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大豆重组自交系群体NJRISX豆腐和豆乳得率的QTL分析 被引量:8
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作者 张红梅 周斌 +3 位作者 赵团结 邢邯 陈受宜 盖钧镒 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期67-75,共9页
以176个家系组成的苏88-M21×新沂小黑豆重组自交系群体NJRISX为材料,通过MAPMAKER3.0构建了包含131个SSR标记、24个连锁群的遗传图谱,覆盖大豆基因组2044.6cM,标记平均间距15.6cM;经2005和2006两年试验,所获数据按主基因... 以176个家系组成的苏88-M21×新沂小黑豆重组自交系群体NJRISX为材料,通过MAPMAKER3.0构建了包含131个SSR标记、24个连锁群的遗传图谱,覆盖大豆基因组2044.6cM,标记平均间距15.6cM;经2005和2006两年试验,所获数据按主基因加多基因混合遗传模型分析干豆腐、湿豆腐和干豆乳得率的遗传机制;应用软件win QTL Cartographer Version2.5复合区间作图法(CIM)和多区间作图法(MIM)检测QTL。结果显示,在A2连锁群的Satt424-Sat_162区间检测到控制干豆腐和干豆乳得率的主效QTL各1个,qODT-A2-1可以解释15.7%-28.2%的表型变异,qODS-A2-1可以解释30.0%-34.8%的表型变异。检测到湿豆腐得率2个主效QTL,qOWT-A2-1位于A2连锁群的Satt424-Sat_162区间,可以解释20.7%-30.7%的表型变异,qOWT-L位于L连锁群的Satt481-Sat_397区间,可以解释19.0%-27.4%的表型变异。分离分析结果表明,干豆腐和干豆乳得率均属于1对主基因加多基因遗传,湿豆腐得率属于2对非连锁主基因加多基因遗传模型。上述QTL定位结果与分离分析所获的主基因数、贡献率及其和多基因的相对贡献可以相互验证,建议育种中要兼顾主基因和多基因的利用。 展开更多
关键词 大豆 重组自交系(ril) 豆腐 豆乳 得率 分离分析 QTL定位
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应用重组自交系群体定位大豆根重QTL 被引量:12
2
作者 王宏林 喻德跃 +2 位作者 王永军 陈受宜 盖钧镒 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期333-336,共4页
应用构建的NJRIKY(科丰1号×1138-2)大豆重组自交家系群体,对大豆根重QTL进行8次重复的随机区组分析;以该群体所构成的遗传连锁图谱为基础,采用复合区间作图法(Cartographer V.1.21)检测到3个与根重有关的QTL位于连锁群N3-B1和N6-C... 应用构建的NJRIKY(科丰1号×1138-2)大豆重组自交家系群体,对大豆根重QTL进行8次重复的随机区组分析;以该群体所构成的遗传连锁图谱为基础,采用复合区间作图法(Cartographer V.1.21)检测到3个与根重有关的QTL位于连锁群N3-B1和N6-C2上。其中rw1在N3-B1的端距离是66.31cM,位于A520T~ACCCA-GO5区间,rw2和rw3分别在N6-C2的端距离是169.91cM和179.71cM,并与OPW13和ACGCATO6重叠。LOD值分别是10.34、4.01和3.15,可以解释26.3%、9.2%和6.8%的遗传变异。加性效应估计值分别为-0.514、-0.303和-0.260。 展开更多
关键词 大豆根重 QTL定位 重组自交系(ril) 分子遗传图谱
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粳稻十和田/昆明小白谷重组自交系群体主要农艺性状的低温反应 被引量:4
3
作者 徐福荣 余腾琼 +6 位作者 汤翠凤 阿新祥 樊传章 胡意良 张敦宇 董超 戴陆园 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期3437-3447,共11页
【目的】培育重组自交系群体是发掘或定位水稻孕穗开花期耐冷性QTL的重要基础。本研究通过培育"十和田/昆明小白谷"重组自交系群体(RIL),在云南自然低温条件下,分析RIL的株高、穗长、穗伸出度、单株结实率、特定结实率和穗粒... 【目的】培育重组自交系群体是发掘或定位水稻孕穗开花期耐冷性QTL的重要基础。本研究通过培育"十和田/昆明小白谷"重组自交系群体(RIL),在云南自然低温条件下,分析RIL的株高、穗长、穗伸出度、单株结实率、特定结实率和穗粒数等主要农艺性状低温反应,为耐冷性相关性状的遗传分析及QTLs定位等提供研究材料和参考。【方法】以由230个家系组成的"十和田/昆明小白谷"RILs及其亲本为试验材料,2001年在昆明和呈贡,2002年在昆明和剑川,2003年在昆明进行了孕穗开花期耐冷性自然低温鉴定,并对株高、穗长、穗伸出度、单株结实率、特定结实率和穗粒数等性状进行方差和相关分析。