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基于线粒体COI基因序列分析辽东湾镰鲳(Pampus echinogaster)群体遗传多样性
被引量:
3
1
作者
李玉龙
刘修泽
+4 位作者
董婧
于旭光
李轶平
郭栋
付杰
《海洋湖沼通报》
CSCD
北大核心
2015年第2期29-35,共7页
根据线粒体COI基因序列对辽东湾附近海域的镰鲳(Pampus echinogaster)群体(n=28)的遗传多样性进行了研究。在COI序列中,共检测到17个多态性核苷酸位点,定义了12种单倍型,其核苷酸多态度和单倍型多态度都较低(H=0.49±0.12,π=0.16...
根据线粒体COI基因序列对辽东湾附近海域的镰鲳(Pampus echinogaster)群体(n=28)的遗传多样性进行了研究。在COI序列中,共检测到17个多态性核苷酸位点,定义了12种单倍型,其核苷酸多态度和单倍型多态度都较低(H=0.49±0.12,π=0.16±0.12%)。与黄海、东海的群体相比,辽东湾镰鲳群体的遗传多样性水平较低。利用GenBank数据库中已有的COI同源序列,系统分析和分子变异分析(AMOVA)的结果都表明来自辽东湾的镰鲳个体和东海、南海个体间存在较小但明显的遗传分化。研究结果表明:中国近海的镰鲳尤其是相距较远的群体在其分布范围内可能存在遗传分化现象。
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关键词
辽东湾
镰鲳
线粒体COI基因
遗传多样性
原文传递
基于线性混合效应模型的镰鲳叉长-体质量关系的异质性分析
被引量:
3
2
作者
王杨楠
韩东燕
+3 位作者
麻秋云
高春霞
田思泉
唐久
《上海海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期135-143,共9页
根据2016—2018年3月初(冬季)、5月(春季)、8月(夏季)、11月(秋季)4个季节在浙江南部近海的温台地区底拖网调查数据,通过构建广义线性模型(GLM)和9个线性混合效应模型,对镰鲳(Pampus echinogaster)的叉长-体质量关系(W=aLb)及其异质性...
根据2016—2018年3月初(冬季)、5月(春季)、8月(夏季)、11月(秋季)4个季节在浙江南部近海的温台地区底拖网调查数据,通过构建广义线性模型(GLM)和9个线性混合效应模型,对镰鲳(Pampus echinogaster)的叉长-体质量关系(W=aLb)及其异质性进行了分析。结果表明:浙江南部近海的镰鲳叉长范围为53.00~238.00 mm,平均叉长128.54 mm,优势叉长组为110.00~160.00 mm;体质量范围为3.80~420.50 g,平均体质量63.61 g,优势体质量为60.00~180.00 g。根据赤池信息准则(AIC),最佳的生长拟合模型为同时存在季节和年份对镰鲳生长参数a,b的随机效应的组合模型;均方根误差结果同样表明该模型的性能最优。在最优模型中,参数a的固定值为1.75×10^(-5),参数b的固定值为3.083,表示镰鲳为正异速增长,肥满度较高。最优线性混合模型结果显示:a值在秋季最大,其次是夏季和冬季,而春季最小;b值与其相反。从不同年份来看:a值在2016年最大,2018年和2017年次之;b值在2017年最大,2018年和2016年次之。本研究分析了年份、季节与镰鲳的叉长-体质量关系,通过混合效应模型,显示出年份和季节对镰鲳的叉长-体质量关系具有较为显著的影响,表明该模型在镰鲳的叉长-体质量关系的异质性研究中具有重要的参考价值,并为其资源的合理开发和管理提供科学依据。
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关键词
浙江南部近海
镰鲳
叉长-体质量关系
异质性
线性混合效应模型
原文传递
题名
基于线粒体COI基因序列分析辽东湾镰鲳(Pampus echinogaster)群体遗传多样性
被引量:
3
1
作者
李玉龙
刘修泽
董婧
于旭光
李轶平
郭栋
付杰
机构
辽宁省海洋水产科学研究院
出处
《海洋湖沼通报》
CSCD
北大核心
2015年第2期29-35,共7页
基金
海洋公益性行业科研专项黄渤海重要经济生物产卵场修复与重建技术集成与示范(20140505010)
