长链非编码RNA肝癌高表达转录本通过微小RNA-134-5p促进宫颈癌细胞恶性生物学行为的机制研究

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)肝癌高表达转录本(HULC)通过抑制微小RNA-134-5p促进宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移,促进凋亡的作用及其作用机制。方法2019年10月至2020年5月,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测体外培养的人正常宫颈上皮细胞和宫颈癌细胞中HULC的表达情况,在宫颈癌C-33A细胞中转染特异性HULC siRNA,qRT-PCR检测转染效果,细胞计数试剂盒(CCK-8)法分析C-33A细胞增殖情况,采用流式细胞术分析C-33A细胞凋亡情况,Transwell实验分析C-33A细胞侵袭和迁移能力,双荧光素酶报告基因实验检测HULC与miR-134-5p的相互作用。在抑制HULC表达的C-33A细胞中转染miR-134-5p抑制剂,以同样的方法检测对细胞增殖、侵袭和迁移的影响。结果HULC在宫颈癌细胞(HeLa、Cas‐ki、SiHa、C-33A)中的表达水平为(1.95±0.24、2.26±0.21、1.77±0.19、3.49±0.40),显著高于正常宫颈上皮细胞1.00±0.11,HULC在C-33A细胞中的表达量最高(P<0.05)。转染特异性HULC siRNA能够抑制C-33A细胞中HULC的表达(0.94±0.08比0.18±0.02)。抑制HULC表达后,C-33A细胞OD值降低(0.59±0.08比0.38±0.05),凋亡率明显升高[(3.01±0.34)%比(18.54±2.16)%],侵袭[112.54±13.86比46.28±10.16]和迁移(158.65±18.66比78.18±10.80)能力减弱。HULC能够与miR-134-5p特异性结合,负向调控miR-134-5p的表达。抑制miR-134-5p的表达能够逆转抑制HULC导致的C-33A细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移能力的抑制作用。结论HULC通过抑制miR-134-5p的表达促进宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移,并诱导细胞凋亡。

长链非编码RNA肝癌高表达转录本促进人骨髓间充质干细胞向肝样细胞的分化

背景:骨髓间充质干细胞在体外可以被诱导分化为肝样细胞,但是细胞功能不成熟。研究表明,长链非编码RNA可以影响间充质干细胞的分化,但是关于长链非编码RNA肝癌高表达转录本是否能够参与骨髓间充质干细胞向肝细胞分化还未有报道。目的:探讨长链非编码RNA肝癌高表达转录本在人骨髓间充质干细胞向肝样细胞分化中的作用。方法:体外添加细胞因子诱导人骨髓间充质干细胞(购自上海中科院细胞库)向肝样细胞分化,诱导4周后倒置显微镜观察细胞的形态学变化,免疫荧光技术检测肝细胞特异性蛋白的表达,qRT-PCR检测分化过程中肝癌高表达转录本的表达;然后通过慢病毒转染构建稳定表达肝癌高表达转录本的人骨髓间充质干细胞株,以转染阴性对照病毒作为对照组,两组同时添加细胞因子进行肝向细胞诱导分化,qRT-PCR、Western blot检测过表达组与对照组肝细胞特异性基因、蛋白表达的差异。结果与结论:①人骨髓间充质干细胞在体外添加细胞因子下可以成功被诱导分化为肝样细胞,在分化过程中肝癌高表达转录本的表达逐渐增高;②过表达肝癌高表达转录本后促进了人骨髓间充质干细胞诱导分化后肝细胞特异性基因及蛋白的表达;③结果表明,肝癌高表达转录本在人骨髓间充质干细胞向肝样细胞分化中发挥着至关重要的作用,将为细胞治疗肝脏疾病奠定坚实的理论基础。