【结果】株高、穗伸出度和穗粒数3性状以基因型控制为主,穗长以基因型×环境互作为主,单株结实率和特定结实率以试点环境控制为主。在5种生长环境下,上述6个性状F值为4.019~97.284,株系间均具有极显著差异。在每个试点环境条件下,单株结实率与特定结实率都表现出极显著的正相关关系,相关系数为0.826~0.885;株高与穗长和穗伸出度均表现出极显著的正相关关系。在5种不同生长环境下6个性状变异系数大小顺序依次是特定结实率(66.3%)>穗伸出度(57.4%)>单株结实率(37.2%)>穗粒数(16.2%)>株高(9.6%)>穗长(6.4%);特定结实率、穗伸出度和单株结实率反应最敏感,穗粒数、株高和穗长不太敏感。【结论】本研究培育的"十和田/昆明小白谷"RIL可作为水稻孕穗开花期耐冷性研究的遗传材料;特定结实率、穗伸出度和单株结实率是孕穗开花期自然低温胁迫反应最敏感的性状指标,株高、穗长和穗粒数的变异与孕穗开花期低温胁迫的相关程度还有待进一步研究;在水稻孕穗开花期耐冷性自然鉴定评价中,必须进行多年多点的鉴定评价。 展开更多
关键词 方差分析 相关分析 低温反应 主要农艺性状 重组自交系群体(rils) 粳稻
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不同钾处理下小麦重组自交系群体主要农艺性状的表型变异及其相关分析 被引量:3
4
作者 梁雪 吴春红 +4 位作者 宫晓平 郭营 李斯深 李絮花 孔凡美 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期520-528,共9页
以"山农483×川35050"组合衍生的小麦重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体的131个株系及其亲本为试验材料,于2008年和2009年采用盆栽土培法,对低、中、高钾处理条件下[0、0.1 g(K2O).kg 1、0.3 g(K2O).kg 1]小麦... 以"山农483×川35050"组合衍生的小麦重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体的131个株系及其亲本为试验材料,于2008年和2009年采用盆栽土培法,对低、中、高钾处理条件下[0、0.1 g(K2O).kg 1、0.3 g(K2O).kg 1]小麦RIL群体的株高、单株穗数、穗长、小穗数、穗粒数、千粒重、粒长、粒宽和单株籽粒产量共9个农艺性状进行了鉴定和统计分析。结果表明,在2008—2009年3个钾处理中,9个农艺性状在RIL群体中的表型变异均呈近似正态分布,其遗传力分别为80.6%(株高)、44.7%(单株穗数)、69.9%(穗长)、71.4%(小穗数)、76.0%(穗粒数)、74.8%(千粒重)、64.9%(粒长)、40.0%(粒宽)和33.2%(单株籽粒产量)。株高、小穗数、穗粒数和粒长4个性状的表型变异以基因型控制为主,千粒重和粒宽以基因型×年份互作效应为主,穗长以基因型和基因型×年份互作效应为主,单株穗数以基因型×钾水平互作效应为主,单株籽粒产量的表型变异则主要受基因型×年份×钾水平互作效应控制。在不同钾处理条件下,RIL群体的平均单株籽粒产量与单株穗数、穗长和穗粒数呈极显著或显著正相关,但与千粒重的关系不稳定。千粒重与穗粒数、单株穗数无关或显著负相关(r为0.07~0.28);穗粒数与单株穗数的关系不稳定(r为0.03~0.27)。千粒重、穗粒数和单株穗数在遗传过程中的相关系数较低,彼此具有较强的相对独立性,不存在绝对的顾此失彼现象。单株籽粒产量与小穗数、穗粒数、千粒重、粒长和粒宽间的相关系数受年份间环境差异的影响较大。 展开更多
关键词 小麦 重组自交系(ril) 农艺性状 遗传变异
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利用重组自交系群体进行抗玉米矮花叶病研究 被引量:1
5
作者 刘小红 张红梅 谭振波 《西华师范大学学报(自然科学版)》 2006年第4期412-415,共4页
玉米矮花叶病在世界范围内广泛分布,且危害十分严重.因此正确认识玉米(Zea maysL.)对矮花叶病的抗性机制非常必要.基于此,本研究利用遗传差异较大的Mo17(高感玉米矮花叶病)和黄早四(高抗玉米矮花叶病)为亲本采用一粒传法构建了F9代重组... 玉米矮花叶病在世界范围内广泛分布,且危害十分严重.因此正确认识玉米(Zea maysL.)对矮花叶病的抗性机制非常必要.基于此,本研究利用遗传差异较大的Mo17(高感玉米矮花叶病)和黄早四(高抗玉米矮花叶病)为亲本采用一粒传法构建了F9代重组自交系(Recomb inant inbred line,R IL)分离群体,共256系.通过人工接甘蔗花叶病毒MDB株系(Sugarcane mosaic virus strain MDB,SCMV-MDB)对该分离群体进行了抗病性分析,统计了发病率和病情指数两项指标,根据这两项指标的频数分布图可知:玉米对矮花叶病的抗性主要由主基因控制,但不能排除还有微效基因的可能性. 展开更多
关键词 甘蔗花叶病毒MDB株系(SCMV-MDB) 重组自交系(ril) 玉米(Zea mays L.)
