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应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成
被引量:
7
1
作者
刘敏
王子峰
+4 位作者
朱开玲
李洪波
高绪敏
邓兵
肖天
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期650-656,共7页
应用 PCR 结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条 DGGE 条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16SrDNA 基因 V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌...
应用 PCR 结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条 DGGE 条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16SrDNA 基因 V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria 和δ-Proteobacteria 相似。时空分析发现,低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同,低氧水体包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobac-teria),非低氧水体中没有发现蓝细菌门(Cyanobacteria)。并且8月份低氧水体中 Flavobac-teria 为优势菌群。
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关键词
细菌群落组成
16S
RDNA序列分析
PCR-DCA3E
长江口低氧区
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职称材料
长江口低氧区的成因及过程
被引量:
5
2
作者
刘贲
张霄宇
+1 位作者
曾江宁
杜文
《海洋地质与第四纪地质》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期187-194,共8页
长江口已成为世界低氧海域的一个代表性区域。近年来长江口低氧区的分布范围不断扩大,强度不断加剧。对该低氧区的表现特征、形成机制、生物地球化学过程以及生态环境影响做系统的分析和综述,并结合世界多处典型低氧区开展对比分析,认...
长江口已成为世界低氧海域的一个代表性区域。近年来长江口低氧区的分布范围不断扩大,强度不断加剧。对该低氧区的表现特征、形成机制、生物地球化学过程以及生态环境影响做系统的分析和综述,并结合世界多处典型低氧区开展对比分析,认为长江口低氧区域在地理学、海洋学上均不同于波罗的海、黑海以及东京湾等区域的低氧区,是全球低氧生态学研究的一个新的案例。该区域的深入研究将有望丰富海洋生态学研究范畴。通过综合地球化学、生态学、物理海洋学等多学科方法和技术手段,发展低氧生态学,为研究海洋低氧现象的形成机制和生态效应,以及开展防治提供方法和理论支持。
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关键词
长江口低氧区
富营养化
水体层化
低氧
生态学
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职称材料
长江口低氧区沉积物表层纤毛虫多样性及其时空变化
被引量:
1
3
作者
赵峰
徐奎栋
孟昭翠
《应用生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第12期3441-3448,共8页
利用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)指纹图谱和测序技术,以及Ludox-QPS(密度梯度离心-定量蛋白银染色)方法,研究了2011年4月和8月长江口低氧区3个站位表层沉积物中纤毛虫多样性及季节变化.结果表明:不同站位之间纤毛虫分子多样性存在显著差...
利用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)指纹图谱和测序技术,以及Ludox-QPS(密度梯度离心-定量蛋白银染色)方法,研究了2011年4月和8月长江口低氧区3个站位表层沉积物中纤毛虫多样性及季节变化.结果表明:不同站位之间纤毛虫分子多样性存在显著差异(ANOSIM分析:R=0.896,P=0.0001),但季节变化不显著(R=0.043,P=0.207).序列数最多的类群为旋唇纲中的寡毛类和舞毛类纤毛虫.Ludox-QPS法研究的纤毛虫活动虫体的种类数及丰度可维持在较高的水平,且在夏季增高2~5倍.Ludox-QPS法与DGGE技术检测到的不同站位间纤毛虫多样性变化趋势基本一致.但Ludox-QPS法检测到纤毛虫活动虫种类数及丰度随季节更替变化显著,该法检获的纤毛虫种类数高于DGGE条带数.长江口低氧区的纤毛虫丰度及多样性较高,可为潜在的水母水螅体提供食物支撑.
