长链非编码RNA母系表达基因8通过微小RNA-495-3p调控急性髓性白血病细胞高迁移率族蛋白A1表达及对细胞增殖、凋亡的作用机制研究

目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因8(MEG8)通过微小RNA-495-3p(miR-495-3p)调控急性髓性白血病细胞(AML)高迁移率族蛋白A1(HMGA1)表达及对细胞增殖、凋亡的机制。方法:选取50例经确诊为AML患者的骨髓活检标本与52例健康骨髓捐赠者骨髓标本,常规培养人AML细胞株HL-60,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法骨髓单个核细胞中lncRNA MEG8 mRNA表达。将HL-60细胞分为六组,即HL-60组(HL-60细胞)、si-NC组(转染si-NC)、si-lncRNA MEG8组(转染si-lncRNA MEG8)、mimic-NC组(转染mimic-NC)、miR-495-3p mimic组(转染miR-495-3p mimic)、si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组(转染si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic),CCK-8法检测培养24、48、72 h各组细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blot法检测细胞中HMGA1表达,双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA MEG8、miR-495-3p、HMGA1之间的关系。结果:与对照组相比,观察组lncRNA MEG8 mRNA表达升高(P<0.05)。与miR NC+MEG8 WT组比较,miR-495-3p mimic+MEG8 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05),与miR NC+HMGA1 WT组比较,miR-495-3p mimic+HMGA1 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组、mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8组、miR-495-3p mimic组和si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组24、48 h细胞增殖能力均显著下降,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组细胞增殖率最低(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HL-60细胞凋亡率高于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HMGA1蛋白表达低于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。结论:沉默lncRNA MEG8可能通过上调miR-495-3p来下调HMGB1,来抑制HL-60细胞的恶性生物学行为,可为探索AML潜在治疗靶点提供了新思路。

急性缺血性脑卒中患者血清长链非编码RNA母系表达基因3和Zeste同源物增强子-2表达与神经功能损伤的相关性分析

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)与Zeste同源物增强子-2(EZH2)在急性缺血性脑卒中(AIS)患者血清中的表达水平及其与神经功能损伤之间的关系。方法选取延安市人民医院2021年1月至2022年11月收治的92例AIS患者为脑卒中组,92例健康体检者为对照组,根据NIHSS评分将脑卒中组患者分为致残性损伤组19例,非致残性损伤组73例。采用实时荧光定量聚合酶链式反应、酶联免疫吸附法分别检测血清lncRNAMEG3、EZH2水平。采用Spearman相关分析法进行AIS患者血清lncRNAMEG3、EZH2表达水平与美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分之间的相关性分析;采用多因素Logistic回归分析AIS患者合并神经功能致残性损伤的影响因素,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA MEG3、EZH2水平对AIS患者合并神经功能致残性损伤的诊断价值。结果脑卒中组患者血清lncRNA MEG3、EZH2表达水平均高于对照组(t=11.817、11.542,P<0.05)。Spearman相关分析显示,AIS患者血清lncRNA MEG3、EZH2水平与NIHSS评分均呈正相关(r=0.540、0.603,P<0.01)。致残性损伤组体质量指数、吸烟史占比、甘油三酯、总胆固醇、同型半胱氨酸、发病-到院时间(ODT)、lncRNAMEG3、EZH2水平均高于非致残性损伤组(t/χ2=2.103、5.050、9.121、5.585、2.276、5.448、4.638、4.682,P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,甘油三酯、总胆固醇、lncRNA MEG3、EZH2以及ODT均是AIS患者合并神经功能致残性损伤的影响因素(OR=4.853、4.277、2.674、3.052、3.901,P<0.05)。lncRNA MEG3、EZH2联合诊断AIS患者合并神经功能致残性损伤的曲线下面积(AUC)大于lncRNAMEG3以及EZH2单独诊断的AUC(Z=2.626、2.954,P<0.01),敏感度、特异度分别为94.74%、82.15%。结论AIS患者血清lncRNA MEG3、EZH2水平均上升,与AIS患者神经功能损伤程度均正相关,可用作AIS患者合并神经功能致残性损伤的诊断指标,且联合诊断效果更好。

