锌指结构转录调控因子Sp8广泛分布于嗅球并在中间神经元表达

目的探讨锌指结构转录调控因子Sp8在成年健康大鼠嗅球的分布及与嗅球中间神经元的关系。方法4月龄SD大鼠嗅球的冠状位切片,免疫荧光单标观察Sp8在嗅球的分布特点,免疫荧光双标观察Sp8与嗅球PV、TH、CB中间神经元的共表达。结果Sp8免疫阳性细胞在大鼠嗅球各层均有分布,其中主要分布于僧帽细胞层、内丛状层和颗粒细胞层,而在外丛状层最少;Sp8/PV和Sp8/CB双标细胞均主要分布在EPL层,Sp8/TH双标细胞主要分布在突触球层,共表达率均超过90%。结论Sp8广泛分布于嗅球且在其大多数中间神经元表达。

组织因子的分子结构、转录调控及临床意义

组织因子(tissue factor,TF)又称凝血因子Ⅲ,是外源性凝血系统的启动因子,机体内活性最强的促凝物质之一。它在钙离子、磷脂存在的条件下,能与第Ⅶ因子(FⅦ)结合成复合体,同时使FⅦ裂解为有活性的FⅦa。TF-FⅦa复合体迅速活化X和Ⅸ因子,从而启动凝血系统。 九十年代以来,特别是发现组织因子途径抑制物(tissue factor pathway inhibitor,

MYB转录因子在调控植物响应逆境胁迫中的作用

MYB作为植物中最大的多功能转录因子(transcription factors,TFs)家族之一,在基因转录水平上广泛地参与调控植物生长发育、激素信号转导及逆境胁迫应答等过程。该类转录因子N端含有典型的MYB结构域,根据MYB结构域中R重复序列的数量分为不同的亚组;而C端结构域差异较大,因此功能上具有多样性。大量研究表明,在受到外界环境信号的激活后,MYB可单独或通过和其他蛋白互作后,与下游靶基因启动子区域的顺式作用元件MYBCORE和AC-box结合,参与调控下游胁迫应答相关基因的表达,从而调节植物对逆境胁迫的耐受性。另外,MYB也通过参与脱落酸(abscisic acid,ABA)、油菜素内酯(brassinolide,BR)、茉莉酸(jasmonic acid,JA)和活性氧(reactive oxygen species,ROS)等信号通路的方式,对非生物胁迫以及生物胁迫做出应答反应。论文对植物MYB家族的结构与分类及其作用方式进行了归纳,重点对植物MYB参与调控响应盐、干旱、极端温度、营养亏缺、重金属以及病原菌等非生物和生物逆境胁迫的作用机制进行了综述,并对未来重点研究方向提出了展望,为今后农作物的抗逆性遗传改良和生物育种提供优异基因资源和理论支持。

转录因子KLF家族的结构、功能及调控机制研究进展

转录因子KLF家族(Krüppel-like factors)成员的C-末端区域中均存在3个保守的Cys2/His2锌指结构,它们能够参与调控真核生物的多种生理过程并发挥重要作用,包括促进脂肪组织和肌肉形成、影响神经系统发育、参与肿瘤发生过程、调控细胞和组织及系统水平的代谢和修复损伤的代谢组织等,是当前生物领域的研究热点。因此,综述了KLF家族成员的共同结构特征,以及KLF3、KLF5、KLF6、KLF7、KLF8、KLF14、KLF15的主要生理功能及其调控机制的研究进展,为未来进一步探讨KLF家族转录因子的作用和相关疾病的分子机制提供参考。

Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子的结构和功能研究进展

Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子,是一类真菌所特有的转录因子。近年来的研究表明,Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子主要参与真菌对外界胁迫应答反应、脂类等物质的合成、致病性和次级代谢产物调节过程。但关于Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子全面的功能整理鲜有报道。因此本综述从锌指类转录因子的结构和分类出发,对Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子进行简述,并重点阐述Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子在真菌生长发育过程中主要发挥的各项功能。