基于长链非编码RNA HOX转录反义RNA探讨次乌头原碱对人肝癌SK-Hep-1细胞自噬的影响实验研究

目的:基于长链非编码RNA(lncRNA)HOX转录反义RNA(HOTAIR)探讨次乌头原碱对人肝癌SK-Hep-1细胞自噬的影响。方法:取对数期人肝癌SK-Hep-1细胞,将lncRNA HOTAIR抑制质粒lncRNA HOTAIR-shRNA转染至SK-Hep-1细胞,随机分为转染组和联合组,转染组常规培养,联合组加入次乌头原碱(终浓度200μmol/L)。另取SK-Hep-1细胞随机分为空白组和次乌头原碱组,空白组常规培养,次乌头原碱组加入次乌头原碱(终浓度200μmol/L)。48 h后收集细胞,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测各组lncRNA HOTAIR表达量;流式细胞仪检测各组凋亡率;绿色荧光蛋白(GFP)-微管相关蛋白1轻链3(LC3)转染检测各组自噬情况;免疫印迹法检测细胞Beclin1、P62、微管相关蛋白1轻链3Ⅰ(LC3Ⅰ)蛋白相对表达量。结果:与空白组比较,次乌头原碱组lncRNA HOTAIR表达量升高,转染组lncRNA HOTAIR表达量降低(均P<0.05)。与次乌头原碱组比较,联合组lncRNA HOTAIR表达量降低(P<0.05)。与转染组比较,联合组lncRNA HOTAIR表达量升高(P<0.05)。与空白组比较,次乌头原碱组细胞凋亡率及Beclin1、P62、LC3Ⅰ蛋白相对表达量升高,GFP-LC3斑点数增加(均P<0.05);转染组细胞凋亡率及Beclin1、P62、LC3Ⅰ蛋白表达量降低,GFP-LC3斑点数减少(均P<0.05)。与次乌头原碱组比较,联合组细胞凋亡率及Beclin1、P62、LC3Ⅰ蛋白相对表达量降低,GFP-LC3斑点数减少(均P<0.05)。与转染组比较,联合组细胞凋亡率及Beclin1、P62、LC3Ⅰ蛋白相对表达量升高,GFP-LC3斑点数增加(均P<0.05)。结论:次乌头原碱可能通过诱导人肝癌SK-Hep-1细胞过度自噬而促进细胞凋亡,其作用机制可能与上调LncRNA HOTAIR表达有关。

长链非编码RNA母系表达基因8通过微小RNA-495-3p调控急性髓性白血病细胞高迁移率族蛋白A1表达及对细胞增殖、凋亡的作用机制研究

目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因8(MEG8)通过微小RNA-495-3p(miR-495-3p)调控急性髓性白血病细胞(AML)高迁移率族蛋白A1(HMGA1)表达及对细胞增殖、凋亡的机制。方法:选取50例经确诊为AML患者的骨髓活检标本与52例健康骨髓捐赠者骨髓标本,常规培养人AML细胞株HL-60,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法骨髓单个核细胞中lncRNA MEG8 mRNA表达。将HL-60细胞分为六组,即HL-60组(HL-60细胞)、si-NC组(转染si-NC)、si-lncRNA MEG8组(转染si-lncRNA MEG8)、mimic-NC组(转染mimic-NC)、miR-495-3p mimic组(转染miR-495-3p mimic)、si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组(转染si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic),CCK-8法检测培养24、48、72 h各组细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blot法检测细胞中HMGA1表达,双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA MEG8、miR-495-3p、HMGA1之间的关系。结果:与对照组相比,观察组lncRNA MEG8 mRNA表达升高(P<0.05)。与miR NC+MEG8 WT组比较,miR-495-3p mimic+MEG8 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05),与miR NC+HMGA1 WT组比较,miR-495-3p mimic+HMGA1 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组、mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8组、miR-495-3p mimic组和si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组24、48 h细胞增殖能力均显著下降,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组细胞增殖率最低(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HL-60细胞凋亡率高于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HMGA1蛋白表达低于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。结论:沉默lncRNA MEG8可能通过上调miR-495-3p来下调HMGB1,来抑制HL-60细胞的恶性生物学行为,可为探索AML潜在治疗靶点提供了新思路。