蓬莱19-3溢油辽宁省生物资源养护与渔业生态环境修复项目共同资助
文摘
根据线粒体COI基因序列对辽东湾附近海域的镰鲳(Pampus echinogaster)群体(n=28)的遗传多样性进行了研究。在COI序列中,共检测到17个多态性核苷酸位点,定义了12种单倍型,其核苷酸多态度和单倍型多态度都较低(H=0.49±0.12,π=0.16±0.12%)。与黄海、东海的群体相比,辽东湾镰鲳群体的遗传多样性水平较低。利用GenBank数据库中已有的COI同源序列,系统分析和分子变异分析(AMOVA)的结果都表明来自辽东湾的镰鲳个体和东海、南海个体间存在较小但明显的遗传分化。研究结果表明:中国近海的镰鲳尤其是相距较远的群体在其分布范围内可能存在遗传分化现象。
关键词
辽东湾
镰鲳
线粒体COI基因
遗传多样性
Keywords
Liaodong Bay
Pampus echinogaster
mtDNA
COI gene
genetic diversity
分类号
Q244 [生物学—细胞生物学]
原文传递
题名
基于线性混合效应模型的镰鲳叉长-体质量关系的异质性分析
被引量:
3
2
作者
王杨楠
韩东燕
麻秋云
高春霞
田思泉
唐久
机构
上海海洋大学海洋科学学院
国家远洋渔业工程技术研究中心
大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室
浙江省海洋水产养殖研究所
出处
《上海海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期135-143,共9页
基金
国家自然科学基金(41906074,31902372)
中国博士后科学基金(2019M651475)
温台地区海洋渔业资源调查项目(158053)。
文摘
根据2016—2018年3月初(冬季)、5月(春季)、8月(夏季)、11月(秋季)4个季节在浙江南部近海的温台地区底拖网调查数据,通过构建广义线性模型(GLM)和9个线性混合效应模型,对镰鲳(Pampus echinogaster)的叉长-体质量关系(W=aLb)及其异质性进行了分析。结果表明:浙江南部近海的镰鲳叉长范围为53.00~238.00 mm,平均叉长128.54 mm,优势叉长组为110.00~160.00 mm;体质量范围为3.80~420.50 g,平均体质量63.61 g,优势体质量为60.00~180.00 g。根据赤池信息准则(AIC),最佳的生长拟合模型为同时存在季节和年份对镰鲳生长参数a,b的随机效应的组合模型;均方根误差结果同样表明该模型的性能最优。在最优模型中,参数a的固定值为1.75×10^(-5),参数b的固定值为3.083,表示镰鲳为正异速增长,肥满度较高。最优线性混合模型结果显示:a值在秋季最大,其次是夏季和冬季,而春季最小;b值与其相反。从不同年份来看:a值在2016年最大,2018年和2017年次之;b值在2017年最大,2018年和2016年次之。本研究分析了年份、季节与镰鲳的叉长-体质量关系,通过混合效应模型,显示出年份和季节对镰鲳的叉长-体质量关系具有较为显著的影响,表明该模型在镰鲳的叉长-体质量关系的异质性研究中具有重要的参考价值,并为其资源的合理开发和管理提供科学依据。
关键词
浙江南部近海
镰鲳
叉长-体质量关系
异质性
线性混合效应模型
Keywords
offshore waters of southern Zhejiang
Pampus echinogaster
fork length-mass relationship
heterogeneity
linear mixed-effect model
分类号
S932.4 [农业科学—渔业资源]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体COI基因序列分析辽东湾镰鲳(Pampus echinogaster)群体遗传多样性
李玉龙
刘修泽
董婧
于旭光
李轶平
郭栋
付杰
《海洋湖沼通报》
CSCD
北大核心
2015
3
原文传递
2
基于线性混合效应模型的镰鲳叉长-体质量关系的异质性分析
王杨楠
韩东燕
麻秋云
高春霞
田思泉
唐久
《上海海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
原文传递
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