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光合释氧机理的ABEEM/MM/MD和BS-DFT理论研究
被引量:
1
1
作者
郭宇
姚远
+6 位作者
李慧
赫兰兰
朱尊伟
杨忠志
宫利东
刘翠
赵东霞
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第9期903-913,共11页
建立了S_2态光合释氧络合物(OEC)的原子-键电负性均衡模型(ABEEMσπ)的电荷参数,并使用ABEEM/MM/MD可极化力场的分子动力学模拟和对称性破损的DFT研究了光合作用制造氧气的微观机制.HF/STO-3G(采用此基组的原因请见引用文献)水平下的...
建立了S_2态光合释氧络合物(OEC)的原子-键电负性均衡模型(ABEEMσπ)的电荷参数,并使用ABEEM/MM/MD可极化力场的分子动力学模拟和对称性破损的DFT研究了光合作用制造氧气的微观机制.HF/STO-3G(采用此基组的原因请见引用文献)水平下的电荷拟合结果证明了ABEEMσπ模型计算电荷分布的合理性和高效性.MD模拟显示,S_2态Mn_4CaO_5的双向异构化过程伴随Ca上的水分子W3转移至Mn1(Ⅲ)/Mn_4(Ⅲ),它很可能作为底物水之一,与O_5在S4态结合产生O_2.基于此,考察了全自旋态下两种异构体形式中O-O键形成的自由基耦合机理.BS-DFT计算结果表明,开立方结构的释氧活性大大优于闭立方结构,金属锰和氧自由基的自旋耦合方式也是反应性的决定性因素,同时,OEC的结构灵活性对于S态循环和光合水分解至关重要.
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关键词
光合
释
氧
络合物
原子-键电负性均衡模型
分子动力学模拟
对称性破损密度泛函理论
异构化
底物水结合
释氧机理
自旋态
原文传递
题名
光合释氧机理的ABEEM/MM/MD和BS-DFT理论研究
被引量:
1
1
作者
郭宇
姚远
李慧
赫兰兰
朱尊伟
杨忠志
宫利东
刘翠
赵东霞
机构
辽宁师范大学化学化工学院
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第9期903-913,共11页
基金
中国国家自然科学基金(Nos.21473083
21133005)
辽宁省自然科学基金(No.2014020150)资助~~
文摘
建立了S_2态光合释氧络合物(OEC)的原子-键电负性均衡模型(ABEEMσπ)的电荷参数,并使用ABEEM/MM/MD可极化力场的分子动力学模拟和对称性破损的DFT研究了光合作用制造氧气的微观机制.HF/STO-3G(采用此基组的原因请见引用文献)水平下的电荷拟合结果证明了ABEEMσπ模型计算电荷分布的合理性和高效性.MD模拟显示,S_2态Mn_4CaO_5的双向异构化过程伴随Ca上的水分子W3转移至Mn1(Ⅲ)/Mn_4(Ⅲ),它很可能作为底物水之一,与O_5在S4态结合产生O_2.基于此,考察了全自旋态下两种异构体形式中O-O键形成的自由基耦合机理.BS-DFT计算结果表明,开立方结构的释氧活性大大优于闭立方结构,金属锰和氧自由基的自旋耦合方式也是反应性的决定性因素,同时,OEC的结构灵活性对于S态循环和光合水分解至关重要.
关键词
光合
释
氧
络合物
原子-键电负性均衡模型
分子动力学模拟
对称性破损密度泛函理论
异构化
底物水结合
释氧机理
自旋态
Keywords
oxygen-evolving complex(OEC)
atom-bond electronegativity equalization method(ABEEM)
molecular dynamic(MD) simulation
broken-symmetry density functional theory(BS-DFT)
isomerization
substrate water binding
oxygen evolution
spin state
分类号
O644.1 [理学—物理化学]
TQ116.14 [化学工程—无机化工]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
光合释氧机理的ABEEM/MM/MD和BS-DFT理论研究
郭宇
姚远
李慧
赫兰兰
朱尊伟
杨忠志
宫利东
刘翠
赵东霞
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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