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应用重组自交系群体定位大豆抗虫QTL 被引量:5
6
作者 付三雄 王慧 +3 位作者 吴娟娟 刘华 盖钧镒 喻德跃 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1139-1143,共5页
以大豆组合科丰1号×南农1138-2衍生的重组自交系(RIL)群体为材料构建遗传连锁图谱,利用软件Cartographer V.2.5采用复合区间作图法检测定位大豆抗虫QTL。以斜纹夜蛾幼虫重为抗性指标,检测到1个与抗虫性有关的QTL,位于G20-O连锁群上... 以大豆组合科丰1号×南农1138-2衍生的重组自交系(RIL)群体为材料构建遗传连锁图谱,利用软件Cartographer V.2.5采用复合区间作图法检测定位大豆抗虫QTL。以斜纹夜蛾幼虫重为抗性指标,检测到1个与抗虫性有关的QTL,位于G20-O连锁群上,其端距离为31.91cM,加性效应估计值为0.0408,对性状变异的解释率为11.74%;以蛹重为抗性指标,检测到2个与抗虫性有关的QTL,分别位于G8-D1b+W和G17-L连锁群上,其端距离分别为14.71cM和0.01cM,加性效应估计值分别为-0.0139和0.0103,对性状变异的解释率分别为11.30%和6.36%。 展开更多
关键词 大豆 抗虫 重组自交系(ril) QTL定位
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基于不同遗传群体的大豆分枝数QTL定位分析
7
作者 朱晨博 张东梅 +7 位作者 孙明明 刘淼 袁明 贾晓轲 赵艳强 张艳婷 杨明亮 陈庆山 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1017-1028,共12页
分枝数是大豆重要的农艺性状,与大豆株型结构、产量潜力和适应性密切相关。为挖掘大豆分枝数稳定遗传位点,本研究以多分枝大豆Charleston和主茎型大豆东农594为亲本构建的148份重组自交系群体(RILs)和以主茎型大豆绥农14和多分枝野生大... 分枝数是大豆重要的农艺性状,与大豆株型结构、产量潜力和适应性密切相关。为挖掘大豆分枝数稳定遗传位点,本研究以多分枝大豆Charleston和主茎型大豆东农594为亲本构建的148份重组自交系群体(RILs)和以主茎型大豆绥农14和多分枝野生大豆ZYD00006为亲本构建的213份染色体片段代换系(CSSLs)2个遗传群体为试验材料,采用ICIMapping软件中的完备区间作图法(inclusive composite interval mapping,ICIM)和Win-QTL-Cart 2.5软件中的复合区间作图法(composite interval mapping,CIM),对2018-2021年两个遗传群体的分枝数表型数据进行QTL分析,对QTL置信区间内的候选基因进行挖掘。共检测到17个与大豆分枝数性状相关的QTL位点,其中qBNA2_1和qBNK_1在不同年份和不同群体中稳定出现,分布在第8和9号染色体。根据基因注释等信息对两个QTL区间内的候选基因进行筛选,并通过qRT-PCR预测Glyma.08G053700、Glyma.08G068200、Glyma.08G082400和Glyma.09G167100为调控分枝数的候选基因。本研究结果有助于探明大豆分枝数形成的遗传机制,为大豆理想株型研究提供候选基因与材料支撑。 展开更多
关键词 大豆 重组自交系(ril) 染色体片段代换系(CSSL) 分枝数 QTL 候选基因
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玉米GY220×1145组合RIL群体粗缩病抗性性状的遗传分析 被引量:3
8
作者 石明亮 陆虎华 +8 位作者 薛林 徐辰武 黄小兰 胡加如 陈国清 程玉静 陈小晖 孙权星 彭长俊 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期48-53,共6页
调查玉米GY220×1145组合的RIL群体109个家系(F10;11)及其亲本在2个环境下粗缩病抗性的表型值,运用RIL群体的主基因多基因模型进行遗传分析,探讨玉米粗缩病抗性遗传规律。结果表明:①2008年GY220/1145组合的RILs粗缩病抗性性状的最... 调查玉米GY220×1145组合的RIL群体109个家系(F10;11)及其亲本在2个环境下粗缩病抗性的表型值,运用RIL群体的主基因多基因模型进行遗传分析,探讨玉米粗缩病抗性遗传规律。结果表明:①2008年GY220/1145组合的RILs粗缩病抗性性状的最佳遗传模型为E-1-5模型,即2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因混合遗传;2009年最佳遗传模型为G-0模型,即3对加性-上位性主基因+加性-上位性多基因模型混合遗传。②各主基因效应值不同。③上位性总效应小于主基因总效应。④有单个上位性效应大于单个主基因效应的情形出现。⑤主基因遗传为主,多基因遗传为辅。 展开更多