锌指结构转录抑制因子Snail及NF-κB在卵巢上皮癌中的表达及临床意义

目的通过对卵巢上皮癌组织中Snail、NF-κB的检测,探讨其在卵巢上皮癌中的表达及临床意义。方法卵巢恶性肿瘤59例,良性上皮性肿瘤18例,应用免疫组化方法检测其在良恶性卵巢肿瘤的表达情况。结果 Snail及NF-κB在卵巢上皮癌的表达明显高于良性上皮,两者呈正相关。结论 Snail,NF-κB在卵巢上皮癌中高表达,卵巢癌期别越高,表达越强,NF-κB与Snail在卵巢癌的发展过程中可能起协同作用。

锌指蛋白ZBTB20是调控肝脏甲胎蛋白基因转录的关键抑制因子

甲胎蛋白(AFP)在胎肝中高表达,出生后不久就快速下调至很低水平。有关肝脏AFP基因出生后的转录抑制机制一直是未解之谜。AFP基因的增强子、抑制区域和启动子等顺式调控元件可能参与其转录抑制的调节,但有关的关键性转录抑制因子尚不明确。我们发现了一种新型锌指蛋白ZBTB20,为研究其体内的生理功能,我们利用条件打靶技术,建立了ZBTB20的组织特异性基因敲除小鼠模型,发现肝细胞特异性ZBTB20基因敲除小鼠出生后的肝脏AFP基因一直维持近乎胎肝的高水平表达,而其肝细胞处于正常的静息状态。生化分析显示,ZBTB20具有转录抑制活性,体外可有效抑制AFP启动子的转录活性;染色质免疫沉淀和EMSA实验结果显示ZBTB20体内和体外能直接结合AFP启动子。在小鼠肝脏的发育过程中,ZBTB20基因被渐进激活,与AFP基因的表达水平呈负相关,提示激活的ZBTB20参与了AFP基因的转录抑制。上述结果表明ZBTB20是调控AFP基因表达的关键转录因子,由此我们认为肝脏ZBTB20基因出生后的表达上调及其发挥的转录抑制作用是导致AFP基因出生后快速下调的主要原因。

植物bHLH转录因子的结构特点及其生物学功能

bHLH(basic/helix-loop-helix)转录因子在真核生物的生长发育过程中起着重要的调控作用,它们组成了转录因子中的一个大家族。bHLH转录因子不仅普遍参与了植物的生长发育,包括毛状体的发生、光形态建成和光信号转导,而且在植物响应逆境胁迫和次生代谢方面也具有重要作用。对植物bHLH转录因子的结构特点及其生物学功能进行综述。

锌指结构转录因子GATA家族的一员(GATA-3)在乳腺癌发生转移过程中的作用分析

锌指结构转录因子GATA家族的一员(GATA-3)在乳腺癌发生转移过程中的作用分析。方法 选取100例在我院接受治疗的乳腺癌患者纳入本研究,患者均于2021年1月~2021年12月期间入院。对患者的病理资料进行总结,分析不同病理组织中锌指结构转录因子GATA家族的一员(GATA-3)的表达情况,并分析雌激素受体与GATA-3的表达相关性以及临床病理指标与GATA-3的表达相关性。结果 癌旁乳腺组织中,导管上皮细胞中GATA-3表达阳性率显著高于肌上皮细胞(P<0.05);乳腺癌组织中,浸润性神经内分泌癌、派杰病、黏液腺癌、导管原位癌、浸润性小叶癌、浸润性导管癌组间GATA-3表达阳性率无显著差异(P>0.05);癌旁乳腺组织中GATA-3表达阳性率显著高于乳腺癌组织(P<0.05);乳腺癌组织中GATA-3与雌激素受体表达的的相关性呈正相关(P<0.05);乳腺癌组织中GATA-3表达与肿块大小、年龄无相关性(P>0.05);乳腺癌组织中GATA-3表达与淋巴结转移呈负相关(P<0.05);乳腺癌组织中GATA-3表达与组织分级呈正相关(P<0.05)。结论 在乳腺癌发生转移过程中,锌指结构转录因子GATA家族的一员(GATA-3)的表达与其密切相关,可通过对该指标表达的监测,预判疾病的转移情况。