肝癌高表达长链非编码RNA在肝癌中的表达及其对自噬水平的影响

目的探讨肝癌高表达(HULC)长链非编码RNA在肝癌中的表达及其与自噬的关系。方法采用实时定量PCR检测60例肝癌组织以及相应正常肝组织中HULC的表达水平,并检测HULC在肝癌细胞系及正常肝细胞系中的表达情况。通过pcDNA3.1-HULC转染肝癌细胞系HepG2、Bel-7402过表达HULC;分别采用CCK-8试剂盒、Western blotting和免疫荧光检测细胞增殖改变情况、自噬相关蛋白LC3Ⅱ/Ⅰ和自噬相关蛋白Atg3的表达变化以及LC3斑点数目的变化情况。结果 HULC在肝癌组织中的表达高于正常肝组织,差异有统计学意义(P <0.05)。过表达HULC能促进肝癌细胞增殖,并且过表达HULC的肝癌细胞中LC3-Ⅰ向LC3-Ⅱ的转化和Atg3的表达均显著增加(P <0.05)。免疫荧光可见,过表达HULC后LC3荧光斑点明显增多。结论肝癌组织中HULC的表达高于正常肝组织,HULC促进肝癌细胞增殖,并且能够提高肝癌细胞自噬水平,有望成为肝癌治疗的潜在靶点。

白藜芦醇苷通过抑制长链非编码RNA HULC表达抑制肝癌SMMC-7721和HepG2细胞的增殖和侵袭

原发性肝癌是临床上最常见的恶性肿瘤之一,目前仍在寻找有效的治疗手段。我们之前的研究证实白藜芦醇苷能够抑制肝癌细胞的增殖和侵袭,但其具体的分子生物学机制仍不清楚。本文主要探讨白藜芦醇苷调控肝癌细胞系SMMC-7721和Hep G2肝癌细胞系增殖能力的分子生物学机制。首先,我们构建大鼠原发性肝癌模型,发现模型组肝组织中长链非编码RNA HULC的表达较正常组明显升高;同时检测白藜芦醇苷预防组(分为低剂量组,中剂量组和高剂量组)肝组织中肝癌细胞中出现异常的高表达(HULC)的表达情况。结果显示,在中、高剂量组中HULC的表达明显降低。在体外实验中,SMMC7721和Hep G2中HULC的表达明显较正常肝组织显著增高,然而白藜芦醇苷高剂量组中HULC的表达发生明显降低,同时在SMMC7721和Hep G2中加入白藜芦醇苷后,高剂量组中细胞增殖能力明显下降。为了进一步探究HULC在白藜芦醇苷预防肝癌中的功能,我们构建了HULC过表达质粒以及针对HULC的siRNA片段,并验证了过表达和敲低的效率。在使用高剂量白藜芦醇苷处理SMMC7721和Hep G2的同时,过表达HULC能够逆转白藜芦醇苷引起的对细胞增殖的抑制,然而敲低HULC则能够更加有效地降低白藜芦醇苷对细胞增殖的抑制效果。这提示我们白藜芦醇苷能够可能通过调控HULC的表达抑制肝癌细胞的增殖和侵袭,二者具有协同作用。本文结果为预防原发性肝癌提供了新的理论依据但其临床疗效还需要进一步验证。

