建立6种近交系大鼠遗传质量检测及品系鉴别的单核苷酸多态性组合

目的 筛选出均匀分布在大鼠染色体上的单核苷酸多态性(SNP)位点,建立常用近交系大鼠遗传质量检测及品系鉴别方法。方法 在文献中获得SNP共141个,利用Ensembl数据库中获取的信息筛选出在BN、F344、GK、LEW、SHR和WKY 6种大鼠品系中呈现多态性的SNP位点,并从中优化出均匀分布各染色体且包含品系特异性SNP的最佳位点组合。通过PCR扩增技术和Sanger测序方法对组合位点用于常用近交系大鼠遗传质量检测和品系鉴别的效果进行验证。结果 优化出了在各品系内表现单态性、品系间呈多态性的40个SNP标记。其中包含可以用于品系鉴别的特异性位点:4个BN大鼠特异性位点,3个F344大鼠特异性位点,2个GK大鼠特异性位点,2个LEW大鼠特异性位点和1个SHR大鼠特异性位点。分别利用BN、F344、LEW、SHR和WKY大鼠的DNA混合样本对优化出的40个位点进行验证,结果与网站数据一致。结论 成功建立了常用近交系大鼠遗传质量检测及品系鉴别的SNP组合。

随机扩增多态性DNA和同工酶分析鉴别金银花品系

目的 采用多态基因研究新技术鉴定金银花品系。方法 用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和过氧化物酶同工酶(POD)电泳分析技术对大毛花忍冬和鸡爪花忍冬两品系进行鉴别。结果 大毛花忍冬共扩增DNA谱带 2 4条 ,鸡爪花忍冬共扩增DNA谱带 2 6条 ,POD的谱带数目分别为 5条和 2条。

爱玉子性别与品系的SRAP分析

爱玉子雌、雄异株,其性别以及品系在结果前难以通过枝叶等形态特征进行辨别。作者将序列相关扩增多态性(SRAP)标记应用于爱玉子性别及品系鉴别研究,建立了完整的PCR反应体系,扩增效果好,结果稳定可靠,可重复性强。在153对SRAP引物中,只有引物me5-em14在爱玉子雌株上扩增出约220bp的特异条带,将其命名为FAme5-em14-220,该标记与雄株没有关联,可作为爱玉子性别鉴别的SRAP标记。从153对引物中筛选出8对多态性好、分辨率高的引物组合,在24个爱玉子雌性品系和16个雄性品系的DNA样品中扩增出171条多态性带,并获得爱玉子雌、雄各品系独特的核酸指纹,其中em6-me6引物与me3-em2、me1-em8、me1-em9中的任何一对引物进行组合,都能鉴别24个爱玉子雌性品系;me3-em2与me9-em142对引物组合也能鉴别24个爱玉子雌性品系;me1-em8单独一对引物,以及me1-em9与me3-em2(或me6-em6)2对引物组合能鉴别16个爱玉子雄性品系,并获得2个雄性品系的特异性片段,即片段me1-em8-350bp为大洋57特有,me1-em8-240bp为大洋241特有。研究结果对爱玉子种质资源遗传多样性的分析、品种和品系的鉴定、以及种苗质量仲裁检验等具有重要的理论意义和实践价值。

水稻地方品种‘月亮谷’纯系对田间稻瘟病菌的选择

云南元阳哈尼梯田稻作模式是水稻可持续生产模式之一。尽管梯田地理条件适合稻瘟病的发生,但地方品种‘月亮谷’在超百年的种植历史上未有稻瘟病大发生的记载,其原因值得探索。为了解‘月亮谷’不同抗性品系对环境中稻瘟病菌的选择作用,以‘月亮谷’单粒传纯系为材料,通过孢子捕捉法和常规病组织分离法采集稻瘟菌株,进行人工培养、表型观察,接种测定了这些稻瘟菌菌株对25个抗稻瘟病单基因近等基因系的致病型。结果表明,梯田环境空气中采集的稻瘟菌孢子菌落形态呈放射状,菌落疏松,生长在培养基浅表,产孢量总体差异不明显,黑色素颜色较浅;从水稻感病组织上分离到的稻瘟菌菌落呈地毯状,菌落紧密,匍匐在培养基表面,产孢量个体差异较大(P<0.05),黑色素颜色较深。测定的稻瘟菌菌株对25个近等基因系都有致病性,联合致病性在12.0%~56.0%之间。来自环境空气中的菌株的平均联合致病性(24.8%)低于分离自‘月亮谷’纯系的菌株(38.4%)。进一步分析显示,稻瘟菌株联合致病性与其菌丝生长速率、产孢量相关性不明显;但与黑色素合成存在一定关联,颜色越深,致病性越强,来源于‘月亮谷’不同品系上的菌株致病性强于环境空气中的菌株。上述结果表明,元阳哈尼梯田环境中的稻瘟菌群体与‘月亮谷’纯系上分离到的稻瘟菌群体存在较大差异。

江西稻瘟病菌稻巨座壳致病性分化年度动态变化

为明确江西水稻种植区稻巨座壳菌(稻瘟病病菌)的年际变化规律,本研究采用7个中国鉴别寄主与30个单基因鉴别品系两套鉴别寄主分别鉴定分析了2006–2018年间从江西37个水稻主要种植县市分离的1161个稻瘟病单孢菌的生理小种、致病力、致病类型与无毒基因型等。研究结果表明,江西稻瘟病菌可以分成7群49个生理小种,其中ZA、ZB、ZC群为优势种群,ZB13为优势小种,出现频率为18.00%,以毒性较强的强致病力菌株为主;江西稻瘟病菌在生理小种构成、优势小种、致病力年际变化方面均具有3–5年的周期性;江西历年稻瘟病菌的致病类型较为丰富且存在年度差异,菌株致病类型占各年度总菌株数的82.79%–98.21%,优势致病型菌株占当年总菌株的3.57%–5.77%;历年稻瘟病菌的无毒基因个数为24–29个,其中Avr-Pizt、Avr-Piz5、Avr-Pik、Avr-Pik(C)在历年供试菌株中出现频率较高,说明与之相对应的抗瘟基因在江西抗病育种与抗性品种布局中具有较好的应用价值。