转录因子FoxO3a相关调控通路研究进展

Forkhead转录因子的命名，源于果蝇的“叉头”突变，该突变可导致肠的前后部发育缺陷。Forkhead转录因子家族有着一个高度保守的DNA结构域，这个保守序列的共同特征是具有一个长110个氨基酸的DNA结合结构域，即Forkheadbox（Fox）结构域，并折叠成3个α-螺旋（helix1、2、3）和2个翅膀状（winged）的大环结构，从而形成一个“螺旋-转角-螺旋”的基序。由此，根据上述保守DNA结合结构域的特点，义把这类转录因子叫做Forkhead／winged helix转录因子。2000年，Fox基因被正式统一命名为Forkhead转录因子家族。

Dof转录因子在植物中的调控作用

DNA binding with one finger(Dof)蛋白是植物中特有的一类转录因子,自1993年在玉米中发现该转录因子到如今已有26年的历史。Dof蛋白只有一个由52个氨基酸组成的单锌指保守结构域,该结构域包含4个保守的半胱氨酸残基和一个二价锌离子,这两者都是Dof转录因子重要的组成部分,二者缺一不可,若半胱氨酸发生突变,或存在其他二价离子螯合剂都将会影响锌指结构的生成,进而使Dof蛋白不能与DNA结合,导致其丧失活性。半胱氨酸残基和Zn2+可以共价结合构成CX2CX21CX2C基序,此基序能够特异识别启动子中的AAAG(或CTTT)序列,从而激活或抑制靶基因的表达。Dof蛋白C-末端氨基酸序列的多变性导致该转录因子进化的多样性,从而在植物的生长发育过程中发挥着不同且重要的功能,如种子萌发、维管的发育和叶片极性、花和花粉发育、光周期反应、参与碳和氮的代谢、合成次生代谢产物、植物的逆境响应过程等。围绕着Dof转录因子的结构、系统进化关系、motif的组成和在植物中发挥的功能展开综述,以期为后续Dof转录因子的研究奠定相应的理论基础。

植物锌指蛋白转录因子家族研究进展

锌指蛋白(zinc-finger protein,ZFP)因其具有指状结构特征且能与锌结合而得名,是真核生物中最重要的转录因子之一。锌指蛋白主要通过与核酸的相互作用,如与单链DNA、RNA结合或RNA/DNA双向结合以及蛋白-蛋白互作来激活或抑制基因的转录,在植物的基因表达与调控、生长发育与衰老、非生物胁迫及生物胁迫等过程中发挥着重要的作用。本文对锌指蛋白转录因子的结构、分类、生物学功能以及调控机制等方面进行了综述,以期为今后锌指蛋白的深入研究提供参考。

MYB转录因子功能与调控研究进展

综述了MYB蛋白家族的结构、功能和调控机制的研究进展,为分析、预测和阐明植物多物种中的MYB家族成员的功能打下良好的基础。

细菌GntR家族转录调控因子的研究进展

GntR家族转录调控因子是细菌中分布最为广泛的一类螺旋–转角–螺旋(helix-turn-helix,HTH)转录调控因子,此家族转录调控因子包含两个功能域,分别是N端的DNA结合结构域和C端的效应物结合结构域/寡聚化作用结构域。DNA结合结构域的氨基酸序列是非常保守的,但效应物结合结构域/寡聚化作用结构域的氨基酸序列却存在很大的差异性。目前许多GntR家族的转录调控因子已经被鉴定,这些转录因子调控细菌许多不同的细胞过程,如运动性、葡萄糖代谢、细菌的耐药性、病原细菌的致病力等。本文主要阐述了GntR家族转录调控因子的发现、二级结构、生物学功能、调控模式等方面的研究进展,旨在为研究者全面、深入地了解GntR家族转录调控因子的功能及作用机理提供帮助。

