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东山湾软珊瑚共附生可培养细菌的多样性和产酶活性鉴定 被引量:2
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作者 刘阳 赖其良 +4 位作者 陈华 王建宁 余志伟 王丽萍 邵宗泽 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 2013年第3期396-403,共8页
利用稀释10倍的2216E培养基,采用涂布平板法分离软珊瑚共附生可培养细菌,然后提取各菌株基因组DNA,扩增其16S rRNA基因并测序,通过比对分析确定菌株的分类地位,进而研究东山湾软珊瑚共附生可培养细菌的多样性;同时测定各菌株产淀粉酶、... 利用稀释10倍的2216E培养基,采用涂布平板法分离软珊瑚共附生可培养细菌,然后提取各菌株基因组DNA,扩增其16S rRNA基因并测序,通过比对分析确定菌株的分类地位,进而研究东山湾软珊瑚共附生可培养细菌的多样性;同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶和酯酶能力,进而获得具有产酶活性的细菌资源.结果表明:一共分离到244株细菌,剔除重复后共获得128株不同的细菌.128株细菌包括变形菌纲(86株)、放线菌纲(高G+C革兰氏阳性菌,17株)、厚壁菌门(低G+C革兰氏阳性菌,22株)和拟杆菌纲(3株)4大类群,共包含44个属,72个种,多样性十分丰富,其中有9株细菌的16S rRNA基因相似度低于98.0%,为分离到的潜在新种.同时,128株细菌3种酶活检测的结果表明:16株细菌具有淀粉酶活性,73株细菌具有酯酶活性,23株细菌具有蛋白酶活性,其中15株细菌同时具有3种酶活性.本研究首次报道了东山湾软珊瑚共附生可培养细菌丰富的多样性,同时获得了具有良好的产酶特性菌株资源,具有进一步研究和应用价值. 展开更多
关键词 海洋生物学 软珊瑚 共附生细菌 多样性 酶活鉴定
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人乙醛脱氢酶2的原核表达及其活性的鉴定 被引量:2
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作者 黄娟 王荷花 +3 位作者 张小骥 潘博宇 陈孝平 吴元欣 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期201-206,共6页
商品化的乙醛脱氢酶主要从动物细胞、肝细胞线粒体中提取,其来源受到很大的限制,而且价格昂贵。为了解决乙醛脱氢酶原料有限的问题,利用微生物发酵法获取乙醛脱氢酶。将人乙醛脱氢酶2基因(aldh2)克隆至原核表达载体p ET32a中,构建重组载... 商品化的乙醛脱氢酶主要从动物细胞、肝细胞线粒体中提取,其来源受到很大的限制,而且价格昂贵。为了解决乙醛脱氢酶原料有限的问题,利用微生物发酵法获取乙醛脱氢酶。将人乙醛脱氢酶2基因(aldh2)克隆至原核表达载体p ET32a中,构建重组载体p ET32a-ALDH2。将构建的重组载体转化大肠杆菌E.coli BL21(DE3),用异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)进行诱导,SDS-PAGE电泳结果显示目的蛋白得到大量表达;且对诱导表达条件进行优化。结果显示,在37℃,1.0 mmol/L IPTG诱导表达6 h为最优表达条件。由于目的蛋白几乎都是以包涵体形式表达,为了得到有活性的乙醛脱氢酶,对包涵体变性、复性和纯化进行了研究。试验数据显示,酶的最终得率为14.49 U/L。并通过用Bradford法,测定复性蛋白的浓度约为77μg/m L,进行活性检测表明,该复性蛋白具有乙醛脱氢酶活性,酶活性约为1.449 U/m L。通过构建重组载体p ET32a-ALDH2和优化表达条件,aldh2在原核表达宿主E.coli BL21(DE3)得到大量表达;此外,利用透析复性法得到的复性蛋白酶活性有所提高。 展开更多
关键词 乙醛脱氢2 克隆 条件优化 酶活鉴定
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南大西洋热液区沉积物可培养细菌的多样性分析和产酶活性鉴定 被引量:1
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作者 杜雅萍 李贵珍 +4 位作者 赖其良 董纯明 孙风芹 刘秀片 邵宗泽 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期427-433,共7页
为获得深海可培养微生物资源,利用2216E培养基,采用涂布平板法从南大西洋热液区沉积物中分离可培养细菌,并通过16S rRNA基因进行分类鉴定.同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶、果胶酶、木聚糖酶、褐藻酸酶和脂肪酶(三丁酸甘油酯和吐温80)... 为获得深海可培养微生物资源,利用2216E培养基,采用涂布平板法从南大西洋热液区沉积物中分离可培养细菌,并通过16S rRNA基因进行分类鉴定.同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶、果胶酶、木聚糖酶、褐藻酸酶和脂肪酶(三丁酸甘油酯和吐温80)的能力.分离共获得216株菌株,经16S rRNA基因序列比对,共获得71株不同的菌株.其中包括变形菌纲62株、放线菌纲3株、芽孢杆菌纲2株和拟杆菌纲4株,分布于27个属,41个种.酶活检测结果显示,具有淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶(底物为三丁酸甘油酯)和脂肪酶(底物为吐温80)的产酶细菌分别为18、14、25、32株,供测细菌中未检出产果胶酶、木聚糖酶和褐藻酸酶的菌株.这些菌株为进一步研究开发提供了深海微生物资源. 展开更多