关键词 玉米 重组自交系(ril) 主基因+多基因遗传模型 遗传分析 玉米粗缩病
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水稻RIL群体苗期耐冷性QTL分析 被引量:16
9
作者 胡莹 王奕众 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2005年第3期211-215,共5页
水稻苗期冷害是影响早春季节和高纬度地区水稻成苗和秧苗生长的重要限制因素之一。为了鉴定控制水稻苗期耐冷性的QTL,研究采用了1个水稻"粳籼交"重组自交系(RIL)群体,结合1张高密度分子遗传图谱,对3叶期幼苗经过10℃冷处理3d... 水稻苗期冷害是影响早春季节和高纬度地区水稻成苗和秧苗生长的重要限制因素之一。为了鉴定控制水稻苗期耐冷性的QTL,研究采用了1个水稻"粳籼交"重组自交系(RIL)群体,结合1张高密度分子遗传图谱,对3叶期幼苗经过10℃冷处理3d、恢复培养2d和4d时的秧苗存活率进行复合区间作图。亲本Lemont和特青的苗期耐冷性具有极显著差异,Lemont的苗期耐冷性很强,而特青对低温敏感。在重组自交系群体中,苗期耐冷性表现为连续变异,在两个方向上均出现大量超亲分离。共检测到5个水稻苗期耐冷性QTL,分别位于水稻1、3、8和11号染色体上,单个QTL对性状的贡献率为7%~21%。其中,4个QTL的增效基因来源于亲本Lemont,另1个QTL的增效基因来源于亲本特青。2个主效QTL(qSCT-3和qSCT-8)分别位于3号染色体标记区间RM282-RM156和8号染色体标记区间RM230-RM264,对性状的贡献率达到或接近20%,被检测到的LOD值显著较高,其增效基因均来自于耐冷性亲本Lemont。研究结果进一步揭示了水稻苗期耐冷性QTL具有丰富的位点多样性,表明耐冷性普遍较强的粳稻是发掘苗期耐冷性优异基因的主要稻种资源。 展开更多
关键词 水稻(Oryza SATIVA L.) 重组自交系(ril) 耐冷性 数量性状基因座位(QTL)
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水稻长穗大粒RIL群体主要品质性状的遗传分析 被引量:2
10
作者 林志强 郑燕 +6 位作者 许旭明 陈仁财 姚小兰 林晶 王乃元 郭玉春 梁康迳 《热带作物学报》 CSCD 2010年第11期1881-1889,共9页
为探讨水稻长穗大粒RILs群体主要品质性状的遗传规律,以自育的一个水稻长穗大粒品系FJCD与籼型三系恢复系IR24配制杂交组合,单粒传法构建含有178个株系的RILs群体(F11)为材料,分别在福州和沙县2个不同生态条件下种植,采用植物数量性状... 为探讨水稻长穗大粒RILs群体主要品质性状的遗传规律,以自育的一个水稻长穗大粒品系FJCD与籼型三系恢复系IR24配制杂交组合,单粒传法构建含有178个株系的RILs群体(F11)为材料,分别在福州和沙县2个不同生态条件下种植,采用植物数量性状的主基因+多基因混合遗传模型及其相应的统计方法,研究水稻主要品质性状的遗传特征。结果表明:除了精米率呈多基因遗传外,其他9个品质性状的最适遗传模型符合主基因+多基因混合遗传。精米率、米粒长、米粒宽、米粒长宽比、透明度、碱消值和直链淀粉含量在不同环境中表现相似的遗传模型;整精米率、垩白度和垩白粒率表现不同的遗传模型。由主基因遗传率为主的有整精米率、米粒长、垩白粒率、垩白度、透明度、碱消值和直链淀粉含量;由多基因遗传率为主的有米粒宽和米粒长宽比。环境因素对碱消值的影响最大。在不同生态条件下稻米主要品质性状间的相关性有82.22%的比率表现较为一致,不因环境的变化而改变其相关性。因此,在稻米品质选择与鉴定时需对整精米率、垩白度和垩白粒率在多个特定环境中进行,才能提高育种效率;对由主基因和多基因遗传率为主的性状需分别采用不同选择方法和育种策略。 展开更多
关键词 水稻 重组自交系(rils) 品质性状 主基因+多基因遗传模型 遗传分析
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基于基因型选择提高QTL作图的精度——以一个RIL群体为例(英文) 被引量:1
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作者 严建兵 汤继华 +5 位作者 孟义江 马西青 滕文涛 Subhash Chander 李林 李建生 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第7期617-624,共8页
