碘化钾与酚/氯仿提取外周血基因组DNA方法的比较

目的建立碘化钾快速提取外周血基因组DNA的方法。方法采用碘化钾法和酚/氯仿提取法,直接从人外周血中提取基因组DNA,并以此为模板,进行人类生长激素(HGH)基因片段的扩增及鉴定。结果此方法提取的DNA量大,DNA体外扩增结果稳定。结论该方法较传统酚/氯仿提取基因组DNA法快速、简便、经济,可用于PCR模板DNA的制备。

酚/氯仿抽提法提取绵羊凝血块中基因组DNA

[目的]对组织DNA提取方法进行改进,建立一种从绵羊凝血块中提取基因组DNA的方法。[方法]将绵羊凝血块用眼科剪剪碎,用组织DNA抽提液裂解细胞,用蛋白酶K消化后,经过酚/氯仿抽提,无水乙醇沉淀获得基因组DNA。[结果]提取的DNA浓度为(159.90±0.70)ng/μl,A260/A280比值为1.80±0.01,分子完整,结果理想。以从凝血块中提取的DNA为模板,对绵羊BM203微卫星位点进行了PCR扩增,扩增效果良好。[结论]该方法简单、实用,提取的DNA可满足后续相关研究对DNA质量的要求,值得推广借鉴。

经典酚/氯仿抽提法和纯化试剂盒法提取全血基因组DNA的比较

目的 比较经典酚/氯仿法和纯化试剂盒法抽提全血基因组DNA的差异.方法 分别对两种方法抽提的全血DNA产物进行紫外分光光度仪、琼脂糖凝胶电泳和体外聚合酶链锁反应（PCR）扩增.结果 两种方法DNA的提取效率相似,TaKaBa试剂盒法提取的纯度[光密度（OD）260nm/280nm]较常规酚/氯仿法明显提高.结论 TaKaBa试剂盒法较传统酚/氯仿提取基因组DNA法快速、简便、经济,可用于PCR模板DNA的制备.

酚/氯仿抽提法提取绵羊凝血块中基因组DNA(摘要)(英文)

[目的]对组织DNA提取方法进行改进,建立一种从绵羊凝血块中提取基因组DNA的方法。[方法]将绵羊凝血块用眼科剪剪碎,用组织DNA抽提液裂解细胞,用蛋白酶K消化后,经过酚/氯仿抽提,无水乙醇沉淀获得基因组DNA。用NanoDrop ND-1000微型分光光度计检测DNA浓度和纯度。用0.8%琼脂糖凝胶电泳检验基因组DNA的完整性。以绵羊微卫星位点BM203为扩增位点,分别以F:5′-GGGTGTGACATTTTGTTCCC-3′,R:5′-CTGCTCGCCACTAGTCCTTC-3′为上下游引物,进行PCR扩增试验。PCR产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。[结果]提取的DNA浓度为(159.90±0.70)ng/μl,A260/A280比值为1.80±0.01,分子完整,结果理想。以从凝血块中提取的DNA为模板,对绵羊BM203微卫星位点进行了PCR扩增,扩增产物条带整齐、明亮、特导性强,扩增效果好。[结论]该方法简单、实用,提取的DNA可满足后续相关研究对DNA质量的要求,值得推广借鉴。

虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei, EHP)基因组不同提取方法的比较

为探寻最佳EHP基因组提取方法,本研究采用传统酚/氯仿抽提法、改良酚/氯仿抽提法、几丁质酶法、商品化海洋动物DNA提取试剂盒及商品化植物DNA提取试剂盒共5种方法分别对等量的EHP进行基因组提取。提取的基因组浓度由高到低依次为:商品化海洋动物DNA提取试剂盒(18.825 ng/µL) > 几丁质酶法(17.17 ng/µL) > 改良酚/氯仿抽提法(15.06 ng/µL) > 传统酚/氯仿抽提法(10.8 ng/µL) > 商品化植物DNA提取试剂盒(2.175 ng/µL);提取的基因组完整性由高到低依次为:商品化海洋动物DNA提取试剂盒 > 改良酚/氯仿抽提法 > 商品化植物DNA提取试剂盒 > 传统酚/氯仿抽提法 > 几丁质酶法。由上述结论可知,采用商品化海洋动物DNA提取试剂盒提取的EHP基因组浓度最高,且完整性最好,是5种方法中最佳的提取方法。

快速提取肠道微生物基因组DNA的方法

目的:肠道微生物的研究日益成为热点,如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本文通过对酚/氯仿法提取总DNA过程进行考察和优化,建立一种简便酚/氯仿抽提法。方法:考察和优化酚/氯仿法提取总DNA的过程,并根据DNA产量、纯度以及ERIC-PCR及16S rNDA-RFLP所反映的微生物群落结构特性的指标,并与QIAamp?DNA Stool Mini Kit提取的进行比较,评价了所建立的快速提取方法。结果:用简便酚/氯仿法得到基本完整的基因组DNA,ERIC-PCR和16S rDNA-RFLP结果与QIAamp?DNA Stool Mini Kit法基本相同。结论:该方法快速并成本低,适合肠道微生物研究中总DNA提取,尤其适合处理大批量的样品。