关键词 海洋生物学 细菌 多样性 酶活鉴定 热液区 南大西洋
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多星韭黄酮醇合成酶基因AwFLS1的克隆及功能验证
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作者 陈瑶 张艳 +4 位作者 黄菊 赵鑫 鞠志刚 龚记熠 孙威 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2024年第5期732-739,共8页
黄酮醇合成酶(Flavonol synthase,FLS)可以催化3种二氢黄酮醇形成相对应的黄酮醇,是调控黄酮醇合成的关键酶。以多星韭(Allium wallichii)盛开期花朵为材料,提取RNA并通过反转录获得cDNA,利用PCR技术对AwFLS1基因进行克隆并完成生物信... 黄酮醇合成酶(Flavonol synthase,FLS)可以催化3种二氢黄酮醇形成相对应的黄酮醇,是调控黄酮醇合成的关键酶。以多星韭(Allium wallichii)盛开期花朵为材料,提取RNA并通过反转录获得cDNA,利用PCR技术对AwFLS1基因进行克隆并完成生物信息学分析;利用qRT-PCR技术分析AwFLS1基因在多星韭花朵不同发育时期、不同组织器官的表达,初步推测其功能;构建原核表达载体BL21-pET32a(+)-AwFLS1,制备可溶性重组蛋白并进行体外酶活性鉴定。结果表明,多星韭AwFLS1基因CDS全长为1008 bp,编码335个氨基酸,推测形成一种不稳定且不定位于膜上的非分泌亲水性蛋白,分子量约为38.22 kDa,具有保守的2-酮戊二酸/FeⅡ依赖型双加氧酶结构域。AwFLS1基因在多星韭花朵不同发育时期表达量呈逐渐降低趋势,在小苞期最高;在不同组织器官中,表达量存在显著差异,在叶中表达量最高,根中表达量最低。AwFLS1重组蛋白可在体外催化3种二氢黄酮醇底物形成对应的黄酮醇,底物偏好性有待进一步验证。研究结果证实了多星韭AwFLS1在类黄酮代谢途径中的功能,为解析多星韭黄酮醇合成机制奠定了理论基础,为利用基因工程技术提高药用植物活性成分含量提供了候选的基因资源。 展开更多
关键词 黄酮醇合成 基因克隆 生物信息学分析 载体构建 体外酶活鉴定 多星韭
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2型猪链球菌丝氨酸/苏氨酸磷酸酶重组蛋白的制备及鉴定 被引量:2
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作者 杜骁杰 郭静静 +4 位作者 王晶 李敏 王玲 王长军 潘秀珍 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2014年第2期120-123,共4页
目的链球菌丝氨酸/苏氨酸磷酸酶(serine/threonine phosphotase,STP)是重要的磷酸化信号调控系统成员之一。文中对2型猪链球菌(Streptococcus suis serotype 2,S.suis 2)STP编码基因stp进行原核表达并对纯化蛋白进行酶活测定。方法对S.s... 目的链球菌丝氨酸/苏氨酸磷酸酶(serine/threonine phosphotase,STP)是重要的磷酸化信号调控系统成员之一。文中对2型猪链球菌(Streptococcus suis serotype 2,S.suis 2)STP编码基因stp进行原核表达并对纯化蛋白进行酶活测定。方法对S.suis 2 stp进行生物信息学分析,PCR扩增stp基因片段,构建重组表达载体pET28a::stp。将载体转入E.coli BL21中,经IPTG诱导,Ni2+亲和层析柱纯化重组蛋白,SDS-PAGE和Western blot鉴定,利用磷酸对硝基苯酯(p-nitrophenyl phosphate,pNPP)为底物测定其水解量进而鉴定磷酸酶活性。结果从05ZYH33基因组中PCR扩增到810 bp的片段,经连接获得重组表达载体pET28a::stp;经诱导表达及纯化获得相对分子质量为32000的重组蛋白,该蛋白在Mn2+存在下能够水解pNpp。结论获得纯度较高的STP重组蛋白,该蛋白具有Mn2+依赖的磷酸酶活性,为后续阐明STK/STP磷酸化系统的调控机制打下基础。 展开更多
关键词 2型猪链球菌 链球菌丝氨酸 苏氨酸磷酸 原核表达 酶活鉴定
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集胞藻PCC6803中S2P同源蛋白Slr0643及Sll0862金属蛋白酶活性的体外鉴定 被引量:3
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作者 秦春燕 张旭 陈谷 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期130-135,共6页
【目的】金属蛋白酶S2P在细菌中通过在膜切割转录调控因子、释放δ因子参与胁迫响应是跨膜信号转导的保守机制,但蓝细菌中S2P的功能还未被鉴定,故我们考察集胞藻PCC6803中的S2P同源蛋白Slr0643及Sll0862的金属蛋白酶活性。【方法】以pET... 【目的】金属蛋白酶S2P在细菌中通过在膜切割转录调控因子、释放δ因子参与胁迫响应是跨膜信号转导的保守机制,但蓝细菌中S2P的功能还未被鉴定,故我们考察集胞藻PCC6803中的S2P同源蛋白Slr0643及Sll0862的金属蛋白酶活性。【方法】以pET-30b(+)为载体,分别构建重组质粒pF0643和pF0862,在大肠杆菌BL21(CE3)中诱导表达并纯化Slr0643及Sll0862蛋白,以β-酪蛋白为底物检测重组蛋白的酶活性。【结果】体外酶活实验显示重组表达的Slr0643及Sll0862蛋白有内切蛋白酶活性,且其活性受金属螯合剂o-phenanthroline的抑制。体外酶活的鉴定结果为进一步研究Slr0643和Sll0862的体内酶活和生物学功能奠定了基础。【结论】集胞藻PCC6803中的S2P同源蛋白Slr0643及Sll0862具有金属蛋白酶活性。 展开更多