长链非编码RNA CASC8在食管癌组织中的表达及临床意义

目的分析长链非编码RNA癌易感性候选基因8(cancer susceptibility candidate 8,CASC8)在食管癌组织中的表达及临床意义。方法结合癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析结果和回顾郑州大学第一附属医院2018年2月至2019年2月行手术治疗的38例食管癌患者临床资料,采用qRT-PCR检测食管癌和癌旁组织CASC8表达水平。以患者性别、年龄、TNM分期、分化程度、淋巴结转移作为观察指标,分析CASC8与上述临床资料的关系。结果CASC8在TCGA数据库的食管癌样本中显示出高表达,高表达CASC8的食管癌患者生存率降低(P<0.05),但与肿瘤的TNM分期相关性并不明显(P>0.05)。在临床上所收集的食管癌患者肿瘤样本中,与低表达CASC8组比,高表达组食管癌患者3 a生存率明显降低。临床资料分析显示CASC8表达越高,与患者分化程度、淋巴结转移和TNM分期有显著相关性(P<0.05)。结论CASC8在食管癌组织中的表达水平高于癌旁组织,且CASC8表达与患者分化程度、淋巴结转移、TNM分期及预后显著相关。CASC8可以作为食管癌诊断及预后评价的指标之一。

特应性皮炎患儿血清长链非编码RNA母系表达基因3和微小RNA-23b-3p水平检测及意义

目的:探讨特应性皮炎(AD)患儿血清长链非编码RNA母系表达基因3(lncRNA MEG3)和微小RNA-23b-3p(miR-23b-3p)水平检测及意义。方法:选取AD患儿165例(AD组)和体检健康儿童160例(对照组)为研究对象。采用荧光定量PCR法检测两组血清lncRNA MEG3和miR-23b-3p水平。采用AD积分指数(SCORAD)对AD患儿疾病严重程度进行评估,并将AD组患儿分为AD轻度组(65例)、AD中度组(68例)和AD重度组(32例)。比较对照组和AD组以及不同严重程度AD患儿血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p水平。采用Pearson法分析AD组血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p水平和SCORAD评分三者间的相关性。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p水平检测对中、重度AD的诊断价值。结果:与对照组比较,AD组血清lncRNA MEG3和miR-23b-3p水平显著降低(均P<0.05)。与AD轻度组比较,AD中度组和AD重度组血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p水平依次降低,SCORAD评分依次升高(均P<0.05)。AD组血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p水平呈正相关(r=0.404,P<0.05)。血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p水平与SCORAD评分均呈负相关(r=-0.383、-0.366,均P<0.05)。血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p单项及联合检测诊断中度AD的曲线下面积(AUC)分别为0.818、0.753、0.883。与血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p单独检测比较,两者联合检测诊断中度AD的AUC更高(Z=2.177、3.595,均P<0.05)。血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p单项及联合检测诊断重度AD的AUC分别为0.794、0.778、0.895。与血清lncRNA MEG3、miR-23b-3p单独检测比较,两者联合检测诊断重度AD的AUC更高(Z=2.104、2.293,均P<0.05)。结论:AD患儿血清lncRNA MEG3和miR-23b-3p水平呈低表达,与病情严重程度有关,有望成为评估儿童AD病情程度的生物标志物。

