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草鱼的微卫星亲权鉴定
被引量:
8
1
作者
任昆
白俊杰
+2 位作者
樊佳佳
全迎春
于凌云
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期1367-1371,共5页
【目的】从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础。【方法】利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F0)及其子代(F1)的基因型,以Cervus3.0软件进行亲...
【目的】从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础。【方法】利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F0)及其子代(F1)的基因型,以Cervus3.0软件进行亲权鉴定,并统计微卫星位点的等位基因数(Na)、多态信息含量(PIC)、观测杂合度(H0)和期望杂合度(He)等;最后通过模拟分析和试验验证,评估8个微卫星位点最多可鉴定的亲本数及其与鉴定率、置信度之间的关系。【结果】8个微卫星位点中,当两个亲本基因型未知时,单个亲本排除率(E-1P)介于0.342-0.668,平均值为0.520;当一个亲本基因型已知时,另一个亲本的排除率(E-2P)介于0.521-0.802,平均值为0.681;一对亲本组合的亲权排除率(E-PP)介于0.711-0.937,平均值为0.847。以95%置信水平和100%鉴定率为标准,模拟分析及试验验证结果表明,所选择的8个微卫星位点最多可以鉴定598个已知性别的亲本或431个未知性别的亲本。【结论】所选的H118、H137、H165、H148、4703、C2489、H57、H81等8对微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取草鱼系谱信息。
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关键词
草鱼
微卫星标记
亲权鉴定
系谱信息
置信度
亲权排除率
鉴别准确率
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题名
草鱼的微卫星亲权鉴定
被引量:
8
1
作者
任昆
白俊杰
樊佳佳
全迎春
于凌云
机构
中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室
上海海洋大学水产与生命学院
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期1367-1371,共5页
基金
国家大宗淡水鱼产业技术体系建设项目(CARS-46-03)
国家高技术研究发展计划项目(2011AA100403)
国家科技支撑计划项目(2012BAD26B02)
文摘
【目的】从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础。【方法】利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F0)及其子代(F1)的基因型,以Cervus3.0软件进行亲权鉴定,并统计微卫星位点的等位基因数(Na)、多态信息含量(PIC)、观测杂合度(H0)和期望杂合度(He)等;最后通过模拟分析和试验验证,评估8个微卫星位点最多可鉴定的亲本数及其与鉴定率、置信度之间的关系。【结果】8个微卫星位点中,当两个亲本基因型未知时,单个亲本排除率(E-1P)介于0.342-0.668,平均值为0.520;当一个亲本基因型已知时,另一个亲本的排除率(E-2P)介于0.521-0.802,平均值为0.681;一对亲本组合的亲权排除率(E-PP)介于0.711-0.937,平均值为0.847。以95%置信水平和100%鉴定率为标准,模拟分析及试验验证结果表明,所选择的8个微卫星位点最多可以鉴定598个已知性别的亲本或431个未知性别的亲本。【结论】所选的H118、H137、H165、H148、4703、C2489、H57、H81等8对微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取草鱼系谱信息。
关键词
草鱼
微卫星标记
亲权鉴定
系谱信息
置信度
亲权排除率
鉴别准确率
Keywords
Ctenopharyngodon idellus
micro-satellite marker
parentage identification
pedigree information
confidence level
parentage exclusion probability
identification accuracy
分类号
S965.112 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
草鱼的微卫星亲权鉴定
任昆
白俊杰
樊佳佳
全迎春
于凌云
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
8
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