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整合进禽反转录病毒长末端重复序列的马立克氏病病毒的分离鉴定 被引量:5
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作者 周祥 韦平 滕丽琼 《畜牧与兽医》 北大核心 2007年第8期22-26,共5页
应用鸭胚成纤维细胞(DEF)从曾免疫过CVI988/Rispens株疫苗的患马立克氏病(MD)肿瘤的三黄鸡中分离到一株马立克氏病病毒(MDV,命名为GXY2株。用禽肿瘤病聚合酶链式反应(PCR)鉴别诊断技术对患鸡的肿瘤组织病料及克隆纯化毒株的DEF培养物进... 应用鸭胚成纤维细胞(DEF)从曾免疫过CVI988/Rispens株疫苗的患马立克氏病(MD)肿瘤的三黄鸡中分离到一株马立克氏病病毒(MDV,命名为GXY2株。用禽肿瘤病聚合酶链式反应(PCR)鉴别诊断技术对患鸡的肿瘤组织病料及克隆纯化毒株的DEF培养物进行检测,结果均扩增到MDV-1强毒株的132-bpr特异性带和网状内皮组织增殖病病毒(REV)的长末端重复序列(LTR)。用基于抗MDV-1的gB蛋白单克隆抗体BA4、MEQ蛋白单克隆抗体3G12E6和抗REV的单克隆抗体11B118分别对毒株的培养物进行间接免疫荧光试验(IFA),结果样品只与抗MDV-1的单克隆抗体呈现阳性反应,而与抗REV的单克隆抗体呈现阴性反应。应用PCR技术扩增并测定了毒株的致瘤相关基因meq的核苷酸序列,并与其他MDV-1参考毒株的序列进行比较分析,结果发现其序列与我们之前分离鉴定的MDV-1野强毒株G2和YL040920高度同源。研究的结果表明,分离株GXY2为整合有REVLTR片段的重组MDV强毒株。 展开更多
关键词 马立克氏病病毒 网状内皮组织增殖病病毒 分离鉴定 末端重复序列/LTR 基因重组 间接免疫荧光
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长末端重复序列在人转移和非转移性肺癌中的表达
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作者 陆纲 李钰 +2 位作者 冯会臣 刘春祥 李璞 《北京医科大学学报》 CAS CSCD 2000年第5期399-402,共4页
目的 :观察人类内源性逆转录病毒长末端重复序列 (humanretroviruslongterminalrepeat,HRTVLTR)在转移和非转移性肺癌中的表达 ,探讨HRTVLTR激活与肺癌转移的关系。方法 :采用PCR扩增 17例肺癌病人原发灶、邻近淋巴结及癌旁正常组织基... 目的 :观察人类内源性逆转录病毒长末端重复序列 (humanretroviruslongterminalrepeat,HRTVLTR)在转移和非转移性肺癌中的表达 ,探讨HRTVLTR激活与肺癌转移的关系。方法 :采用PCR扩增 17例肺癌病人原发灶、邻近淋巴结及癌旁正常组织基因组中的内源性HRTVLTR ,证明内源性HRTVLTR的存在 ;以RNA斑点杂交检测 17例肺癌病人原发灶、邻近淋巴结及癌旁正常组织内源性HRTVLTR的表达 ,比较其在转移和非转移性肺癌中的表达差异。结果 :PCR结果显示 ,在转移能力不同的人肺腺癌细胞系 (AGZY 83a和Anip 973)及肺癌病人原发灶、邻近淋巴结及癌旁正常组织均获得了HRTVLTR扩增产物。 17例肺癌标本RNA斑点杂交分析发现 ,8例转移性非小细胞肺癌病人中有 5例原发灶及其转移淋巴结表现为HRTVLTR的高表达 ,4例小细胞肺癌无HRTVLTR的表达。结论 :人类基因中普遍存在内源性HRTVLTR ; 展开更多
关键词 肺癌 肿瘤转移 末端重复序列 表达 HRTVLTR
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Tat蛋白对马传染性贫血病毒长末端重复序列启动子活性的影响
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作者 刘益民 左咏梅 +4 位作者 周艳君 王晓钧 童光志 相文华 沈荣显 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期301-304,共4页