关键词 集胞藻PCC6803 S2P金属蛋白 Slr0643 Sll0862 原核表达 纯化 体外酶活鉴定
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生菜查尔酮异构酶基因克隆及体外酶活测定
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作者 徐朝阳 张苛苛 +6 位作者 王晨晨 张彬 刘雪 唐金富 周军 刘敏 李大勇 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2135-2143,共9页
查尔酮异构酶(chalcone isomerase,CHI)是植物黄酮类化合物合成的关键限速酶之一。生菜(Lactuca sativa)是全球性的叶用蔬菜,含有丰富的黄酮类物质。本研究在生菜基因组中鉴定到一个编码查尔酮异构酶的基因LsCHI,该基因编码235 aa的蛋白... 查尔酮异构酶(chalcone isomerase,CHI)是植物黄酮类化合物合成的关键限速酶之一。生菜(Lactuca sativa)是全球性的叶用蔬菜,含有丰富的黄酮类物质。本研究在生菜基因组中鉴定到一个编码查尔酮异构酶的基因LsCHI,该基因编码235 aa的蛋白质,具有典型的查尔酮异构酶活性残基位点。系统进化分析显示,LsCHI属于I型查尔酮异构酶。基因表达模式分析表明,LsCHI在生菜的地上部分表达量明显高于地下部分,且在花序中表达量最高。构建原核表达载体pET28a-LsCHI并诱导表达,纯化后获得LsCHI蛋白。体外酶活实验表明,LsCHI蛋白催化柚皮素查尔酮转化为柚皮素。本研究为进一步探讨查尔酮异构酶在生菜中的功能以及在黄酮类化合物生物合成中的作用提供一定基础。 展开更多
关键词 生菜 查尔酮异构 黄酮类化合物 酶活鉴定
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半胱氨酸蛋白酶IdeS的原核表达、纯化及活性鉴定
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作者 许静 赵自叶 +5 位作者 徐进 郭怀祖 郑娟 段树燕 彭晓云 王皓 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期8-14,共7页
酿脓链球菌来源的免疫球蛋白G降解酶(immunoglubulin G-degrading enzyme of Streptococcus pyogenes,IdeS)是一种典型的半胱氨酸水解酶,可以在抗体铰链区的特定位点进行酶切,使IgG水解为完整的F(ab)2片段和Fc片段,由于其独特的酶活特... 酿脓链球菌来源的免疫球蛋白G降解酶(immunoglubulin G-degrading enzyme of Streptococcus pyogenes,IdeS)是一种典型的半胱氨酸水解酶,可以在抗体铰链区的特定位点进行酶切,使IgG水解为完整的F(ab)2片段和Fc片段,由于其独特的酶活特异性和高活性,IdeS可以作为工具酶应用于IgG的亚单位制备、结构分析及表征分析。利用双标签(GST-tag及His6-tag)表达系统在E.coli中高效表达了可溶性重组蛋白酶GST-IdeS-His6,并在IdeS的氨基端与GST之间加上肠激酶酶切位点,以利于标签的去除。再利用亲和层析的纯化方法对目的蛋白进行纯化。使用SDS-PAGE、HPLC-SEC、LC-MS对纯化后的IdeS进行分析和鉴定。结果表明:本系统所表达的蛋白酶IdeS得率高,每1L菌液纯化可获得约25mg纯度为90%以上的蛋白酶IdeS,将此蛋白酶与抗体IgG以1∶100(m/m)比例混合,于37℃反应30min,即可酶切完全。能够满足蛋白质结构分析中对蛋白酶的高质量要求,并且适用于抗体类药物的表征分析。同时,蛋白酶IdeS也可以应用于生物仿制药、生物改良药和新一代抗体以及Fc-融合蛋白的研究。 展开更多
关键词 IdeS 原核表达 纯化 酶活鉴定
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Identification and characterization of the Vibrio anguillarum prtV gene encoding a new metalloprotease 被引量:3
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作者 莫照兰 郭东升 +4 位作者 茅云翔 叶旭红 邹玉霞 肖鹏 郝斌 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2010年第1期55-61,共7页
We cloned and sequenced a prtV-like gene from Vibrio anguillarum M3 strain.This prtV gene encodes a putative protein of 918 amino acids,and is highly homologous to the V.cholerae prtV gene.We found that a prtV inserti... We cloned and sequenced a prtV-like gene from Vibrio anguillarum M3 strain.This prtV gene encodes a putative protein of 918 amino acids,and is highly homologous to the V.cholerae prtV gene.We found that a prtV insertion mutant strain displayed lower gelatinase activity on gelatin agar,lower