花生重组近交系群体的遗传变异与高油种质的创新

花生是世界上食用植物油脂的重要来源之一,提高含油量是花生育种的重要目标。以不同遗传背景的亲本远杂9102与中花5号杂交构建的花生重组近交系（recombined inbreed lines,RIL）群体,进行含油量的系统测试和DNA多样性分析。结果表明,RIL群体家系的含油量范围（50.85%-62.11%）大于两个亲本的差异,最高含油量家系比高油亲本中花5号高5个百分点以上。通过SSR技术分析RIL群体的DNA多样性,发现家系间存在较大的遗传变异,杂交重组产生的超亲高油种质分布在不同类群中,含油量高低与荚果大小和青枯病抗性无明显连锁关系。鉴定获得了3组SSR遗传距离为0、含油量和主要农艺性状相似但青枯病抗性不同的家系。农艺性状和抗病性等鉴定试验筛选出了3份含油量高、农艺性状优良、高抗青枯病的新种质并已进入品种比较试验。

利用微卫星标记评估大豆重组近交系NJRIKY

分离群体的构建及其合理性评估是遗传作图等基因组研究的基础。利用SSRs标记对以科丰1号为母本、南农1138-2为父本构建的大豆RILs群体NJRIKY进行了分析评估。随机选取覆盖大豆基因组的138对SSRs引物对两个亲本进行多态性筛选分析，86对具有多态性，多态率高达约62.32%，共计90个多态位点。进一步利用具多态性的SSRs位点对供试群体的分析表明不仅绝大多数位点符合11分离比，而且各家系也趋于纯合。该RILs群体各家系的基因型组成近似正态分布，是一个适于遗传作图及其他基因组研究理想的RILs群体。

陆地棉重组近交系“中G6”QTL的初步定位

利用2个陆地棉种质材料爱字棉1517与德州047构建了重组近交系。田间调查显示,两亲本田间性状差异多数达到显著或极显著,群体性状数据完全符合受多位点控制的数量性状遗传的特征。分子标记多态性筛选结果表明,两亲本亲缘关系相对较近,利用SSR构建高密度遗传连锁图有一定困难,但对于所定位的QTL位点,其准确性将会有一定程度提高。试验构建了一张包括51个标记分为15个连锁群的遗传连锁图,总长504.05cM,覆盖棉花基因组总长度的10.08%。利用两年田间数据检测到QTL位点15个,其中生育期性状3个,纤维品质性状7个,产量性状5个。与标记图距在1cM以内的QTL位点7个,这将对分子标记辅助育种具有一定的参考价值。

花生重组近交系黄曲霉产毒抗性的变异与相关分析

以不同遗传背景的亲本远杂9102与中花5号杂交构建重组近交系(R IL)群体,进行人工接种和黄曲霉毒素含量测定。结果表明,R IL群体对黄曲霉的产毒抗性存在较大变异,产毒抗性为受亲本加性基因控制的数量性状,而且存在超亲优势,因此利用微效加性基因的累加和互补提高产毒抗性的潜力较大。相关性分析表明,R IL群体中黄曲霉产毒抗性与百果重、含油量、青枯病抗性之间相关性不显著,不存在紧密连锁关系。初步筛选到大果、高油、兼抗青枯病与黄曲霉产毒的优异材料,可以作为进一步育种研究的核心亲本。

普通×爆裂玉米自交系F_7重组近交系植株性状初步分析

利用普通玉米自交系丹232与爆裂玉米自交系N04为亲本构建了含有259个家系的重组近交系(RILs)群体,对株高、穗位高、顶高、顶高/株高、茎粗、穗上位叶片数、叶面积、雄花分枝数、雄穗长9个植株性状初步分析。结果表明:RILs群体各性状分离明显,且基本符合正态分布,表现为数量性状遗传特点,是一个较为理想的作图群体。但RILs系内各性状都存在不同程度的变异,需要增加自交代数。