肝癌组织中长链非编码RNA CCAT2的表达变化及意义

目的观察长链非编码RNA(LncRNA)结肠癌相关转录物2(CCAT2)在肝癌(HCC)组织中的表达变化,并探讨其意义。方法收集100例份HCC患者的癌及癌旁组织,采用实时荧光定量PCR法检测癌及癌旁组织中CCAT2表达;分析癌组织中CCAT2表达与HCC患者临床病理特征间的关系;Kaplan-Meier法检测CCAT2表达与患者生存率间的关系。结果 LncRNA CCAT2在HCC癌组织中的表达高于癌旁组织(P<0.05);LncRNA CCAT2表达与HCC患者的TNM分期、肝内播散灶及血管侵袭密切相关(P均<0.05),而与患者年龄、性别、肿瘤大小及肝硬化无关(P均>0.05);Log Rank检验结果显示,CCAT2高表达与HCC患者不良预后呈正相关(χ~2=6.481,P=0.011)。结论 HCC癌组织中LncRNA CCAT2呈高表达,且与TNM分期、肝内播散、血管侵袭有关;检测LncRNA CCAT2在癌组织中的表达有助于病情判断。

长链非编码RNA HULC在乳腺癌组织中表达及临床意义

目的探讨长链非编码RNA肝癌高表达转录本(HULC)在乳腺癌组织中表达及临床意义。方法选取2013年5月至2015年5月在南阳市中心医院乳腺科行手术治疗且资料完整的乳腺癌病人112例,实时荧光定量PCR术检测乳腺癌和正常乳腺组织中HULC表达,病人均于术后1 d开始随访,随访截止日期2020年5月31日,以死亡作为终点事件,记录病人生存时间,采用Kaplan-Meier法进行生存分析,采用Cox比例风险回归模型分析影响乳腺癌病人预后的风险因素。结果乳腺癌组织中HULC表达量为(2.27±0.18),高于正常乳腺组织的(1.02±0.08),差异有统计意义(t=67.38,P<0.001);不同组织学分级、TNM分期、淋巴结转移、ER和Ki-67的乳腺癌组织中HULC表达量差异有统计学意义(P<0.05);以乳腺癌组织中HULC表达量的P25值为界值,将病人分为低表达组(n=29)和高表达组(n=83),低表达组病人生存时间(52.72±3.06)个月,5年生存率为82.76%,高表达组病人则分别为(35.51±2.25)个月和36.14%,差异有统计学意义(χ^(2)=15.16,P<0.001);HULC表达是影响乳腺癌病人预后的独立风险因素[HR=5.249(95%CI:1.965~14.024),P<0.05]。结论乳腺癌组织中HULC表达量升高,可能发挥类似癌基因的作用而参与了乳腺癌进展,且是影响病人预后的风险因素。

非编码长链RNA与基因表达调控

近年来,在小鼠全长cDNA文库大规模测序中发现一类新的转录物——非编码长链RNA(long noncoding RNA,lncRNA),引起了科学界的关注.lncRNA长度大于200个核苷酸,无蛋白质编码功能,在真核细胞基因组中被普遍转录.lncRNA种类繁多,数量庞大,占哺乳动物基因组转录物的绝大部分.相对于研究较多的非编码小RNA,lncRNA的功能目前尚不完全清楚.但越来越多的研究发现,lncRNA在多个水平调控基因的表达,在胚胎发育、物种进化、细胞分化和某些疾病如神经退行性疾病及肿瘤的发生过程中起着重要作用.本文在简要介绍lncRNA基本概念的基础上,结合当前研究成果,就lncRNA在转录水平、转录后水平和表观遗传水平调控基因表达的机制作一综述.

长链非编码RNA高表达与小细胞肺癌预后不良相关性的Meta分析

目的旨在确定长链非编码RNA表达水平在小细胞肺癌(SCLC)中的潜在预后和临床病理价值。方法计算机全面检索PubMed、Embase、Cochrane Library、中国知网、万方数据库、维普中文期刊全文数据库和中国生物医学文献数据库等在线数据库,收集LncRNA高表达与SCLC预后的相关性研究(建库至2020年5月)。由2名研究人员独立筛选文献、提取资料,质量评价后使用统计软件STATA12.0进行Meta定量综合分析。结果共计纳入13个病例-对照研究,包括1302例患者。结果表明:LncRNA高表达的SCLC患者更易早期广泛转移[比值比(Odds ratio,OR)=6.10,95%置信区间(confidence interval,CI)(4.69,7.93),P<0.01]、对化疗药物反应较差[OR=5.17,95%CI(3.44,7.77),P<0.01]、生存状态较差[OR=5.96,95%CI(4.22,8.40),P<0.01]、总生存期(OS)[风险比(hazard ratio,HR)=3.33,95%CI(2.65,4.19),P<0.01]及无进展生存期(PFS)[HR=4.88,95%CI(3.00,7.94),P<0.01]更短。结论LncRNA高表达可以预测SCLC患者的不良生存率和不良的临床病理特征,可能是潜在的预后标志物。然而,这需要更多高质量研究的支持。

