缺氧诱导因子1-α参与结直肠癌细胞上皮间质转化及DNA同源重组修复的机制

目的:研究氯化钴(CoCl_2)模拟的细胞体外缺氧微环境对结直肠癌细胞株SW480及Caco-2上皮间质转化及DNA同源重组修复的影响并探究其机制。方法:应用不同浓度的氯化钴(CoCl_2)处理SW480及Caco2细胞72 h后,CCK8法检测细胞增殖能力,划痕及Transwell试验检测细胞的迁移及侵袭能力,流式细胞术(FCM)检测细胞周期及凋亡情况,RT-PCR及Western blotting实验检测细胞内相关基因mRNA及蛋白水平的变化情况。结果:CCK-8实验提示细胞在缺氧后增殖能力明显增加(P<0.05);划痕试验及Transwell侵袭实验提示细胞在缺氧条件下迁移及侵袭能力明显增强(P<0.05);流式细胞术提示细胞在缺氧后被阻滞在S期(P<0.05),凋亡率明显下降(P<0.05);RT-PCR试验表明缺氧后细胞内缺氧诱导因子1-α(hypoxia inducible factor 1 alpha,HIF-1α)及RAD51的mRNA水平上调(P<0.05);Western blotting实验表明在缺氧环境下细胞内HIF-1α表达上调(P<0.05),上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition)相关蛋白:钙黏附蛋白E(E-cadherin)表达下调,波形蛋白(vimentin)及转录抑制因子(snail)表达上调(P<0.05),DNA同源重组相关蛋白BRCA1及RAD51表达上调(P<0.05),PI3K/AKT(磷脂酰肌醇-3-羟激酶)信号通路下游关键信号分子AKT1及共济失调毛细血管扩张症突变基因(ataxia-telangiectasia mutant gene)的编码产物ATM激酶磷酸化水平显著上调(P<0.05)。结论:慢性缺氧环境可促进结直肠癌细胞SW480及Caco-2的增殖、迁移和侵袭能力,抑制凋亡,其机制可能与HIF-1α/PI3K-AKT、HIF1-α/ATM信号通路介导EMT及DNA同源重组修复过程有关。

DNA重组修复试验检测39种药品和化学品诱变性的研究

本文按Kada推荐的方法建立了DNA重组修复试验的3种方法,用于检测药品的遗传毒性和潜在致癌性。 结果表明:基本划线法、低温孵化法和代谢活化法同时检测7种致突变剂,4-硝基喹啉、呋喃基糠酰胺、丝裂霉素C、盐酸氮芥、正定霉素和黄曲霉毒素B1等6种获阳性结果,仅环磷酰胺1种呈阴性结果。低温孵化法比基本划线法敏感性高的多,代谢活化法可做为低温孵化法的补充。

MUS81在DNA修复过程中的作用

DNA常受到内源性细胞代谢产物、外源性化学物质和辐射等损伤。不同修复途径可修复各种损伤的DNA,从而维持基因组的完整性,预防基因突变。近年发现,MUS81基因表达的蛋白质与生物的DNA修复息息相关,在DNA重组修复中起极重要的作用。由于MUS81被发现较晚,目前人们对其研究尚处起步阶段。本文结合近年国内外相关文献报道，综述如下。

RAD51基因突变的首诊卵巢癌患者真实患病体验质性研究

目的:了解DNA重组修复基因(RAD51)突变的首诊卵巢癌(OC)患者真实患病体验,为后续制定干预措施提供理论依据.方法:采用目的抽样的方法抽取2022年1-12月在北京市某三级甲等医院妇科收治的RAD51基因突变、未开展治疗的OC患者作为研究对象,采用现象学方法进行半结构化访谈并现场录音,应用Colaizzi现象学7步分析法对访谈资料进行分析、提炼主题.结果:本研究归纳提炼出3个主题,即积极与消极并存、希望专业指导和行为观念转变.RAD51基因突变OC患者存在明显的负性情绪,也有积极心态养成的趋势,存在自我行为观念转变,有意愿监督易感亲属行为,对OC的认知程度较低,希望得到专业指导.结论:RAD51基因突变OC患者存在负性情绪及认知不足的情况,医护人员应及时关注RAD51基因突变OC患者的负性情绪,促进其积极心态的养成,纠正患者的不良认知.医疗机构应尽早构建OC基因检测咨询体系,为患者提供专业基因检测后续指导.