Siete Cerros×Seri-82重组近交系小麦耐热性的测定

为了筛选耐热性较强的品系,为小麦耐热性遗传研究及耐热品种选育奠定基础,以S iete C erros×Seri-82的66个重组近交系(R IL)小麦叶片为材料,测定了在热锻炼(34℃,48 h)及热胁迫(49℃,60 m in)条件下叶片的相对电导率,以此评价耐热性。结果表明,供试的66个重组近交系中,51个(77.27%)为热敏感近交系,7个(10.61%)为中等耐热近交系,8个(12.12%)为耐热近交系。由此可见,耐热性发生了明显的重组和分离现象,筛选出的耐热近交系可作为耐热性遗传改良以及耐热品种选育的种质材料加以利用。

普通小麦×斯卑尔脱小麦重组近交系群体构建及性状遗传变异分析

以普通小麦3338和斯卑尔脱小麦Altgold为亲本杂交,从F2代开始采用单粒传法构建了含188个重组近交系的群体,对该群体的抽穗期、株高、每穗小穗数、穗长、不孕小穗率、旗叶长、旗叶宽、芒长8个农艺性状的变异进行了分析。结果表明,该重组近交系群体存在着广泛的遗传变异,各性状的变异系数在6.55%到93.38%范围内变化。除芒长、穗长外,其余6个性状都符合或近似正态分布,表现为数量性状遗传特点,是一个适合遗传作图的理想群体。对株高和抽穗期两个性状的遗传参数进行了估计,广义遗传力分别为88%和58%。

籼粳稻区重组近交系孕穗期耐冷性研究

以昆明小白谷和大理早籼杂交培育的孕穗期耐冷性重组近交系(RIL)为材料进行籼粳稻区水稻耐冷性研究。结果表明:(1)籼粳稻区株高、穗下节长、穗长和总粒数均呈数量性状的分布特征.(2)籼粳稻区一些性状间的相关性存在一定的差异,冷凉粳稻区株高与结实率等性状密切关性;相反高温粳稻区穗颈长与穗部4个性状达极显著或显著相关。(3)遗传研究表明对低温和高温均敏感的穗颈长和结实率受主效基因控制,多数弱耐冷单株的耐热性相对较强。

人工合成小麦与普通小麦的重组近交系主要品质性状的初步研究(英文)

为了解人工合成六倍体小麦（Synthetic hexapliod wheats,SHW）导入对普通小麦品质的影响及其潜在利用价值,2004-2005年,对重组近交系群体（人工合成六倍体小麦Syn-CD780×普通小麦品种CY12）的主要品质指标进行了检测。结果表明,籽粒硬度、籽粒蛋白质含量、降落值、湿面筋含量、吸水率、形成时间和稳定时间等7个品质参数的群体平均值都介于两个亲本之间,只有降落值和面团稳定时间2个参数的群体平均值高于Syn-CD780。在131个株系中,有15个株系的综合品质指标较为突出。非遮雨处理的籽粒硬度和吸水率显著低于遮雨处理,而籽粒蛋白质含量、降落值、湿面筋含量和稳定时间等4个品质指标则相反,表明遮雨与否对小麦品质参数的影响较大。Syn-CD780在小麦品质改良上有一定的潜在利用价值。

陆地棉F2与F2：7重组近交系群体图谱比较

为比较棉花F2与重组近交系群体(Recombinant inbred line,RIL)图谱的特点,利用312对在陆地棉品种渝棉1号与中棉所35间表现多态性的SSR引物,分别检测(中棉所35×渝棉1号)F2和F2∶7重组近交系群体的标记基因型.采用相同作图参数分别构建F2和RIL群体图谱.F2和RIL群体图谱在连锁群数、标记数、基因组覆盖率、标记间平均距离以及标记染色体分布顺序一致性上均存在差异.

玉米重组近交系的高质分析

本研究以自交系掖478、丹340及其衍生的345个F_(3:4)重组自交系(RIL)为材料,对该群体穗长(EL)、穗粗(ED)、穗行数(KRE)、行粒数(KRN)、干籽重(DSW)、百粒重(100-GW)等6个重要穗部性状进行方差、相关性分析,正态性检测。结果表明:除100-GW外,其他各性状在345个家系间存在真实的遗传差异;F_(3:4)家系的6个主要穗部性状均表现出数量遗传特点,其平均值接近双亲平均值,有一定数量的双向超亲家系,是一个适合遗传作图的理想群体。

