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底物特异性的生物催化与酶设计改造 被引量:8
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作者 姜恬 冯旭东 +1 位作者 李岩 李春 《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期606-614,共9页
随着生物产业的发展,生物酶催化发挥着越来越重要的作用。然而,部分酶在应用过程中仍然存在诸多问题,影响了生物催化的进一步发展。本文以酶的底物特异性为切入点,回顾了酶的专一性、高效性和环保性;介绍了酶在药物合成和天然产物改性... 随着生物产业的发展,生物酶催化发挥着越来越重要的作用。然而,部分酶在应用过程中仍然存在诸多问题,影响了生物催化的进一步发展。本文以酶的底物特异性为切入点,回顾了酶的专一性、高效性和环保性;介绍了酶在药物合成和天然产物改性领域的应用以及所遇到的问题;综述了酶的底物特异性改造过程中各种方法的应用,包括化学修饰、非理性和理性设计。化学修饰作为一种直观的修饰方法,通过化学反应对酶分子进行改造;非理性设计是利用易错PCR和DNA Shuffling等手段获得底物特异性提高的突变体;理性设计是基于序列和结构信息对酶分子进行改造。本文从重塑活性口袋提高酶的底物特异性和重塑活性口袋改变酶促反应类型两个方面出发,详述了理性设计改变酶的底物特异性的方法,为酶的特异性改造提供借鉴。 展开更多
关键词 生物催化 酶设计 底物特异性 分子改造
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基于非天然结构组件的人工酶设计与应用 被引量:1
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作者 袁飞燕 于洋 李春 《合成生物学》 2020年第6期685-696,共12页
人工酶是由人类设计得到的具有类似天然酶活性的催化剂。人工酶设计可能成为天然酶研究的补充,揭示天然酶的催化机理,实现天然酶尚未实现的作用。酶由20种天然氨基酸残基以及有限种类的辅因子组成,限制了蛋白质可实现的结构、反应性和... 人工酶是由人类设计得到的具有类似天然酶活性的催化剂。人工酶设计可能成为天然酶研究的补充,揭示天然酶的催化机理,实现天然酶尚未实现的作用。酶由20种天然氨基酸残基以及有限种类的辅因子组成,限制了蛋白质可实现的结构、反应性和功能空间。通过在蛋白质中引入非天然结构组件,包括非天然氨基酸和非天然辅因子,可以得到具有较高催化活性或全新反应性的人工酶。本文总结了引入非天然氨基酸和非天然辅因子构建人工酶和高效制备此类人工酶的策略,并以参与氧化还原反应的人工金属酶为例,探讨构建人工酶的方法,包括通过基因密码子扩展技术引入含生物正交反应基团或金属螯合基团的非天然氨基酸,或通过非共价、共价相互作用在骨架蛋白中引入非天然金属卟啉和其他金属有机催化剂,展望了引入非天然结构组件结合计算设计或代谢工程构建人工酶的新方法,这有助于实现媲美天然酶效率的人工酶的设计与应用。 展开更多
关键词 人工酶设计 非天然氨基酸 非天然辅因子 引入策略 氧化还原反应
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生物信息学在蛋白质(酶)改造及设计中应用的新进展 被引量:2
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作者 孙伟峰 钟文娟 +5 位作者 孙彬 伍圆明 苟赟 林泉秀 陈祥贵 刘义 《西华大学学报(自然科学版)》 CAS 2016年第2期67-71,共5页
蛋白质(酶)的改造和设计是人类面对纷繁复杂自然界的一个重大挑战,是自然进化的突发事件,是人类不断掌握自然规律的必然结果,对人类更深入地了解蛋白质结构与功能,促进生物蛋白工业生产具有重大的意义。本文介绍了新型蛋白质(酶)改造和... 蛋白质(酶)的改造和设计是人类面对纷繁复杂自然界的一个重大挑战,是自然进化的突发事件,是人类不断掌握自然规律的必然结果,对人类更深入地了解蛋白质结构与功能,促进生物蛋白工业生产具有重大的意义。本文介绍了新型蛋白质(酶)改造和设计的新思路和实施过程,以及目前生物酶改造和设计的一些前沿研究团队和研究成果,以期为生物酶或蛋白质的改造与设计提供借鉴。 展开更多
关键词 生物信息学 蛋白质改造 酶设计
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数据驱动的酶反应预测与设计 被引量:2
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作者 曾涛 巫瑞波 《合成生物学》 CSCD 2023年第3期535-550,共16页
酶催化已经在日用化学品、药物和功能材料等生产中得到越来越广泛的应用。酶,作为生物制造业的核心“芯片”,其催化反应的预测与设计是推动传统生物制造走向生物智造发展的核心驱动力之一。然而目前我们对大自然酶催化的了解仍然非常有... 酶催化已经在日用化学品、药物和功能材料等生产中得到越来越广泛的应用。酶,作为生物制造业的核心“芯片”,其催化反应的预测与设计是推动传统生物制造走向生物智造发展的核心驱动力之一。然而目前我们对大自然酶催化的了解仍然非常有限,这严重阻碍了我们对酶催化空间的探索和利用。随着大数据时代的到来,数据驱动的计算模拟已经成为酶催化新空间的挖掘及其功能优化设计的重要手段。各种计算工具和平台的开发正极大地加速并赋能于酶学相关领域的各类实验研究。本文针对酶催化过程中底物、产物和酶的预测及设计方法进行了综述,概述了近年来酶反应相关的数据库,汇总比较了数据驱动的酶反应设计工具,着重介绍了深度学习在该领域的应用,并从数据、模型、算法、平台等多方面展望和探讨了数据驱动型计算方法在酶反应预测与设计领域的发展前景。 展开更多
关键词 大数据 机器学习 催化 酶设计 生物合成
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计算机辅助蛋白结构预测及酶的计算设计研究进展 被引量:6
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作者 崔颖璐 吴边 《广西科学》 CAS 2017年第1期1-6,共6页
随着不可再生资源的日益减少以及化学催化所带来的环境污染问题的日益严重,应用低污染的生物催化技术改造或取代传统化工工艺已经成为可持续发展的研究热点。酶作为一种重要的生物催化剂,具有高效无污染、专一性较强等优点,在化工、医... 随着不可再生资源的日益减少以及化学催化所带来的环境污染问题的日益严重,应用低污染的生物催化技术改造或取代传统化工工艺已经成为可持续发展的研究热点。酶作为一种重要的生物催化剂,具有高效无污染、专一性较强等优点,在化工、医药等领域具有巨大的应用潜力和良好的发展前景。但由于新功能酶的开发速度较慢,使其应用受到严重限制。酶的理性设计是新酶发现的一个重要来源,随着计算机技术的发展,蛋白质结构预测方法和新功能酶计算设计策略得到迅猛的发展,已成为酶功能改造的有力工具和新的研究前沿。本文就蛋白质结构预测方法、新功能酶计算设计方法和策略以及未来发展趋势进行简要介绍和讨论。 展开更多