将来源于马传染性贫血病毒(EIAV)强毒株第25代和第118代病毒的LTR,白细胞弱毒(EIAV-DLA)的LTR,以及TAR起始碱基和/或poly(A)附加位点发生突变的驴胎皮肤细胞弱毒(EIAV-FDD)的LTR分别克隆到pCAT3-Basic质粒中,获得了6个重组质粒pCAT-25、... 将来源于马传染性贫血病毒(EIAV)强毒株第25代和第118代病毒的LTR,白细胞弱毒(EIAV-DLA)的LTR,以及TAR起始碱基和/或poly(A)附加位点发生突变的驴胎皮肤细胞弱毒(EIAV-FDD)的LTR分别克隆到pCAT3-Basic质粒中,获得了6个重组质粒pCAT-25、pCAT-118、pCAT-FD、pCAT-G219A、pCAT-A294C和pCAT-G219A-A294C。同时用pcDNA3.1(+)构建了EIAV反式激活蛋白(Tat)基因的重组真核表达质粒pcTM7-D。将pcTM7-D分别与含有不同LTR的重组质粒共转染驴胎皮肤细胞,考察Tat对LTR启动子活性的增强作用。结果表明,在皮肤细胞中Tat蛋白可以特异性增强来源于皮肤细胞弱毒疫苗株LTR的启动子活性,而对白细胞源的LTR无明显增强作用;TAR起始位点和poly(A)的单碱基突变和联合突变对Tat的反式激活作用并无明显影响。 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 末端重复序列 反式激活蛋白 启动子
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马传染性贫血病毒驴白细胞弱毒疫苗株及其亲本驴强毒株长末端重复序列(LTR)的启动子活性比较
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作者 周家喜 孔宪刚 +6 位作者 张宝山 刘胜旺 刘丽玲 孙成群 刘相东 刘永刚 杨威 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期342-347,共6页
将马传染性贫血病毒驴强毒(donkey adaptedequineinfectiousanemiavirus,D AEIAV)、马传染性贫血病毒驴白细胞弱毒(donkeyleukocyteattenuatedEIAV,DLAEIAV)及EIAVWyoming株的全长长末端重复序列(LTR)分别克隆到报告基因载体pCAT Basicv... 将马传染性贫血病毒驴强毒(donkey adaptedequineinfectiousanemiavirus,D AEIAV)、马传染性贫血病毒驴白细胞弱毒(donkeyleukocyteattenuatedEIAV,DLAEIAV)及EIAVWyoming株的全长长末端重复序列(LTR)分别克隆到报告基因载体pCAT Basicvector中,获得重组质粒p D A LTR CAT、p DLA LTR CAT及p Wyo LTR CAT。将这3个重组质粒分别体外转染EIAV阴性健康驴的白细胞,比较这三者LTR启动报告基因CAT表达的基础活性和在tat pcDNA3共转染条件下激活活性的差异。结果表明:在驴白细胞中,DLAEIAVLTR启动CAT表达的活性略高于D AEIAVLTR;而与EIAVWyoming株LTR比较,DLAEIAV与D AEIAV二者LTR启动CAT表达的活性都较低。在有共转染重组表达质粒tat pcDNA3条件下,D AEIAV、DLAEIAV及EIAVWyoming株LTR起始CAT表达的活性都得到提高,分别提高了4 8倍、6 0倍和3 2倍。上述结果提示,LTR可能是体现DLAEIAV驴白细胞适应性的因素,不一定是影响其毒力减弱的根本原因。 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 驴白细胞弱毒疫苗株 亲本驴强毒株 末端重复序列 启动子活性比较
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内源性逆转录病毒长末端重复序列在嗜酸性粒细胞增多症的基因表达及核苷酸序列分析
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作者 滕智平 张萍 +7 位作者 秦效英 潘秀英 郝乐 徐红 史惠琳 江滨 曾毅 陆道培 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期209-213,共5页