以PCR为基础的分子标记以及其他检测技术的发展,使得大规模的标记分析成为现实。这也为通过大群体标记分析,然后基于基因型选择挑选合适的小群体,从而提高QTL定位准确性和精度提供了可能。以一个包含294个家系的重组自交系(RIL)群体为例... 以PCR为基础的分子标记以及其他检测技术的发展,使得大规模的标记分析成为现实。这也为通过大群体标记分析,然后基于基因型选择挑选合适的小群体,从而提高QTL定位准确性和精度提供了可能。以一个包含294个家系的重组自交系(RIL)群体为例,通过基因型选择和随机选择的办法产生了一系列大小不等的亚群体,比较了两类群体QTL定位的结果。分析表明:相同大小的基因型选择群体与随机群体相比性状的表型分布都符合正态分布;标记的偏分离情况也没有明显的差别,都随着群体大小的增大,偏分离的比例也逐渐增大。但同等大小的基因型选择群体比随机群体的交换富集率(CE)要大,且随着选择强度的增大不断增大,如群体大小为270时,CE=1.04,群体大小为30时,CE=1.45。总体上,随着群体大小的增加,不管是随机群体还是选择群体,其QTL检测能力、灵敏性和特异性也随之增加,但选择群体的检测能力、灵敏性和特异性总体上要好于随机群体。当群体大于或等于240时,其QTL检测能力基本没有差别;群体大小大于或等于210时,其QTL检测的灵敏性和特异性也没有什么差别。这也说明:选择强度越大,效果越明显。以QTL1-LOD区间作为衡量QTL精度的一个指标,结果显示所有基因型选择群体都比相同大小随机群体的QTL定位精度高。目前QTL定位研究中,基因型数据较表型数据而言更容易准确获得,因此通过基因型选择可以更好的优化群体结构,减少田间实验的工作量,提高全基因组水平QTL作图的精度,为随后的QTL辅助选择和精细定位以及克隆提供帮助。 展开更多
关键词 数量性状位点(QTL) 基因型选择 重组自交系(ril) QTL定位精度
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不同浓度硫处理小麦RIL群体苗期性状的表型变异及相关分析
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作者 李家丽 蒲艳艳 +1 位作者 于鸿翔 赵岩 《山东农业科学》 2016年第9期27-31,共5页
本试验以"川35050×山农483"组合衍生的小麦重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体及其亲本为材料,采用水培法,对低、中、高浓度硫处理下小麦RIL群体的苗高、最大根长、分蘖数、根条数、根干重、苗干重、总干重... 本试验以"川35050×山农483"组合衍生的小麦重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体及其亲本为材料,采用水培法,对低、中、高浓度硫处理下小麦RIL群体的苗高、最大根长、分蘖数、根条数、根干重、苗干重、总干重、根冠比、根S积累量、苗S积累量、总S积累量、根S利用效率、苗S利用效率和总S利用效率共14个性状进行了测量,并进行了变异分析和相关分析。结果表明,在不同浓度硫处理下,苗期性状的变异都较大。随S浓度增加,根干重、根冠比、根S利用效率、苗S利用效率和总S利用效率5个性状均呈降低趋势,而其余9个性状均呈升高趋势,表明适当提高硫浓度可促进小麦生长,但硫利用效率降低。变异分析表明,在同一环境下双亲各性状的表型值大都表现出较大差异;在RIL群体中,家系间变异系数在不同硫处理下的平均值以S积累量(根S积累量、苗S积累量、总S积累量)的最大,以根条数、根冠比和苗高性状的最小。相关分析表明,干重和S积累量、S利用效率呈极显著正相关,说明可以用干重性状来表征S积累量及S利用效率。 展开更多
关键词 小麦 重组自交系(ril) 苗期 变异分析 相关分析
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利用RIL群体对精米氨基酸含量的QTL定位 被引量:1
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作者 周旭升 何予卿 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第16期3408-3411,3415,共5页
通过一个重组自交系及已构建好的遗传图谱,研究稻米氨基酸含量的QTL定位。结果表明,通过Winqtlcart软件发现多个控制不同氨基酸合成的区段,其中位于第一染色体的RM259~RM580片段影响了多种氨基酸的含量。通过氨基酸含量相关QTL定位的研... 通过一个重组自交系及已构建好的遗传图谱,研究稻米氨基酸含量的QTL定位。结果表明,通过Winqtlcart软件发现多个控制不同氨基酸合成的区段,其中位于第一染色体的RM259~RM580片段影响了多种氨基酸的含量。通过氨基酸含量相关QTL定位的研究,为将来的分子标记辅助选择改良稻米营养品质打下了基础。 展开更多
关键词 水稻 重组自交系(ril) 氨基酸 赖氨酸 数量性状基因座(QTL) 营养品质
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谷子苗期耐低氮相关性状的QTL分析 被引量:1
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作者 秦娜 付森杰 +6 位作者 朱灿灿 代书桃 宋迎辉 魏昕 王春义 叶珍言 李君霞 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第20期3931-3945,共15页
