猪源性成分检测中3种DNA提取方法比较

为了达到对动物源性成分快速、准确的检定,对提取动物源性基因组DNA的方法进行了比较分析。考察酚-三氯甲烷法、聚乙烯吡咯烷酮法(PVP法)和试剂盒法这3种方法对DNA提取的浓度、纯度及实时荧光PCR扩增效果的影响。结果表明:酚-三氯甲烷法提取DNA浓度最高,试剂盒法纯度最高且实时荧光PCR扩增效果最好,但PVP法操作简单、安全、经济,提取的DNA用于实时荧光PCR扩增检出限可达1.98 pg/μL。使用PVP法对市场上10份不同类型的动物性产品进行了检测,检出两份产品中含有猪源性成分。PVP法应是3种方法中的首选方法,本文为实验室选择合适的DNA提取方法提供了依据。

转基因玉米检测中4种DNA提取方法比较

以1%转基因玉米MON810粉末为材料,对比了酚-三氯甲烷法、PVP法、CTAB法、胍-三氯甲烷法4种经过调整和优化的DNA提取方法在转基因玉米检测中的效果差别,该4种方法均能获得可供进行进一步转基因成分检测分析的DNA,其中CTAB提取法获得的DNA质量相对较高。DNA提取过程中,略去蛋白酶、淀粉酶以及RNA酶的使用步骤,同样可获得质量良好的DNA用于转基因成分检测分析。在转基因玉米检测中,可针对样品情况选择和优化方法。

基于UPLC-Q/TOF-MS分析淫羊藿炮制前后黄酮组分的变化规律

目的基于UPLC-Q/TOF-MS技术建立淫羊藿炮制前后指纹图谱,对其全成分进行分析并找出标志性化学成分,以明确淫羊藿炮制前后黄酮组分的变化规律。方法采用UPLC-Q/TOF-MS技术,在正离子模式下采集淫羊藿生品及炮制品样品数据,并在此基础上根据正交-偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)整体探究9个不同产地、批次的淫羊藿炮制前后化学成分的差异。结果从淫羊藿生品及炮制品中寻找并鉴定出9个标志性化学成分,即8-乙烯-山柰酚、淫羊藿素、淫羊藿次苷I、淫羊藿素-3-O-葡萄糖苷、异戊醇基箭藿苷B、1,3-异戊二烯基朝藿定C、1,3-异戊二烯基-箭藿苷B-7-O-葡萄糖醛酸、3-O-(4-乙酰氧基)鼠李糖-2-O-(间二乙酰氧基)葡萄糖-淫羊藿苷及其同分异构体。结论淫羊藿炮制后黄酮组分结构发生变化,次级糖苷增加,多级糖苷减少,淫羊藿黄酮组分总体向低糖苷组分转化,进一步阐明了淫羊藿加热炮制后黄酮组分的变化规律。

5种血浆游离DNA提取方法的比较

目的分别应用5种方法进行血浆游离DNA的提取,从而判定与筛选最佳的血浆cfDNA提取方法。方法采集19例健康人血浆标本,针对每一样本取350μl血浆分别应用经1次/2次酚-氯仿-异戊醇抽提法,经1次/2次酚-氯仿-异戊醇抽提配合微量DNA助沉剂法和介孔纳米磁珠法5种方法进行cfDNA提取,应用紫外分光法测定提取cfDNA的含量与纯度,应用实时荧光定量PCR方法以提取血浆cfDNA为模板进行扩增反应,以验证提取效果。结果应用5种方法从19例350μl血浆样本中提取的血浆cfDNA含量分别为(6971.43±1934.40)ng/ml、(2196.86±823.94)ng/ml、(12397.14±4197.37)ng/ml、(5568.29±1618.17)ng/ml和(7458.57±3706.83)ng/ml,A260/A280值分别为0.93±0.07、1.09±0.12、1.15±0.05、1.16±0.12和0.89±0.19,RT-qPCR扩增成功率为100%。结论经1次酚-氯仿-异戊醇配合微量DNA助沉剂法提取量大,纯度高,所提取的血浆cfDNA可以为RT-qPCR提供模板,进行后续实验。

Fluka的RNA分离盒

作为Sigma-Aldrich Co Ltd一部分的Fluka Chemicals研制出一种新的RNA分离盒,其Micro Selelct区具有快速、一步提取RNA的功能。这种盒使用guanidiam硫氰酸盐-酚-氯仿提取法,能获得纯RNA,不含DNA且污染蛋白含量低于用guanidium-CsC1法制备的样品。因为没有离心步骤,所以能同时加工大量样品。Fluka介绍说,这种盒可应用于小规模和大规模制备RNA。

阿胶DNA提取方法优化

目的:优选阿胶DNA的提取方法和效率,为其他高蛋白含量产品中DNA的提取提供参考。方法:采用十二烷基苯磺酸钠(SDS)法和十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取阿胶DNA,针对阿胶产品的自身特性,优选SDS法中蛋白酶K作用时间和蛋白洗脱步骤。结果:在同等条件下,SDS法较CTAB法对阿胶DNA的平均提取量高0.022 g·L-1。优化的SDS法为蛋白酶K作用时间1.5 h,使用酚-三氯甲烷-异戊醇洗脱阿胶中蛋白质,重复3次;阿胶DNA的纯度较原工艺提高了48.3%。结论:采用SDS法对阿胶中蛋白的清除作用较CTAB法效率高,优化的SDS法对阿胶DNA的提取适用性较强,为阿胶中动物来源分子生物学检测提供条件。