胆管癌患者血清长链非编码RNA母系表达基因3表达及其与预后相关性研究

目的:探讨胆管癌患者血清长链非编码RNA母系表达基因3(lncRNA MEG3)表达及其与预后的关系。方法:选取胆管癌患者92例(胆管癌组)和体检健康者92例(对照组)为研究对象。术后随访36个月,根据预后情况分为预后不良组(44例,患者死亡)和预后良好组(48例,患者存活)。采用荧光定量PCR检测血清lncRNA MEG3表达水平。比较对照组与胆管癌组血清lncRNA MEG3表达水平。比较预后良好组和预后不良组临床资料、病理特征及血清lncRNA MEG3表达水平。采用Spearman法分析胆管癌患者血清lncRNA MEG3表达水平与肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结转移、血管浸润的相关性。采用多因素Logistic回归分析胆管癌患者预后不良的影响因素。采用受试者工作特征(ROC)曲线评价血清lncRNA MEG3对胆管癌患者预后不良的预测价值。结果:胆管癌组血清lncRNA MEG3表达水平低于对照组(P<0.05)。预后不良组肿瘤低分化、TNM分期Ⅲ期、有淋巴结转移、有血管浸润比例高于预后良好组,血清lncRNA MEG3表达水平低于预后良好组(均P<0.05)。胆管癌患者血清lncRNA MEG3表达水平与肿瘤分化程度呈正相关,与TNM分期、淋巴结转移、血管浸润呈负相关(均P<0.05)。肿瘤低分化、TNM分期Ⅲ期、有淋巴结转移、血清lncRNA MEG3低表达是胆管癌患者预后不良的独立危险因素(均P<0.05)。血清lncRNA MEG3预测胆管癌患者预后不良的曲线下面积为0.820,截断值为0.620,敏感度为87.10%,特异度为70.80%。结论:胆管癌患者血清lncRNA MEG3呈低表达,与患者预后密切相关,对预测胆管癌患者预后不良有较高预测价值。

长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)对糖尿病视网膜病变大鼠模型视网膜血管内皮细胞凋亡的影响

目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)对糖尿病视网膜病变(DR)大鼠模型视网膜血管内皮细胞凋亡的影响。方法取SPF级雄性SD大鼠以及体外培养的人视网膜微血管内皮细胞(HRMEC),均随机分为对照组、模型组、LncRNA MEG3过表达组、miR-145-5p agomir组、共转染(LncRNA MEG3过表达质粒+miR-145-5p agomir)组、共转染阴性对照(LncRNA MEG3空载质粒+miR-145-5p agomir阴性对照质粒)组,采用腹腔注射链脲佐菌素建立DR大鼠模型,25 mmol·L^(-1)葡萄糖诱导DR细胞模型。对照组大鼠腹腔注射柠檬酸缓冲液,对照组细胞以正常培养基培养,将大鼠与细胞均分组进行处理,以LncRNA MEG3质粒、miR-145-5p agomir转染处理后,通过伊文思蓝(EB)检测大鼠视网膜血管通透性;TUNEL染色检测大鼠视网膜血管内皮细胞凋亡率;EdU染色与Hoechst 33258染色分别检测细胞增殖、凋亡情况;依照试剂盒测量大鼠房水中及HRMEC炎症因子白细胞介素(IL)-6、IL-1β含量;实时荧光定量PCR实验检测HRMEC及大鼠视网膜组织miR-145-5p表达;蛋白免疫印迹法检测HRMEC及大鼠视网膜组织凋亡相关蛋白(Bcl-2、Bax)表达;双荧光素酶实验验证HRMEC中LncRNA MEG3对miR-145-5p的靶向调节作用。结果LncRNA MEG3过表达组大鼠玻璃体中EB含量、视网膜血管内皮细胞凋亡率及房水中IL-6、IL-1β含量均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05);miR-145-5p agomir组大鼠玻璃体中EB含量、视网膜血管内皮细胞凋亡率及房水中IL-6、IL-1β含量均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。LncRNA MEG3过表达组HRMEC增殖率均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05),HRMEC凋亡率及IL-6、IL-1β含量均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05);miR-145-5p agomir组HRMEC增殖率均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05),HRMEC凋亡率及IL-6、IL-1β含量均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。LncRNA MEG3过表达组HRMEC、大鼠视网膜组织miR-145-5p及Bax表达均低于模型组、共转染组,Bcl-2表达均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05);miR-145-5p agomir组HRMEC、大鼠视网膜组织miR-145-5p及Bax表达均高于模型组、共转染组,Bcl-2表达均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。转染野生型miR-145-5p报告质粒+LncRNA MEG3过表达质粒组细胞相对荧光素酶活性(0.33±0.05)低于转染野生型miR-145-5p报告质粒+LncRNA MEG3空载质粒组(1.02±0.21),差异有统计学意义(P<0.05)。结论LncRNA MEG3可通过靶向下调miR-145-5p表达,抑制炎症反应,减轻DR大鼠视网膜血管内皮细胞凋亡,促使HRMEC DR细胞模型存活,改善DR大鼠视网膜血管屏障功能。

