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BvHIPP24介导甜菜应答镉胁迫的作用分析
1
作者
黄烁淇
赵晓鑫
+3 位作者
翟妍
倪渊嵘
鲁振强
刘大丽
《中国农学通报》
2023年第27期110-117,共8页
为探究甜菜重金属相关异戊二烯化植物蛋白24(BvHIPP24)在重金属镉胁迫下的作用机制,本研究利用生信方法预测了该基因上游的顺式作用元件、转录因子和下游的互作蛋白,并分析了它们在镉胁迫下的转录表达特性。结果表明,BvHIPP24含有CGTCA-...
为探究甜菜重金属相关异戊二烯化植物蛋白24(BvHIPP24)在重金属镉胁迫下的作用机制,本研究利用生信方法预测了该基因上游的顺式作用元件、转录因子和下游的互作蛋白,并分析了它们在镉胁迫下的转录表达特性。结果表明,BvHIPP24含有CGTCA-motif、生长素类、光响应、MYB结合、厌氧诱导和水杨酸应答相关的作用元件;转录因子BVRB_2g046790、BVRB_1g021800和BVRB_6g128880可能参与BvHIPP24的转录调控;BvHIPP24的互作蛋白主要包括SOD、NaKR1-like、COX1、MT2、NaKR3、REP1、RCA和LHCP等,它们可能通过与重金属离子结合参与离子运输和维持细胞内环境稳态。转录组测序结果表明BvHIPP24及互作蛋白的转录表达均受到镉胁迫的调控。综上推测,BvHIPP24主要通过上游转录因子的调控表达,直接或间接的与互作蛋白共同介导镉离子螯合及解毒。本研究为进一步揭示甜菜对镉胁迫的响应机制提供了参考。
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关键词
甜菜
重金属
相关
异戊二烯化
植物蛋白
(HIPP)
镉胁迫
蛋白
互作
生物信息学
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职称材料
星星草PutNaKR3基因的克隆及其耐逆性分析
被引量:
1
2
作者
张常旭
冯鹏
+2 位作者
赵宗宝
李莹
常缨
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期50-56,共7页
以NaCl胁迫星星草( Puccinellia tenuiflora )cDNA酵母文库为基础,在星星草中筛选和鉴定 PutNaKR3 基因,对 PutNaKR3 基因及其编码的氨基酸序列进行生物信息学、组织特异性表达和非生物胁迫应答表达分析。结果表明:星星草 PutNaKR3 基...
以NaCl胁迫星星草( Puccinellia tenuiflora )cDNA酵母文库为基础,在星星草中筛选和鉴定 PutNaKR3 基因,对 PutNaKR3 基因及其编码的氨基酸序列进行生物信息学、组织特异性表达和非生物胁迫应答表达分析。结果表明:星星草 PutNaKR3 基因具有组织表达特异性,在根和叶中的表达量明显高于其他组织;过表达 PutNaKR3 基因可增强酵母菌株在盐、碱、氧化和渗透胁迫下的生存能力,同时可提高酵母在部分金属胁迫下的适应能力。
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关键词
星星草
重金属相关植物蛋白
钠钾根缺陷3基因(PutNaKR3)
盐胁迫
非生物胁迫
抗逆育种
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职称材料
伴矿景天SpHIPP45基因特异介导镉耐受性
被引量:
3
3
作者
张培红
张仕泽
+6 位作者
张治远
李明悦
刘奕君
张雪洁
白宁宁
马敏
彭佳师
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期1346-1352,共7页
重金属超积累植物是一种高度特化的植物资源,其高效吸收、转运和耐受重金属的机理解析将极大促进植物修复技术发展和农作物的遗传改良。以仅在中国发现的景天科超积累植物新种伴矿景天(Sedum plumbizincicola)为研究对象,我们克隆了一...
重金属超积累植物是一种高度特化的植物资源,其高效吸收、转运和耐受重金属的机理解析将极大促进植物修复技术发展和农作物的遗传改良。以仅在中国发现的景天科超积累植物新种伴矿景天(Sedum plumbizincicola)为研究对象,我们克隆了一个重金属相关异戊二烯基植物蛋白基因SpHIPP45。表达SpHIPP45的酵母转化子对镉(Cd)的耐受性得到极大增强,但对其他金属离子如锌(Zn)、锰(Mn)、铜(Cu)胁迫的耐受性没有影响。由于SpHIPP45酵母转化子中Cd的含量变化不大,暗示其不是通过减少细胞中Cd含量来介导Cd抗性。进一步研究发现,表达SpHIPP45后,参与内质网应激反应的靶基因在SpHIPP45酵母转化子中转录上调,暗示SpHIPP45可能通过调控内质网应激反应介导Cd耐受性。
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关键词
镉
伴矿景天
内质网应激反应
超积累
植物
重金属
相关
异戊二烯基
植物蛋白
原文传递
茶树‘黄金芽’CsHIPP26.1基因克隆与光响应表达分析
被引量:
2
4
作者
范延艮
刘富浩
+2 位作者
赵秀秀
王域
张丽霞
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1087-1097,共11页
本研究以茶树(Camellia sinensis)‘黄金芽’芽下第二叶为材料,克隆了前期蛋白组学分析获得的一个响应光强变化且在‘黄金芽’中高表达的重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPP)基因,将其命名为CsHIPP26.1, GenBank登记号:MK654903。该基因...
