阴沟肠杆菌B8发酵液对植物的促生作用和IAA分析

以甜玉米 Sh2和番茄为试验材料 ,研究阴沟肠杆菌 B8发酵液对植物的促生作用 ,并对其所含的主要生理活性物质进行了分析 .结果表明 :以适当浓度的发酵液喷施植株幼苗期的叶面 ,两周后 ,发现其株高与对照相比明显增加 ,根系也较对照发达 . HPL C证实该发酵液中含有植物生长激素吲哚乙酸( IAA) .在最适条件下 ,培养基中添加 0 .2 %色氨酸时 ,发酵液中 IAA含量可达 90 4 .38mg/ L.试验还发现 ,喷施发酵液后的植株内源

阴沟肠杆菌B8拮抗活性基因‘admA’及上游调控序列的克隆与功能鉴定

为了阐明水稻白叶枯病拮抗菌阴沟肠杆菌B8的作用机理,文章采用转座子标签法和染色体步移技术克隆到突变株B8B中Tn5插入位点周边拮抗活性相关片段,并通过基因敲除验证了获得的拮抗相关片段admA’上游调控序列的功能。以转座子中Kan抗性基因为标签,克隆了B8B菌株中Tn5插入位点左侧2 608 bp序列,经两次染色体步移得到Tn5插入位点右侧的2 354 bp序列。序列拼接后获得B8菌株拮抗相关序列4 611 bp的Bcontig。生物信息学分析显示该序列含有7个ORF,分别对应于3-磷酸甘油醛脱氢酶(GADPH)基因的部分编码区、2个LysR家族转录调控因子、弧菌假设蛋白VSWAT3-20465及成团泛菌(Pantoea agglomerans)andrimid生物合成基因簇的admA、admB和部分admC基因序列。B8B菌株Tn5插入分别位于同源于弧菌假设蛋白的anrPORF及‘admA’基因上游200 bp和894 bp处。通过同源重组技术,借助敲除质粒pMB-BG,获得拮抗活性消失的突变株B-1和B-3。结果表明B8B突变株中Tn5的插入可能影响了anrP蛋白的转录和表达,进而调控拮抗物质编码基因簇的生物合成。B8菌株中拮抗物质相关基因是类似于andrimid生物合成基因簇的基因家族,其上游调控区对该抗生素的生物合成具有重要的作用。

转座子标签法对阴沟肠杆菌B8拮抗水稻白叶枯病菌相关基因片段的克隆与检测

阴沟肠杆菌B8是从水稻叶面分离获得的具有拮抗水稻白叶枯病菌等多种病原细菌的广谱拮抗菌.为研究其拮抗机理,我们应用转座子标签法对阴沟肠杆菌B8中与抗水稻白叶枯病菌拮抗活性相关的DNA片段进行了克隆.通过自杀性质粒pZJ25介导,将Tn5转座到B8的染色体上,从而筛选到2株拮抗活性丧失的菌株B8B和B8F;用Tn5片段为探针,分别对B8、B8B、B8F进行Southern杂交,结果在B8中无特异条带,而在B8B和B8F中各有一条约20 kb和9 kb的EcoRⅠ特异条带;分别提取二株突变菌株的基因组DNA,BamHⅠ酶切,克隆于pBS的BamHⅠ位点上,利用Tn5上的Kan抗性,分别筛选到质粒pTLB和pTLF,获得包含Tn5部分序列的B和F二个基因片段,大小约为6 kb和7 kb;应用pTLB全质粒和pTLF中约0.8 kb的BamHⅠ+HpaⅠ外源F片段为探针,对B8、B8B、B8F进行Southern杂交,证实我们克隆到Tn5转座位点周围的二个片段,且他们分别位于B8菌株染色体DNA的二个不同位置.

阴沟肠杆菌B8拮抗活性相关基因的克隆与分析

为研究具有广谱拮抗活性的阴沟肠杆菌B8的拮抗机理,应用自杀性质粒pZJ25,将Tn5转座到B8的染色体上,筛选到2株拮抗活性丧失的菌株.选择其中B8F突变株,应用Tn5上的Kanr基因作为标签,对Tn5插入位点右侧的拮抗活性相关基因片段进行了克隆,筛选得到质粒pTLF,经亚克隆后测序,获得F片段735bp的序列.提取原始菌株B8基因组DNA,酶切后与PstⅠ接头连接,应用接头引物和根据F片段设计的特异引物,在F片段的左右两侧进行染色体步行,获得了F片段(Tn5插入位点)左侧的1106bp序列和F片段右侧的664bp序列.生物信息学分析显示,获得的B8菌株拮抗相关基因序列包含3个ORF,与Pantoeaagglomerans的andrimid生物合成基因簇(基因GenBank登录号AY192157)有较高的同源性,分别对应于admM,admN和admO共3个基因.被Tn5插入破坏的ORF(命名为anrF基因)对应于admM(Polyketide合酶基因),插入位点位于终止密码前214bp处.由此证明,anrF基因与B8菌株的拮抗活性相关,推测B8菌株产生的拮抗物质为andrimid.