含锌指和BTB结构域7B(ZBTB7B/ThPOK)及其相关因子在T细胞分化及功能中的作用

含锌指和BTB结构域7B(ZBTB7B/ThPOK)是CD4谱系分化中的关键转录因子,并抑制CD8谱系生成。ThPOK蛋白表达促进CD4谱系分化,维持CD4谱系稳定性,并抑制CD8谱系分化。首先在胸腺内,ThPOK基因表达受T细胞受体(TCR)信号、基因增强子、基因沉默子等调节,且ThPOK表达受GATA结合蛋白3(GATA3)、Runt相关转录因子3(Runx3)、白血病/淋巴瘤相关因子(LRF)、胸腺细胞选择相关性高迁移率族盒基因(TOX)、Myc关联的锌指蛋白相关因子(MAZR)、E1A结合蛋白p300(P300)等转录因子影响,进而影响CD4、CD8谱系分化。而在外周T细胞中,ThPOK影响CD_4^+T细胞亚群、CD_8^+T细胞分化及功能。在此基础上,正逐步展开针对外周疾病中ThPOK作用的研究。

TFAP2A对肾小球硬化相关基因ADCK4转录调控机制的研究

目的探索细胞中TFAP2A对局灶节段性肾小球硬化(FSGS)相关基因含aarF结构域的激酶4(ADCK4)的转录调控机制及TFAP2A与ADCK4是否存在特定的结合区域。方法生物信息学分析肾小球硬化基因火山图,ADCK4及TFAP2A表达水平的关系。JASPAR数据库预测ADCK4基因转录起始位点-464 bp/+206 bp区域包含TFAP2A转录因子结合位点;TFAP2A siRNA浓度分别为5、10、15µmol/L,TFAP2A过表达质粒质量浓度分别为50、100、300µg/L,通过双萤光素酶报告基因实验验证TFAP2A对ADCK4基因启动子水平的调控作用。TFAP2A siRNA及TFAP2A过表达质粒转染细胞,实时荧光定量PCR检测TFAP2A、ADCK4 mRNA表达,蛋白免疫印迹实验检测TFAP2A、ADCK4蛋白表达。染色质免疫沉淀试验验证TFAP2A与ADCK4启动子的特定区域结合。结果生物信息学分析显示FSGS肾组织中RNA-Seq RNA表达上调的基因273个,表达下调的基因219个;ADCK4与TFAP2A表达水平呈正相关(P<0.01)。双萤光素酶报告基因实验证明TFAP2A siRNA浓度为10、15µmol/L的ADCK4启动子相对萤光素酶活性增强,TFAP2A过表达质粒质量浓度为100、300µg/L的ADCK4启动子萤光素酶活性降低(P<0.05)。与对照组相比,实验组ADCK4 mRNA和蛋白表达水平升高;过表达实验中,与对照组比较,实验组ADCK4 mRNA和蛋白表达水平降低(P<0.05)。染色质免疫沉淀试验发现TFAP2A能与ADCK4启动子的特定区域结合。结论转录因子TFAP2A负向调控ADCK4基因表达,增加了调控足细胞重要基因的转录因子成员。