【目的】分析谷子(Setaria italica L.)耐低氮性状相关的QTL,为耐低氮基因的精细定位、克隆及功能研究奠定基础,同时,也为揭示谷子耐低氮遗传机理和培育耐低氮谷子品种提供技术支撑。【方法】以耐低氮品种豫谷28和低氮敏感品种七叶黄为... 【目的】分析谷子(Setaria italica L.)耐低氮性状相关的QTL,为耐低氮基因的精细定位、克隆及功能研究奠定基础,同时,也为揭示谷子耐低氮遗传机理和培育耐低氮谷子品种提供技术支撑。【方法】以耐低氮品种豫谷28和低氮敏感品种七叶黄为亲本构建的包含120个家系的重组自交系(RIL)群体为试验材料,在谷子苗期进行低氮和正常氮处理,并对处理21 d的水培幼苗的苗长、主根长、根干质量、苗干质量、总干质量、叶绿素相对含量、植株含氮量7个性状进行分析。同时,采用复合区间作图法(composite interval mapping,CIM)对耐低氮相关性状进行QTL定位与分析,并对QTL置信区间内的候选基因进行预测。【结果】在低氮和正常氮水平下,RIL群体的耐低氮相关性状均表现为连续正态分布,且呈双向超亲分离现象,符合典型的数量性状遗传特点,适于QTL分析。相关分析表明,苗长与主根长、根干质量、苗干质量、总干质量、叶绿素相对含量呈极显著正相关,主根长与植株含氮量呈显著负相关。共定位到低氮和正常氮水平下与苗长、主根长、根干质量、苗干质量、总干质量、叶绿素相对含量及植株含氮量相关的34个QTL,分布于第1—9染色体,单个QTL表型贡献率为5.15%—52.42%。其中,2种氮水平下共同定位到10个QTL,低氮和正常氮单一环境下分别定位到11和13个QTL。15个为主效QTL,qRDW3、qMRL1.1、qMRL1.2、qSL5和qSPAD15个主效QTL在2种氮水平下均被定位到。共检测到5个QTL重叠区,聚集了2种氮水平下多个性状的QTL,通过基因预测与功能注释,筛选出5个QTL置信区间内6个与氮代谢相关的候选基因,表明氮同化、吸收和利用相关基因极有可能控制了这些基因的表达。【结论】34个QTL分别聚集于9条染色体上的16个QTL簇,基于基因注释,共筛选了6个与谷子氮代谢相关的候选基因,表明不同性状参与到了共同遗传机制,并可通过分子标记辅助选择进行耐低氮有利等位基因的聚合育种。 展开更多
关键词 谷子 重组自交系(ril) 耐低氮 QTL
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利用高密度遗传图谱定位水稻耐低氧萌发QTL 被引量:2
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作者 闫晓霞 朱满山 +5 位作者 王丰 柳武革 李金华 霍兴 黄永相 刘迪林 《广东农业科学》 CAS 2023年第4期13-21,共9页
【目的】耐低氧萌发能力是水稻直播适应性的核心性状之一。采用直播型温带粳稻品种Francis和多穗型优质恢复系R998衍生的重组自交系群体开展水稻耐低氧萌发QTL定位研究,旨在为直播稻品种培育提供新的有价值的基因资源,促进直播稻新品种... 【目的】耐低氧萌发能力是水稻直播适应性的核心性状之一。采用直播型温带粳稻品种Francis和多穗型优质恢复系R998衍生的重组自交系群体开展水稻耐低氧萌发QTL定位研究,旨在为直播稻品种培育提供新的有价值的基因资源,促进直播稻新品种培育和直播稻生产方式的推广。【方法】以28℃淹水10 cm暗培养7 d的水稻胚芽鞘长、芽长和最大根长作为耐低氧萌发能力指标,通过低倍基因组重测序构建含有3106个bin标记的高密度遗传图谱,采用WinQTL Cart 2.5进行QTL扫描。【结果】低氧萌发条件下,Francis的胚芽鞘长度和根长显著高于R998,但是两者芽长差异不显著。构建的遗传图谱总图距为3646.2 cM,其中12号染色体标记数最少,1号染色体标记数最多,分别为174个和389个。遗传图谱的标记平均图距为1.21 cM,各染色体的平均图距范围为0.68~1.84 cM,5 cM以上的Gap比例为0.36%。采用复合区间作图法(CIM),共检测到分布于5条染色体上的6个耐低氧萌发相关QTL。其中,控制胚芽鞘长度、芽长和根长的QTL个数分别为3、1、2个。表型贡献率超过10%的2个QTL是胚芽鞘长度位点qCL9和芽长位点qSL5,二者分别解释群体表型变异的13.39%和10.78%。qCL9与根长QTL qRL2-1的增效等位基因均来自亲本Francis,其余4个QTL的增效等位基因来自亲本R998。6个QTL中有3个暂未见报道,可能是新的QTL。【结论】Francis和R998低氧萌发特性存在显著差异,双亲中均含有耐低氧萌发的增效等位基因。qCL9和qSL5是分别影响胚芽鞘长和芽长的主效QTL,在直播稻分子育种中具有潜在应用价值。 展开更多
关键词 直播稻 重组自交系(ril) 淹水萌发 QTL 低氧 胚芽鞘
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黄瓜果实相关性状QTL定位分析 被引量:33