长链非编码RNA母系表达基因3对宫颈癌细胞自噬的影响

目的研究长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)对宫颈癌细胞自噬的影响。方法将人宫颈癌细胞系HeLa分为两组,对照组转染空载质粒的HeLa细胞,实验组使用病毒转染方式对HeLa细胞系进行过表达MEG3基因。使用实时荧光定量聚合酶链反应技术测定HeLa细胞中MEG3基因的信使RNA(mRNA)表达水平,然后采用CCK8法检测细胞增殖情况,流式细胞术检测细胞凋亡情况。利用Western blot技术检测HeLa细胞中自噬标记蛋白[微管相关蛋白1轻链3(LC3)-Ⅱ/LC3-Ⅰ]的表达水平。结果实验组lncRNA MEG3 mRNA表达水平显著高于对照组(750.59±7.30比1.01±0.04)(t=324.911,P<0.001)。不同时点间HeLa细胞增殖率的主效应差异有统计学意义(P<0.01),不考虑测量时间两组间的主效应差异有统计学意义(P<0.01),组间和时点间存在交互作用;与对照组相比,实验组不同时点间HeLa细胞的细胞增殖能力明显降低(P<0.05)。实验组HeLa细胞总凋亡率明显高于对照组[(32.43±0.50)%比(19.67±0.05)%](t=36.032,P<0.001)。两组LC3-Ⅰ蛋白表达比较差异无统计学意义(P>0.05),实验组LC3-Ⅱ蛋白表达、LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ比值低于对照组(P<0.01)。结论lncRNA MEG3可以抑制宫颈癌自噬和增殖活性,促进肿瘤细胞的凋亡,有望成为宫颈癌治疗的靶点。

长链非编码RNA与骨性关节炎

背景:骨性关节炎作为中老年常见疾病,发病机制尚不清晰。长链非编码RNA通过多种途径参与骨性关节炎发病过程,如调控翻译、促进或者抑制mRNA表达、吸附miRNA等。目的:综述多种长链非编码RNA在骨性关节炎中的作用机制及研究进展。方法:检索中国知网、万方数据库、维普数据库、PubMed、Web of Science和Sciencedirect数据库,以“osteoarthritis,degenerative joint disease,degenerative arthritis,OA,LncRNA,long non-coding RNA,long noncoding RNA,long intergenic non-coding RNA”为英文检索词,以“骨性关节炎,骨关节炎,OA,长链非编码RNA,长链非编码核糖核酸,LncRNA”为中文检索词,检索1976年至2024年5月发表的所有相关文献,并对其进行筛选、归纳、分析、总结,最后纳入93篇文献进行综述。结果与结论:①收集了目前与骨性关节炎关系研究较多且较深入的25种长链非编码RNA;②长链非编码RNA可以充当miRNA的分子海绵,作为竞争性内源性RNA竞争性吸附miRNA,进而影响下游靶点;③长链非编码RNA可以调控软骨细胞的凋亡与增殖、软骨细胞外基质降解以及炎症反应等生理病理进程;④长链非编码RNA有望成为骨性关节炎临床诊断及治疗预后的生物标志物和潜在治疗靶点,未来可能会成为骨性关节炎临床治疗的新策略。