一种快速提取质粒DNA用于鉴别重组克隆的方法

介绍了一种利用过夜培养的菌液瞬时提取质粒DNA，并用于电泳鉴别含有插入子克隆的方法。事先无需准备许多繁琐的相关试剂，提取质粒的全过程只需3～5min就可完成，非常适合于做重组克隆的快速鉴别。

三种山羊全血基因组DNA提取方法的比较

采用碘化钾法、酚/氯仿和试剂盒提取法直接从山羊全血中提取基因组DNA,并以碘化钾提取基因组DNA为模板,进行山羊生长激素(GH)基因片段的扩增,扩增效果良好。结果表明:碘化钾法提取基因组DNA快速、简便、经济,提取的DNA可满足后续相关研究对DNA质量的要求,值得借鉴。

一种有效的葡萄叶片总RNA提取方法

RNA的提取技术是现代分子生物技术的基础,植物RNA的提取比较困难。实验以新鲜的葡萄叶片为材料,采用SDS、CTAB相结合的方法,进行酚/氯仿的提取,消除了DNA及植物中较多的多糖、多酚等污染,提取到较纯净的总RNA,此方法适合于葡萄叶片总RNA的提取,试剂简单经济,实验结果稳定,重现性强。

两种DNA提取法对腐败胎盘组织STR分型结果的比较

在法医物证检验工作中,对于新鲜的人体组织检材,一般采用Chelex-100法提取DNA就可得到理想的STR分型结果,但是对于高度腐败的人体组织,单纯地依靠此法检测存在失败的可能。笔者运用两种不同的DNA提取法对高度腐败的胎盘组织进行了DNA提取，并对其STR基因座分型的检出率、DNA含量及纯度进行了比较。

外周血基因组DNA提取方法比较

目的建立快速经济有效提取微量外周血基因组DNA的方法。方法采用酚/氯仿提取法、NaCL沉淀法和试剂盒法,直接从人外周血中提取基因组DNA,并以此为模板,进行肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)基因片段的扩增及鉴定。结果酚/氯仿法和试剂盒法提取的DNA量大,需血量少,用于PCR扩增结果稳定。结论酚/氯仿提取外周血DNA稳定、高效、经济,可用于批量临床标本的制备。

影响RNA提取质量的因素分析

RNA提取技术已经成为分子生物学中一个基本技术。教学和有一定特殊要求的科学研究需要透彻了解影响RNA提取的详细因素。细节对RNA提取的质量至关重要。本文对CTAB法提取RNA的全过程中各种影响因子进行了分析:CTAB法可以被用于RNA的提取;在CTAB提取缓冲中的温育时间以及机械摇动力是影响所提RNA质量的两个主要因素;合适的温育时间是65℃5min;轻柔地将组织与CTAB提取缓冲液充分混合可以避免DNA的污染;采用此方法进行实验可在在酚抽提的步骤停下,同时不影响RNA的质量,给实验安排带了灵活性。这是一个用于一般实验室的简单便宜的方法。

逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测石斑鱼神经坏死病毒方法的建立和应用

神经坏死病毒是导致石斑鱼等多种海水鱼类暴发性传染病的致病原。根据石斑鱼神经坏死病毒编码核衣壳蛋白的RNA2基因组序列设计的一对特异性引物,用来扩增其中的421bp病毒核酸片段。比较了酚-氯仿法、试剂盒法等3种RNA抽提的方法对神经坏死病毒的核酸抽提效果,结果表明3种方法均适合于RT-PCR方法。实验证明在cDNA过程中,RNA酶抑制剂并非反应所必需。对RT-PCR过程进行了条件优化,建立了一步法的RT-PCR检测方法,在网箱养殖石斑鱼以及育苗场的病鱼检测实践中获得满意效果。

家禽血液基因组DNA的快速提取

[目的]建立一种应用硅胶膜提取禽血DNA的新方法。[方法]应用硅胶膜法和传统的酚/氯仿法提取抗凝禽血基因组DNA,设计合成了一对2.7 kb的鸡卵清蛋白基因的引物,检测这2种方法提取的基因组DNA模板对聚合酶链式反应(PCR)扩增效率的影响。[结果]用硅胶膜法提取的基因组DNA产量和质量均比传统的酚/氯仿法高,将该法提取的基因组DNA作为模板能够消除抗凝剂对后续PCR反应的影响。[结论]硅胶膜法为快速提取高质量的禽血基因组DNA奠定了基础。

一种快速经济的外周血DNA提取方法

目的:将传统酚/氯仿提取DNA方法改进,建立一种快速、经济的从全血中提取高质量基因组DNA的方法。方法:用双蒸水破红细胞,KI30秒内充分裂解白细胞、细胞核,然后通过高浓度NaCL沉淀蛋白,酚-氯仿-异戊醇混合液同时萃取。结果:提取的基因组DNA吸光度值A260/280为(1.84±0.03),产量为(27.2±2.6)μg/ml全血。提取基因组DNA凝胶电泳条带完整,PCR扩增目的条带完整。结论:本方法是一种快速、经济的外周血DNA提取方法,适合大规模人群基因组学研究。