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陕西7个毛樱桃自然居群遗传多样性的SSR评价
被引量:
6
1
作者
何恒流
蔡宇良
+3 位作者
高天翔
李彬
宛甜
王玉
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2015年第6期193-198 204,共7页
【目的】研究陕西野生毛樱桃自然居群的遗传多样性,为科学保存和利用陕西野生毛樱桃资源提供理论依据。【方法】以陕西野生毛樱桃的7个自然居群140份样本为材料,用SSR分子标记技术研究其遗传多样性和遗传结构。【结果】用10对SSR引物...
【目的】研究陕西野生毛樱桃自然居群的遗传多样性,为科学保存和利用陕西野生毛樱桃资源提供理论依据。【方法】以陕西野生毛樱桃的7个自然居群140份样本为材料,用SSR分子标记技术研究其遗传多样性和遗传结构。【结果】用10对SSR引物从7个毛樱桃自然居群中共检测出92个等位基因,各引物扩增的条带数在6~14个。居群多态位点比率(PPL)为100%,Shannon’s 信息指数(I)平均值为1.280,Nei’s 基因多样性指数(H)平均值为0.655,可观察杂合度(Ho)平均值为0.584,期望杂合度(He)平均值为0.672,表明陕西7个毛樱桃自然居群具有较高的遗传多样性水平。居群的基因分化系数Fst=0.181,表明陕西野生毛樱桃的遗传变异主要存在于居群(81.9%)内,遗传分化居群内高于居群间,基于Fst测得基因流Nm为1.128。利用UPGMA对7个毛樱桃自然野生居群进行聚类,可以分为3类:麟游(LY)、绣房(XF)、华阴(HY)、哭泉(KQ)归为第1类,小峪(XY)为第2类,鹦鸽(YG)和青化(QH)归为第3类。【结论】李属植物SSR引物在毛樱桃上能够有效的转移利用,陕西毛樱桃自然居群具有较高的遗传多样性水平,其中华阴居群遗传多样性水平最高,遗传分化居群内高于居群间,7个居群可聚为3大类。
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关键词
野生毛樱桃
SSR
遗传多样性
遗传结构
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职称材料
题名
陕西7个毛樱桃自然居群遗传多样性的SSR评价
被引量:
6
1
作者
何恒流
蔡宇良
高天翔
李彬
宛甜
王玉
机构
西北农林科技大学园艺学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2015年第6期193-198 204,共7页
基金
"十二五"国家科技计划项目(2013BAD02B00)
唐仲英果树育种基金项目(2009YZ033)
文摘
【目的】研究陕西野生毛樱桃自然居群的遗传多样性,为科学保存和利用陕西野生毛樱桃资源提供理论依据。【方法】以陕西野生毛樱桃的7个自然居群140份样本为材料,用SSR分子标记技术研究其遗传多样性和遗传结构。【结果】用10对SSR引物从7个毛樱桃自然居群中共检测出92个等位基因,各引物扩增的条带数在6~14个。居群多态位点比率(PPL)为100%,Shannon’s 信息指数(I)平均值为1.280,Nei’s 基因多样性指数(H)平均值为0.655,可观察杂合度(Ho)平均值为0.584,期望杂合度(He)平均值为0.672,表明陕西7个毛樱桃自然居群具有较高的遗传多样性水平。居群的基因分化系数Fst=0.181,表明陕西野生毛樱桃的遗传变异主要存在于居群(81.9%)内,遗传分化居群内高于居群间,基于Fst测得基因流Nm为1.128。利用UPGMA对7个毛樱桃自然野生居群进行聚类,可以分为3类:麟游(LY)、绣房(XF)、华阴(HY)、哭泉(KQ)归为第1类,小峪(XY)为第2类,鹦鸽(YG)和青化(QH)归为第3类。【结论】李属植物SSR引物在毛樱桃上能够有效的转移利用,陕西毛樱桃自然居群具有较高的遗传多样性水平,其中华阴居群遗传多样性水平最高,遗传分化居群内高于居群间,7个居群可聚为3大类。
关键词
野生毛樱桃
SSR
遗传多样性
遗传结构
Keywords
Prunus tomentosa
SSR
genetic diversity
genetic structure
分类号
S [农业科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陕西7个毛樱桃自然居群遗传多样性的SSR评价
何恒流
蔡宇良
高天翔
李彬
宛甜
王玉
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2015
6
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