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作者 苗晗 顾兴芳 +9 位作者 张圣平 张忠华 黄三文 王烨 程周超 张若纬 穆生奇 李曼 张振贤 方智远 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第24期5031-5040,共10页
【目的】果实性状对黄瓜的商品性及产量具有重要影响,对黄瓜果实性状进行QTL定位分析将有助于了解其遗传机制,为黄瓜果实性状改良以及高产、稳产育种提供有益参考和帮助,同时也可为基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】利用华北保护... 【目的】果实性状对黄瓜的商品性及产量具有重要影响,对黄瓜果实性状进行QTL定位分析将有助于了解其遗传机制,为黄瓜果实性状改良以及高产、稳产育种提供有益参考和帮助,同时也可为基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】利用华北保护地类型黄瓜材料9930和欧洲温室类型黄瓜材料9110Gt为亲本构建的遗传图谱,结合不同年份、不同季节4次表型鉴定数据,采用MapQTL4.0软件对12个黄瓜果实相关性状进行多座位QTL模型(MQM)检测。【结果】检测到与8个商品瓜性状相关的QTLs 18个:瓜长Fl(3个)、把长Fsl(1个)、瓜粗Fd(1个)、瓜长/把长Lsr(5个)、瓜长/瓜粗Ldr(1个)、刺色Fsc(4个)、刺密度Fsd(1个)、果瘤大小Fws(2个);与4个种瓜性状(种瓜长Sfl、种瓜粗Sfd、种瓜重Sfw、种瓜果皮颜色Sfc)相关的QTLs 14个。其中表型贡献率≥10.0%的主效QTL有27个,占QTL总数的84.4%,这些QTL大都分布在Chr.5和Chr.6上。各QTLs的LOD值在3.53—42.21,可解释8.4%—73.1%的表型变异。【结论】本研究检测到与12个黄瓜果实性状相关的QTL共32个,其中刺色和果瘤大小2个性状在2006—2009年春秋两季均检测到主效QTL位点,并获得紧密连锁的特异标记(SSR02697、SSR19256、SSR15818、SSR06003、SSR00116、SSR05321、SSR00004、SSR02309),可用于基因精细定位研究。 展开更多
关键词 黄瓜(Cucumis SATIVUS L.) 果实性状 数量性状座位QTL 重组自交系ril 微卫星标记
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玉米GY220×1145组合粗缩病抗性的QTL定位分析 被引量:7
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作者 石明亮 薛林 +12 位作者 梁奎 黄殿成 黄小兰 胡加如 江建华 阮方松 陈国清 陆虎华 程玉静 陈小晖 孙权星 彭长俊 洪德林 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期259-264,共6页
玉米粗缩病是近年严重影响中国玉米生产的病害,研究其QTL定位有助于利用分子标记辅助选择提高玉米粗缩病抗性育种效率。该研究调查了GY220×1145杂交衍生的重组自交系(RIL)群体109个家系(F10∶11)在2个环境下粗缩病的抗感表型值,结... 玉米粗缩病是近年严重影响中国玉米生产的病害,研究其QTL定位有助于利用分子标记辅助选择提高玉米粗缩病抗性育种效率。该研究调查了GY220×1145杂交衍生的重组自交系(RIL)群体109个家系(F10∶11)在2个环境下粗缩病的抗感表型值,结合该组合由272个DNA分子标记构建的遗传连锁图谱,分别采用基于多元回归模型的Win QTL Cartographer 2.5软件的复合区间作图法(CIM)和基于混合线性模型的QTL Network 2.0软件中CIM方法,检测了玉米粗缩病的抗性位点。结果表明:(1)运用Win QTL Cartographer 2.5软件中CIM法,检测到5个抗玉米粗缩病的QTL,解释表型变异的6.9%~17.6%,其中有3个QTL在2个环境下都检测到。5个QTL的加性效应变异幅度为-8.57~11.94。(2)用QTL Network 2.0软件中CIM法,检测到1个控制玉米粗缩病的位点MRDD2-22,解释表型变异的9.0%,加性效应为6.93。在第5连锁群与13连锁群之间存在1对非主效QTL间的互作,解释表型变异的7.4%,互作效应为-7.70。运用多元回归模型和混合线性模型都检测到的位点是MRDD2-22,位于第4染色体长臂g7M7806~n142标记区间,抗性等位基因来自自交系1145,平均加性效应为9.3。MRDD2-22位点可用于分子标记辅助选择进行玉米自交系粗缩病抗性的改良。 展开更多
关键词 玉米 重组自交系(ril) 数量性状基因位点(QTL) 玉米粗缩病
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小麦熟期相关性状的QTL定位分析 被引量:4
