金冕草(Paspalum notatum)盐胁迫转录组差异性分析

为揭示金冕草在盐胁迫处理下基因表达谱的变化,在缺乏参考基因组的情况下采用高通量Illumina Hiseq^TM 4000测序技术对金冕草进行转录组测序,并对测序数据进行分析,探究金冕草响应盐胁迫的适应机制。结果表明:盐胁迫24 h上调和下调的DEGs(Differential-expressed genes)分别有6 707个和1 972个;48 h分别有8 652个和1 747个。在GO富集分析中,差异基因主要存在于细胞成分、生物进程、结合和催化活性中。KEGG分析结果表明,差异基因主要参与核糖体、植物激素信号转导、氨基酸生物合成等代谢途径。通过GO和KEGG显著性富集分析得知,NaCl胁迫下差异表达上调的基因数明显多于下调的基因表达数。q RT-PCR验证了DEGs的表达趋势与RNA-Sep测序分析结果一致,证明了RNA-Sep结果的准确性。本研究为金冕草耐盐分子机制研究提供了参考依据。