关键词 生物催化 三维结构预测 计算功能设计
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组合优化算法在酶功能设计中的应用
6
作者 舒茂 王红 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第10期1803-1810,共8页
酶功能设计是指野生型酶如何通过基因突变得到具有特定功能的酶的过程,定点突变是改变酶功能的一种重要途径.从数学的观点看,基于定点突变的酶功能设计是一个NP难的组合优化问题.针对该问题,提出一种最优突变组合的预测模型.首先产生酶... 酶功能设计是指野生型酶如何通过基因突变得到具有特定功能的酶的过程,定点突变是改变酶功能的一种重要途径.从数学的观点看,基于定点突变的酶功能设计是一个NP难的组合优化问题.针对该问题,提出一种最优突变组合的预测模型.首先产生酶基因上每个活性位点的饱和突变模拟数据;然后根据位点间的独立性假设得到多个位点组合突变的作用效果;最后利用模拟退火和遗传算法求解最优的突变组合.仿真实验结果表明,遗传算法在求解该问题时具有更优越的性能.文中模型可为生物实验提供一定指导. 展开更多
关键词 功能设计 定点突变 组合优化 模拟退火 遗传算法
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酶分子设计常用策略和进展
7
作者 苏绍玉 叶秀云 鄢仁祥 《生物信息学》 2023年第4期233-246,共14页
酶分子的生物学功能很大程度上是由其三维空间结构和所处溶剂环境共同决定的。因此,优化酶分子的结构性质以及探索其性质最优的溶剂环境是改善酶分子功能以及进行理性设计的一个可行途径。从实际应用的角度来看,分子设计方法可以为酶工... 酶分子的生物学功能很大程度上是由其三维空间结构和所处溶剂环境共同决定的。因此,优化酶分子的结构性质以及探索其性质最优的溶剂环境是改善酶分子功能以及进行理性设计的一个可行途径。从实际应用的角度来看,分子设计方法可以为酶工程提供一种有效的解决方案。目前,酶分子设计有两个重要的研究方向,包括提高酶分子的催化活力和优化其稳定性。同时,对酶分子设计方法的研究也有助于对蛋白质生物学机理的探索。在近些年的学术界酶分子设计案例中,生物信息学方法得到广泛的应用。本文系统地总结基于生物信息学的酶分子设计方法的背景、策略和一些经典案例。 展开更多
关键词 分子设计 功能分析 性质优化
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饲用复合酶生产中多酶系统的设计与实施
8
《湖南饲料》 1998年第1期9-11,共3页
一、前言自从1975年美国饲料工业首次把微生物酶作为添加剂应用于配合饲料之中,在饲养业方面取得显著效果后,酶作为饲料添加剂正式登上了历史舞台。进入八十年代,国外配合饲料中已普遍使用这类新型饲料添加剂。
关键词 饲用复合 系统设计 饲料 畜禽 特异性
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计算机辅助设计酶
9
《现代化工》 CAS CSCD 北大核心 2004年第10期67-67,共1页
美国和德国的科学家已成功地研制出一种生物催化剂NovoTim,它能进行一种通常是由磷酸丙糖异构酶完成的反应。他们用计算机预测从非活性蛋白质生成合成酶所需要的突变。
关键词 生物催化剂 磷酸丙糖异构 合成 二羟基丙酮磷酸酯 甘油醛-3-磷酸酯 计算机辅助设计
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挖掘教材实验背后的科学思维--以酶的实验设计的教学为例
10
作者 朱满员 《中学生物学》 2023年第3期81-83,共3页
围绕酶的实验设计中反应类型和检测方法的选择及其本质与原理的剖析,充分运用了归纳演绎、评价比较、综合分析、批判反思等科学思维,建构概念,提炼观念,落实了生物学学科核心素养的培养。
关键词 科学思维 活性实验设计
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超声波辅助复合酶法提取枸杞多糖工艺研究 被引量:21
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作者 王杉杉 马韵升 +3 位作者 姚刚 刘圣鹏 虞凤慧 魏征 《中国酿造》 CAS 北大核心 2015年第7期134-137,共4页
以枸杞为试验材料,研究了超声波辅助复合酶(脂肪酶/蛋白酶/纤维素酶/果胶酶=1:1:1:1)提取枸杞多糖的工艺条件。以枸杞多糖得率为评价指标,通过正交试验确定了最佳提取条件为料液比1∶40(g∶m L),提取温度50℃,超声时间50 min,复合酶添加... 以枸杞为试验材料,研究了超声波辅助复合酶(脂肪酶/蛋白酶/纤维素酶/果胶酶=1:1:1:1)提取枸杞多糖的工艺条件。以枸杞多糖得率为评价指标,通过正交试验确定了最佳提取条件为料液比1∶40(g∶m L),提取温度50℃,超声时间50 min,复合酶添加量0.5%。在此最佳条件下,枸杞多糖平均得率为58.910%。 展开更多
关键词 枸杞 多糖 超声波 复合:正交设计
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计算机辅助糖苷酶分子设计与改造研究进展 被引量:4
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作者 程瑞琛 刘艳丽 戴大章 《分子催化》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第5期475-483,共9页
糖苷酶作为一种重要的生物催化剂,在工业生物催化领域有着广阔的应用前景.但天然糖苷酶存在催化活性低、热稳定性和底物选择性差等缺点,严重限制了它在规模化生产中的推广应用.近年,有关糖苷酶催化机制与结构功能关系的研究备受关注,特... 糖苷酶作为一种重要的生物催化剂,在工业生物催化领域有着广阔的应用前景.但天然糖苷酶存在催化活性低、热稳定性和底物选择性差等缺点,严重限制了它在规模化生产中的推广应用.近年,有关糖苷酶催化机制与结构功能关系的研究备受关注,特别是计算机辅助酶设计在相关研究领域发挥着越来越重要的作用.我们综述了糖苷酶分子设计改造过程中应用的计算机辅助方法:包括同源比对、分子对接以及动力学模拟;阐述了这些计算方法在糖苷酶的结构与功能关系解析、酶催化分子机制、酶催化性能改造方面的应用现状.最后,对开发智能精准的计算分析方法的新发展趋势进行了展望. 展开更多