探索人内源性逆转录病毒长末端重复序列(LTR)基因及表达与嗜酸性粒细胞增多症发生的关系。PCR法检测嗜酸性粒细胞增多症患者外周血中内源性逆转录病毒长末端重复序列基因,RT-PCR法检测内源性逆转录病毒基因表达。变性高效液相分析和序... 探索人内源性逆转录病毒长末端重复序列(LTR)基因及表达与嗜酸性粒细胞增多症发生的关系。PCR法检测嗜酸性粒细胞增多症患者外周血中内源性逆转录病毒长末端重复序列基因,RT-PCR法检测内源性逆转录病毒基因表达。变性高效液相分析和序列测定LTR片段核苷酸序列,对不同株基因序列作同源性的比较分析。PCR结果显示:20例嗜酸性粒细胞增多症患者细胞中均获得内源性逆转录病毒长末端重复序列扩增产物,嗜酸性粒细胞增多症组中长末端重复序列基因有高的表达,而正常人表达为阴性。与HERV-K家族LTR基因相应区域核苷酸序列比较;嗜酸性粒细胞增多组长末端重复序列U3、R、U5区同源性分析有核苷酸的改变,与淋巴瘤对照比较没有大片段的缺失。人类基因组中普遍存在逆转录病毒长末端重复序列。正常人和嗜酸性粒细胞增多症患者中长末端重复序列有不同程度核苷酸碱基的变异,但是,二者比较,这种改变与嗜酸性粒细胞的增多没有明显的相关性。在嗜酸性粒细胞增多症患者中有高的基因表达而正常人中没有可检出的病毒基因的表达,嗜酸粒细胞的增多可能与逆转录病毒基因表达水平有关,其诱导嗜酸粒细胞增多的机制需进一步的研究。 展开更多
关键词 人内源性逆转录病毒(HRTV) 末端重复序列(LTR) 核苷酸序列分析 变性高效液相分析(DHPLC) 嗜酸性粒细胞增多症
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牛泡沫病毒长末端重复序列在大肠杆菌中的启动子功能 被引量:3
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作者 郭春光 乔文涛 +3 位作者 胡文治 王金忠 陈启民 耿运琪 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期181-184,共4页
The long terminl repeat(LTR) of the bovine foamy virus(BFV) contains the viral promoter,which is responsible for viral gene expression in eukaryotic cells We have demonstrated that BFV LTR linked to the luciferase gen... The long terminl repeat(LTR) of the bovine foamy virus(BFV) contains the viral promoter,which is responsible for viral gene expression in eukaryotic cells We have demonstrated that BFV LTR linked to the luciferase gene can express the enzyme efficiently upon transformation into bacteria Deletion analysis and sequence comparison showed that the BFV LTR has a sequence(from-125 to-90)which is greatly homologous to the model bacteria promoter And the proposed transcriptional starting site is at the thymine of-91 or the cytosine of -92 Besides,being fully functional in E coli,the BFV LTR can also be specifically trans activated by BFV tas gene product,Borf-1 protein The responsive element lies between base -310 and -140,which is in accordance with the responsive region in eukaryotic cells The trans-activation of BFV LTR by Borf 1 protein in bacteria offers a useful system to investigate further the specific interaction between Borf-1 protein with BFV LTR and the mechanism of the trans 展开更多