OsSPL转录因子调控水稻生长发育的研究进展

[目的]总结OsSPL转录因子在调控水稻生长发育、组织构建、产量以及逆境响应等方面的研究成果,为水稻分子育种改良提供基因功能信息。[方法]通过文献检索,综述了OsSPL转录因子的结构特点及其在水稻中的表达调控和生物学功能等研究进展。[结果]目前已发现19个水稻OsSPL转录因子,其氨基酸序列含有SBP结构域,大部分OsSPL转录因子基因表达在翻译水平上受OsmiRNA调节。OsSPL转录因子影响水稻根系发育、株型结构、叶片器官形成、表皮毛分化、开花期及产量等;还参与水稻对生物与非生物逆境胁迫的响应代谢过程,进而调控植株对逆境胁迫的抗性。[结论]OsSPL转录因子参与调控水稻的根、叶、花、穗、籽粒等多组织的发育过程,并与植株的逆境响应代谢相关。目前OsSPL转录因子的部分生物学功能仍未被系统研究。

植物C2H2型锌指蛋白的结构与功能

锌指蛋白是一类具有指状结构域的转录因子。根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)残基的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类。C2H2型锌指蛋白是最多也是研究最为清楚的一类锌指蛋白,在植物中已经克隆了50多个,主要涉及植物的生长发育和对环境胁迫的应答反应。该类锌指蛋白大部分在锌指区具有植物中特有的QALGGH保守结构,可能涉及调控植物特有的生物学功能。文章主要讨论了植物C2H2型锌指转录因子的结构、对靶DNA的识别及在生长发育和环境胁迫反应中可能的调控功能。

茶树两个Dof转录因子的分离及其在温度胁迫中的响应分析

茶树是一种重要的经济作物,温度胁迫对茶叶生产影响较大.本研究以茶树品种迎霜为实验材料,克隆获得2个编码Dof转录因子的基因CsDof1和CsDof2.序列分析显示,CsDof1含有1 389 bp,编码463个氨基酸;CsDof2含有1 458 bp,编码486个氨基酸.CsDof1和CsDof2转录因子都具有典型的锌指结构域,分别位于第133-195和124-186个氨基酸位点之间.对CsDof1和CsDof2转录因子理化性质、亲/疏水性、二级和三级结构分析显示,两者都是亲水性蛋白且显偏碱性.空间结构分析显示,CsDof1和CsDof2均有1个α-螺旋,且Dof结构域的位点完全相同,均有4个半胱氨酸残基.实时定量PCR表明,CsDof1和CsDof2在不同茶树品种、不同温度胁迫下均能诱导表达,且表达呈现差异.

KLF转录因子家族与脂肪细胞分化

Kruppel样转录因子(Kruppel-like factors,KLF)是一类具有锌指结构的转录因子,其典型结构特征是在其羧基端具有3个C2H2锌指结构.KLF广泛参与细胞增殖、凋亡、分化以及胚胎发育等多个生命活动的调控.近年来脂肪细胞分化研究的结果显示,KLF家族的多个成员参与脂肪细胞分化过程的调控,既有促进脂肪细胞分化的,也有抑制脂肪细胞分化的.其中KLF4通过与Krox20协同作用,激活C/EBPβ(CCAAT-enhancer-binding proteinβ)基因表达,促进脂肪细胞分化;KLF5和KLF15都通过直接结合到氧化物酶增殖体激活受体γ(peroxisome proliferator-activated receptorγ,PPARγ)基因的启动子,激活PPARγ基因表达,促进脂肪细胞分化;而KLF6则通过抑制前脂肪细胞因子(pre-adipocyte factor1,PREF1)基因表达,促进脂肪细胞分化.抑制脂肪细胞分化的KLF2通过结合于PPARγ的启动子,抑制PPARγ基因表达,从而抑制脂肪细胞的分化;KLF3通过募集辅助抑制因子C-末端结合蛋白(c-terminal binding protein,CtBP)形成KLF3-CtBP抑制复合体,结合于C/EBPα(CCAAT-enhancer-binding proteinα)基因的启动子,抑制C/EBPα表达,进而抑制脂肪细胞的分化;KLF7通过抑制葡萄糖转运蛋白2(glucosetransporter2,GLUT2)基因的表达抑制脂肪细胞的成熟.本文综述这些KLF转录因子在脂肪细胞分化过程的作用及其作用的机制.