基于加权基因共表达网络分析筛选结肠癌关键长链非编码RNA及其竞争性内源RNA网络构建

目的通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法筛选与结肠癌可能相关的长链非编码RNA(lncRNA),并构建其竞争性内源RNA(ceRNA)网络,为进一步探索结肠癌的机制提供依据。方法在GEO数据库下载结肠癌GSE126092的数据信息,获得差异表达lncRNA。下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠癌组织及结肠正常组织lncRNA的表达数据,通过WGCNA方法筛选出与结肠癌相关性最高的模块,与GEO差异表达lncRNA取交集筛选出结肠癌关键lncRNA,进一步构建这些lncRNA相关的ceRNA网络,对靶mRNA进行基因本位(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果共筛选出6个在结肠癌组织和正常组织中具有差异表达的lncRNA:锌指NFX1结构1反义RNA1(ZFAS1),β1,3-半乳糖基转移酶5反义RNA1(B3GALT5-AS1),细胞色素P450家族1亚家族B成员1反义RNA1(CYP1B1-AS1),二肽基肽酶样10反义RNA1(DPP10-AS1),VPS9包含域1反义RNA1(VPS9D1-AS1)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B反义RNA1(CDKN2B-AS1),并构建了其相关ceRNA网络。GO功能分析结果显示,生物功能主要集中在DNA模板转录调控、RNA聚合酶Ⅱ基因启动子的转录调控和RNA聚合酶Ⅱ启动子转录负向调控等;细胞功能主要集中在细胞核、突触、神经细胞体、突触后密集区和微管相关复合体;分子功能主要集中在核酸结合、金属离子结合、DNA结合等。KEGG富集分析结果显示,基因主要富集在癌症蛋白聚糖、磷脂酰肌醇-3-羟激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)信号通路、Rap1信号通路和局部粘连等。结论本研究通过WGCNA分析方法筛选出可能与结肠癌相关的lncRNA,并构建了其相关的ceRNA调控网络,可供后续实验验证。

长链非编码RNA母系表达基因3在肿瘤中表达的研究现状

长链非编码RNA母系表达基因3(MEG3)在多种肿瘤组织及细胞中异常表达,可通过不同的机制参与肿瘤的发生发展,并且与肿瘤转移、耐药及预后密切相关。作者就MEG3在肿瘤中表达的研究现状及作用机制作一综述。

高血压病人血清中长链非编码RNA MEG3、miR-142-3p表达及与内皮功能的相关性

目的:通过检测高血压病人血清中长链非编码RNA母系表达基因3(lncRNA MEG3)和微小RNA-142-3p(miR-142-3p)的表达水平,分析两者与高血压相关内皮功能的相关性。方法:入选2018年8月—2020年10月我院门诊部收治的145例高血压病人为观察组,另入选同期在我院体检的145名健康体检者为对照组。所有研究对象空腹采集5 mL静脉血,采用反转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测血清lncRNA MEG3和miR-142-3p的mRNA的相对表达水平,酶联免疫吸附技术检测血清一氧化氮(NO)、血管内皮素(ET-1)、血管性血友病因子(vWF)表达水平,比较观察组和对照组各项指标表达水平。根据疾病分级标准将观察组高血压病人分为轻度组(45例)、中度组(60例)和重度组(40例),比较不同组别之间各项指标表达水平,使用Pearson法分析观察组血清lncRNA MEG3和miR-142-3p表达水平与NO、ET-1和vWF水平之间的相关性及lncRNA MEG3与miR-142-3p表达水平之间的相关性。结果:与对照组比较,观察组血清lncRNA MEG3和NO的表达水平下降(P<0.001),血清miR-142-3p、ET-1和vWF的表达水平升高(P<0.001);血清lncRNA MEG3和NO在轻度组、中度组和重度组高血压病人中的表达水平依次降低,血清miR-142-3p、ET-1和vWF的表达水平则依次增高(P<0.001);观察组血清lncRNA MEG3表达水平与NO水平呈正相关(r=0.682,P<0.001),与ET-1和vWF水平呈负相关(r=-0.500,P<0.001;r=-0.637,P<0.001);血清miR-142-3p表达水平与NO水平呈负相关(r=-0.683,P<0.001),与ET-1和vWF水平呈正相关(r=0.458,P<0.001;r=0.678,P<0.001);观察组血清lncRNA MEG3与miR-142-3p表达水平呈负相关(r=-0.607,P<0.001);多因素Logistic回归分析结果显示,lncRNA MEG3、NO水平降低及miR-142-3p、ET-1、vWF水平升高均是高血压的危险因素(P<0.05)。结论:高血压病人血清中lncRNA MEG3表达水平降低,miR-142-3p表达水平升高,可能在高血压的进展中具有调节作用,其表达水平能够反映高血压病人内皮功能受损的程度。