本研究以茶树(Camellia sinensis)‘黄金芽’芽下第二叶为材料,克隆了前期蛋白组学分析获得的一个响应光强变化且在‘黄金芽’中高表达的重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPP)基因,将其命名为CsHIPP26.1, GenBank登记号:MK654903。该基因c DNA全长为465 bp,编码154个氨基酸,蛋白分子质量为17.01 kDa;理论等电点为9.13,无跨膜结构域;共有16个磷酸化位点,位于丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸三个氨基酸残基上;二级结构中含α螺旋28.6%、310螺旋3.9%、β折叠32.5%、β转角6.5%,此外还含无序化区域28.6%,且主要分布于N端和C端;亚细胞定位于核中。以不同遮荫度‘黄金芽’新梢为材料进行实时荧光定量PCR (qRT-PCR)实验,结果显示CsHIPP26.1表达响应光照强度变化,且随光照强度增大表达量增加;将CsHIPP26.1转化苹果(Malus pumila)‘王林’愈伤组织,能助其在强光下正常生长。
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关键词
‘黄金芽’
重金属
相关
异戊二烯化
植物蛋白
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
原文传递
题名
BvHIPP24介导甜菜应答镉胁迫的作用分析
1
作者
黄烁淇
赵晓鑫
翟妍
倪渊嵘
鲁振强
刘大丽
机构
黑龙江大学省高校生化与分子生物学重点实验室/黑龙江大学生命科学学院
国家甜菜种质中期库
黑龙江省普通高等学校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学现代农业与生态环境学院
出处
《中国农学通报》
2023年第27期110-117,共8页
基金
黑龙江省自然科学基金项目“BvHIPP24基因在能源甜菜重金属镉污染生物修复中的分子机制研究”(LH2019C057)
甜菜种质资源精准鉴定(19230709)
+2 种基金
普查收集甜菜种质资源鉴定评价与编目入库项目(19230801)
国家糖料产业技术体系项目“甜菜种质资源鉴定与新种质创制”(CARS-170102)
黑龙江省教育厅基本科研业务费“镉胁迫下能源甜菜金属伴侣蛋白BvHIPPs家族成员的应答机制和功能研究”(2022-KYYWF-1070)。
文摘
为探究甜菜重金属相关异戊二烯化植物蛋白24(BvHIPP24)在重金属镉胁迫下的作用机制,本研究利用生信方法预测了该基因上游的顺式作用元件、转录因子和下游的互作蛋白,并分析了它们在镉胁迫下的转录表达特性。结果表明,BvHIPP24含有CGTCA-motif、生长素类、光响应、MYB结合、厌氧诱导和水杨酸应答相关的作用元件;转录因子BVRB_2g046790、BVRB_1g021800和BVRB_6g128880可能参与BvHIPP24的转录调控;BvHIPP24的互作蛋白主要包括SOD、NaKR1-like、COX1、MT2、NaKR3、REP1、RCA和LHCP等,它们可能通过与重金属离子结合参与离子运输和维持细胞内环境稳态。转录组测序结果表明BvHIPP24及互作蛋白的转录表达均受到镉胁迫的调控。综上推测,BvHIPP24主要通过上游转录因子的调控表达,直接或间接的与互作蛋白共同介导镉离子螯合及解毒。本研究为进一步揭示甜菜对镉胁迫的响应机制提供了参考。
关键词
甜菜
重金属
相关
异戊二烯化
植物蛋白
(HIPP)
镉胁迫
蛋白
互作
生物信息学
Keywords
sugar beet
heavy metal-associated isoprenylated plant protein(HIPP)
cadmium stress
protein interaction
bioinformatics
分类号
S566.3 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
星星草PutNaKR3基因的克隆及其耐逆性分析
被引量:
1
2
作者
张常旭
冯鹏
赵宗宝
李莹
常缨
机构
东北农业大学生命科学学院
东北林业大学盐碱地生物资源环境研究中心
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期50-56,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31570189)
文摘
以NaCl胁迫星星草( Puccinellia tenuiflora )cDNA酵母文库为基础,在星星草中筛选和鉴定 PutNaKR3 基因,对 PutNaKR3 基因及其编码的氨基酸序列进行生物信息学、组织特异性表达和非生物胁迫应答表达分析。结果表明:星星草 PutNaKR3 基因具有组织表达特异性,在根和叶中的表达量明显高于其他组织;过表达 PutNaKR3 基因可增强酵母菌株在盐、碱、氧化和渗透胁迫下的生存能力,同时可提高酵母在部分金属胁迫下的适应能力。
关键词
星星草
重金属相关植物蛋白
钠钾根缺陷3基因(PutNaKR3)
盐胁迫
非生物胁迫
抗逆育种
Keywords
Puccinellia tenuiflora
heavy metal-associated plant proteins
sodium potassium root defective3 ( PutNaKR3 )
salt stress
abiotic stress
strees resistance breeding
分类号
