高原人群铁调素基因多态性与铁过载的相关性分析

探讨高原人群铁调素基因单核苷酸位点与机体内铁过载易感性的关系。选取2016年9月1日至2017年8月31日就诊于西藏自治区人民政府驻成都办事处医院体检中心信息完整的铁过载体检者77例,选取同期的非铁过载体检者80例,收集受试者的一般资料,提取外周静脉血基因组DNA进行基因测序及单核苷酸多态性(SNP)分型,用SPSS 25.0软件和Graph Pad Prism v.8软件对结果进行统计,分析铁调素基因多态性及与铁过载之间的关系。结果在铁调素基因上发现高原人群存在8个SNP位点,均位于内含子区。经过统计分析,铁调素位点基因型在藏族和汉族间的分布差异无显著性(P>0.05);在3个符合Hardy-Weinberg平衡的位点中,基因型频率及等位基因频率在铁过载组和非铁过载组间差异无显著性;不同遗传模式下基因型的分布在铁过载组和非铁过载组间也无差异显著性。据此推测铁调素这8个位点多态性与高原人群铁过载易感性无关。

骨质疏松模型体内铁调素(Hepcidin)基因表达的相关研究

目的观察维甲酸制作的大鼠骨质疏松模型中,肝脏内铁调素(Hepcidin)基因在不同时间表达变化,探讨其与骨质疏松形成的相关性。方法取80只SD大鼠,分成实验组和对照组。实验组用维甲酸(70mg/kg.d)每天灌胃,14d后形成骨质疏松模型;在实验组中采用RT-PCR方法分别观察灌胃第1、3、5、8、9、10、12、14d肝脏铁调素基因表达变化;在第14d还检测大鼠骨密度、分析脱钙骨切片、观察肝组织切片。结果与对照组相比,实验组大鼠肝脏铁调素基因表达在维甲酸灌胃的不同时间组存在明显不同:早期铁调素相对表达量逐渐下降,在第8、9d达到最低值,随后有回升。另外,维甲酸灌胃第14d的骨密度比灌胃前明显降低、骨切片中骨小梁稀松皮质骨变薄;维甲酸灌胃第14d的肝组织切片与对照组比较差异无显著性。结论①本研究骨质疏松模型采用人工干预方法,没有其他影响因素。实验结束时大鼠骨密度、骨组织学检查表明骨质疏松形成;因此,同期不同时间组大鼠体内铁调素基因表达可以代表体内铁代谢不同时间的变化。②在本研究中实验组与对照组研究结果的差异表明:铁调素基因RT-PCR变化与维甲酸制作的大鼠骨质疏松模型形成有实验相关性。

高原人群铁调素基因单核苷酸多态性研究

目的了解铁调素基因(hamp)基因单核苷酸多态性(SNP)各等位基因及基因型在中国高原人群中的分布频率,比较其在不同种族间分布的差异。方法采用单碱基延伸的PCR技术和DNA测序法检测高原人群的hamp基因SNP,选取197例藏族和190例汉族高原人群(西藏)作为研究对象,并结合人类基因组计划公布的4个人群[欧洲人群、非洲人群、日本人群及平原人群(北京)和千人基因组计划公布的5个人群(东亚、欧洲、非洲、美国和南亚)]的SNP分型数据,比较基因型及等位基因频率分布差异。结果在本研究中发现高原人群(西藏)存在8个SNP位点,均位于hamp基因内含子区,与平原人群(北京)在8个位点中差异均无统计学意义;与其他人群相比,在rs8101606位点上与欧洲人群和非洲人群相比差异有统计学意义,在rs7251432上与日本人群和非洲人群相比差异有统计学意义,在rs2293689位点上与欧洲人群和日本人群差异有统计学意义,在rs55863037A/G等位基因频率上仅与欧洲人群比较差异有统计学意义。结论在高原人群(西藏)中存在hamp基因多态性,与其他种族人群比较有明显差异。

西藏高原人群铁调素基因hamp密码子偏好性分析

目的:通过对西藏高原人群及平原人群、恒河猴等其他5种物种的密码子使用进行分析,从而得出西藏高原人群铁调素基因(hamp)的密码子偏好性。方法:采用PCR技术获得西藏高原人群铁调素全基因序列,利用在线软件CodonW进行密码子偏好性分析,通过在线软件PredictProtein以及Signal P等软件进行西藏高原人群铁调素基因的结构分析,比较与GenBank数据库中选取的平原人群、恒河猴等其他5种物种的密码子偏好性的差异。结果:西藏高原人群的铁调素基因全长为2681 bp,由3个外显子和2个内含子组成,编码84个氨基酸的铁调素前体肽,包含信号肽、中间肽与成熟肽,其密码子偏好性与平原人群、恒河猴等其他5个物种的密码子偏好性均有不同程度的差异。结论:西藏高原人群铁调素基因hamp密码子偏好性与其他物种的密码子偏好性均有不同程度的差异。

团头鲂hepcidin基因单核苷酸多态性及与抗病性状的相关性

为了解hepcidin(铁调素)基因的多态性及其与抗病性状的相关性,以团头鲂(Megalobrama amblycephala)为研究对象,从公共数据库中获得hepcidin基因序列,对团头鲂进行嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)人工感染来区分易感和抗病个体,采用PCR扩增及测序技术筛选hepcidin基因序列中的SNP(单核苷酸多态,single nucleotide polymorphisms)位点,对SNP位点运用高分辨率熔解曲线法(high-resolution melting,HRM)进行分型,分析其多态性及与抗病性状之间的关系。结果在hepcidin基因上共筛选出2个SNP位点,其中1个位点位于内含子部分,1个位于3′非编码区。经过统计分析发现,位于3 371bp(A/G)的这一SNP位点的基因型频率和等位基因频率在易感和抗病组间差异极显著,位于217bp(A/G)位点的基因型频率和等位基因频率在易感组和抗病组间差异显著。据此推测hepcidin的这2个SNP位点多态性与团头鲂抗病性状相关。