核酸碱基的非谐性振动:正规及错配碱基对的一维和二维红外光谱及其结构基础

用量子化学计算研究了正规Watson-Crick碱基对和四例典型的错配碱基对.对碱基单体和二聚体进行了详细的非谐性频率分析,以揭示其结构方面的一些振动特征.研究发现这些振动特征能在模拟的一维和二维红外光谱中很好地表现出来.利用势能分布研究了所选简正模式的离域化程度,发现从孤立的碱基单体到参与氢键的二聚体,模式的离域化程度变化很大;同时,这些模式的非谐性常数也发生了相应的改变.以人们通常认为的位于红外光谱中6-μm波长区域的羰基伸缩模式为例进行了探讨.

核酸碱基配对与错配的拉曼光谱——A-U与A-C的比较研究

采用激光拉曼光谱技术对碱基配对与错配形成的核酸复合物(即PolyA.PolyU和PolyA.PolyC)进行了研究,并比较了复合前后的光谱改变以及此二种复合物形态结构的差异.研究表明,在所研究的溶液环境下二者在分子构象和形成前后光谱改变的特征上都存在着一定的相似性;但在参与复合的两条单链结构改变和碱基氢键配位结构上存在明显差异.这对于需要准确预测配对碱基与非配对碱基的数目和种类的基因芯片测序技术来说无疑具有重要意义.