关键词 计算机模拟 糖苷 酶设计 分子工程 结构改造
原文传递
用DREAM技术纠正人工合成基因中的突变 被引量:2
13
作者 朱晓峰 陈锦辉 +3 位作者 张昕 安小平 周育森 童贻刚 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期86-92,共7页
目的:介绍一种简便、有效的定点突变技术。方法:根据突变位点附近的DNA序列推导出氨基酸序列,再以此氨基酸序列进行逆翻译,这样在不改变氨基酸序列的前提下可以得到数目巨大的隐性突变(silent mutations),这些突变中包含大量的限制性内... 目的:介绍一种简便、有效的定点突变技术。方法:根据突变位点附近的DNA序列推导出氨基酸序列,再以此氨基酸序列进行逆翻译,这样在不改变氨基酸序列的前提下可以得到数目巨大的隐性突变(silent mutations),这些突变中包含大量的限制性内切酶位点,选择合适的酶切位点,自酶切位点向两侧合成引物(其中仅一个引物含有突变),用这些引物扩增两侧DNA片段(其中仅一个片段含有突变),然后将这两个片段以相应的内切酶切割后融合即可完成定点突变。结果:用该方法成功地纠正了人工合成的可溶性组织因子基因中两个碱基的缺失,校正了阅读框架,获得了预期的目的基因。结论:该方法简便、有效,突变成功率高,适合于在一般分子生物学实验室使用;该方法能避免了因多轮PCR和合成长引物导致突变的可能性,可作为一种定点突变的替代方法。这种改进的PCR定点诱变技术我们称之为“设计限制酶辅助突变”(Designed Restriction Enzyme Assisted Mutagenesis,DREAM)。 展开更多
关键词 定点突变 聚合链反应 设计限制辅助突变
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Optimization of Wickerhamomyces anomalus Fermentation Conditions for Pectinase Production Based on Wet Processing of Arabica Coffee in Yunnan Province 被引量:2
14
作者 ZHANG Shu-zhu MENG Jin +6 位作者 XUE Xiao-ran KONG De-ting TIE Li-ping HUANG Jia-xiong QIN Shi-wen HE Fei-fei SUO Yu-kai 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2022年第3期30-39,共10页
In order to improve the pectin-degrading efficiency in wet processing of Arabica coffee in Yunnan, Box-Behnken design and single factor experiment were used to optimize the fermentation conditions of five pectinolytic... In order to improve the pectin-degrading efficiency in wet processing of Arabica coffee in Yunnan, Box-Behnken design and single factor experiment were used to optimize the fermentation conditions of five pectinolytic Wickerhamomyces anomalus strains from the fermentation broth of Arabica coffee in Baoshan, Yunnan during wet processing with pectase activity as an indicator. The results showed that the five strains all synthesized pectin lyase(PL), polygalacturonase(PG), and pectin methylesterase(PM).Among them, strain CAP5 had strong ability to produce PG and PL,while strain CAP4 secreted a large amount of PM. Under optimized conditions, the activity of PG, PL, and PM of the five strains came in at 250.17~411.20 U/mL, 12.98~16.55 U/mL, and 208.52~322.83 U/mL,respectively. The four factors of nitrogen source concentration,fermentation time, Mn2+ concentration, and pH value were optimized and the optimal pectinase-producing fermentation conditions for five strains were as follows: peptone 2.2 g/L, fermentation time 30 h, Mn2+ 1.5 mmol/L, and pH 4.3. After fermentation under the optimized conditions, the maximum PG activity of CAP5 amounted to 411.20 U/mL, 114.03% higher than that before optimization.Meanwhile, the PG activity of strains CAP3, CAP4, CAP8, and CAP10 increased by 86.74%, 114.55%, 65.79%, and 66.07%,respectively, and the activity of PL and PM of the five strains rose 150.35%~218.56% and 341.07%~418.52%, respectively. These findings suggested that W. anomalus strains could be used as coffee starter and had great potential for the lysis of pectin. 展开更多