长链非编码RNA与原发性肝癌相关性研究进展

人类基因组研究发现大多数基因可转录成无编码蛋白质的功能RNA,即非编码RNA （ncRNA）[1].随着基因测序和分析技术的突飞猛进,越来越多的研究开始关注这些曾经被认为是基因组中＂暗物质＂的ncRNA,包括小干扰RNA（siRNA）、微小RNA （miRNA）和长链ncRNA（lncRNA）,并发现其在细胞生命的各环节中都具有重要作用.

HBV相关性和非HBV相关性肝细胞癌组织的长链非编码RNA的表达分析

目的探讨HBV相关性和非HBV相关性肝细胞癌(HCC)组织的长链非编码RNA(lncRNA)的表达情况。方法选择行手术治疗的HBV相关HCC患者42例、非HBV相关HCC患者45例,采用原位杂交技术检测两组患者肿瘤维修组和癌旁组织中肌动蛋白丝相关蛋白1-反义RNA1(AFAP1-AS1)、肝癌微血管浸润相关lncRNA(MVIH)和肺腺癌转移相关转录本1(MALAT-1)的表达水平,并比较不同临床特征HCC患者肿瘤组织AFAP1-AS1、MVIH和MALAT-1的表达情况。结果在两组患者中,肿瘤组织AFAP-AS1的染色分数低于癌旁组织(P<0.05),而肿瘤组织MVIH和MALAT-1的染色分数高于癌旁组织(P均<0.05)。HBV相关性HCC组癌旁组织中的AFAP-AS1染色分数高于非HBV相关HCC组癌旁组织(P<0.05),而两组肿瘤组织AFAP-AS1染色分数、两组肿瘤组织或癌旁组织中MVIH和MALAT-1的染色分数比较,差异均无统计学意义(P均>0.05)。在HBV相关性HCC、非HBV相关性HCC患者中,AFAP1-AS1、MVIH和MALAT-1在不同的分期和分型患者的肿瘤组织中的表达水平比较,差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论在HCC组织中AFAP1-AS1表达下调而MVIH和MALAT-1表达上调,三者均参与了HCC的发生发展,而AFAP1-AS1的表达可能还受到HBV相关生物学过程的调节。