关键词 牛泡沫病毒 末端重复序列 大肠杆菌 启动子 功能
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牛免疫缺陷病毒长末端重复序列(BIV一LTR)在大肠杆菌中的启动子功能 被引量:3
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作者 陈宙涛 梁臣 +1 位作者 刘淑红 耿运琪 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第2期148-155,共8页
牛免疫缺陷病毒(BIV)的长末端重复序列(LTR)含有病毒的启动子,调控病毒在真核细胞中的表达。我们将BIVLTR与萤火虫荧光素酶基因连接构建成重组质粒pBIV一Luc,该质粒能在Ecoli中有效地表达出荧光素酶的活... 牛免疫缺陷病毒(BIV)的长末端重复序列(LTR)含有病毒的启动子,调控病毒在真核细胞中的表达。我们将BIVLTR与萤火虫荧光素酶基因连接构建成重组质粒pBIV一Luc,该质粒能在Ecoli中有效地表达出荧光素酶的活性,从而证明BIVLTR在大肠杆菌中也具有启动子功能。Mungbean核酸酶作图分析发现,BIVLTR在Ecoli中的转录起始位点位于U_3区,而不是在真核细胞中的U_3一R交界处。同时我们也证实了BIVLTR在E,coli中仍可被BIVtat蛋白特异性地反式激活,为研究tat蛋白的作用机制提供了一条新的途径。 展开更多
关键词 牛病毒 免疫缺陷病毒 末端重复序列 启动子
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HCV非结构蛋白5A对HIV长末端重复序列影响的初步探讨
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作者 彭米林 肖新强 +6 位作者 蒋永芳 田沂 许允 张旻 王文龙 彭锋 龚国忠 《临床肝胆病杂志》 CAS 2014年第2期136-140,共5页
目的本研究拟探讨HCV非结构蛋白5A(NS5A)对HIV长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)影响,从而为HCV对HIV的影响提供实验依据。方法将构建的LTR启动子驱动的荧光素酶(Luc)报告基因表达质粒(pGL3-LTR-Luc)和含HCV NS5A基因的表达质粒... 目的本研究拟探讨HCV非结构蛋白5A(NS5A)对HIV长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)影响,从而为HCV对HIV的影响提供实验依据。方法将构建的LTR启动子驱动的荧光素酶(Luc)报告基因表达质粒(pGL3-LTR-Luc)和含HCV NS5A基因的表达质粒pCNS5A共转染肝癌细胞株(Huh7细胞),采用免疫细胞化学技术、Western Blot及逆转录聚合酶链反应检测HCV NS5A蛋白及mRNA的表达;本实验分三组,将质粒pGL3-LTR-Luc(空白组)、质粒pRc/CMV+pGL3-LTR-Luc(对照组)、质粒pCNS5A+pGL3-LTR-Luc(实验组)分别转染Huh7细胞,48 h后收集细胞,采用Luc活性检测LTR的活性,以观察HCV NS5A对LTR的调控影响。所得荧光活性值以均数±标准差表示,采用Levene's方差齐性检验,多组间比较采用单因素方差分析,两两比较行LSD-t检验。结果转染pcNS5A质粒的Huh7细胞质经RT-PCR及Western Blot检测,HCV NS5A mRNA及蛋白在细胞中获得表达。方差分析结果提示LTR荧光活性在三组间有明显的差异(F=7.876,P=0.002),进一步比较各组间的差异,结果提示共转染质粒pcNS5A+pGL3-LTR-Luc组的Huh7细胞中Luc相对活性(22 476±4471)明显高于单转染pGL3-LTR-Luc组(15 887±3039,P=0.002)及共转染质粒pRc/CMV+pGL3-LTR-Luc组(16 321±4162,P=0.008),差异有统计学意义。结论表达HCV NS5A的质粒pCNS5A成功转染至Huh7细胞;HCV NS5A蛋白能激活HIV LTR,提示HCV NS5A可能为HCV促进HIV复制的分子机制之一。 展开更多
关键词 肝炎病毒属 HIV 病毒非结构蛋白质类 HIV末端重复序列
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长末端重复序列(LTR)起源假说