关键词 Wickerhamomyces anomalus COFFEE Wet processing PECTINASE Box–Behnken design
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Optimization of fermentation conditions for P450 BM-3 monooxygenase production by hybrid design methodology 被引量:3
15
作者 LU Yan MEI Le-he 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2007年第1期27-32,共6页
Factorial design and response surface techniques were used to design and optimize increasing P450 BM-3 expression in E, coll. Operational conditions for maximum production were determined with twelve parameters under ... Factorial design and response surface techniques were used to design and optimize increasing P450 BM-3 expression in E, coll. Operational conditions for maximum production were determined with twelve parameters under consideration: the concentration of FeCl3, induction at OD578 (optical density measured at 578 nm), induction time and inoculum concentration. Initially, Plackett-Burman (PB) design was used to evaluate the process variables relevant in relation to P450 BM-3 production. Four statistically significant parameters for response were selected and utilized in order to optimize the process. With the 416C model of hybrid design, response surfaces were generated, and P450 BM-3 production was improved to 57.90×10^-3 U/ml by the best combinations of the physicochemical parameters at optimum levels of 0,12 mg/L FeCl3, inoculum concentration of 2.10%, induction at OD578 equal to 1.07, and with 6.05 h of induction. 展开更多
关键词 Optimization P450 BM-3 Plackett-Burman (PB) design Hybrid design
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Hybrid enzyme catalysts synthesized by a de novo approach for expanding biocatalysis 被引量:3
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作者 Yufei Cao Jun Ge 《Chinese Journal of Catalysis》 SCIE EI CAS CSCD 2021年第10期1625-1633,共9页
The two major challenges in industrial enzymatic catalysis are the limited number of chemical reaction types that are catalyzed by enzymes and the instability of enzymes under harsh conditions in industrial catalysis.... The two major challenges in industrial enzymatic catalysis are the limited number of chemical reaction types that are catalyzed by enzymes and the instability of enzymes under harsh conditions in industrial catalysis.Expanding enzyme catalysis to a larger substrate scope and greater variety of chemical reactions and tuning the microenvironment surrounding enzyme molecules to achieve high enzyme performance are urgently needed.In this account,we focus on our efforts using the de novo approach to synthesis hybrid enzyme catalysts that can address these two challenges and the structure-function relationship is discussed to reveal the principles of designing hybrid enzyme catalysts.We hope that this account will promote further efforts toward fundamental research and wide applications of designed enzyme hybrid catalysts for expanding biocatalysis. 展开更多
