用,本文着眼于Ras/Raf/MEK/ERK信号通路中的关键靶点,以法尼基转移酶(FTase)为主靶点,以Raf-1激酶为次靶点,借助计算机辅助药物设计(CADD),构建法尼基转移酶抑制剂(FTIs)和Raf-1激酶抑制剂的药效团模型,设计出同时与这两个靶点相匹配的多靶点配体药物。所设计的多靶点配体药物以氨甲基苯甲酸为母核结构,具有较好的预测活性。

前列腺特异性膜抗原介导的抗肿瘤药物研究

前列腺癌是男性最常见的恶性肿瘤之一,在美国前列腺癌的发病率在男性肿瘤中排名第一,死亡率排名第二。前列腺特异性膜抗原是存在于前列腺上皮细胞膜的一种II型跨膜糖蛋白,它在前列腺癌中高度表达,尤其是转移前列腺癌及激素抵抗前列腺癌,在前列腺癌的诊断和靶向治疗中显示出良好的应用前景。此外,前列腺特异性膜抗原还具有叶酸水解酶和N-乙酰基-α-连接二肽酶I活性,能够催化α或γ键连接的谷氨酸从肽或小分子物质上水解出来。本文重点对以前列腺特异性膜抗原为靶标的配体-药物偶联物和前列腺特异性膜抗原激活前药的最新研究进展进行综述。

偏向β-抑制蛋白的GPCR信号传导机制及药物研究进展

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors, GPCR)是一类存在于细胞膜表面的受体超家族。随着对GPCR脱敏调节器β-抑制蛋白(β-arrestin)研究的深入,发现GPCRs激活后不仅能通过G蛋白依赖途径进行信号的传导,也能通过非G蛋白依赖途径,即β-抑制蛋白通路来调节受体内吞和脱敏,甚至启动一波新的信号传导,由此提出"偏向性传导"的概念,即配体激活受体后能够选择性激活相应的信号通路,使信号沿着特定"偏好"的下游通路继续向下传导,并将与受体结合后能引起偏向性激活的配体称为"偏向性配体"。一般认为,偏向性的产生是因为配体与受体结合方式存在差别,包括受体构象的差异、下游信号蛋白结合位点的差异以及信号蛋白自身构象的差异等。本文就偏向β-抑制蛋白的GPCR信号传导机制以及偏向β-抑制蛋白通路的配体类药物研究进展做一简要综述。

我国核酸药物市场分析及对策建议

近年来,因兼具基因修饰和传统药物的双重特点,核酸药物已逐渐成为精准生物医学和疾病治疗的热点。为进一步推动我国核酸药物行业创新发展,采用定量分析和定性分析相结合的方法,对国内外核酸药物获批/授权、市场和研发情况进行分析,揭示全球ASO、siRNA、RNA aptamer及mRNA等四大类核酸药物的产业发展态势,系统梳理我国支持核酸药物创新发展的政策与措施,明确未来的技术主攻方向和应用潜力。面对国内基因治疗的迫切需求及核酸药物创制的严峻形势,研究提出推动源头创新、完善成果转移转化机制和营造良好竞争环境等对策建议。

计算机辅助药物设计在新农用化合物开发中的应用

农药创新关系到我国农业可持续发展和生态环境安全,计算机辅助药物设计能够有效帮助农药创新。介绍了药物靶标的选择和预测、分子对接、分子动力学模拟、从头设计、基于药效团的虚拟筛选和定量构效关系模型等计算机辅助药物设计方法在农药创制过程中的应用,探讨了这些计算机辅助药物设计方法在农药创制过程中存在的问题,展望了计算机辅助药物设计在未来新农药开发中的应用前景。

适配体及其在生物医药和诊断分析方面的应用

近年来,适配体倍受关注。因其具备抗体所有优势的同时,还具有热稳定,低成本和应用广泛等特点,而被认为是抗体的理想代替品。本文全面系统地总结了适配体技术及其在生物医学领域的应用:适配体筛选技术;适配体在生物传感技术方面的应用;适配体在特异性识别靶细胞(尤其是癌细胞)方面的探讨;适配体在诊断治疗及医学方面的应用。综述了核酸适配体的获得途径,体外修饰以及在各领域的应用。综合核酸适配体的一系列应用,发现其在生物医学方面应用极其广泛,也最具前景。

PD-1/PD-L1抗体临床药效标志物和CAR-T细胞临床前药效评价的特点及检测方法

肿瘤免疫疗法是应用免疫学原理和方法,提高肿瘤细胞自身的免疫原性及其对效应细胞杀伤作用的敏感性,激发和增强机体抗肿瘤免疫应答,并应用免疫细胞和效应分子,协同机体免疫系统杀伤肿瘤,抑制肿瘤生长的方法;因其具有抑瘤作用特异性强,毒副作用小,疗效好等特点,日益受到研究者青睐,如何科学控制与反映该疗法的药效作用已成为研究热点。本文针对目前肿瘤免疫疗法的两大类热点产品[抗细胞程序性死亡受体1/细胞程序性死亡配体1(PD-1/PD-L1)抗体药物和嵌合抗原受体T(CAR-T)细胞]药效研究面临的问题,如抗PD-1/PD-L1抗体药物的整体临床药效反应率偏低,CAR-T细胞治疗实体瘤的临床疗效不尽理想,对抗PD-1/PD-L1抗体药物临床药效标志物和CAR-T细胞临床前药效评价的特点与分析方法、发展面临的挑战及转基因动物在此类产品药效学研究中的应用进行分析,以期为准确预测此类产品的临床药效,提高其疗效提供参考。