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作者 陈宙涛 耿运琪 《生命的化学》 CAS CSCD 1996年第3期45-46,共2页
长末端重复序列(LTR)起源假说陈宙涛,耿运琪(南开大学生命科学学院,天津300071)关键词长末端重复序列(LTR)起源反转录酶是一种很古老的酶,编码反转录酶的基因不仅在绝大多数的真核生物(动物、植物和真菌)中的病... 长末端重复序列(LTR)起源假说陈宙涛,耿运琪(南开大学生命科学学院,天津300071)关键词长末端重复序列(LTR)起源反转录酶是一种很古老的酶,编码反转录酶的基因不仅在绝大多数的真核生物(动物、植物和真菌)中的病毒、质粒或可转移因子上发现,而且在... 展开更多
关键词 反转录酶 末端重复序列 LTR 起源
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猪内源性逆转录病毒(PERV)γ1长末端重复序列(LTRs)的分子特性及鉴定
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作者 Jae-Won Huh 晋大鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第1期197-197,共1页
猪基因组中的猪内源性逆转录病毒(PERV)γ1可能是异种移植(从猪到人)中的有害因子。众所周知,长末端重复序列(LTRs)是强启动元件,能够控制PERV元件和邻近功能基因片段的转录活性。本试验通过生物信息学和试验分析对猪组织中PERVγ1 LTR... 猪基因组中的猪内源性逆转录病毒(PERV)γ1可能是异种移植(从猪到人)中的有害因子。众所周知,长末端重复序列(LTRs)是强启动元件,能够控制PERV元件和邻近功能基因片段的转录活性。本试验通过生物信息学和试验分析对猪组织中PERVγ1 LTRs的转录活性进行了研究。经RT-PCR扩增及测序鉴定出69个不同的LTR转录元件。并根据种内变异将69个LTR元件分为6个类型(15个亚型),包括串联重复序列,插入和缺失(INDEL)。更值得注意的是,所有的种内变异都发生在LTR元件的U3区域。本试验结果表明,不同PERV LTR转录体的分子特性及鉴定为进一步研究PERV及其转录奠定了基础。 展开更多
关键词 猪内源性逆转录病毒γ1 末端重复序列 转录
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整合REV-LTR基因的MDV活疫苗与亲本CVI988/Rispens株的免疫效力比较
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作者 张秀梅 宋翠萍 +6 位作者 谭磊 孙英杰 刘炜玮 廖瑛 丁铲 仇旭升 罗廷荣 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第1期73-81,共9页
利用同源重组技术将禽网状内皮组织增生症病毒(REV)的长末端重复序列(LTR)整合进CVI988/Rispens疫苗株基因组中所构建成的重组马立克氏病病毒株(r MDV-LTR株),具有较高的增殖效率。为比较r MDV-LTR株与亲本CVI988/Rispens株的免疫效力差... 利用同源重组技术将禽网状内皮组织增生症病毒(REV)的长末端重复序列(LTR)整合进CVI988/Rispens疫苗株基因组中所构建成的重组马立克氏病病毒株(r MDV-LTR株),具有较高的增殖效率。为比较r MDV-LTR株与亲本CVI988/Rispens株的免疫效力差异,开展了对这两种疫苗的比较试验。试验将这两种疫苗分别按照三个不同剂量经颈背部皮下接种1日龄SPF鸡。接种后第7 d,攻毒马立克氏病强毒株rMd5,连续观察60 d后进行剖检。临床病理观察结果发现,以不低于250 PFU/羽剂量的rMDV-LTR株或CVI988/Rispens株免疫SPF雏鸡都可以提供大于80%的免疫保护效率;以125 PFU/羽剂量的两种疫苗虽均不能提供大于80%的免疫保护效力,但rMDV-LTR株免疫组试验鸡未出现死亡,仅有2只鸡出现消瘦,剖解脏器无肿瘤,而CVI988/Rispens株免疫组鸡出现2只死亡,其中1只剖解后检出肿瘤。rMDV-LTR株和CVI988/Rispens株免疫组的免疫保护指数分别为77.78%和66.67%。由实验结果可见,在较小免疫剂量下,rMDV-LTR株免疫保护率高于亲本CVI988/Rispens疫苗株。说明重组毒rMDV-LTR疫苗株可以作为一种安全的、有效的新型MDV疫苗。 展开更多