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作者 杨睿 杨兴圣 +4 位作者 刘联正 李华 钟欢 王竹林 刘曙东 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期398-403,共6页
抽穗期、始花期和开花期是衡量小麦成熟期的重要指标,对其进行QTL定位并分析其遗传效应,对小麦品种改良至关重要。为了给小麦分子标记辅助选择育种提供参考,本研究以波兰小麦和普通小麦品系中13杂交后代的F8重组自交系为作图群体,构建由... 抽穗期、始花期和开花期是衡量小麦成熟期的重要指标,对其进行QTL定位并分析其遗传效应,对小麦品种改良至关重要。为了给小麦分子标记辅助选择育种提供参考,本研究以波兰小麦和普通小麦品系中13杂交后代的F8重组自交系为作图群体,构建由A染色体组和B染色体组共14个连锁群构成的遗传连锁图谱,包含115个SSR标记位点,图谱全长822.9cM,标记间的平均遗传距离为7.16cM;利用复合区间作图法在两年的环境中检测到分别位于1A、5A、6A、7A、2B、4B、5B和6B染色体上的8个抽穗期QTL,5个始花期QTL和6个开花期QTL。表型变异解释率分别为10.12%~31.51%、11.98%~19.75%和9.64%~20.27%。无论是抽穗期、始花期或开花期,都在4B染色体上检测出了与其相关的QTL,说明4B染色体与小麦成熟期关系密切。另外,在1A染色体上检测出2个控制抽穗期的QTL,对表型变异的贡献率分别达到28.13%和31.48%,说明1A染色体控制小麦抽穗期的作用较大。本研究检测出多个成熟期相关的QTL与连锁标记间的遗传距离仅0.01cM,近乎共分离,可在育种中直接用于成熟期的分子辅助选择。 展开更多
关键词 普通小麦 波兰小麦 重组自交系(ril)群体 成熟期 QTL
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水稻糙米蛋白质含量的QTL定位 被引量:11
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作者 张涛 郑家奎 +4 位作者 吴先军 蒋开锋 杨乾华 陈温福 杨莉 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第1期67-72,共6页
蛋白质含量是评价稻米品质的一项重要指标,控制水稻糙米蛋白质含量的基因位点是数量性状,检测水稻糙米蛋白质含量的QTL并进行遗传效应分析对于水稻品质遗传育种具有重要的意义。本研究以中优早/丰锦重组自交系群体作为定位群体,结合构... 蛋白质含量是评价稻米品质的一项重要指标,控制水稻糙米蛋白质含量的基因位点是数量性状,检测水稻糙米蛋白质含量的QTL并进行遗传效应分析对于水稻品质遗传育种具有重要的意义。本研究以中优早/丰锦重组自交系群体作为定位群体,结合构建的遗传连锁图谱利用Windows QTL Cartogtapher2.0软件,采用复合区间作图法对水稻糙米蛋白质含量进行QTL定位和效应分析。检测到控制糙米蛋白质含量的QTL6个(qPc-3、qPc-6、qPc-7、qPc-8-1、qPc-8-2和qPc-11),分别位于第3、6、7、8和11连锁群上。单个QTL对群体表型变异的贡献率为3.79%~19.41%,联合贡献率为61.07%。在这些QTL的区间中,第8染色体的qPc-8-1基因区域对糙米蛋白质含量具有主效作用。进一步分析和比较了相关研究结果,讨论了研究结果对开展稻米品质遗传育种的意义。 展开更多
关键词 糙米蛋白质含量 数量性状座位(QTL) 重组自交系(ril)
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籼型水稻SSR标记遗传连锁图谱的构建及偏分离分析 被引量:22
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作者 陈庆全 张玉山 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第4期685-689,共5页
水稻是禾本科植物研究的模式植物,水稻分子标记连锁图谱是开展水稻分子生物学研究的重要前提。本研究利用两个优良的籼型水稻恢复系T219和T226衍生的202个重组自交系(RILs)作为作图群体,构建了水稻全基因组连锁图谱。图谱共包括181个简... 水稻是禾本科植物研究的模式植物,水稻分子标记连锁图谱是开展水稻分子生物学研究的重要前提。本研究利用两个优良的籼型水稻恢复系T219和T226衍生的202个重组自交系(RILs)作为作图群体,构建了水稻全基因组连锁图谱。图谱共包括181个简单重复序列(SSR)分子标记,图谱总长1559.6cM。该图谱与多数已经发表的图谱相比具有较好的一致性。同时检测到偏分离标记有33个,除第4、第7和第9染色体没有偏分离标记外,其余染色体都存在偏分离标记,绝大多数偏分离标记偏向于T226。 展开更多
关键词 水稻 遗传连锁图谱 重组自交系(rils) SSR标记
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