急性胰腺炎病人血清长链非编码RNA核富集转录体1、Toll样受体2表达变化及临床意义研究

目的探讨急性胰腺炎(AP)病人血清长链非编码RNA核富集转录体1(LncRNA NETA1)、Toll样受体2(TLR2)表达及临床意义。方法选取2017年5月至2020年12月石家庄平安医院收治的AP病人125例为研究对象,根据急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHEⅡ)对AP病人进行评分,并将病人分为轻症组56例,重症组69例;根据住院期间重症组AP病人预后情况,将病人分为预后不良25例,预后良好44例。同期选取该院健康体检者130例为健康组。实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测血清LncRNA NETA1水平,酶联免疫吸附测定(ELISA)检测血清TLR2水平;Pearson相关性分析探索AP病人血清LncRNA NEAT1、TLR2水平相关性及二者与病人APACHEⅡ评分的关系;受试者操作特征曲线(ROC曲线)分析血清LncRNA NEAT1、TLR2对AP病人重症的评估价值。结果与健康组比较,AP组血清LncRNA NEAT1(2.16±0.31比1.00±0.00)、TLR2水平[(6.43±1.05)µg/L比(0.59±0.24)µg/L]升高(P<0.05);与轻症组比较,重症组AP病人血清LncRNA NEAT1(2.31±0.33比1.98±0.27)、TLR2水平[(6.89±1.16)µg/L比(5.86±0.92)µg/L]升高(P<0.05);与预后良好组比较,预后不良组重症AP病人血清LncRNA NEAT1(2.43±0.36比2.14±0.27)、TLR2水平[(7.12±1.24)µg/L比(6.45±1.02)µg/L]升高(P<0.05);Pearson相关性分析结果表明,AP病人血清LncRNA NEAT1、TLR2呈正相关(r=0.65,P<0.05),二者与病人APACHEⅡ评分均呈正相关(r=0.50、0.52,P<0.05);ROC曲线结果显示,血清LncRNA NEAT1水平、TLR2单独及联合评估AP病人重症的曲线下面积(AUC)分别为0.73[95%CI:(0.64,0.82)]、0.75[95%CI:(0.67,0.84)]、0.88[95%CI:(0.82,0.94)],血清LncRNA NEAT1联合TLR2水平预测AP病人重症的AUC明显大于二者单独预测(P<0.05)。结论AP病人血清LncRNA NEAT1、TLR2表达水平显著升高,且与病人严重程度和预后有关,临床上检测LncRNA NEAT1、TLR2表达可能有助于AP病人的病情评估。

长链非编码RNA在肝癌中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是指长度超过200个核苷酸的非编码RNA,不具有编码蛋白质功能。近年来研究发现,与肝癌有关的lncRNA包括H19、HOC转录反义RNA、肝癌过表达转录本、肺腺癌转移相关转录本1、人母系表达基因3等,其与肝癌的发生、发展关系密切,有望成为新型的肝癌标志物及治疗靶点,在肝癌诊断、预后和治疗方面应用前景良好。

牛体外受精胚胎抗氧化相关的长链非编码RNA表达谱

旨在探究培养液中添加3mmol·L^(-1)谷胱甘肽(Glutathione,GSH)对牛体外受精胚胎中长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的影响。收集8~16-细胞期和桑椹期的胚胎,构建文库后测序,筛选差异lncRNAs,共表达分析后,获得的差异基因进行GO功能注释和KEGG通路分析;同时对lncRNA进行了顺式作用靶基因的预测及其功能分析;通过荧光定量PCR对8个lncRNAs表达水平进行检测,验证测序结果的准确性。测序共得到4 273个lncRNAs,通过对其表达量、长度和外显子个数分析表明,测序数据的可靠性较好。筛选共得到59个差异lncRNAs(其中23个在对照组(不添加GSH)上调,而在处理组(添加3mmol·L-1 GSH)下调;36个在对照组下调,而在处理组上调),在对照组和处理组中,59个lncRNAs分别与754和2 782个蛋白编码基因共表达,这些基因分别参与47和48个功能分类,且主要富集于5和13条信号通路。对23和36个差异lncRNAs临近的145和154个蛋白编码基因进行GO注释,结果表明,这些基因分别参与35和43个功能分类。14个lncRNAs共表达的差异基因参与谷胱甘肽代谢通路。综上表明,在培养液中添加GSH能导致胚胎lncRNA表达谱的变化。