关键词 马立克氏病 重组病毒 禽网状内皮组织增生症病毒的末端重复序列 攻毒保护 免疫效力
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马传染性贫血病毒疫苗致弱过程中不同代次毒株LTR序列变异 被引量:4
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作者 王晓钧 魏丽丽 +5 位作者 范秀娟 吕晓玲 相文华 张晓燕 邵一鸣 沈荣显 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期179-183,共5页
有研究认为病毒基因组长末端重复序列LTR与病毒的毒力和复制能力直接相关。中国马传染性贫血弱毒疫苗是由一株高致病力毒株经体外白细胞传代而致弱的疫苗。经过体外超过110代传代后,病毒丧失了对马高致死性毒力并保持了良好的免疫原性... 有研究认为病毒基因组长末端重复序列LTR与病毒的毒力和复制能力直接相关。中国马传染性贫血弱毒疫苗是由一株高致病力毒株经体外白细胞传代而致弱的疫苗。经过体外超过110代传代后,病毒丧失了对马高致死性毒力并保持了良好的免疫原性。本文对传代过程中的不同代次病毒基因LTR进行了克隆和序列测定,发现传代过程中LTR发生了一系列明确的变异,一是转录起始位点在64代之前均以GGAC为特征,64代之后则表现为不规律的GAAC,AAAC,AGAC或GGTC;二是TAR起始碱基在59代之前多数为A,而64代之后均为G;三是在45代之后(55代除外),poly(A)附加位点一致表现为AA,这种一致的核苷酸变化均发生在毒力明显降低的代次,提示这些突变引起的位点或结构变化很可能与病毒毒力减弱有直接关系。 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 代次毒株 末端重复序列
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不同亚群禽白血病病毒5′LTR序列及启动子活性分析 被引量:3
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作者 冯少珍 李娇 +2 位作者 吴晓婵 曹伟胜 廖明 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第8期125-131,共7页
对不同亚群禽白血病病毒(avian leukosis virus,ALV)5′LTR序列及其启动子活性进行了比较分析,以探讨LTR对ALV复制和致病力的影响。通过PCR分别扩增克隆了中国分离株GD08(ALV-A)、CD08(ALV-B)、HN06(血管瘤病变型ALV-J)和NX0101(骨髓瘤... 对不同亚群禽白血病病毒(avian leukosis virus,ALV)5′LTR序列及其启动子活性进行了比较分析,以探讨LTR对ALV复制和致病力的影响。通过PCR分别扩增克隆了中国分离株GD08(ALV-A)、CD08(ALV-B)、HN06(血管瘤病变型ALV-J)和NX0101(骨髓瘤病变型ALV-J)毒株基因组5′LTR片段。与国内外不同亚群ALV分离株5′LTR核苷酸序列比较发现,NX0101株和HN06株与ALV-J国内外分离株的同源性最高,达90.8%~97.5%;GD08株与ALV-A国内分离株SDAU09C1的同源性最高,为94.6%;CD08株与GD08株和ALV-J各株的同源性高达90%以上。LTR中的R区具有较高的保守性,但CD08株U3区缺失11bp,GD08株U5区与其它毒株的U5区差异较大。将LTR片段插入到pCAT-Basic载体的CAT报告基因前,通过转染DF-1细胞和测定CAT表达量来评价LTR的启动子活性。HN06株和NX0101株之间,以及GD08株和CD08株之间LTR启动子活性有差异,但差异不显著;而ALV-J毒株与GD08株和CD08株之间的LTR启动子活性差异显著。 展开更多
关键词 不同亚群禽白血病病毒 末端重复序列5′端 启动子活性
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禽网状内皮组织增殖病病毒LTR序列的启动子功能 被引量:3
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作者 赵文明 丁家波 +1 位作者 姜世金 崔治中 《中国病毒学》 CSCD 2004年第3期255-258,共4页