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关键词
纤毛虫多样性
长江口低氧区
DGGE指纹图谱
水母暴发
原文传递
题名
应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成
被引量:
7
1
作者
刘敏
王子峰
朱开玲
李洪波
高绪敏
邓兵
肖天
机构
中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室
中国科学院研究生院
国家海洋环境监测中心
华东师范大学河口海岸国家重点实验室
出处
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期650-656,共7页
基金
973计划(2006CB400604)
国家自然科学基金(40376048)
中国科学院研究生院科学与社会实践资助专项(创新研究类)资助
文摘
应用 PCR 结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条 DGGE 条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16SrDNA 基因 V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria 和δ-Proteobacteria 相似。时空分析发现,低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同,低氧水体包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobac-teria),非低氧水体中没有发现蓝细菌门(Cyanobacteria)。并且8月份低氧水体中 Flavobac-teria 为优势菌群。
关键词
细菌群落组成
16S
RDNA序列分析
PCR-DCA3E
长江口低氧区
Keywords
bacterial community composition, 16S rDNA phylogenetic analysis, PCR-DGGE, hypoxia in Changjiang estuary
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
长江口低氧区的成因及过程
被引量:
5
2
作者
刘贲
张霄宇
曾江宁
杜文
机构
浙江大学地球科学学院
国家海洋局第二海洋研究所国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室
浙江大学海洋学院
出处
《海洋地质与第四纪地质》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期187-194,共8页
基金
国家自然科学基金"富稀土的含沸石深海黏土中稀土元素的物质来源研究"(41773005)
国家自然科学基金"基于现场数据的CDOM光学属性和陆源输入DOC的定量关系研究"(40706057)
+2 种基金
国家海洋局第二海洋研究所基本科研业务费专项(JG1616
JG1312)
海洋公益性行业科研专项(201505008-2)
文摘
长江口已成为世界低氧海域的一个代表性区域。近年来长江口低氧区的分布范围不断扩大,强度不断加剧。对该低氧区的表现特征、形成机制、生物地球化学过程以及生态环境影响做系统的分析和综述,并结合世界多处典型低氧区开展对比分析,认为长江口低氧区域在地理学、海洋学上均不同于波罗的海、黑海以及东京湾等区域的低氧区,是全球低氧生态学研究的一个新的案例。该区域的深入研究将有望丰富海洋生态学研究范畴。通过综合地球化学、生态学、物理海洋学等多学科方法和技术手段,发展低氧生态学,为研究海洋低氧现象的形成机制和生态效应,以及开展防治提供方法和理论支持。
关键词
长江口低氧区
富营养化
水体层化
低氧
生态学
Keywords
the hypoxia zone of the Yangtze Estuary
eutrophication
stratification
hypoxia ecology
分类号
X141 [环境科学与工程—环境科学]
下载PDF
职称材料
题名
长江口低氧区沉积物表层纤毛虫多样性及其时空变化
被引量:
1
3
作者
赵峰
徐奎栋
孟昭翠
机构
中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室
中国科学院大学
出处
《应用生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第12期3441-3448,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划项目(2011CB403604)
中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-Z-5)资助
文摘
利用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)指纹图谱和测序技术,以及Ludox-QPS(密度梯度离心-定量蛋白银染色)方法,研究了2011年4月和8月长江口低氧区3个站位表层沉积物中纤毛虫多样性及季节变化.结果表明:不同站位之间纤毛虫分子多样性存在显著差异(ANOSIM分析:R=0.896,P=0.0001),但季节变化不显著(R=0.043,P=0.207).序列数最多的类群为旋唇纲中的寡毛类和舞毛类纤毛虫.Ludox-QPS法研究的纤毛虫活动虫体的种类数及丰度可维持在较高的水平,且在夏季增高2~5倍.Ludox-QPS法与DGGE技术检测到的不同站位间纤毛虫多样性变化趋势基本一致.但Ludox-QPS法检测到纤毛虫活动虫种类数及丰度随季节更替变化显著,该法检获的纤毛虫种类数高于DGGE条带数.长江口低氧区的纤毛虫丰度及多样性较高,可为潜在的水母水螅体提供食物支撑.
关键词
纤毛虫多样性
长江口低氧区
DGGE指纹图谱
水母暴发
Keywords
ciliate diversity
hypoxic zone of Yangtze River estuary
DGGE fingerprinting
jelly-fish bloom.
分类号
Q958.8 [生物学—动物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成
刘敏
王子峰
朱开玲
李洪波
高绪敏
邓兵
肖天
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2008
7
下载PDF
职称材料
2
长江口低氧区的成因及过程
刘贲
张霄宇
曾江宁
杜文
《海洋地质与第四纪地质》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
下载PDF
职称材料
3
长江口低氧区沉积物表层纤毛虫多样性及其时空变化
赵峰
徐奎栋
孟昭翠
《应用生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
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参考文献
引证文献
统计分析
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