长链非编码RNA配对盒基因8反义RNA1在恶性肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的RNA转录本。配对盒基因8反义RNA1(PAX8-AS1)是lncRNA的一种,在甲状腺癌、乳腺癌、子宫内膜癌、急性白血病、肾上腺皮质癌等多种恶性肿瘤中异常表达,通过作为竞争性内源RNA和其单核苷酸多态性等机制调节癌细胞的增殖、凋亡、侵袭和耐药性,对癌症的诊断、治疗及预后具有非常重要的价值。本文就lncRNA PAX8-AS1在恶性肿瘤中的作用机制及潜在应用进行综述。

长链非编码RNA母系表达基因3、微小RNA-21表达与冠状动脉钙化的相关性分析

目的探究长链非编码RNA母系表达基因3(LncRNA MEG3)、微小RNA-21(miR-21)与冠状动脉钙化的相关性。方法选取2018年6月至2019年6月在邯郸市中心医院行冠状动脉造影及CT检查确诊为冠状动脉钙化病人189例作为钙化组,另选取同期在该院行冠状动脉造影及CT检查显示无冠状动脉钙化者183例作为未钙化组。采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)法检测血清LncRNA MEG3、miR-21表达水平,采用Pearson法分析病人血清LncRNA MEG3、miR-21水平及与糖化血红蛋白(HbA1c)、高敏C反应蛋白(hs-CRP)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-1β(IL-1β)水平相关性,采用logistic回归模型分析冠状动脉钙化发生的影响因素,采用ROC曲线评估血清LncRNA MEG3、miR-21表达水平对冠状动脉钙化的预测价值。结果与未钙化组相比,钙化组血清miR-21[2.87±0.93比1.02±0.29]、HbA1c[(6.95±1.31)%比(5.41±1.26)%]、hs-CRP[(5.13±1.74)mg/L比(3.02±1.01)mg/L]、TNF-α[(11.72±3.92)ng/L比(9.82±4.13)ng/L]、IL-1β水平[(4.96±0.95)ng/L比(2.32±0.74)ng/L]及冠心病(80.95%比15.85%)、高血压比例(53.97%比22.40%)较高(P<0.05),血清LncRNA MEG3表达水平[0.62±0.17比1.01±0.31]较低(P<0.05)。冠状动脉钙化病人血清LncRNA MEG3与miR-21、hs-CRP、TNF-α、IL-1β水平呈负相关,miR-21与hs-CRP、TNF-α、IL-1β水平呈正相关(P<0.05)。冠心病、LncRNA MEG3、miR-21水平是影响冠状动脉钙化发生的危险因素(P<0.05)。血清LncRNA MEG3、miR-21联合检测预测冠状动脉钙化的曲线下面积为0.88[95%CI:(0.84,0.91)],灵敏度为84.13%,特异度为85.79%。结论冠状动脉钙化病人血清LncRNA MEG3表达水平明显降低,miR-21表达水平明显升高,二者可能作为生物标志物,共同预示冠状动脉钙化发生。

长链非编码RNA母系表达基因3在心血管疾病中的作用

长链非编码RNA(lncRNA)通过调节细胞增殖、分化、凋亡和转移等过程,影响疾病进展。母系表达基因3(MEG3)属于lncRNA,参与肿瘤、肺动脉高压、肺纤维化、动脉粥样硬化等多种疾病的发病。该文主要介绍MEG3在冠状动脉粥样硬化性心脏病、心力衰竭等疾病中的作用。