通过PCR方法,将禽网状内皮组织增殖病病毒(REV)的长末端重复序列(LTR)扩增并克隆进pUC-18质粒多克隆位点(MCS)的EcoRI和SacI之间,并以BGH基因的多聚腺苷酸序列作为终止子克隆到SphI和HindⅢ之间,构建成重组质粒pUC-LTR。将GFP基因和REV... 通过PCR方法,将禽网状内皮组织增殖病病毒(REV)的长末端重复序列(LTR)扩增并克隆进pUC-18质粒多克隆位点(MCS)的EcoRI和SacI之间,并以BGH基因的多聚腺苷酸序列作为终止子克隆到SphI和HindⅢ之间,构建成重组质粒pUC-LTR。将GFP基因和REV囊膜糖蛋白gp90基因分别克隆到pUC-LTR载体中,获得质粒pUC-LTR-GFP和质粒pUC-LTR-gp90。重组质粒经转染48h,能够检测到外源基因的表达。本研究提示,REVLTR能够作为启动子构建表达质粒。 展开更多
关键词 禽网状内皮组织增殖病病毒(REV) 末端重复序列(LTR) 启动子 表达质粒
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石家庄市人类免疫缺陷病毒Ⅰ型流行株基因序列测定和亚型分析 被引量:1
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作者 刘丽花 周红 +2 位作者 李秀娟 刘淑君 党静 《临床荟萃》 CAS 2009年第17期1502-1504,共3页
目的了解石家庄市人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)流行株的亚型及分布情况。方法184例HIV-1抗体阳性者抗凝全血中提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V3区并进行序列测定,与国际标准参考序列比较确定... 目的了解石家庄市人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)流行株的亚型及分布情况。方法184例HIV-1抗体阳性者抗凝全血中提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V3区并进行序列测定,与国际标准参考序列比较确定亚型。结果148例样品扩增阳性并得到相应序列,经进化树分析,45例为欧美B,37例为CRF07-BC,35例为泰国B(B’),25例为CRF01-AE,C和CRF02-AG各2例,CRF03-AB和CRF11-CPX各1例。结论石家庄市目前主要流行B、CRF07-BC、B’和CRF01-AE亚型。性传播以B、CRF01-AE亚型为主;注射吸毒以CRF07-BC亚型为主;既往采输血感染及其造成的家庭内传播全部是B’亚型。 展开更多
关键词 获得性免疫缺陷综合征 HIV末端重复序列 蛋白质亚型 序列分析
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牛泡沫病毒LTR的反式激活因子靶序列研究(英文) 被引量:1
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作者 刘佳建 耿运琪 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期87-92,共6页
牛泡沫病毒(BFV)是反转录病毒科泡沫病毒属成员之一.其基因组除编码gag,pol,env三个结构基因外,在env和3'LTR之间有2个ORF(ORF-1和ORF-2),编码自身的反式激活因子Tas等调节蛋白.本研究... 牛泡沫病毒(BFV)是反转录病毒科泡沫病毒属成员之一.其基因组除编码gag,pol,env三个结构基因外,在env和3'LTR之间有2个ORF(ORF-1和ORF-2),编码自身的反式激活因子Tas等调节蛋白.本研究利用我们实验室分离鉴定的BFV3026中国毒株[12]为材料,克隆Orf-1基因,构建pBFVORF-1表达质粒,通过带有luc基因的LTR系列缺失质粒与pBFVORF-1共转染,瞬时表达分析结果将BFVLTR上Tas应答元件(TRE)定位于-983/-668(TREI),-470/-140(TREI)和RU5区.其中TREI、TREII为正调控区域,RU5为负调控区域,并进一步证明RU5在异源启动子(BIVLTR)上具有抑制其下游基因表达的功能.这些结果表明BFVTas作用机理与慢病毒(Tat)。 展开更多
关键词 牛病毒 泡沫病毒 末端重复序列 反式激活因子