氮肥对玉米高代重组近交系穗部性状的影响

以农大108的152个F8重组自交系为基础材料,通过2点田间试验,在施氮(N+)和不施氮(N-)条件下,对玉米穗长、穗粗等8个穗部性状进行了分析.结果表明,施氮条件下,穗部各性状均明显优于不施氮,差异达极显著水平,F8重组自交系之间穗部各性状也存在显著或极显著差异,但不同性状对氮反应不同,互作效应明显;不同家系穗部性状变异呈正态分布,其中穗粒重在2种氮水平下均表现出超亲分离,各穗部性状变异范围存在较大差异,其中穗重和穗粒重的变异系数较大,而穗粗和轴粗的较小.相关分析表明,当土壤基础氮含量较高时,在施氮与不施氮情况下,穗部各性状之间大多呈正相关关系.

CXA－1重组近交系小鼠生物学特性研究Ⅰ、皮肤移植Ⅱ、毛色基因测试Ⅲ、血液学常规值

对培育成功的ＣＸＡ－１重组近交系小鼠进行部分生物学特性观察：（１）皮肤移植；（２）毛色基因测试；（３）血液学常规值，结果表明，同系异体植皮观察１００天以上，未见排斥现象，毛色基因测试，Ａ、Ｂ位点均为纯合，基因型为ａａｂｂｃｃＤＤ，血液学常规和血清蛋白质均在正常范围内，本观察所得结果可为ＣＸ－１重组近交系小鼠在科学实验中应用提供资料。

陆地棉重组近交系HM188及其性状表现

重组近交系(Recombinant Inbred Line,RIL)群体是利用相应的亲本材料杂交,其杂种后代再经过多次自交而产生的一种作图群体.通常是从F2代开始,采用单子传(single seed descent,SSD)和连续自交的方法建立的群体.

云南水稻品种与美国光壳稻构建的重组近交系的籽粒与糙米相关性状遗传分析

【目的】籽粒和糙米及其相关性状影响稻米品质与产量,而这些性状多属于数量性状。本研究利用合适的分离群体研究它们的遗传规律,以便后期进一步定位、克隆相关基因。【方法】以来源于美国的光壳稻US19和云南高海拔粳稻TJ15为亲本杂交,采用单粒传法构建1个具有90个株系的重组近交系(RILs)群体,考察该群体的籽粒和糙米相关性状,利用相关分析和通径分析等方法研究其遗传规律。【结果】籽粒和糙米长宽及其长宽比和粒重等性状在重组近交系的株系间存在广泛的变异,且有大量的超亲株系产生;各性状均呈连续分布,符合数量性状遗传规律;籽粒的千粒重与籽粒的粒长、粒宽显著相关(P<0.05),籽粒的千粒重和糙米的粒长、粒宽也显著相关(P<0.05)。通径分析表明:影响千粒重最主要的因素是籽粒宽和长宽比;糙米的粒型决定于籽粒的形状,而千粒重是影响糙米率的重要因素。【结论】以美国的光壳稻US19和云南高海拔粳稻TJ15构建的重组近交系群体内存在广泛的遗传重组变异,除粒宽和长宽比性状之外还有其他性状对籽粒千粒重有较大的作用,细长粒型和短圆粒型的水稻均可能有较高的出糙率,为下一步开展籽粒灌浆特性与出糙率关系的研究和创制优异种质材料奠定了基础。

CXA──1重组近交系小鼠的建立和生物学特性研究

为培育成我国首株ＣＸＡ──１重组近交系小鼠。应用国际统一培育设计方法，采用杂交Ｆ２后，再行全同胞兄妹（ｂ×ｓ）交配达Ｆ２０以上。检测微生物和寄生虫符合规定的一级小鼠标准。遗传监测１２条染色体上２５个生化标记位点的测定，基因型均已纯含，符合近交系小鼠特征。与皮肤移植、毛色基因测试、混合淋巴细胞培养及检测结果标准对照，表明该品系小鼠已符合近交系小鼠的培育要求。ＣＸＡ－１系小鼠第７条染色体上Ｈｂｂ（血红蛋白β链）位点的基因型独特，呈国内外实验小鼠中罕见的ＰＰ型。它丰富我国实验小鼠的基因库，在遗传上具有特殊意义。该品系小鼠的受孕率为９１．３４％（３２／３５），每窝平均产仔７．２５只，离乳率８９％～９８％，初生体重１，８±０．１５ｇ，２０日龄１１．４７±１．４３ｇ，３０日龄１５．０７±２．２３ｇ，６０日龄２４．３９±２．６２ｇ。自发肿瘤率低，自发微核率低于２％，单抗腹水量高于ＢＡＬＢ／Ｃ小鼠。

