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应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成 被引量:7
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作者 刘敏 王子峰 +4 位作者 朱开玲 李洪波 高绪敏 邓兵 肖天 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期650-656,共7页
应用 PCR 结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条 DGGE 条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16SrDNA 基因 V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌... 应用 PCR 结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条 DGGE 条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16SrDNA 基因 V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria 和δ-Proteobacteria 相似。时空分析发现,低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同,低氧水体包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobac-teria),非低氧水体中没有发现蓝细菌门(Cyanobacteria)。并且8月份低氧水体中 Flavobac-teria 为优势菌群。 展开更多
关键词 细菌群落组成 16S RDNA序列分析 PCR-DCA3E 长江口低氧区
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长江口低氧区的成因及过程 被引量:5
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作者 刘贲 张霄宇 +1 位作者 曾江宁 杜文 《海洋地质与第四纪地质》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期187-194,共8页
长江口已成为世界低氧海域的一个代表性区域。近年来长江口低氧区的分布范围不断扩大,强度不断加剧。对该低氧区的表现特征、形成机制、生物地球化学过程以及生态环境影响做系统的分析和综述,并结合世界多处典型低氧区开展对比分析,认... 长江口已成为世界低氧海域的一个代表性区域。近年来长江口低氧区的分布范围不断扩大,强度不断加剧。对该低氧区的表现特征、形成机制、生物地球化学过程以及生态环境影响做系统的分析和综述,并结合世界多处典型低氧区开展对比分析,认为长江口低氧区域在地理学、海洋学上均不同于波罗的海、黑海以及东京湾等区域的低氧区,是全球低氧生态学研究的一个新的案例。该区域的深入研究将有望丰富海洋生态学研究范畴。通过综合地球化学、生态学、物理海洋学等多学科方法和技术手段,发展低氧生态学,为研究海洋低氧现象的形成机制和生态效应,以及开展防治提供方法和理论支持。 展开更多
关键词 长江口低氧区 富营养化 水体层化 低氧生态学
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长江口低氧区沉积物表层纤毛虫多样性及其时空变化 被引量:1
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作者 赵峰 徐奎栋 孟昭翠 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期3441-3448,共8页
利用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)指纹图谱和测序技术,以及Ludox-QPS(密度梯度离心-定量蛋白银染色)方法,研究了2011年4月和8月长江口低氧区3个站位表层沉积物中纤毛虫多样性及季节变化.结果表明:不同站位之间纤毛虫分子多样性存在显著差... 利用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)指纹图谱和测序技术,以及Ludox-QPS(密度梯度离心-定量蛋白银染色)方法,研究了2011年4月和8月长江口低氧区3个站位表层沉积物中纤毛虫多样性及季节变化.结果表明:不同站位之间纤毛虫分子多样性存在显著差异(ANOSIM分析:R=0.896,P=0.0001),但季节变化不显著(R=0.043,P=0.207).序列数最多的类群为旋唇纲中的寡毛类和舞毛类纤毛虫.Ludox-QPS法研究的纤毛虫活动虫体的种类数及丰度可维持在较高的水平,且在夏季增高2~5倍.Ludox-QPS法与DGGE技术检测到的不同站位间纤毛虫多样性变化趋势基本一致.但Ludox-QPS法检测到纤毛虫活动虫种类数及丰度随季节更替变化显著,该法检获的纤毛虫种类数高于DGGE条带数.长江口低氧区的纤毛虫丰度及多样性较高,可为潜在的水母水螅体提供食物支撑. 展开更多
关键词 纤毛虫多样性 长江口低氧区 DGGE指纹图谱 水母暴发
原文传递
Fish assemblage structure in the hypoxic zone in the Changjiang (Yangtze River) estuary and its adjacent waters 被引量:1
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作者 单秀娟 金显仕 袁伟 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2010年第3期459-469,共11页
Fish assemblage structure in the hypoxic zone in the Changjiang (Yangtze River) estuary and its adjacent waters were analyzed based on data from bottom trawl surveys conducted on the R/V Beidou in June, August and Oct... Fish assemblage structure in the hypoxic zone in the Changjiang (Yangtze River) estuary and its adjacent waters were analyzed based on data from bottom trawl surveys conducted on the R/V Beidou in June, August and October 2006. Four fish assemblages were identified in each survey using two-way indicator species analysis (TWIA). High fish biomass was found in the northern part, central part and coastal waters of the survey area; in contrast, high fish diversity was found in the southern part of the survey area and the Changjiang estuary outer waters. Therefore, it is difficult to maintain high fishery production when high fish diversity is evenly distributed in the fish community. Fish became smaller and fish size spectra tended to be narrower because of fish species variations and differences in growth characteristics. Fish diversity increased, the age to maturity was reduced and some migrant species were not collected in the surveys. Fish with low economic value, small size, simple age structure and low tropic level were predominant in fish assemblages in the Changjiang estuary and its adjacent waters. The lowest hypoxic value decreased in the Changjiang estuary and its adjacent waters. 展开更多
关键词 the Changjiang estuary fish assemblage structure diversity size spectrum
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