Q948.11 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
伴矿景天SpHIPP45基因特异介导镉耐受性
被引量:
3
3
作者
张培红
张仕泽
张治远
李明悦
刘奕君
张雪洁
白宁宁
马敏
彭佳师
机构
湖南科技大学生命科学与健康学院
湖南科技大学经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室
湖南科技大学重金属污染土壤生态修复与安全利用湖南省高校重点实验室
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期1346-1352,共7页
基金
湖南省教育厅资助科研项目(20K055)
国家自然科学基金(U20A2024)。
文摘
重金属超积累植物是一种高度特化的植物资源,其高效吸收、转运和耐受重金属的机理解析将极大促进植物修复技术发展和农作物的遗传改良。以仅在中国发现的景天科超积累植物新种伴矿景天(Sedum plumbizincicola)为研究对象,我们克隆了一个重金属相关异戊二烯基植物蛋白基因SpHIPP45。表达SpHIPP45的酵母转化子对镉(Cd)的耐受性得到极大增强,但对其他金属离子如锌(Zn)、锰(Mn)、铜(Cu)胁迫的耐受性没有影响。由于SpHIPP45酵母转化子中Cd的含量变化不大,暗示其不是通过减少细胞中Cd含量来介导Cd抗性。进一步研究发现,表达SpHIPP45后,参与内质网应激反应的靶基因在SpHIPP45酵母转化子中转录上调,暗示SpHIPP45可能通过调控内质网应激反应介导Cd耐受性。
关键词
镉
伴矿景天
内质网应激反应
超积累
植物
重金属
相关
异戊二烯基
植物蛋白
Keywords
cadmium
Sedum plumbizincicola
endoplasmic reticulum stress response
hyperaccumulator
heavy metal-associated isoprenylated plant protein
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
X173 [环境科学与工程—环境科学]
原文传递
题名
茶树‘黄金芽’CsHIPP26.1基因克隆与光响应表达分析
被引量:
2
4
作者
范延艮
刘富浩
赵秀秀
王域
张丽霞
机构
山东农业大学园艺科学与工程学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1087-1097,共11页
基金
山东省“双一流”奖补资金(SYL2017YY03)
山东省现代农业产业技术体系创新团队项目(SDAIT-19-05)。
文摘
本研究以茶树(Camellia sinensis)‘黄金芽’芽下第二叶为材料,克隆了前期蛋白组学分析获得的一个响应光强变化且在‘黄金芽’中高表达的重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPP)基因,将其命名为CsHIPP26.1, GenBank登记号:MK654903。该基因c DNA全长为465 bp,编码154个氨基酸,蛋白分子质量为17.01 kDa;理论等电点为9.13,无跨膜结构域;共有16个磷酸化位点,位于丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸三个氨基酸残基上;二级结构中含α螺旋28.6%、310螺旋3.9%、β折叠32.5%、β转角6.5%,此外还含无序化区域28.6%,且主要分布于N端和C端;亚细胞定位于核中。以不同遮荫度‘黄金芽’新梢为材料进行实时荧光定量PCR (qRT-PCR)实验,结果显示CsHIPP26.1表达响应光照强度变化,且随光照强度增大表达量增加;将CsHIPP26.1转化苹果(Malus pumila)‘王林’愈伤组织,能助其在强光下正常生长。
关键词
‘黄金芽’
重金属
相关
异戊二烯化
植物蛋白
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
Keywords
’Huangjinya’
heavy metal–associated isoprenylated plant protein
gene cloning
bioinformatics analysis
expression analysis
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
BvHIPP24介导甜菜应答镉胁迫的作用分析
黄烁淇
赵晓鑫
翟妍
倪渊嵘
鲁振强
刘大丽
《中国农学通报》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
星星草PutNaKR3基因的克隆及其耐逆性分析
张常旭
冯鹏
赵宗宝
李莹
常缨
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
下载PDF
职称材料
3
伴矿景天SpHIPP45基因特异介导镉耐受性
张培红
张仕泽
张治远
李明悦
刘奕君
张雪洁
白宁宁
马敏
彭佳师
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
原文传递
4
茶树‘黄金芽’CsHIPP26.1基因克隆与光响应表达分析
范延艮
刘富浩
赵秀秀
王域
张丽霞
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
原文传递
已选择
0
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