基于基因测序分型技术建立NXB重组近交系小鼠群体模型

为构建NOD/ShiLtJ-C57BL/6J重组近交系(recombinant inbred,RI)(简称为NXB RI)小鼠(Mus musculus)群体模型,以保证亲本基因型覆盖度的均衡及提高其近交效率,本研究采用基因测序分型(genotyping by sequencing,GBS)技术对200只F5代NXB RI小鼠群体进行基因分型测序,然后通过主成分分析、群体间遗传分化系数与遗传距离分析、个体间亲缘关系分析等鉴定小鼠群体亲本基因型覆盖度以及近交程度。测序覆盖F5代NXB RI小鼠36个亚群的200个样本,共测得115634个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,其中41.67%为C57BL/6J纯合位点,27.05%为NOD/ShiLtJ纯合位点,26.79%为杂合位点,SNP位点在所有染色体中均有分布;94.6%的亚群F_(st)值大于0.15,表明大部分的F5代NXB RI小鼠群体之间的遗传结构差异大,分化程度较高;200个NXB RI样本间的状态一致性(identity by state,IBS)距离平均值为0.667,最高为0.925,最低为0.480,可为下一代繁殖筛选提供依据。另外,对F5代200只NXB RI小鼠进行听力和空腹血糖测试,结果表明两种表型的数据均符合正态分布。以上研究结果表明,F5代NXB RI小鼠的亲本基因型覆盖度分布较为均衡,能够保留较多的NXB RI品系,所产生的NXB RI群体可作为一代全新的遗传参考群体,可作为相关复杂遗传性疾病研究模型。

Ptgs2基因在BXD重组近交系小鼠海马组织中的遗传基因组学分析

目的研究前列腺素内过氧化物合酶(Ptgs)2基因在BXD重组近交系(RI)小鼠海马组织中的基因表达变化及表达调控。方法使用基因芯片检测BXD RI小鼠海马组织的基因表达。应用遗传基因组学研究方法进行基因表达数量性状基因座(eQTL)定位分析,寻找Ptgs2基因的上游调控位点、下游调控基因以及协同作用的基因。结果 Ptgs2基因在BXD RI小鼠海马组织中特异性高表达,且控制该基因的eQTL为顺式eQTL,该区域同时还是反式eQTL的富集区,偏相关系数分析发现其中有8个基因为Ptgs2基因的下游调控候选基因。皮尔森相关系数分析显示,BXD RI小鼠基因组中有151个基因与Ptgs2密切相关,其中前20个基因与Ptgs2的遗传相关度到达0.59以上。结论遗传基因组学研究能够有效筛选出Ptgs2基因的上游调控位点、下游调节基因及与之高度协同作用的基因,这部分基因是深入研究Ptgs2基因在多种精神类疾病中分子机制的重要靶点。

Gpnmb基因在BXD重组近交系小鼠眼组织的表达差异和基因调控网络分析

目的研究色素播散综合征(PDS)和色素性青光眼(PG)致病基因糖蛋白神经调节肽B相关基因(Gpnmb)在BXD重组近交系(BXD RI)小鼠眼组织的表达差异及其基因调控网络。方法采用Affymetrix基因芯片检测确定68个品系的BXD RI小鼠眼组织中Gpnmb基因的表达差异。采用基因表达数量性状基因座(eQTL)分析方法,结合GeneNetwork网站上的在线分析工具,研究差异表达的特征,进而构建Gpnmb基因调控网络。结果 Gpnmb在BXD RI眼组织中平均表达水平为10.92,不同品系小鼠表达量存在差异。Gpnmb基因为顺式作用的eQTL,End3基因是其下游候选基因。基于和Gpnmb高度相关基因的基因网络得以构建。结论构建Gpnmb基因调控网络,为PDS和PG发病机制的深入研究提供线索。