关键词 Expanding biocatalysis In situ synthesis Hybrid enzyme catalysts Structure-function relationship Rational design
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Ultrasonic Extraction of Polysaccharides from Laminaria japonica and Their Antioxidative and Glycosidase Inhibitory Activities 被引量:6
17
作者 WAN Peng YANG Xiaoman +4 位作者 CAI Bingna CHEN Hua SUN Huili CHEN Deke PAN Jianyu 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2015年第4期651-662,共12页
In the present study, ultrasonic extraction technique (UET) is used to improve the yield of polysaccharides from Lami- naria japonica (LJPs). And their antioxidative as well as glycosidase inhibitory activities ar... In the present study, ultrasonic extraction technique (UET) is used to improve the yield of polysaccharides from Lami- naria japonica (LJPs). And their antioxidative as well as glycosidase inhibitory activities are investigated. Box-Behnken design (BBD) combined with response surface methodology (RSM) is applied to optimize ultrasonic extraction for polysaccharides. The optimized conditions are obtained as extraction time at 54 min, ultrasonic power at 1050 W, extraction temperature at 80℃ and ratio of material to solvent at 1:50 (g mL-1). Under these optimal ultrasonic extraction conditions, an actual experimental yield (5.75% + 0.3%) is close to the predicted result (5.67%) with no significant difference (P〉0.05). Vitro antioxidative and glycosidase inhibitory activities tests indicate that the crude polysaccharides (LJP) and two major ethanol precipitated fractions (LJP1 and LJP2) are in a concentration-dependent manner. LJP2 (30%-60% ethanol precipitated polysaccharides) possesses the strongest α-glucosidase in- hibitory activity and moderate scavenging activity against hydroxyl radicals (66.09% ±2.19%, 3.0 mg mL-l). Also, the inhibitory activity against a-glucosidase (59.08% ± 3.79%, 5.0 mg mL-1) is close to that of acarbose (63.99% ± 3.27%, 5.0 mg mL-l). LJP 1 (30% ethanol precipitated polysaccharides) exhibits the strongest scavenging activity against hydroxyl radicals (99.80%q-0.00%, 3.0mg mL-1) and moderate a-glucosidase inhibitory activity (47.76%± 1.92%, 5.0 mgmL-1). LJP shows the most remarkable DPPH scav- enging activity (66.20%±0.11%, 5.0mgmL-1) but weakest a-glucosidase inhibitory activity (37.77%±1.30%, 5.0mgmL-1). How- ever, all these LJPs exert weak inhibitory effects against a-amylase. These results show that UET is an effective method for extract- ing bioactive polysaccharides from seaweed materials. LJP 1 and LJP2 can be developed as a potential ingredient in hypoglycemic agents or functional food for the management of diabetes. This study provides scientific evidence and advances in the preparation technology and a hypoglycemic activities evaluation method for seaweed polysaccharides, especially glycosidase inhibition in com- bination with an antioxidative activity evaluation method. 展开更多
