对虾白斑综合症病毒重组cDNA克隆的构建与分析

取经人工注射感染了对虾白斑综合症病毒 40— 45h的凡纳对虾鳃组织 ,分离mRNA ,以mRNA为模板合成双链cDNA ,并克隆于PUC质粒的NotI/SalI位点 ,构建了 1 0 0 0余株对虾感染后期鳃细胞的重组cDNA克隆。重组质粒经PCR鉴定插入片段 ,DNA斑点杂交分析目的片段 ,测定了 2 0株对虾白斑综合症病毒的重组cDNA克隆的末端DNA序列 ,并对其进行了包含存在的开放阅读框架、启动区上游序列、编码产物的特性等分析。结果显示 :PCR产物在0 3— 1 6kb之间 ;大于 1kb的克隆中有 31 8%的克隆为白斑综合症病毒的重组cDNA克隆。已测序的不包含同源序列的 1 3株克隆中含有 1 4个开放阅读框 ,其中 1 1个上游可检出启动子基序 ,4个可检出启动子调制元件。ORF转译产物的特性基序分析显示 :有 2个ORFs可检出锌指基序 ,3个ORFs可检出亮氨酸拉链基序 ,2个ORFs可检出NTP结合基序 ,未检出核定位信号基序。

TIA重组cDNA表达克隆血清抗原基因的识别

目的:应用重组cDNA表达克隆血清学鉴定技术(SEREX)筛选与识别短暂性脑缺血发作(TIA)血清相关性抗原基因.方法:采集19例TIA患者血清,免疫筛选人主动脉内皮细胞cDNA表达文库;对阳性靶抗原行单克隆扩增,经单克隆内切除后转换载体pBluescript SK(+)提取质粒;对包含cDNA插入目的基因片段的质粒进行DNA序列检测,通过NCBI-BLAST同源性检索,鉴定具有免疫原性的独立的TIA重组cDNA表达克隆血清抗原基因.结果:(1)SEREX筛选出172个重组cDNA阳性单克隆;(2)单克隆内切除后获得167个pBluescript质粒,酶切鉴定质粒中均包含有目的基因插入片段;(3)生物信息学分析:识别11个独立的重组cDNA表达克隆抗原基因.(4)基因功能解析:发现matrix metalloproteinase 1(MMP1)、chromobox homolog 1(CBX1)和chromobox homolog 5(CBX5)与TIA和脑梗死(CI)的发生、发展关系密切.结论:应用SEREX技术成功筛选及鉴定出TIA相关靶抗原基因,发现MMP1、CBX1和CBX5可能与短暂性脑缺血发作(TIA)和脑梗死(CI)发生发展有关.