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润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测
1
作者
刘天娇
张晶晶
+2 位作者
马洁桦
潘连军
阮红杰
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1585-1591,共7页
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-cod...
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中mRNA的生物学功能。结果:通过下一代测序技术,根据|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05标准筛选出LD组和正常对照组中共计499条上调表达的lncRNA、337条下调表达的lncRNA,以及1582条上调表达mRNA、633条下调表达的mRNA。随后,通过其中100个lncRNA与311个mRNA构建了基于差异表达的lncRNA和mRNA的共表达网络。最后,共表达网络的功能富集分析表明mRNA主要与心肌相关的疾病和功能有关。结论:LD的发病机制可能与血液循环功能障碍、局部肌肉功能障碍以及cGMP通路等有关,需要相关研究来进一步证实。
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关键词
阴道润滑障碍
长链非编码RNA
共表达网络
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职称材料
题名
润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测
1
作者
刘天娇
张晶晶
马洁桦
潘连军
阮红杰
机构
南京医科大学附属妇产医院妇女保健科
南京医科大学附属妇产医院产科
南京医科大学附属妇产医院医学研究中心
南京医科大学附属妇产医院泌尿外科
南京医科大学附属妇产医院急诊医学科
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1585-1591,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81771572)。
文摘
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中mRNA的生物学功能。结果:通过下一代测序技术,根据|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05标准筛选出LD组和正常对照组中共计499条上调表达的lncRNA、337条下调表达的lncRNA,以及1582条上调表达mRNA、633条下调表达的mRNA。随后,通过其中100个lncRNA与311个mRNA构建了基于差异表达的lncRNA和mRNA的共表达网络。最后,共表达网络的功能富集分析表明mRNA主要与心肌相关的疾病和功能有关。结论:LD的发病机制可能与血液循环功能障碍、局部肌肉功能障碍以及cGMP通路等有关,需要相关研究来进一步证实。
关键词
阴道润滑障碍
长链非编码RNA
共表达网络
Keywords
vaginal lubrication disorder
long non-coding RNA
co-expression network
分类号
R711.73 [医药卫生—妇产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测
刘天娇
张晶晶
马洁桦
潘连军
阮红杰
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
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