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MD模拟研究Mini-protein Chignolin去折叠过程中残基的构象熵
1
作者
刘贵忠
于家峰
《德州学院学报》
2007年第6期1-4,共4页
采用分子动力学模拟方法,对Chignolin在260 K、300 K、350 K和400 K进行去折叠模拟,计算8个残基(2—9位点)的构象熵.研究发现,构象熵值可大致分为低熵组、中熵组和高熵组.影响残基熵值的因素主要为温度、残基的原子数、残基所在位点、...
采用分子动力学模拟方法,对Chignolin在260 K、300 K、350 K和400 K进行去折叠模拟,计算8个残基(2—9位点)的构象熵.研究发现,构象熵值可大致分为低熵组、中熵组和高熵组.影响残基熵值的因素主要为温度、残基的原子数、残基所在位点、与邻近残基的相互作用等.还发现残基的构象熵有短时间急剧变化——阶梯跃变的现象.这意味着蛋白质的去折叠可能是不连续的.提示蛋白质的折叠过程可能也是不连续的.
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关键词
Chignolin
构象熵
分子动力学模拟
去折叠
阶梯跃变
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职称材料
题名
MD模拟研究Mini-protein Chignolin去折叠过程中残基的构象熵
1
作者
刘贵忠
于家峰
机构
德州学院物理系
出处
《德州学院学报》
2007年第6期1-4,共4页
基金
国家自然科学基金(90403120)
山东省自然科学基金(Y2005D12)
文摘
采用分子动力学模拟方法,对Chignolin在260 K、300 K、350 K和400 K进行去折叠模拟,计算8个残基(2—9位点)的构象熵.研究发现,构象熵值可大致分为低熵组、中熵组和高熵组.影响残基熵值的因素主要为温度、残基的原子数、残基所在位点、与邻近残基的相互作用等.还发现残基的构象熵有短时间急剧变化——阶梯跃变的现象.这意味着蛋白质的去折叠可能是不连续的.提示蛋白质的折叠过程可能也是不连续的.
关键词
Chignolin
构象熵
分子动力学模拟
去折叠
阶梯跃变
Keywords
Chignolin
conformational
entropies
MD simulation
unfolding
ladder jump
分类号
Q612 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MD模拟研究Mini-protein Chignolin去折叠过程中残基的构象熵
刘贵忠
于家峰
《德州学院学报》
2007
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