东方蜜蜂微孢子虫RRDRP的分子特性及系统进化分析

【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein,RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-model等软件分析RRDRP的理化性质、亲水性和三级结构。利用SignalP 4.1 Server、NetPhos 3.1 Server、TMHMM和SOPMA等软件预测RRDRP的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构。使用PSORTⅡ软件预测RRDRP蛋白的亚细胞定位。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种RRDRP的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RRDRP进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP基因含有2928个核苷酸,可编码975个氨基酸,分子质量约11.50 ku,脂溶系数93.58,等电点6.63,分子式C_(5135)H_(8253)N_(1377)O_(1545)S_(34),平均亲水系数为-0.627,可同时定位于细胞核、细胞质、过氧化物酶体和细胞骨架;RRDRP包含55个磷酸化位点、678个α-螺旋、99条延长链、22个β-转角及176个无规则卷曲;RRDRP不含信号肽与跨膜结构域。东方蜜蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子虫、颗粒病微粒子虫等11个物种的RRDRP中均含有5个相同的保守基序(Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 5)。东方蜜蜂微孢子虫与颗粒病微粒子虫在进化树上聚为一支,同源性较高。【结论】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP是潜在的亲水性蛋白和胞内蛋白,在东方蜜蜂微孢子虫以及其他微孢子虫和真菌中高度保守。【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein, RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-model等软件分析RRDRP的理化性质、亲水性和三级结构。利用SignalP 4.1 Server、NetPhos 3.1 Server、TMHMM和SOPMA等软件预测RRDRP的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构。使用PSORT Ⅱ软件预测RRDRP蛋白的亚细胞定位。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种RRDRP的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RRDRP进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP基因含有2 928个核苷酸,可编码975个氨基酸,分子质量约11.50 ku,脂溶系数93.58,等电点6.63,分子式C5135H8253N1377O1545S34,平均亲水系数为-0.627,可同时定位于细胞核、细胞质、过氧化物酶体和细胞骨架;RRDRP包含55个磷酸化位点、678个α-螺旋、99条延长链、22个β-转角及176个无规则卷曲;RRDRP不含信号肽与跨膜结构域。东方蜜蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子虫、颗粒病微粒子虫等11个物种的RRDRP中均含有5个相同的保守基序(Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 5)。东方蜜蜂微孢子虫与颗粒病微粒子虫在进化树上聚为一支,同源性较高。【结论】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP是潜在的亲水性蛋白和胞内蛋白,在东方蜜蜂微孢子虫以及其他微孢子虫和真菌中高度保守。

应用下一代测序技术检测BRCA1/2及同源重组修复通路多基因胚系突变及相关性分析

目的应用下一代测序(next-generation sequencing,NGS)技术检测乳腺癌患者及高风险个体胚系基因突变,分析同源重组修复(homologous recombination repair,HR)通路基因突变状态与乳腺癌临床病理特征的相关性,以补充中国乳腺癌相关基因突变数据库。方法本研究为横断面研究,收集2020年10月至2021年9月就诊于北京大学人民医院并自愿接受基因检测的350例乳腺癌患者和49例乳腺癌高风险个体的全血样本。应用NGS检测32个乳腺癌相关基因的胚系突变情况,统计乳腺癌患者发病年龄、肿瘤家族史、单/双侧肿瘤、Luminal分型(Luminal A型、Luminal B型、HER2过表达型和三阴性乳腺癌)、肿瘤大小、肿瘤转移情况等临床病理特征,采用χ^(2)检验和Fisher精确概率检验分析HR通路基因突变与临床病理特征的相关性。结果在350例乳腺癌患者中,64例(18.3%)携带基因致病突变(包括致病和疑似致病两类突变),包括47例(13.4%)BRCA1/2突变,16例(4.6%)非BRCA1/2基因突变,1例(0.3%)BRCA2和FANCL突变。在49例乳腺癌高风险个体中,7例(14.3%)携带基因致病突变,包括6例(12.3%)BRCA1/2突变,1例(2%)ATM突变。BRCA1/2致病突变与乳腺癌发病年龄相关(18%,8.7%,χ^(2)=6.346,P=0.012),发病年龄≤45岁的乳腺癌患者突变频率较高。HR通路基因突变(包括致病、疑似致病和临床意义不明确的三类突变)与单/双侧肿瘤(49.5%,68.4%,χ^(2)=4.841,P=0.028)和Luminal分型(45.7%,62.2%,32%,60%,χ^(2)=12.004,P=0.007)具有相关性,双侧乳腺癌、Luminal B型和三阴性乳腺癌患者突变频率较高。结论乳腺癌高风险个体BRCA1/2致病突变频率与乳腺癌患者相近,对高风险个体进行BRCA1/2检测有利于指导乳腺癌的筛查和预防。早发性乳腺癌、双侧乳腺癌、Luminal B型和三阴性乳腺癌患者HR通路基因突变频率较高,应及早进行HR通路基因检测,为乳腺癌的诊疗预后和风险评估提供实验室依据。

RDS预测NSCLC患者放化疗疗效的临床观察研究

目的探讨肿瘤DNA重组修复能力评分(RDS)预测非小细胞肺癌(NSCLC)患者放化疗疗效的临床观察。方法回顾性分析我院2019年9月至2021年12月间收治的87例晚期NSCLC患者。根据患者癌组织驱动基因突变阴性或阳性结果,将87例患者分为阴性组(40例)和阳性组(47例),所有患者均采用放化疗联合治疗。比较两组缓解率(ORR)、无病生存期(PFS)、总生存期(OS)及RDS值,采用Pearson法分析RDS值与ORR、PFS、OS的相关性。结果阴性组RDS值(0.41±0.32)低于阳性组(1.53±0.47),ORR(60.00%)高于阳性组(31.91%),PFS(7.67±1.68)及OS(12.23±3.41)个月均长于阳性组(5.11±1.24,9.11±2.79)个月,差异有统计学意义(P<0.05);Pearson法分析结果,RDS值与ORR、PFS、OS均呈负相关性(r2=-0.506、-0.517、-0.469,P均<0.05)。结论放化疗对驱动基因阴性的NSCLC患者预后疗效更优;RDS越低,放化疗对患者病情控制效果越好,患者生存时间越长,RDS可作为NSCLC患者疗效的重要预测因子。