长链非编码RNA的异常表达在肿瘤中的作用

人类基因组测序分析显示，不到2%的基因转录并编码蛋白质，而另外超过98%基因转录为非编码RNA（non-codingRNAs，ncRNAs）。长链非编码RNA（long non-codingRNA，LncRNA）是一类核苷酸长度〉200 nt的ncRNAs的总称，仅有有限的或无蛋白质编码能力，主要以RNA的形式参与表观遗传修饰、转录或转录后修饰等多种层面的基因表达调控。LncRNA在基因沉默、转录激活、转录抑制、转录后调控、染色质修饰等多方面发挥广泛的调节作用 ADDINEN.CITE.DATA。目前已有许多研究 ADDINEN.CITE.DATA 指出,肿瘤组织中的LncRNA与肿瘤发生、发展关系密切，涉及到转录、转录后调控、表观遗传控制等各级层面。本文结合近年来LncRNA在肿瘤细胞中的异常表达情况及其与蛋白质、其他种类的RNA或DNA的相互作用机制，对其在肿瘤发生、发展中 扮演的角色做一综述。

长链非编码RNA HOTAIR在肝癌细胞生物学行为中的调节作用及其机制研究进展

反义转录长链非编码RNA-同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)是在肝癌细胞中第一个被发现的长链非编码RNA,其可通过调控表观遗传和染色质状态来调节其基因的表达水平,并影响肝癌细胞的生物学行为。其中,HOTAIR可通过与PRC2转录抑制复合物结合,使其相应靶基因甲基化,从而诱导和促进肝癌细胞的激活与增殖,或者通过竞争同种miRNA,参与靶基因的水平表达调节,来促进肝癌细胞的侵袭与转移。沉默HOTAIR可通过调控miR-217-5p活化磷酸化-磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸化-苏氨酸蛋白激酶/基质金属蛋白酶-2/9信号通路及降低磷酸化信号转导和转录激活因子3的表达水平,促进肝癌细胞凋亡现象的发生。

长链非编码RNA调控肝癌发生发展相关细胞信号通路的研究进展

高通量RNA测序技术的发展使得大量长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)基因被发现。既往认知中,大多数lncRNA是没有任何功能的随机转录产物;然而近年来越来越多的证据表明,lncRNA参与诸多病理生理过程,是细胞中重要的功能分子。以下对肝癌相关lncRNA的功能和分子机制进行概述,探讨lncRNA在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中Wnt、信号转导与转录活化因子3(STAT 3)、上皮间质转化(epithelial-mesenchymal tramsition,EMT)、NF-κB这4种细胞信号通路发挥的重要调控作用。了解lncRNA在肝癌发生中发挥作用的途径,以期为肝癌的临床诊断和治疗提供帮助。

长链非编码RNA在喉乳头状瘤中的表达及功能分析

目的:分析喉乳头状瘤(laryngeal papilloma,LP)中长链非编码RNA(long chain non-coding RNA,lncRNA)的差异表达谱并预测其靶基因,为喉乳头状瘤的治疗及预防提供新的思路及靶点。方法:用RNA-seq技术对喉乳头状瘤组织及瘤旁组织测序,以差异倍数(FC)作为标准筛选差异表达lncRNAs,分析并提取10 kb范围内lncRNA顺式调控靶标基因,并进入基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析其生物学功能及参与信号通路等。结果:共筛选出227个差异表达基因(Log2FC≥2或≤0.5,P<0.05),其中高表达的上调基因76个(33%)、下调基因151个(67%)。满足位置要求和共表达关系的lncRNA顺式调控靶标基因共有44个,并进入GO和KEGG通路富集分析结果显示,差异表达基因GO BP显著富集在信号传导,KEGG通路显著富集在MAPK信号通路及PI3K-Akt信号通路。结论:lncRNA差异表达及其靶基因以及相关信号通路可能与喉乳头状瘤复发及其癌变密切相关。

长链非编码RNA与前列腺癌

功能基因组学的飞速发展将越来越多的目光引向了对非编码转录产物功能的研究。在某些情况下或者是至少在一种特定的细胞类型中,人类的常染色体中几乎每一对核苷酸对都会发生转录现象[1]。转录产物中能够稳定存在的信使RNA（messenger RNA,mRNA）不超过2%,其余绝大部分为非编码RNA（noncoding RNA,ncRNA）[2]。关于ncRNA的分类,目前有两种较常用的方法,一种是依据ncRNA的表达特点及功能，