关键词 POLYSACCHARIDES Laminariajaponica ultrasonic extraction ANTIOXIDATIVE Α-GLUCOSIDASE a-amylase
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Selection of Relevant Variables to the Enzyme Production on Red Grape Pomace by Solid-State Fermentation
18
作者 Martha Dina Vallejo Maria L. Martin +1 位作者 Pablo Monetta Silvia C. Gouiric 《Journal of Life Sciences》 2012年第6期608-614,共7页
With the aim of to valorise red grape pomace and to reduce its environmental impact, the production of enzymatic preparations appear as an interesting choice. Statistical experimental Plackett-Burman designs were appl... With the aim of to valorise red grape pomace and to reduce its environmental impact, the production of enzymatic preparations appear as an interesting choice. Statistical experimental Plackett-Burman designs were applied for the selection of relevant medium components and culture conditions for cellulase, xylanase, polygalacturonase and tannase production by Aspergillus awamori, in solid-state fermentation on red grape pomace. Ten variables were tested: initial moisture content (IMC), particle size (PS), temperature, initial pH, time of cultivation, mixing (Mx), and additions of: fructose, tannic acid, sodium phosphate, and ammonium sulphate (ASA). Results indicate that the production of each enzyme was affected in a distinct way by the different variables. Also, for each of the enzyme activities considered, IMC must be carefully controlled, and optimized above 65%; PS and Mx, must not be taken into account and ASA must be discarded. The other variables studied, must be selected according to the enzyme activity that will be favored. 展开更多
关键词 Solid-state fermentation enzyme production Aspergillus awamori red grape pomace
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符合工程化需求的生物元件设计 被引量:6
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作者 崔颖璐 吴边 《中国科学院院刊》 CSCD 北大核心 2018年第11期1150-1157,共8页
从合成生物学的角度来认知生命,其本质是可数据化与可设计性。生命体中绝大多数的催化功能是由酶来实现的,因此催化元件是合成生物学中最核心的元件之一。序列决定构象,而构象则决定功能。基于空间结构的催化元件序列数字化设计,是合成... 从合成生物学的角度来认知生命,其本质是可数据化与可设计性。生命体中绝大多数的催化功能是由酶来实现的,因此催化元件是合成生物学中最核心的元件之一。序列决定构象,而构象则决定功能。基于空间结构的催化元件序列数字化设计,是合成生物学研究的重要热点和前沿领域。它既可为开发合成生物学功能器件,特别是全新化学催化器件提供大量原型分子,同时也为发展模块化、工程化调控元件提供设计模板和指导规律。文章针对近年来出现的生物元件,尤其是催化元件的前沿进展进行简要介绍。 展开更多
关键词 分子计算设计 工程 人工金属 底物选择性 热稳定性
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计算机辅助的金属蛋白设计与改造研究进展
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作者 段秉亚 王天元 孙应飞 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期221-230,共10页
金属蛋白是一类含有金属离子的蛋白的统称,具有特殊的催化活性,在生物体中发挥着重要作用,其结构与功能的关系已经得到了较为充分的研究。在此基础上,通过模拟已知金属蛋白的活性位点,利用计算机辅助设计的方法可以人工设计得到具有特... 金属蛋白是一类含有金属离子的蛋白的统称,具有特殊的催化活性,在生物体中发挥着重要作用,其结构与功能的关系已经得到了较为充分的研究。在此基础上,通过模拟已知金属蛋白的活性位点,利用计算机辅助设计的方法可以人工设计得到具有特定结构和功能的金属蛋白。本文综述了近期计算机辅助金属蛋白设计与改造领域的研究进展,概括了引入金属离子结合位点和改造蛋白活性的一般规律,总结了计算机辅助设计的优势以及目前存在的问题和挑战,并展望了此领域未来发展的方向和可能的突破点。 展开更多
关键词 金属蛋白 计算机辅助蛋白设计 的从头设计 基因密码子扩展
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