protease activity against azocasein,and lower activity for four glycosidases.This prtV mutant strain also had increased activity for two esterases in its extracellular products,as analyzed by the API ZYM system.In addition,the prtV mutant strain exhibited decreased growth in turbot intestinal mucus and reduced hemolytic activity on turbot erythrocytes.Infection experiments showed that the LD50 of the prtV mutant strain increased by at least 1 log compared to the wild-type in turbot fish.We propose that prtV plays an important role in the pathogenesis of V.anguillarum. 展开更多
关键词 Vibrio anguillarum: prtV PROTEOLYSIS HEMOLYSIS MUCUS LD50
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Activity identification of anti-caspase-3 mRNA hammerhead ribozyme in both cell-free condition and BRL-3A cells
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作者 徐人欢 刘静 +4 位作者 周霞秋 谢青 金由辛 俞红 廖丹 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2001年第6期46-51,105,共7页
Objective To study the transcription effects and cleavage activities of rat caspase-3 specific hammerhead ribozyme (Rz107) in both cell-free conditions and BRL-3A cells. Methods Rat caspase-3 gene fragment was clone... Objective To study the transcription effects and cleavage activities of rat caspase-3 specific hammerhead ribozyme (Rz107) in both cell-free conditions and BRL-3A cells. Methods Rat caspase-3 gene fragment was cloned into the pGEM-T EASY vector under the T7 promoter control. The 32  P-labeled caspase-3 transcript was the target-RNA. Rz107 genes designed against caspase-3 mRNA were cloned into vector p1.5 between 5'-cis-Rz and 3'-cis-Rz. 32  P-labeled ribozyme transcripts were incubated with target-RNAs at different conditions and autoradiographed after denaturing gel-electrophoresis. Rz107 was electroporated into BRL-3A cells and the Rz107 expression was analyzed by RT-PCR. Results In cell-free conditions, Rz107 was active at 37℃. The optimal temperature was 50℃. The Km and kcat were 14.13?nmol/L and 2.31*min-1 respectively. Intracellular cleavage efficiency of Rz107 was 37%, as analyzed by RT-PCR. This indicated that the design of Rz107 was correct, and Rz107 had the activity of common enzymes.Conclusions Rz107 in cell-free conditions possessed perfect specific catalytic cleavage activity, and it can also cleave the target RNA successfully in cells. The results illustrate the feasibility of ribozyme therapy as a potential alternative approach for treating liver disease caused by apoptosis. 展开更多
关键词 activity identification · ribozyme · BRL-3A · caspase-3 · apoptosis inhibitor
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