长白山野杂猪和东北民猪背最长肌的mRNA转录组比较分析

本研究通过RNA-seq技术对3个长白山野杂猪与3个东北民猪背最长肌样本进行了mRNA测序和差异分析,从而为筛选长白山野杂猪肉质性状功能基因奠定基础。结果显示:在长白山野杂猪与东北民猪中均有100%以上的序列能完全比对到猪的基因组上,而所转录的基因占总基因的比例在3头长白山野杂猪中平均为59.67%,3头东北民猪为58.73%,而在不同个体间SNP位点数为14299~19671;在2个品种猪背最长肌中共表达基因有15842个,仅在长白山野杂猪中表达的基因有619个,仅在东北民猪中表达的基因有710个;在2个品种猪背最长肌中共获得显著差异表达的基因153个,其中在长白山野杂猪中上调表达的基因有55个,下调表达的基因有98个;GO分析显示,153个差异表达基因被注释到33条GO条目中,其中11条被注释到生物学过程中,11条被注释到细胞组分,11条被注释到分子功能;KEGG分析显示,这些差异表达基因被富集到130条通路中,其中主要与脂肪代谢相关的信号通路有关。结果表明,长白山野杂猪与东北民猪背最长肌中mRNA表达存在差异,这些差异表达基因将是将来研究2个品种猪间肉质差异的主要靶标之一。

长白山野杂猪和商品猪骨骼肌组织学特性的比较研究

为了探讨长白山野杂猪和商品猪肉质特点及差异,以长白山野杂猪和商品猪半腱肌、背最长肌、股二头肌和腰大肌为试验材料,采用常规组织化学染色方法,对长白山野杂猪和商品猪骨骼肌组织学特性进行比较研究。结果显示,长白山野杂猪的股二头肌与腰大肌肌纤维的直径和面积均低于商品猪,而肌纤维密度显著高于商品猪,但是长白山野杂猪的半腱肌和背最长肌的肌纤维直径、面积及密度同商品猪相比均没有显著差异。结果表明,长白山野杂猪的猪肉品质优于商品猪的猪肉品质。

长白山野杂猪和东北民猪背最长肌的mRNA转录组和miRNA转录组关联分析

本研究通过对长白山野杂猪与东北民猪背最长肌组织中miRNA和mRNA表达情况的高通量分析,获得了大量的数据信息。通过随机挑选的3个miRNA和3个基因的RNA-Seq测序结果进行qRT-PCR验证,对显著差异表达的23个miRNA与153个mRNA做了关联分析,最终获得6个差异表达miRNA与10个差异表达基因相对应。其中,1个下调miRNA对应2个上调差异表达基因,5个上调miRNA对应8个下调显著表达差异基因。

长白山野杂猪、民猪和大白猪血常规及免疫学指标比较分析

利用血常规及ELISA方法对长白山野杂猪、民猪及大白猪群体免疫学指标进行检测，并对检测结果进行统计学分析。结果显示3个群体中血常规指标及血清免疫学指标均存在显著性差异。其中民猪群体中白细胞数量最低（P〈0．05），原因在于淋巴细胞的数量显著降低（P〈0．01）。民猪群体红细胞含量最高（P〈0．01），但单位数量红细胞内血红蛋白含显著降低以致血液血红蛋白总量降低。野杂猪群体中除含有较高数量的白细胞、淋巴细胞外，还含有较高含量的抗体（P〈0．05），大白猪在大部分指标中均处于较低水平。聚类判定分析显示3群体内个体较为集中，群体间存在明显距离，说明能够代表各自群体。3群体血常规及血清免疫学指标为进一步筛选高抗病力分子标志及遗传基础研究奠定基础。

长白山野杂猪与东北民猪肉质性状的比较

在相同的条件下对长白山野杂猪与东北民猪进行饲养、屠宰,待肌肉成熟后,对两种猪胴体指标(胴体质量、眼肌面积和背膘厚)、肉质的物理指标(pH值、肉色、滴水损失、蒸煮损失和剪切力)、常规化学指标(粗蛋白、粗脂肪、胆固醇、水分和灰分)及氨基酸和肌内脂肪酸组成及含量进行了测定。结果显示,胴体指标在长白山野杂猪和东北民猪肉中无显著性差异(P>0.05);长白山野杂猪肉中剪切力显著低于东北民猪(P<0.05);长白山野杂猪肉中的粗脂肪含量显著高于东北民猪(P<0.05);氨基酸在长白山野杂猪和东北民猪肉中无显著性差异,但在长白山野杂猪中均有增高的趋势(P>0.05);长白山野杂猪肉脂肪酸中的C8:0、C10:0、C12:0、C14:0、C15:0、C16:0、C16:1、C18:1T、C18:1C含量显著高于东北民猪(P<0.05)。结果表明,长白山野杂猪的肉质优于东北民猪,可满足人们对高品质猪肉的需求,表现出了一定的杂交优势。

寒冷季节热休克蛋白70、90在不同遗传背景猪群体中差异分析

为探讨寒冷季节不同遗传背景猪热休克蛋白70,90的分子行为,在寒冷季节(1月份)采集长白山野杂猪、民猪和大白猪外周血及肝脏组织样品,分别用ELISA和QRT-PCR方法检测HSP70,90的表达量。结果显示民猪群体外周血HSP70含量最高,野杂猪次之,大白猪最低,但三个群体中HSP70含量不存在显著差异(p>0.05)。外周血HSP90含量检测发现野杂猪最高,民猪次之,大白猪最低,其中野杂猪与大白猪群体间HSP90含量呈现极显著的差异性(p<0.01)。肝脏mRNA表达检测发现HSP70基因mRNA在野杂猪中高表达,表达量约为大白猪的1.5倍,民猪次之,表达量约为大白猪的1.2倍。HSP90基因mRNA同样在野杂猪中最高,约为大白猪的3.5倍,民猪约为大白猪的1.7倍。HSP70和90外周血含量及肝脏m RNA表达表现出一定的趋同性。本研究结果表明不同遗传背景猪中HSP70和90血清含量及肝脏组织表达量存在差异。