长链非编码RNA母系表达基因3在宫颈癌组织中的表达情况及其对宫颈癌细胞生物学功能的影响

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)在宫颈癌组织中的表达情况及其临床意义,并分析MEG3的表达情况对宫颈癌细胞生物学功能的影响。方法(1)收集68例宫颈癌组织及30例正常宫颈组织,应用实时荧光定量PCR检测组织中MEG3 mRNA表达情况;分析宫颈癌患者MEG3 mRNA表达情况与临床病理及预后的关系。(2)将宫颈癌HeLa细胞及SiHa细胞分别分为OE-MEG3组(转染MEG3过表达质粒)、NC组(转染空载质粒)和空白对照组(MOCK组),以及si-MEG3组(转染MEG3-小干扰RNA)、NC组(转染阴性对照小干扰RNA)、MOCK组。转染后检测各组的细胞增殖率、迁移及侵袭能力。结果(1)宫颈癌组织中MEG3 mRNA相对表达水平低于正常宫颈组织(P<0.05)。MEG3 mRNA低表达的患者肿瘤分化程度更低,国际妇产科联盟分期更高,浸润深度>50%及淋巴结转移发生率更高,中位生存时间及无瘤生存时间更短(均P<0.05)。(2)在HeLa细胞和SiHa细胞中,OE-MEG3组的细胞增殖能力、细胞侵袭数目、迁移数目均低于其他两组;而si-MEG3组的细胞增殖能力、细胞侵袭数目、迁移数目均高于其他两组(均P<0.05)。结论lncRNA MEG3在宫颈癌组织中呈低表达,这可能与患者的不良预后有关;lncRNA MEG3能抑制宫颈癌细胞的增殖及侵袭迁移能力,其或可作为抑癌基因参与宫颈癌的发生与发展。

长链非编码RNA在喉乳头状瘤中的表达及功能分析

目的:分析喉乳头状瘤(laryngeal papilloma,LP)中长链非编码RNA(long chain non-coding RNA,lncRNA)的差异表达谱并预测其靶基因,为喉乳头状瘤的治疗及预防提供新的思路及靶点。方法:用RNA-seq技术对喉乳头状瘤组织及瘤旁组织测序,以差异倍数(FC)作为标准筛选差异表达lncRNAs,分析并提取10 kb范围内lncRNA顺式调控靶标基因,并进入基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析其生物学功能及参与信号通路等。结果:共筛选出227个差异表达基因(Log2FC≥2或≤0.5,P<0.05),其中高表达的上调基因76个(33%)、下调基因151个(67%)。满足位置要求和共表达关系的lncRNA顺式调控靶标基因共有44个,并进入GO和KEGG通路富集分析结果显示,差异表达基因GO BP显著富集在信号传导,KEGG通路显著富集在MAPK信号通路及PI3K-Akt信号通路。结论:lncRNA差异表达及其靶基因以及相关信号通路可能与喉乳头状瘤复发及其癌变密切相关。

长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1参与盆腔器官脱垂的机制

背景:作者所在课题组前期通过高通量测序结果发现长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1在盆腔器官脱垂患者子宫主韧带中表达明显降低,转化生长因子β1信号通路也是相关通路之一。目的:观察长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1对盆底韧带成纤维细胞的影响,探讨其在盆腔器官脱垂疾病发病机制中的可能作用。方法:提取大鼠盆底韧带组织标本,分离成纤维细胞,进行原代培养。慢病毒构建长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1干扰和过表达载体加入成纤维细胞中。通过免疫荧光、MTT、细胞划痕实验、流式细胞术来检测成纤维细胞的形态、增殖、迁移和凋亡情况;RT-PCR和Western-blot检测转化生长因子β1、smad2/3、c-Myc的mRNA及蛋白表达情况。结果与结论:①长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1过表达时可显著促进成纤维细胞的增殖,提高细胞的迁移能力,抑制成纤维细胞凋亡;长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1干扰时结果相反;②此外,长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1过表达时细胞中的c-Myc、转化生长因子β1、smad2/3的mRNA和蛋白相对表达量均明显增加,其干扰时则显著抑制c-Myc和转化生长因子β1的表达;③提示长链非编码RNA浆细胞瘤变异性易位基因1能够影响成纤维细胞的形态和生物学功能,可能与转化生长因子β1/smad2/3/c-Myc通路有关;该研究可为盆腔器官脱垂患者的临床诊断和治疗提供新思路。