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人内源性逆转录病毒长末端重复序列功能研究进展 被引量:1
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作者 刘梦莹 贾磊 +1 位作者 喻长远 李林 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2023年第2期192-197,共6页
人内源性逆转录病毒(human endogenous retroviruses,HERVs)元件广泛分布在人类基因组中,约占人类基因组的8%。HERVs元件参与多种人体生理功能,其异常表达与多种疾病的发生发展密切相关。HERVs两端的长末端重复序列(long terminal repea... 人内源性逆转录病毒(human endogenous retroviruses,HERVs)元件广泛分布在人类基因组中,约占人类基因组的8%。HERVs元件参与多种人体生理功能,其异常表达与多种疾病的发生发展密切相关。HERVs两端的长末端重复序列(long terminal repeats,LTR)上含有的启动子、增强子和转录因子结合位点,与特定的转录因子结合后发挥调节HERVs本身及临近宿主基因的作用。本文介绍了HERVs LTR的结构及分布特点,总结了HERVs LTR相关转录因子的研究进展,旨在阐明HERVs LTR在人体生理病理过程中发挥的调控机制及作用。 展开更多
关键词 人内源性逆转录病毒 末端重复序列 转录因子结合位点 转录因子
原文传递
马传染性贫血病毒自然感染马LTR序列分析
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作者 魏丽丽 王晓钧 +3 位作者 王盈 李景鹏 相文华 沈荣显 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期81-84,共4页
我国从 2 0世纪 70年代开始使用EIAV弱毒疫苗后 ,在全国范围内基本控制了马传贫的发生 ,我们从现地少数EIAV琼扩阳性马外周血中扩增并克隆了二株EIAV前病毒 5’LTR序列 ,并与国内外毒株 5’LTR序列进行了比较分析 ,发现中国EIAVLTR特有... 我国从 2 0世纪 70年代开始使用EIAV弱毒疫苗后 ,在全国范围内基本控制了马传贫的发生 ,我们从现地少数EIAV琼扩阳性马外周血中扩增并克隆了二株EIAV前病毒 5’LTR序列 ,并与国内外毒株 5’LTR序列进行了比较分析 ,发现中国EIAVLTR特有的特异性细胞转录因子结合基序 ,同时发现PEA2位点不是强毒特有的基序 ,在弱毒中亦发现该基序。 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 末端重复序列 序列测定
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致血管瘤型J亚群禽白血病病毒的基因组序列分析
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作者 刘超男 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第A10期2071-2071,共1页
关键词 禽白血病病毒 序列分析 血管瘤病 末端重复序列 亚群 全基因组序列 组织嗜性 非编码区 转录调控 养禽场
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大规模基因组重复序列识别与分类研究进展 被引量:1
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作者 葛瑞泉 王普 +1 位作者 李烨 蔡云鹏 《集成技术》 2017年第5期55-68,共14页
重复序列在基因组中普遍存在,大量实验证实其在生物进化过程中起着重要作用。目前,重复序列的发现与识别技术已经成为基因组学的研究热点,文章分类总结了有关这方面的研究进展,并对相关工具的功能特点进行了简要分析,同时对重复序列发... 重复序列在基因组中普遍存在,大量实验证实其在生物进化过程中起着重要作用。目前,重复序列的发现与识别技术已经成为基因组学的研究热点,文章分类总结了有关这方面的研究进展,并对相关工具的功能特点进行了简要分析,同时对重复序列发展趋势进行了总结和展望。 展开更多
关键词 重复序列 转座子 末端重复序列
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