运用锚引物扩增新城疫病毒鹅源分离株基因组末端序列

在T4RNA连接酶的作用下,将人工合成的锚引物直接与新城疫病毒(NDV)鹅源毒株ZJ1株的基因组5′末端的反转录产物及NDV基因组3′末端直接相连,然后用聚合酶链反应(PCR)和RT PCR分别快速扩增基因组5′末端和3′末端。测序结果表明:3′末端的Leader序列为55nt,5′末端的trailer序列为114nt。将该序列与GenBank报道的NDV鸡源毒株的相应序列相比,ZJ1株与6个鸡源NDV毒株的Leader和trailer序列的同源性分别为83.6%～92.7%和60 5%～63.2%。序列比较结果表明:该鹅源毒株与鸡源毒株在基因组3′端调控区有较高的同源性,而在基因组5′端的调控区同源性则较低。