长链非编码RNA人母系表达基因3在肿瘤发生中作用的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)覆盖了人类DNA的大部分非编码信息,占整个基因组的90%以上,它们构成了一个广泛而复杂的分子群,在肿瘤的病理生理过程中以多种形式存在。2003年,lncRNA人母系表达基因(MEG)3被证明是垂体瘤的一个潜在的肿瘤抑制因子,之后研究者又在脑膜瘤、肝癌、肺癌、神经内分泌瘤,以及前列腺癌等其他肿瘤上对其在基因表达调控、印记、转录和翻译后的作用上进行了研究,发现MEG3在多种恶性肿瘤组织中低表达或表达缺失,而上调MEG3的表达与肿瘤生长抑制相关,其在肿瘤发生中的作用和机制得到了更好地阐明。总结MEG3的功能及在肿瘤发生中的研究进展。

动脉粥样硬化相关长链非编码RNA表达谱分析及初步筛选

目的 探讨与动脉粥样硬化相关的关键长链非编码RNA(lncRNA)。方法 收集2019年1—10月新疆维吾尔自治区人民医院就诊的5例颈动脉粥样硬化患者斑块组织为试验组1,5例接受主动脉瓣置换术无斑块正常主动脉血管内膜组织为对照组1;收集同期20例颈动脉斑块性狭窄患者血液样本为试验组2,无颈动脉斑块患者血液样本为对照组2。通过高通量测序获取试验组1和对照组1中lncRNA、微小RNA(miRNA)和信使RNA(mRNA)的表达谱,使用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对差异表达基因的lncRNA进行功能富集分析,筛选出目标lncRNA构建编码-非编码共表达网络和竞争性内源RNA(ceRNA)网络。使用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)对差异表达的目标lncRNA进行原组织样本基因表达水平的筛选,并在血液样本组中进行基因表达水平验证。结果 高通量基因测序显示的表达谱中包含957个lncRNA、131个miRNA和7024个mRNA;GO分析及KEGG途径显示免疫和炎症反应、T细胞因子途径等在动脉硬化形成中可能发挥重要作用;筛选出的20个目标lncRNA预测出下游的2个miRNA和10个mRNA可能与动脉粥样硬化的形成有密切联系。qRT-PCR法在原组织样本验证结果中显示了9个关键lncRNA(LINC01094、HIF1A-AS2、HCP5、ENSG00000257027.1、ACTA2-AS1、MAGI2-AS3、LINC01278、PRKG1-AS1、LOC102724804),最终结果筛选出在动脉粥样硬化患者血液中明显表达的3个关键lncRNA(LINC01094、ACTA2-AS1、ENSG00000257027.1)。结论 初步从动脉粥样硬化组织和血液样本中筛选出关键lncRNA,可为动脉粥样硬化性疾病提供新的诊断生物标志物和治疗靶点。

非编码长链RNA与基因表达调控

近年来,在小鼠全长cDNA文库大规模测序中发现一类新的转录物——非编码长链RNA(long noncoding RNA,lncRNA),引起了科学界的关注.lncRNA长度大于200个核苷酸,无蛋白质编码功能,在真核细胞基因组中被普遍转录.lncRNA种类繁多,数量庞大,占哺乳动物基因组转录物的绝大部分.相对于研究较多的非编码小RNA,lncRNA的功能目前尚不完全清楚.但越来越多的研究发现,lncRNA在多个水平调控基因的表达,在胚胎发育、物种进化、细胞分化和某些疾病如神经退行性疾病及肿瘤的发生过程中起着重要作用.本文在简要介绍lncRNA基本概念的基础上,结合当前研究成果,就lncRNA在转录水平、转录后水平和表观遗传水平调控基因表达的机制作一综述.