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犀牛钩虫ITS1-5.8S-ITS2基因序列的对比分析
1
作者
李朝
李杨杨
+4 位作者
宋伟斌
杨玉钊
杨建发
邹丰才
刘永张
《动物医学进展》
北大核心
2018年第12期138-142,共5页
为了鉴定云南省昆明动物园非洲白犀牛(Ceratotherium simum)所感染的寄生虫种属,采集犀牛粪便、镜检、孵化幼虫,提取虫体DNA,PCR扩增ITS1-5.8S-ITS2序列,测序后用SeqMan11.1软件拼接。在线Blast比对分析,序列上传NCBI,将其与已公布的钩...
为了鉴定云南省昆明动物园非洲白犀牛(Ceratotherium simum)所感染的寄生虫种属,采集犀牛粪便、镜检、孵化幼虫,提取虫体DNA,PCR扩增ITS1-5.8S-ITS2序列,测序后用SeqMan11.1软件拼接。在线Blast比对分析,序列上传NCBI,将其与已公布的钩虫ITS1-5.8S-ITS2基因序列用MEGA6.06软件构建系统进化树。结果显示,在犀牛粪便中发现虫卵;PCR扩增其ITS1-5.8S-ITS2基因序列,测序结果显示,长度均为781bp,Blast比对显示,与Uncinaria cf.(HE962182)、Uncinaria sp.(HQ262066)同源性分别为99%和98%。因此确认从犀牛分离的钩虫属于钩虫科弯口属钩虫(Uncinaria)。研究结果可为野生珍稀动物的寄生虫病防控提供参考,也为粪便中钩虫的进一步分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。
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关键词
钩口科
内转录间隔区核糖体DNA
非洲白犀牛
遗传进化
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职称材料
题名
犀牛钩虫ITS1-5.8S-ITS2基因序列的对比分析
1
作者
李朝
李杨杨
宋伟斌
杨玉钊
杨建发
邹丰才
刘永张
机构
云南农业大学动物医学院/云南省高校兽医公共卫生重点实验室
昆明动物园
出处
《动物医学进展》
北大核心
2018年第12期138-142,共5页
基金
福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室开放基金项目(2016KL01)
云南农业大学杰出人才专项资助计划项目(2015JY03)
云南农业大学学生科技创新创业行动基金项目(2018ZKX041)
文摘
为了鉴定云南省昆明动物园非洲白犀牛(Ceratotherium simum)所感染的寄生虫种属,采集犀牛粪便、镜检、孵化幼虫,提取虫体DNA,PCR扩增ITS1-5.8S-ITS2序列,测序后用SeqMan11.1软件拼接。在线Blast比对分析,序列上传NCBI,将其与已公布的钩虫ITS1-5.8S-ITS2基因序列用MEGA6.06软件构建系统进化树。结果显示,在犀牛粪便中发现虫卵;PCR扩增其ITS1-5.8S-ITS2基因序列,测序结果显示,长度均为781bp,Blast比对显示,与Uncinaria cf.(HE962182)、Uncinaria sp.(HQ262066)同源性分别为99%和98%。因此确认从犀牛分离的钩虫属于钩虫科弯口属钩虫(Uncinaria)。研究结果可为野生珍稀动物的寄生虫病防控提供参考,也为粪便中钩虫的进一步分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。
关键词
钩口科
内转录间隔区核糖体DNA
非洲白犀牛
遗传进化
Keywords
hookworm
ITS
African white rhinoceros
genetic evolution
分类号
S852.731 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
犀牛钩虫ITS1-5.8S-ITS2基因序列的对比分析
李朝
李杨杨
宋伟斌
杨玉钊
杨建发
邹丰才
刘永张
《动物医学进展》
北大核心
2018
0
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